La greffe de microbiote fécal (FMT) est le terme médical désignant une "greffe de caca", une méthode émergente pour repeupler l'intestin avec un écosystème sain de bactéries.
Cependant, ce n'est pas aussi simple qu'il y paraît. Les méthodes avancées extraient le microbiome vivant pour la transplantation, elles ne se contentent pas de transférer l'ensemble de l'échantillon de selles. Nous allons vous expliquer cela, mais d'abord, passons en revue quelques faits sur le microbiome intestinal et la santé.
Nos corps ne sont pas stériles, ils sont couverts de bactéries qui remplissent des fonctions importantes pour notre santé et nous aident à nous protéger de plusieurs façons. Le côlon (également connu sous le nom de gros intestin) abrite le plus grand de ces écosystèmes microbiens symbiotiques.
Pesant en moyenne 1,5 kg, le microbiome intestinal interagit avec notre corps de différentes manières. Il produit des vitamines essentielles, mais aussi des acides gras à chaîne courte qui acidifient l'environnement et entretiennent la muqueuse intestinale.
Ce faisant, cet organe est plus attractif pour les bactéries bénéfiques, moins attractif pour les agents pathogènes, et peut héberger une grande diversité de microbes qui participent à notre santé globale.
Lorsqu'il n'y a pas assez de diversité - trop de certaines bactéries et pas assez d'autres - c'est un signe de dysbiose . Dans les cas bénins, ces altérations négatives de la composition du microbiome intestinal favorisent l'inflammation et les symptômes digestifs.
Nous recevons fréquemment des questions sur les greffes fécales, c'est pourquoi nous écrivons cet article. La FMT est un domaine sérieux, mais il en est encore à ses balbutiements et il peut y avoir de sérieux risques s'il n'est pas supervisé par une clinique crédible et responsable (dont il y en a peu).
Comment les bactéries intestinales protègent-elles votre santé ?
☝️AVIS DE NON-RESPONSABILITÉ ☝️ Cet article est à titre informatif uniquement. Il ne doit pas être utilisé pour diagnostiquer, traiter, prévenir ou guérir une maladie ou un état.
La dysbiose a été associée à de nombreuses maladies, non seulement du système digestif, comme la maladie de Crohn et la colite ulcéreuse, mais aussi des maladies mortelles et chroniques du corps entier, comme les maladies coronariennes, le diabète de type 2, l'obésité, la maladie de Parkinson et la stéatose hépatique (la type sans alcool).
Même avant que nous ayons la technologie pour évaluer les bactéries dans l'intestin inférieur, les médecins expérimentaient déjà des greffes fécales dans les années 1950 pour traiter une inflammation grave causée par des infections bactériennes dans le côlon.
Les faits sur la dysbiose et les tests du microbiome intestinal
La théorie guidant le regain d'intérêt pour les greffes fécales est simple :remplacer le microbiome dysbiotique des patients malades par une greffe de microbiome sain provenant d'un donneur. La réalité est bien plus complexe.
Les greffes fécales (microbiote) ne sont utilisées que pour traiter quelques maladies spécifiques. Certaines cliniques proposent la FMT en option pour les problèmes digestifs non résolus chez les patients atteints de dysbiose.
Actuellement, de nombreuses recherches sont en cours dans le monde pour déterminer si certaines conditions spécifiques répondront à une restauration du microbiote fécal. Les résultats ne sont pas encore concluants pour autre chose que Clostridium difficile .
Cette infection grave, également connue sous le nom de C. différence , est souvent contractée après un traitement antibiotique et lors de séjours hospitaliers. Elle peut avoir des conséquences mortelles pour les personnes âgées et les personnes dont le système immunitaire est affaibli.
Les antibiotiques sont traditionnellement utilisés pour traiter C. différence , mais les taux de réussite n'étaient pas très bons. Souvent, les patients recevaient plusieurs séries d'antibiotiques, mais l'infection résistait toujours au traitement. La FMT est désormais une option de traitement acceptée (soutenue par plusieurs essais cliniques) pour traiter le C. difficile récurrent.
Les taux de réussite dans le traitement des infections récurrentes à C. diff atteignent 92 % ou plus, ce qui suscite l'intérêt pour la manière dont les greffes fécales peuvent être utilisées pour d'autres pathologies digestives.
Le saviez-vous ? Nous sommes en partenariat avec la clinique Taymount, la première clinique spécialisée en FMT au monde. Ils signalent des taux de réussite de 100 % pour le traitement de C diff et proposer des programmes spéciaux pour les personnes ayant des problèmes digestifs.
