Analiza PIK3CA mutacija u želučanom karcinoma i metaanaliza literature pokazuju da eksona selektivnosti je potpis tipa raka

Analiza PIK3CA mutacija u želučanom karcinomu i metaanaliza literature ukazuju na to da eksona-selektivnost je potpis vrste raka pregled apstraktne pregled Pozadina pregled PIK3CA pregled je jedan od gena najčešće mutiranih rakom u čovjeka, i to je potencijalna meta za personaliziranu terapiju. Cilj ovog istraživanja bio je procijeniti učestalost i tip PIK3CA pregled mutacija u želučanom karcinomu i usporedite ih sa svojim kliničkim patološkim čimbenici.
Metode pregled analizirali smo 264 želučanog raka, uključujući i 39 s mikrosatelitne nestabilnosti (MSI ), za mutacija u dva PIK3CA pregled vrućih mjesta u eksona 9 i 20 neposrednim sekvencioniranje DNA dobivene iz microdissected stanica raka pregled. Rezultati
slučajeva nose mutacije su 42 (16%). Svi su bili heterozigotni misscnsc jedinstvene baze zamjene; najčešći je H1047R (26/42; 62%) u eksona 20, a drugi je bio Q546K (4/42; 9,5%) u eksona 9. Svi mutirani MSI slučajevi (8/39) nosio H1047R mutaciju. Nije pronađena druga povezanost između PI3KCA pregled mutacijama i njihovih kliničkih patoloških kovarijanata. Metaanaliza od mutacija pojavljuju u istim regijama prikazanim u 27 izdanja pokazala je da odnos između eksona 20 i eksona 9 prevalenciji je 0,6 (95% CI: 0,5 -0,8) za debelo crijevo, 1,6 (95% CI: 1,1 -2,3) za prsa , 2,7 (95% CI: 1,6 -4.9) za želučane i 4.1 (95% CI: 1,9 -10.3.) za karcinoma endometrija pregled Zaključci
ukupnu prevalenciju PIK3CA pregled mutacija ukazuje na važnu ulogu PIK3CA pregled kod raka želuca. Nedostatak zajedno s bilo kojim klinički-patološka stanja ukazuje da ta mutacija u PIK3CA
se pojaviti ranije tijekom razvoja raka. Metaanaliza pokazala je da eksona-selektivnost je važan potpis tipa raka koji odražavaju različite kontekste u kojima su tumori nastaju. Pregled Pozadina pregled, raka želuca je drugi rak uzrok smrti u svijetu, iako je njegova učestalost smanjio se u zapadnim zemljama , Unatoč napretku u svojoj molekularnu tipizaciju, do sada, jedino učinkovito liječenje je kirurgija s namjerom izliječenja i 5-godišnje preživljavanje medijan je 25% [1]
sporadična rak želuca može nastati uz dvije velike molekularne putove. Jedan uključuje bruto kromosomska promjena s više gubitaka i dobitaka velikih kromosomskih regija; drugi karakterizira široko rasprostranjena somatskih promjena u jednostavnim ponavljaju genomskih sekvenci (microsatellites), što je rezultat neispravan DNA neslaganje popravak kompleksa. Ovi potonji su definirani mikrosatelitni nestabilne tumori (MSI), predstavlja oko 15% svih želučanih tumora i povezani su s povoljnijom prognozom za veće veličine, ženskog spola, starije životne dobi, manje zahvaćenost limfnih čvorova, crijevna Histotip i sekundarnom adrese [2 ]. Česte promjene pronađen povezane s MSI uključuju promotor metilacije MLH1 pregled [3] i mutacija TGFBR2, IGFR2 Netlogu i Bax pregled. [4] pregled mikrosatelitni stabilno (MSS) želučani neoplazme pokazuju drugačiji set promjene: nekoliko proto-onkogena, uključujući MET Netlogu, FGFR2 Netlogu i erbB2 Netlogu često pojačavaju [5] dok je inaktivacija oba alela TP53 Netlogu gubitak heterozigotnosti i mutacije je najčešći genetski događaj povezan s MSS fenotipom [6]. Osim toga, gubitak TP73, APC
, DCC
, FHIT
i TFF1 pregled se također često otkrivena [5, 7]. Pregled PIK3CA pregled je gen koji kodira za P110 alfa podjedinicu fosfoinozitid-3-kinaze (PI3K). Nedavno je ključna uloga onkogena je u nastajanju za PIK3CA Netlogu, jer je to jedan od gena najčešće pogođene somatskih mutacija u nekoliko vrsta raka kod ljudi [8, 9]. PI3K dio obitelji Ser-Thr-kinaza koja komunicira s fosfatidilinozitol bisfosfat (4,5-PIP2) kako bi se proizveo fosfatidilinozitol trifosfata (3,4,5-PIP3), drugi glasnik s više funkcija. PIP3 uglavnom veže plekstrine homologije (PH) domenu broj ciljnih molekula i dovodi do njihove aktivacije kroz ciljanje ili modulacijom njihovu aktivnost stanične membrane. Jedan od najboljih okarakterizirani meta PI3K produkti lipida je protein kinaza Akt. PI3K /Akt aktivacije je pokazao da će biti uključeni u regulaciju nekoliko staničnih funkcija kao što je stanično preživljavanje, rast stanica i stimulacije angiogeneze, inhibicije apoptoze, prijevoda nekoliko proteina i stoga, u razvoju raka [10, 11].
