Un test d'ARN basé sur la salive pourrait améliorer la capacité à identifier avec précision les enfants atteints de TSA

Une recherche récemment publiée montre qu'un panel de biomarqueurs basé sur la salive et un algorithme associé pourraient améliorer la capacité d'identifier avec précision les enfants atteints de troubles du spectre autistique (TSA) à ses premiers stades, a annoncé Quadrant Biosciences Inc. Dans une étude portant sur plus de 450 enfants âgés de 18 mois à 6 ans, les chercheurs ont démontré qu'un panel de 32 petits ARN pouvait différencier les enfants autistes des enfants présentant un développement typique ou un retard de développement non-TSA avec une précision de 85 %. Cette précision de test a été obtenue à la fois pendant le développement du modèle et pendant la validation du test dans un ensemble distinct d'enfants.

La publication, intitulé « Validation d'un test d'ARN salivaire pour le trouble du spectre de l'autisme chez l'enfant, " a été publié en ligne dans Frontières en génétique par les chercheurs Steven Hicks, MARYLAND., Doctorat., du Pennsylvania State College of Medicine et Frank Middleton, Doctorat., de la SUNY Upstate Medical University en collaboration avec des scientifiques de Quadrant Biosciences.

Suite à une étude pilote démontrant que bon nombre de ces éléments d'ARN pouvaient être détectés dans la salive d'enfants atteints de TSA, les chercheurs ont déterminé que les tests basés sur la salive pourraient fournir les moyens d'interroger largement la génomique, physiologique, microbiote, et les facteurs environnementaux impliqués dans les TSA dans un seul, non invasif, analyse à haut débit.

"De plus en plus de preuves suggèrent que l'autisme résulte d'interactions entre les gènes d'un enfant et l'environnement. Cette étude a mesuré les facteurs qui peuvent contrôler les interactions entre les gènes et l'environnement, surtout le microbiome, " a déclaré le Dr Hicks. " Bien que les enfants autistes aient des antécédents génétiques divers, nous avons découvert qu'un ensemble de 32 facteurs d'ARN dans leur salive pouvait les distinguer avec précision des pairs sans autisme. Compte tenu de cet éventail de facteurs de risque de TSA, nous croyons à une approche basée sur l'ARN « poly-omique » qui intègre la génétique, épigénétique, et les méthodes de métagénomique seraient bien adaptées au développement d'un test objectif basé sur des biomarqueurs. »

L'étude

L'étude multicentrique a inclus 456 enfants recrutés au cours des trois dernières années. Les auteurs ont comparé des échantillons de salive de 238 enfants avec TSA à 218 enfants sans TSA (dont 84 enfants avec un retard de développement et 134 avec un développement typique). Les niveaux d'ARN humains et bactériens ont été mesurés dans les échantillons de salive à l'aide d'un séquençage complet de nouvelle génération. Les meilleurs ARN ont été identifiés à l'aide d'algorithmes d'apprentissage automatique robustes à partir des 372 premiers enfants, puis validés dans les 84 échantillons restants qui n'ont pas été utilisés dans l'apprentissage automatique. Notamment, cet ensemble de validation comprenait également des échantillons prélevés sur des enfants de l'Université de Californie, Irvine, pour vérifier que l'algorithme d'ARN a fonctionné avec précision dans des échantillons de différentes régions géographiques.

Nécessité d'un diagnostic précoce de l'autisme

Le dépistage de l'autisme repose généralement sur un questionnaire destiné aux parents appelé Liste de contrôle modifiée pour l'autisme chez les tout-petits révisée (MCHAT-R). Les enfants avec un score MCHAT-R positif sont généralement référés pour une évaluation diagnostique. Cependant, en raison du nombre élevé de résultats faussement positifs sur le MCHAT-R, les temps d'attente pour l'évaluation de l'autisme dépassent souvent un an. Bien que le diagnostic soit possible chez les enfants aussi jeunes que 24 mois, l'âge moyen du diagnostic de TSA aux États-Unis est aujourd'hui supérieur à 4 ans. Un diagnostic précoce est important car il a été démontré qu'une thérapie comportementale intensive améliore les symptômes de l'autisme, et les enfants bénéficient d'autant plus d'une telle intervention qu'elle est commencée tôt.

Daniel Coury, MARYLAND., Professeur de pédiatrie clinique et de psychiatrie à l'Ohio State University College of Medicine et membre de la section de pédiatrie du développement et du comportement du Nationwide Children's Hospital, voit l'avantage de ce test basé sur les biomarqueurs d'ARN dans un cadre clinique. « Souvent, les interventions spécifiques à l'autisme sont retardées en attendant un diagnostic. Il faut souvent des mois pour obtenir une évaluation de l'autisme en raison du grand nombre de références, dont beaucoup ne recevront pas de diagnostic d'autisme, ", a-t-il expliqué. "Un test qui peut séparer les enfants qui ont dépisté M-CHAT-positif en une forte probabilité d'autisme ou une faible probabilité d'autisme pourrait aider à rationaliser les listes d'attente et permettre un diagnostic et une inscription plus précoces dans le traitement de l'autisme."

Le Dr Middleton de la SUNY Upstate Medical University a accepté. « La capacité de distinguer avec précision les enfants autistes de leurs pairs avec un retard de développement non-TSA est d'une importance primordiale dans le domaine. Bien que l'algorithme ne soit pas conçu comme un outil de dépistage, il peut fournir des informations précieuses chez les enfants avec un écran MCHAT-R positif, plus de 80% d'entre eux n'auront pas de TSA. De cette façon, il peut être utilisé pour prioriser l'orientation vers un spécialiste ou pour apporter une aide objective à un diagnostic d'autisme."

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