Il y a beaucoup d'espoir et d'investissements dans les greffes fécales en tant que forme de traitement non invasive et non agressive pour plusieurs maladies graves.
Maladie inflammatoire de l'intestin et microbiote intestinal
Ils sont de plus en plus fréquents chez les adultes et les enfants dans les pays développés, mais il n'existe toujours pas de traitement efficace pour eux. Il existe plusieurs essais cliniques en cours et prévus pour voir si les greffes fécales peuvent aider les patients.
Bien que les greffes fécales ne guérissent pas les MII, elles semblent atténuer les symptômes de ces maladies chez certains patients.
Colite ulcéreuse :plusieurs essais cliniques randomisés ont rapporté qu'un peu plus de la moitié des patients répondaient à une greffe fécale provenant de donneurs sains. Parmi les participants qui ont répondu, environ 25 % d'entre eux sont entrés en rémission (avec peu ou pas de symptômes de la maladie).
Maladie de Crohn :il y a quelques résultats positifs limités pour la FMT dans de petites études de cohorte, mais c'est encore tôt. Il existe plusieurs études en cours chez les adultes et les enfants pour étudier l'utilisation des greffes fécales pour la maladie de Crohn.
Ce groupe de conditions augmente le risque de diabète de type 2, de maladie cardiaque et d'accident vasculaire cérébral. Les personnes atteintes du syndrome métabolique ont une pression artérielle élevée, une glycémie élevée, un taux élevé de cholestérol ou de triglycérides et un excès de graisse abdominale.
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Chaque échantillon, donneur et receveur a besoin d'un bilan de santé complet avec des laboratoires
Les bactéries intestinales ont un impact sur de nombreuses caractéristiques métaboliques du corps, et un grand nombre de preuves montrent qu'un microbiome sain peut protéger contre les maladies coronariennes et le diabète.
Des essais contrôlés randomisés avec des échantillons de donneurs provenant d'individus maigres montrent qu'il peut améliorer la sensibilité à l'insuline dans les tissus périphériques après six semaines.
Cette maladie rare touche les personnes qui ont reçu des cellules souches de la moelle osseuse ou du sang périphérique d'un donneur. Cela se produit lorsque ces greffes considèrent le corps du patient comme étranger et l'attaquent.
De petites études indiquent que les greffes de microbiote fécal ont des résultats variables, avec quelques résultats positifs, dans le traitement de cette maladie.
Les effets des activités microbiennes intestinales sont vastes et les scientifiques médicaux pensent que la FMT peut potentiellement aider à traiter un large éventail de maladies.
Allergies alimentairesSyndrome du côlon irritable (IBS)DépressionSclérose en plaquesRésistance aux antibiotiquesMalnutrition sévèreObésitéMaladie du foieTroubles auto-immunsMaladies allergiquesTroubles du spectre autistiqueLes greffes fécales peuvent utiliser des selles fraîches ou congelées et sont administrées par l'une des trois méthodes en fonction de l'état du patient.
Les médecins qui utilisent les transplantations fécales comme option thérapeutique suivent des procédures strictes lors de l'évaluation de la meilleure façon de préparer et de livrer l'échantillon.
Directement dans le côlon :cette méthode est considérée comme la plus efficace. L'échantillon du donneur sain est émulsionné avec une solution saline et un long tube est inséré via le rectum dans le côlon. Une fois correctement placé, le liquide est pulvérisé sur la paroi de l'organe.
Des études montrent que cette méthode fonctionne mieux si la FMT peut être appliquée sur le côté droit du côlon, qui est le plus éloigné du rectum. Cependant, dans certains cas, les patients peuvent avoir de graves dommages à cet organe, rendant cette procédure inadaptée.
Par le nez :la solution liquide de selles et de solution saline est délivrée par un tube inséré dans le nez qui descend dans l'intestin grêle en contournant la barrière acide de l'estomac. Cependant, il peut déclencher des vomissements et des particules peuvent être inhalées et provoquer une pneumonie bactérienne, qui met la vie en danger.
Gélules :la solution fécale est insérée dans des capsules conçues pour résister à l'acide gastrique et se décomposer dans l'intestin, délivrant leur contenu au patient. Cependant, cette méthode n'est toujours pas aussi efficace que la transplantation directement dans le côlon.
Les greffes fécales ne sont pas des solutions rapides à tous les problèmes de santé, liés à l'intestin ou autres, et il existe des risques importants si elles ne sont pas effectuées par un prestataire responsable et fiable.
Cette technique a fait la une des journaux comme les souris obèses qui ont perdu du poids après avoir reçu une greffe de caca de souris maigres. Un effet similaire a également été observé chez l'homme.