od dvadeset eksona koji tvore PIK3CA pregled gena, više od 75% od mutacija se nalaze u dva hot-spotova koji se nalazi u eksona 9 i 20, koji kodiraju za spiralnih i domena kinaze, odnosno [8]. Izražavanje najčešćih varijanti (E542K, E545K i H1047R) povezan je s povećanom aktivnošću lipida kinaze i onkogeni, kako u staničnim coltures i in vivo [12, 13]. Mutacije utječu dvije vruće točke nedavno je pokazano da su funkcionalno različiti [14] i njihovih stope mutacije često su prikazani kao povezana na određene vrste raka ili pojedinih obilježja pacijenata [15, 16].
U ovom istraživanju analizirani 264 želučani rak na prisustvo mutacije u eksonima 9 i 20, pomoću direktnog sekvenciranja koreliran prisutnost mutacije klinički-patološke značajke, uključujući MSI fenotipa. Osim toga, usporedili smo učestalost mutacija se pojavljuju u dva eksona s drugih studija koji istražuju primarne uzorke ljudskog raka.
Metode pregled bolesnika i uzorci
Naše istraživanje je uključeno 264 uzastopnih slučajeva uznapredovalog raka želuca u bolesnika prolazi kroz kiruršku intervenciju između 1989. i 2003. godine na Sveučilištu u Veroni. Svi bolesnici su liječeni od strane radikalnog kirurškog uklanjanja s resekcija margine slobodnih mikroskopskih bolesti i nisu primili prije ili postoperativne kemoterapije ili radioterapije. Histološka klasifikacija je u skladu s Lauren i jedinstven 1997 TNM sustav za želučane karcinom je bio korišten za patološku inscenacije. Klinički patološke značajke serije su prikazani u tablici 1. ovog istraživanja bio je predstavljen, pregledan i odobren od strane Etičkog povjerenstva Koncerna Verona bolnicama kako bi se uključile uzorke korištene za ovu analizu lokalne. tumorskog tkiva dobiveni su uz informirani pristanak od insititutions koji je poslao materials.Table 1 Klinička obilježja 264 slučajeva želučanog karcinoma analizi mutacija u PI3KCA. pregled parametra
Kategorije

frekvencija
Spol pregled F
89 (33,7%)
M
175 (66,3%) pregled Starost
srednja (SD)
67,4 (11,2) pregled, Lauren pregled crijeva
170 (65,4%) pregled Mješovite
pregled, 27 (10,4%) pregled Difuzna
63 (24,2%), pregled, PT pregled 2
99 (37,4%), pregled, 3
129 (48,7%)
4
36 (13,6%) pregled pN pregled 0
53 (20,2%) pregled, jedan
100 (38,0%)
2
80 (30,4%) pregled 3
30 (11,4%) pregled pM
0
215 (87,4%) pregled 1
31 (12,6%), pregled, tumor Lokacija pregled antruma
107 (40,5%), pregled tijela
72 (27,3%) pregled fundus
69 (26,1%) pregled Linitis
12 (4,5%) pregled želuca panj
4 (1,5%), pregled, MSI Netlogu MSI
39 (14,8%) pregled MSS
225 (85,2%), pregled, analiza mutacija pregled zdravih i tumorskih DNA je izvađen iz ručno microdissected parafin-ugrađen tkiva kao što je opisano [17]. Mononukleotid mikrosateliti BAT25
i BAT26 pregled (koji se nalazi u introna od MSH2 pregled i KIT
geni, respektivno) su ispitani pomoću PCR amplifikacije pomoću fluorescentne boje obilježenih primera kao što je opisano [18]. PCR amplifikacija i sekvenciranje PIK3CA pregled eksona 9 i 20 su izvedena kao što je opisano [19], upotrebom slijedećih prajmera Exon9_Forward: GGGAAAAATATGACAAAGAAAGC; Exon9_Reverse: CTGAGATCAGCCAAATTCAGTT; Exon9_Sequencing: TAGCTAGAGACAATGAATTAAGGGAAA-3; Exon20_Forward: CTCAATGATGCTTGGCTCTG; Exon20_Reverse: TGGAATCCAGAGTGAGCTTTC; Exon20_Sequencing:.. Identificirano TTGATGACATTGCATACATTCG
