La majorité des aliments fermentés contiennent des milliers de LAB vivantes qui sont ingérées lorsque nous consommons du yaourt, du fromage, kéfir, etc. Certains de ces LAB ont des propriétés probiotiques et, Donc, En conséquence, de nombreux aliments fermentés sont considérés comme naturellement sains.
Combien de ces bactéries atteignent l'intestin ? Et combien font partie du microbiome, la grande communauté de micro-organismes, dans le ventre ?
Chercheurs de l'Université de Naples Federico II (Italie) en collaboration avec l'Université de Trente (Italie), Teagasc (Irlande) et le Centre de recherche SFI d'APC Microbiome Ireland (Irlande) ont analysé les informations génétiques des souches de LAB (génomes) trouvées dans les aliments fermentés et dans les excréments humains pour répondre à ces questions.
Les LAB sont parmi les micro-organismes les mieux étudiés à travers le monde. Ils sont utilisés dans la production de nombreux aliments fermentés dont le yaourt, du fromage, kéfir, produits de boulangerie, viandes fermentées ou légumes fermentés. Les procédés de fermentation sont étudiés depuis plus d'un siècle, mais la pratique de la fermentation des aliments comme stratégie de conservation du lait, la viande et les légumes sont utilisés depuis des millénaires. Le rôle du LAB est de transformer les matières premières, produire des molécules qui préservent les aliments et contribuent aux caractéristiques clés, comme le goût de la nourriture. En d'autres termes, il n'y aurait pas de yaourt ou de fromage sans l'activité de ces micro-organismes importants.
Plusieurs souches de LAB sont également des probiotiques bien connus, le plus commun appartenant au genre Lactobacilles . Les probiotiques présentent un intérêt considérable en tant que suppléments à diverses fins, mais aussi pour leur potentiel à ajouter à la valeur et aux propriétés bénéfiques pour la santé de certains aliments.
À l'aide d'outils d'analyse informatique de pointe, Les génomes LAB ont été reconstruits à partir d'environ 300 aliments et près de 10, 000 échantillons de matières fécales humaines provenant de différents continents, en regardant la distribution des LAB chez l'homme en fonction de l'origine géographique, âge et mode de vie. Les bactéries lactiques ont été trouvées en abondance relativement faible dans les matières fécales humaines et leur prévalence dépendait de l'âge, mode de vie et géographie. Les bactéries lactiques les plus fréquemment retrouvées dans les selles humaines étaient Streptocoque thermophilus et Lactococcus lactis , que l'on trouve couramment dans le yaourt et le fromage.
Les séquences d'ADN d'environ 3, 000 génomes de LAB ont également été comparés; et l'analyse a révélé un niveau élevé de similitude des LAB de la nourriture avec ceux des LAB de l'intestin humain. Cette nouvelle découverte suggère que la consommation d'aliments riches en LAB peut enrichir nos intestins avec ces micro-organismes potentiellement probiotiques.
Les aliments fermentés sont la principale niche écologique des LAB dans la nature. Nos résultats soutiennent l'hypothèse que la nourriture est la principale source de LAB pour le microbiome intestinal. Cette recherche offre également des conseils et des méthodologies pour mettre en œuvre de nouvelles stratégies pour retracer la vie des probiotiques et d'autres bactéries lactiques à partir d'aliments et/ou de suppléments jusqu'au corps humain. Cette recherche ouvre de nouveaux horizons pour les études sur les aliments potentiellement bénéfiques pour la santé. »
Professeur Danilo Ercolini, auteur principal de l'étude
L'étude a été réalisée dans le cadre du projet MASTER (Microbiome Applications for Sustainable Food Systems through Technologies and Enterprise; www.master-h2020.eu). Professeur Paul Cotter, co-auteur et chef du projet MASTER a expliqué :« MASTER est l'une des plus importantes subventions financées par l'UE pour les études sur le microbiome alimentaire dans Horizon 2020 et nous espérons qu'il s'agira de l'une des premières des nombreuses études révolutionnaires qui en résulteront ».