Les médecins ont rapporté un cas particulier dans lequel une femme a reçu une greffe fécale pour traiter C. différence . Le traitement a été considéré comme réussi jusqu'à ce que le patient prenne beaucoup de poids très rapidement, ce qui a suscité des questions sur l'échantillon.
Les médecins ont découvert que l'échantillon fécal provenait d'un donneur obèse et qu'il avait transféré ces caractéristiques au nouvel hôte. Non seulement ce cas démontre comment le microbiote intestinal peut influencer le corps, mais il indique également que vous pourriez être en mesure de transférer des caractéristiques métaboliques spécifiques à d'autres.
Vous pouvez trouver l'étude de cas de ce patient dans notre section Sources à la fin. Cette seule raison souligne à quel point il est essentiel de sélectionner un donneur sain lors de la réalisation de greffes fécales, mais ce n'est pas le seul !
Il existe d'autres risques importants qui découlent de la transplantation de fluides corporels d'une personne à l'autre. Les matières fécales peuvent contenir des souches pathogènes et résistantes aux médicaments de bactéries, de maladies et de virus.
En juin 2019, la Food and Drug Administration (FDA) américaine a émis un avertissement concernant cette technique après que deux patients immunodéprimés (avec un système immunitaire affaibli) ont été infectés par des organismes multirésistants aux médicaments (MDRO) provenant d'échantillons de donneurs. L'un des patients est décédé.
Nous avons interrogé Enid Taylor, co-fondatrice de la clinique Taymount, sur les risques d'infection liés à la FMT, et elle a souligné que même des infections mineures chez des personnes en bonne santé peuvent mettre en danger les personnes dont le système immunitaire est affaibli :
« Même une infection transitoire à E-Coli, qui peut se résoudre en 28 jours chez une personne normale en bonne santé, peut sérieusement menacer la santé du patient qui est déjà immunodéprimé. De telles infections peuvent être contractées par des viandes mal cuites, des restes réchauffés et des plats à emporter, et même des salades laissées dans la chaleur estivale des barbecues, etc. »
Ce sont des rappels importants que les greffes de microbiote fécal doivent être réalisées avec le plus grand soin, un contrôle qualité exceptionnel et des protocoles rigoureux pour la sélection des donneurs de selles et des échantillons avant utilisation.
Parce qu'il s'agit d'une nouvelle technique, tout le monde n'est pas d'accord sur les procédures, mais il y a quelques tests vitaux qui doivent être effectués pour minimiser le risque d'infection et de transmission de maladies avant qu'un échantillon de donneur ne soit approuvé pour utilisation :
DiagnosticsRaisonAntécédents médicauxIdentifier si le donneur a des antécédents de maladie, qui pourrait affecter le receveur.Tests sérologiquesIdentifier la présence d'anticorps dans le sérum sanguin associés à des maladies spécifiques.Tests fécauxÉvaluer si des parasites, des virus ou des agents pathogènes bactériens sont présents dans l'échantillon du donneur.Les complexités du microbiote humain sont vastes et la communauté scientifique a encore beaucoup à apprendre sur cet écosystème.
Le microbiote intestinal est comme une empreinte digitale, chaque personne en a une différente et elle est influencée par de nombreux facteurs. Les bactéries commencent à coloniser notre corps dès la naissance, et ces premières expériences de vie comme la césarienne ou l'accouchement vaginal, l'allaitement ou non, les antibiotiques, ainsi que la santé et le mode de vie de la mère, tout compte.
À mesure que nous devenons adultes, d'autres facteurs entrent en jeu, tels que votre régime alimentaire à long terme, vos antécédents médicaux et vos maladies, les traitements antibiotiques, le stress, etc. Les profils de microbiome peuvent varier d'un jour à l'autre et même d'un repas à l'autre. De nombreux facteurs l'affectent, notamment le stress, les animaux de compagnie et les activités sportives. Tous ces éléments rendent très impossible de garantir le résultat de cette stratégie thérapeutique.
Quels sont les liens entre l'intestin qui fuit et le mode de vie ?
Ainsi, alors qu'en moyenne, il peut y avoir un taux de réussite élevé, il est difficile de prédire si la greffe prendra. Dans certains cas, il peut même y avoir des effets indésirables, même lorsque les résultats sont positifs pour la plupart des gens.
Par exemple, plusieurs études ont analysé l'effet de la TMF chez des patients atteints de C. diff qui souffraient également d'une maladie intestinale inflammatoire. Environ 25 % des patients atteints de MII qui ont reçu une greffe fécale ont eu une poussée (exacerbation aiguë de leurs symptômes de MII) par la suite.