Slijed razlike u odnosu na NCBI referentne sekvence pomoću ručnog pregleda usklađenih elektroferogrami uz pomoć programskog paketa Mutacija Surveyor (SoftGenetics, State College, PA) pregled, Meta-analiza pregled, da istraži uzorak PIK3CA pregled mutacija u drugim studijama koje uključuju želudac, kao i druge vrste raka, analizirali smo prevalenciju PIK3CA pregled mutacija u podacima koji su već prisutni u literaturi i /ili kozmičkog baze podataka [20]. Koraci u izvedbi za pretragu, odaberite radova i prikupljanje podataka su detaljno opisani u dodatne datotečne 1. Potpuni popis literature uključenih studija nalazi se u dodatne datotečne 2. pregled Statistička analiza pregled za meta-analizu, udružena procjene prevalencije, omjeri učestalosti i intervali pouzdanosti izračunati su pomoću fiksnih efekata Poissonov regresija, prilagođen za broj slučajeva analiziranih po studiji. Prevalencija i intervali pouzdanosti pojedinačnih studija su procijenjene pomoću Clopper i Pearson metode [21]. Korelacija prisutnosti H1047R mutacije s kliničkim-patološke značajke, p-vrijednosti i intervala pouzdanosti su ocijenjeni pomoću logističke regresijske analize. Korelacija s preživljavanje je procijenjena pomoću log-rank test. Za Cox multivarijatne regresije, odabrali smo najviše informativne varijable među modelima koji su uključivali mutacije status, pomoću 'naprijed' postupni način. P-vrijednost manja od 0,05 smatra se značajnom. Za sve izračune i ilustracija je korišten R statistički programski paket [22]. Pregled Rezultati
Analizirali smo nizove eksona 9. i 20. PIK3CA pregled gena u 264 naprednim želučanog karcinoma. Popis i učestalost mutacija su prikazani u tablici 2. ukupno 42 slučajeva (15,9%; 95% CI od 11,7% - 20,9%) gajio barem jednu mutaciju u regijama analizu. Sve mutacije pronađene su heterozigotni misscnsc jedinstvene baze zamjene. Najčešći mutacija H1047R javljaju na aktivnom mjestu kinasic domene u eksonu 20 i predstavljaju 62% od svih mutacija. Drugi najčešći mutacija je Q546K koji uključuje aminokiselinski promjenu u uzvojnice domene eksona 9 i predstavlja 9,5% svih mutacija found.Table 2 Učestalost PI3KCA mutacija koje se nalaze u 264 želučanog karcinoma, prema tipu mutacije. Pregled pregled Mutacija
Ukupna učestalost pregled (MSI samo)
posto /ukupni slučajevi pregled
Postotak /mutirani slučajevi
egzona 9
E542K
2 pregled, 0,76%
4,76%
E545K
2 pregled, 0,76% pregled 4,76%
Q546K
4
1,52%
9,52:% pregled Ukupno mutacije (ex. 9) pregled, 8
3,03% pregled egzona 20 pregled M1043V
1 pregled 0,38%
2,38%
H1047R
26 (8) pregled, 9,85%
61.90% pregled H1048T
pregled 1 pregled 0,38%
2,38%
G1050D
2 pregled, 0,76%
4,76%
T1052I
1
0,38%
2,38%
T1053I
1 pregled 0,38%
2,38%
D1056N
2 pregled, 0,76%
4,76% pregled L1067F
1 pregled 0,38%
2,38%
Ukupno mutacije (ex.20)
35 pregled 13.26:% pregled Ukupno mutacija
42
15.91% pregled našli smo dva misscnsc mutacije naime T1052I i T1053I da nikad prije nije bilo. Mutacije su potvrđene pomoću drugi par primera (vidi dodatne datotečne 1). Oba mutacije uključivati ​​aminoacidic promjene od treonin na izoleucin koji podrazumijeva promjenu u hidrofobnim svojstvima ostataka i može potencijalno utjecati na funkciju proteina. Jedan slučaj gajili dvije mutacije naime E545K i L1067F u eksona 9 i 20, respektivno.
U našoj seriji, MSI slučajevi samo gajili H1047R mutaciju. H1047R je, u stvari, promatrana u 8 od 39 slučajeva MSI i bio je statistički značajno povezana s MSI statusa (ili 3,0; 95% CI 1,0 - 7,9; Fisher-ov test P pregled = 0,035). Prisutnost mutacije H1047R nije bio u korelaciji s bilo preživljavanje ili drugih kliničkih patološke osobine općenito povezane s MSI, vjerojatno zbog malog broja slučajeva koji nose tu mutaciju. Osim toga, nismo promatrati značajnu povezanost između prisutnosti mutacije i preživljavanja pri razmatranju samo MSI slučajeva. Osim toga, nismo pronašli nikakvu povezanost s kliničkim patološke osobine kada je s obzirom na prisutnost mutacija u oba eksona (tablica 3), ili u eksona 9. i 20. odvojeno. Multivarijantna analiza preživljenja provedena je kako bi se procijenio učinak prisutnosti mutacije zajedno s drugim kliničkim-patološka varijabli (Tablica 4). Nakon odabira najboljeg modela, TNM stadij, dob i mjesto tumora značajno su povezane s preživljavanjem, dok je samo marginalni učinak bio je za MSI status.Table 3 Raspodjela kliničko-patoloških kovarijanata prema prisutnosti PI3KCA pregled mutacija u 264 želučani karcinom. pregled parametar
Kategorije
Wt
Mutirani pregled
Odds Ratio pregled (95% CI)
P
Spol pregled F
74 (83,1%)
15 (16,9%) pregled 1 pregled 0,766
M
148 (84,6%)
27 (15,4%) pregled, 0,9 (0,5-1,8) pregled Starost
znače
pregled, 67,47 pregled 66,81 pregled 0,771 pregled PT pregled 2
88 (88,9%)
11 (11,1%)
1 pregled 0,077
3
108 (83,7%)
21 (16,3%) pregled, 1,6 (0,7-3,5) pregled, 4
26 (72,2%)
10 ( 27,8%)
3.1 (1.2 - 8.1) pregled pN pregled 0
42 (80,8%)
10 (19,2%), pregled, 1 pregled 0,840 pregled 1
86 (86,0%)
14 (14,0%)
0,7 (0,3 - 1,7) pregled 2
67 (83,8%)
13 (16,2 %) pregled, 0,8 (0,3-2,1) pregled 3
26 (86,7%) pregled, 4 (13,3%) pregled, 0,6 (0,2-2,2) pregled pM pregled 0
182 (85,0%)
32 (15,0%)
1 pregled 0,298
1
24 (77,4%) pregled, 7 (22,6% )
1,7 (0,6-4,0) pregled, Lauren pregled crijeva
147 (86,5%)
23 (13,5%) pregled, 1 pregled 0.275
Mješoviti
pregled, 22 (81,5%)
5 (18,5%)
1,5 (0,5 - 4,0) pregled difuznim
49 (77,8%)
14 (22,2%) pregled, 1,8 (0,9-3,8) pregled Location pregled antruma
93 (86,9%)
14 (13,1%)
1 pregled 0.394
tijelo
pregled, 58 (79,5%)
15 (20,5%)
1,7 (0,8 - 3,9) pregled Fundus
59 (85,5%)
10 (14,5%)
1,1 (0,5-2,7) pregled Ocjenjivanje pregled G1
13 (86,7%) pregled 2 (13,3%)
1 pregled 0,652 pregled G2
pregled, 76 (87,4%)
11 (12,6%) pregled, 0,9 (0,2-6,5) pregled G3
117 (83,0%)
24 (17,0%)
1,3 (0,3-8,9) pregled mikrosatelitne nestabilnosti pregled MSI
31 (79,5%) pregled, 8 (20,5%) pregled, 1 pregled 0,408 pregled MSS pregled pregled, 191 (84,9%)
34 (15,1%) pregled, 0,7 (0,3-1,7) pregled opstanak stopu na 2 godine (95% CI)
46,7% (40,5% -53,9%) pregled, 46,9% (32,4% -67,8%) pregled 0,941 pregled Tablica 4 Multivarijatna Cox analiza preživljavanja od 245 pacijenata s rakom želuca. pregled Parametar pregled pregled Kategorija
HR (95% CI)
P-vrijednost
PI3KCA status pregled mas