Enid Taylor du Taymount explique plus :"Les bactéries FMT sont pro-inflammatoires, étant invasives de par leur nature même et il est fortement contre-indiqué d'entreprendre la FMT lorsqu'une poussée inflammatoire est suspectée ou menace de se produire."
L'administration d'une greffe via le côlon comporte également certains risques, comme c'est le cas pour toute application médicale de la procédure de coloscopie. Les risques comprennent les saignements, les réactions indésirables aux sédatifs, les événements cardiovasculaires, les fièvres passagères ou les infections.
Mais généralement, les procédures coloscopiques ne sont pas particulièrement risquées :"Certaines cliniques utilisent un cathéter rectal pédiatrique simple qui est facilement administré, bien toléré, et toute la procédure est terminée en quelques minutes", explique Enid.
Plusieurs maladies et traitements peuvent affaiblir la barrière immunitaire qui nous protège des maladies.
Certains médicaments, comme la chimiothérapie et ceux pour les problèmes auto-immuns, comme l'arthrite et le lupus, suppriment le système immunitaire. D'autres personnes peuvent avoir des troubles d'immunodéficience qui empêchent le système immunitaire de faire son travail et de lutter contre les maladies.
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La FMT pourrait devenir plus courante à mesure que la recherche progresse sur le microbiome
Le virus de l'immunodéficience humaine (VIH) est l'une des causes les plus connues d'un système immunitaire affaibli, mais il en existe d'autres aussi. Ces facteurs augmentent considérablement le risque qu'une personne tombe gravement malade à cause d'infections et de virus.
C'est pourquoi il est essentiel que des antécédents médicaux complets, des analyses de laboratoire et des tests de diagnostic soient effectués sur le donneur de selles et le receveur avant qu'une greffe ne soit effectuée. Étant donné que la FMT est un concept relativement nouveau, seules des cliniques reconnues et réputées devraient effectuer de telles procédures.
En plus de traiter C. diff, certaines cliniques réputées proposent la FMT aux personnes souffrant de problèmes digestifs chroniques non diagnostiqués.
Comme nous l'avons établi, les scientifiques et les médecins travaillent toujours sur des applications médicales spécifiques pour les greffes fécales dans le traitement des infections et des maladies. Cependant, il existe des cliniques qui proposent la FMT pour d'autres problèmes.
Leur objectif ? Patients souffrant de problèmes digestifs chroniques non résolus qui n'ont pas trouvé de solutions avec les diagnostics et traitements médicaux standard. Notre partenaire, la Clinique Taymount, est l'une de ces cliniques.
La clinique Taymount a ouvert ses portes en 2003 et propose la FMT depuis 2012. Avec des cliniques effectuant des transplantations fécales au Royaume-Uni, au Canada, en Slovaquie et aux Bahamas, leurs méthodes sont basées sur les principes de la médecine fonctionnelle.
En utilisant une approche intégrée de la santé des patients, ils se concentrent sur la grande variété de facteurs qui peuvent jouer un rôle dans les problèmes digestifs non résolus, y compris les tests du microbiome intestinal par Atlas Biomed.
Voici ce qu'ils disent à propos de la FMT :"Bien qu'aucune réclamation ne puisse être faite pour résoudre des conditions spécifiques, le corps commence souvent à se guérir lorsqu'il reçoit le bon soutien de l'intérieur du microbiome intestinal. L'approche de la médecine fonctionnelle consiste à soutenir le corps et à activer les mécanismes naturels de guérison."
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Chaque donneur et échantillon doit subir un examen approfondi
Les bactéries intestinales meurent rapidement lorsqu'elles sortent du corps, c'est pourquoi cette clinique utilise un procédé de laboratoire innovant et protecteur pour extraire le microbiome vivant de l'échantillon de selles et le transplanter, et non les déchets biliaires indésirables, les cellules épithéliales mortes et les aliments non digérés qui sont aussi normalement dans les selles humaines.
Ils appliquent également un processus de quarantaine de 3 à 6 mois sur leur matériel pour éliminer tout risque de transfert de conditions de longue latence comme le VIH ou l'hépatite A, B et C. FMT n'est jamais proposé avec du matériel frais pour cette raison; les tests sanguins ne révèlent pas une maladie dans son stade d'incubation précoce.
Quand leurs tests révèlent une dysbiose , altérations négatives de la composition du microbiome intestinal, ils utilisent la FMT dans le cadre du plan de traitement. Nous avons choisi de nous associer à la clinique Taymount car elle applique des protocoles rigoureux pour tester chaque don de selles, ainsi qu'une surveillance et un suivi stricts des patients pour les traitements FMT.