1,0 pregled, 0.630
mutirani
1.1 (0.7-1.7) pregled Stage
i
1,0 izvoznici < 0.001 Netlogu II
3,1 (1,1-9,1 ) pregled, III
11.6 (4.2-31.8)
IV
19.1 (6.8- 53.2) pregled doba (10 godina prirast) pregled, 1.3 (1,1-1,5 ) pregled, < 0,001 pregled tumorskih Location pregled antruma
1.0 pregled 0,004
Body
1,1 (0,7-1,5) pregled Fundus pregled pregled, 1,8 (1,3-2,6) pregled statusa MSI
MSI
1,0
0,077
MSS
1,7 (0,9-3,0) pregled Kako bi sustavno usporediti naše rezultate s dostupnoj literaturi za želudac i druge raka tipova, odabrali smo 38 serija opisan u 27 radova analiziranje mutacija u PIK3CA pregled lokusa u uzorcima primarnog raka (puni popis literature nalazi se u dodatne datotečne 2) , ograničeni smo analizu na mutacije koje nastaju na aminokiseline 542-549 i 1043-1048, od eksona 9 i 20, odnosno, koje su analizirane u zajedničko između serija. Ta područja sadrže veliku većinu mutacija promatrane u PIK3CA pregled [8].
Učestalost mutacija u eksona 9 i 20 za svaku seriju prikazana je na slici 1. Iako ukupna stopa mutacija je varijabla između serije čak i iste vrste raka, stope mutacije u eksona 9 i 20 godina značajno koreliraju međusobno (Spearman je r = 0,75, p-vrijednost 0,001), što ukazuje da je odnos između eksona 9 i eksona 20 mutacija ovisi o vrsta raka. Stoga, procijenili smo ujedinjene omjer učestalosti između eksona 20 i 9 u različitim proučavanjima grupirane prema vrsti raka pomoću Poisson regresijske analize. Rezultati su prikazani u tablici 5. Za rak dojke, s obzirom na velik broj studija prijavio, podijelili smo niz prema Histotip (duktalni i lobularni), gdje su podaci bili dostupni, a kategoriziran je ostatak serije što je rak dojke s Histotip nedefinirana , Među nizom duktalni Histotip, učestalost mutacija značajno usmjeren prema egzona 20, dok se ne uoči značajna neznatno sklonost za ekson 9 za lobularni Histotip serije (vidi tablicu 5 i slika 1). Studije na rak debelog crijeva pokazale su značajno povećane učestalosti mutacije u eksonu 9, sve serije ima sličnu mutacije uzorak. Tumori endometrija su znatno pogođena mutacije utječu ekson 20. Za rak želuca, predmetni serije i serije izvijestila Samuels pokazala veću učestalost eksona 20, dok je ostatak serije pokazao malu ili nikakvu razliku između exons.Table 5 Ukupna učestalost i skupe omjer učestalost mutacija koje utječu dva žarišta od PIK3CA pregled nalazi u eksona 9 i eksona 20 u 36 seriji grupirani prema vrsti pregled Tip tumora
br. serija
ukupnog broja slučajeva
eksona 9
egzona 20
Ex20 /Ex9 pregled Prevalencija Omjer pregled (95% CI) pregled pregled P-vrijednost
rak dojke (Histotip nije navedeno)
6
788 pregled 101 pregled 105 pregled 1,0 (0,8 -1,4) pregled 0,7805 pregled raka dojke (lobularni Histotip)
4
99 pregled, 25 pregled, 15 pregled, 0,6 (0,3 -1,1)
0.1178 pregled rak dojke (duktalni Histotip )
5
499 pregled 41 pregled, 64 pregled, 1,6 (1,1 -2,3) pregled 0,0260 pregled endometrija Rak
5 pregled 263
7 pregled 29 pregled, 4,1 (1,9 -10,3)
0.0007 rak pregled debelog crijeva
6
1292 pregled 134 pregled 80 pregled, 0,6 (0,5 -0,8) pregled 0,0003 pregled želuca Rak
5
602 pregled 17 pregled, 46 pregled, 2,7 (1,6 -4,9)
0,0005 pregled glave i vrata rak pločastih
3
175
7
2
0,3 (0,0 -1.2)
0.1182 pregled glioblastom
4 pregled 203
3. pregled 5 pregled 1,7 (0,4 -8,1)
0.4842 pregled Slika 1 bod, a 95% interval pouzdanosti procjene prevalencije mutacija koje utječu ekson 9 i 20 od PI3KCA u 36 serije. Mutacije koje utječu ekson 9 i 20 prikazani su kao čvrste ispunjene kutijama i praznih dijamanti, respektivno. Sakupljene procjene za svaku grupu prikazane su sivo. Pregled Rasprava pregled Cilj ovog istraživanja bio je karakterizirati mutacije status PIK3CA Netlogu u velikom nizu želučanog karcinoma, kako bi se utvrdila njegova pojavnost uz odgovarajuća preciznost i dovesti u korelaciju s kliničkim-patološke značajke. Ukupna učestalost mutacija bila je 15,9%, vrijednost koja je u rasponu od trenutno dostupne literature [8, 23-25], ipak se Prevalencija uočene u različitim serijama su heterogeni, u rasponu od 4,5% do 25%. Razlozi za takav heterogenosti može biti zbog specifičnih interakcija mutacija s okolišnih i genetskih pozadina, iako eksperimentalni faktori ne mogu biti isključeni.
Prema našim saznanjima, mutacije koje uključuju aminokiseline 1052 i 1053 (T1052I i T1053I) nikada nisu bili objavljeni prije, niti su opisani u kozmičkom bazi podataka, unatoč velikom broju studija koje su istraživale regiju. Kako su mutacije podrazumijevaju promjene u hidrofobnosti aminoacidic ostatka, funkcionalna uloga ne može se isključiti. Mutacije su pronađeni u rukopisnim slučajevima koji nisu pokazivale nikakvu posebnu značajku. Pregled Također smo otkrili da je najčešći PIK3CA pregled mutacije (H1047R) značajno je povezana s MSI fenotipa. Udruga je umjerena i da će imati koristi od potvrde o nezavisnom serije. Povezanost između PIK3CA pregled, mutacijama i MSI je prijavljen ili barem sugerira kako u debelog crijeva i želuca [8, 23, 24, 26]. U raskoraku s našim saznanjima, u dvije studije u vezi raka želuca i izvještavanje mutacije koje MSI status, eksona 9 i eksona 20 mutacije su ravnomjerno raspoređena između podtipova [23, 24]. Međutim, mali broj mutiranih MSI slučajeva sprečava statističku usporedbu. Činjenica da je pronađen samo jedan tip mutacije u našoj seriji MSI tumora ne čudi što su uski spektar izmjenama MSI želučanih tumora može se, pak, ograničiti tip PIK3CA pregled mutacija koje su onkogeni u tom kontekstu. pregled, unatoč velikom serija analizirati, nismo pronašli nikakvu korelaciju PIK3CA pregled mutacija s kliničkim patološke značajke želučanog karcinoma osim povezanosti između MSI i H1047R. Nedostatak udruga predlaže da promjena PIK3CA Netlogu je događaj koji se javlja rano u podskupini želučanog karcinoma koji napreduje prema malignosti kroz druge mehanizme. U stvari, u više varijacija modela preživljavanja nije bilo vidljivo učinak prisutnosti mutacije na prognozu.