Le don de selles gagne du terrain et plusieurs endroits acceptent des donneurs répondant à des critères spécifiques.
Le don de selles deviendra probablement une pratique reconnue dans les années à venir, peut-être pas dans la même mesure, mais de la même manière que le don de sang. Pour effectuer des greffes fécales, il faut trouver des personnes en bonne santé et prêtes à partager leur microbiote.
Au Royaume-Uni, la clinique Taymount accepte les donneurs, et aux États-Unis, une banque de selles à but non lucratif appelée Open Biome recrute des donneurs de selles et les transforme en traitement C. diff pour les cliniques du continent nord-américain.
Pour devenir donneur de selles, vous devez subir des tests rigoureux pour vous assurer que votre échantillon répond aux exigences et ne rendra pas les gens malades. Des questionnaires détaillés sur les antécédents médicaux, les motivations et le mode de vie ne sont qu'un point de départ.
La co-fondatrice de la clinique Taymount, Enid, explique :« Les avantages du don ne sont pas seulement de savoir que les gens sont aidés à utiliser la restauration de la flore intestinale, mais aussi qu'un dépistage sanguin complet régulier donne un bon retour d'information sur la santé. Les donneurs reçoivent également un encadrement en médecine fonctionnelle et des conseils sur le mode de vie et l'alimentation pour maximiser la santé de leur microbiome. »
Il y a cependant des caractéristiques spécifiques qu'ils cherchent à éviter :"Les bébés de césarienne mettent beaucoup plus de temps à assembler un microbiome intestinal mature et diversifié et n'atteignent parfois jamais la riche diversité dont ils ont besoin."
"Notre dépistage vérifie également les antécédents de problèmes de poids, pas seulement le poids actuel. Même les voyages dans les pays tropicaux peuvent présenter un risque :ils auraient pu laisser un agent pathogène résident hautement indésirable tranquillement en phase de dormance chez le donneur. »
Les donneurs doivent être en bonne santé et ne doivent avoir aucun des problèmes de santé suivants :
Critères d'exclusionRaisonÂge <18 ans ou>65 ansLe microbiome intestinal subit des modifications au cours de la jeunesse et de la vieillesse. Surpoids ou insuffisance pondérale Les caractéristiques du microbiome intestinal associées à un poids corporel excessif ou insuffisant peuvent être transférées au receveur. Antécédents médicauxC. infections difficiles, IBS, IBD, syndrome métabolique, diarrhée, maladies auto-immunes et troubles digestifs ont tous des liens avec la dysbiose. Antibiotiques récents Les antibiotiques sont l'un des facteurs négatifs les plus puissants qui influencent la composition du microbiome intestinal. Consommation de drogues, risque de VIH of HIV put the recipient at risk of contracting this disease.Neurologic or neurodevelopmental disordersConditions that affect the brain may be linked to the gut microbiome too, studies are underway.Travel to tropical placesTropical locations mean the donor may contract bacteria that could make the recipient sick .Faecal transplants may be a popular topic in the media, but this treatment should only be performed by a reputable clinic with stringent protocols.
For people with signs and symptoms of dysbiosis, like gas, bloating, diarrhoea, constipation, and abdominal discomfort, FMT should not be the automatic solution. Often, they can be resolved by small changes to your eating habits.
A rich diversity of food choices is the first place to start. Most of us eat the same few foods, by habit, every week. This can make the gut microbiome quite lacking in diversity.
That’s right, what you eat has a major impact on your gut microbiome. Whole, plant foods contain special dietary fibers called prebiotics that nourish beneficial bacteria. Their effects are wide-ranging.
Prebiotics encourage the growth of beneficial and probiotic bacteria that produce important substances like short-chain fatty acids. They help maintain the correct pH in the gut and deter bacteria that could make you sick or cause digestive discomfort.
What is fiber and why is it important for health?
In order to transform your microbiome for better health, your diet should contain at least 30g of fiber per day from a variety of whole, plant foods in your diet. These include vegetables, fruit, grains, beans and other legumes, as well as seeds and nuts.
At Atlas Biomed, we specialise in gut microbiome tests delivered to your doorstep with an in-depth report on the functions of your microbiome, and how to improve it with personalised food and probiotic recommendations based on your results.
☝️REMEMBER ☝️FMT has great potential for the future of medicine, but change starts at home. Even if you do receive a faecal transplant, you need to maintain a healthy lifestyle to make sure the benefits stick.
Sources:
Symptômes, causes et traitement du ténesme rectal
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