Na temelju meta-analizi, omjer između mutacija prevalenciji u eksona 9 i 20, može se općenito smatra potpis tipa raka , Konkretno, pronašli smo značajnu eksona pristranost za rak debelog crijeva, rak dojke duktalni Histotip i endometrija raka. U raka debelog crijeva, eksona 9 je znatno više hit od eksona 20. To potvrđuje sugestije iz prethodnih studija [8, 23, 27]. Suprotna mutacije obrazac dosljedno pronađen je u studijama u vezi raka endometrija s eksona 20 uglavnom više pogodila nego eksona 9. Ova posebnost je već istaknuto i predlaže određeni mehanizam PI3KCA pregled angažmana za rak endometrija [28-30].
To je manje jasno postoji li eksona pristranosti u raka dojke kao i mnoge studije su naizgled kontradiktorne (vidi sliku 1). Međutim, za studije koje su radili dostavi informaciju o Histotip svakog uzorka, gledali smo drugačiji sklonost eksona između lobuliranim i duktalnih histotypes kao što je već rečeno [15]. Za duktalni Histotip, eksona 20 bio je znatno više u odnosu na hit eksona 9, dok je neznatno, ali obrnut trend je pronađena u nizu lobuliranim karcinoma dojke. Ovaj obrazac se ne očituje u studijama u kojima su informacije o Histotip nije dostupan, vjerojatno kao rezultat miješanja različitih vrsta tumora zajedno.
Za pločastih tumora glave i vrata blagi trend u većoj prevalenciji eksona 9 mutacija opažena među serijama, iako je niska učestalost PIK3CA pregled mutacija u ovoj vrsti neoplazme, vjerojatno je spriječila ova tendencija da se ističu. Za glioblastom, nije bilo dokaza o eksona-selektivnosti, s obzirom na činjenicu da je visok postotak ne hot-spot mutacije često se nalaze u ovom bolesti [8, 31].
Konačno, u želucu serije raka, eksona 20 rezultiralo da se više pozornosti nego eksona 9, iako je zajednički trend među serijama uglavnom nedostaje. Heterogenost u oba ukupnu učestalost i eksona-selektivnosti raka želuca može biti zbog snažnog utjecaja koji specifični eti-patološke, genetski i okolišni čimbenici imaju na ovu bolest.
Iako je nekoliko zapažanja iznesenih u našem meta-analize su sporadično predložio ili pokazao u pojedinim novinama, ovaj pristup omogućuje da se okupe više uvjerljive dokaze udruživanjem sličnih studija. Štoviše, meta-analiza ima još jednu prednost, pružajući izgled i procjenu PIK3CA pregled eksona-selektivnost i standardizirana stopa mutacije u različitim vrstama raka, iako to može biti pod utjecajem ograničenja dobivenih od retrospektivnih studija.
udruga specifičnih mutacija s bilo koje vrste karcinoma ili podtip je u skladu s nedavnim nalazima o različitim mehanizmima putem kojih ove mutacije ispoljavaju svoje onkogeni potencijal. U stvari, pokazalo se da mutacije pojavljuju na kinasic domene ovise vezanja s p85, druga komponenta PI3K, da se u potpunosti onkogeni, a mutacija u spiralni domene ovise RAS-GTP vezanje [14]. Ovisnost PIK3CA pregled mutacija na drugim signalnih komponenti je u skladu s činjenicom da je genetska pozadina u kojem tumori razvijaju može zahtijevati i odabrati određene promijenjene aktivnosti P110-alfa. Pregled Zaključci pregled smo našli relativno visoka prevalencija PIK3CA pregled somatskih mutacija dalje podržavaju ulogu PIK3CA pregled kao jedno od glavnih onkogena kod raka želuca. Takva učestalost je vrlo pristran prema eksona 20, osobito u MSI slučajevima za koje se čini da se nose samo jednu vrstu eksona 20 mutacija. Po analizi mutacija koji se pojavljuju u dvije standardne hot spot regijama PIK3CA pregled u 27 objavljenih radova na šest glavnih tipova raka (debelog crijeva, dojke duktalnih, grudi lobuliranim, želuca, endometrija, glave i vrata i glioblastoma), pronašli smo

• Izrazi i kliničke značajnosti c-MET, p-MET i E2F-1 u ljudske želučane carcinoma
• Oralni ulkus kao ekskluzivni znak raka želuca: Izvješće rijetke case