UMSOM lanserar nytt initiativ för att utöka COVID-19-testning

University of Maryland School of Medicine (UMSOM) Dean E. Albert Reece, MD, Doktorsexamen, MBA, tillkännagav idag lanseringen av ett storskaligt COVID-19-testinitiativ som väsentligt kommer att utöka testförmågan under de kommande veckorna, möjliggörs genom ny finansiering på 2,5 miljoner dollar från staten Maryland.

Det nya initiativet kommer att lanseras med starkt stöd och samarbete från University of Maryland, Baltimore (UMB) och dess ordförande, Bruce Jarrell, MD, som har stött programmet sedan dess start. På UMSOM, detta initiativ kommer att ledas av Claire Fraser, Doktorsexamen, dekanusens begåvade professor och direktör för Institute for Genome Sciences (IGS) vid UMSOM, och Sanford Stass, MD, Professor och ordförande för både UMSOM -avdelningen för patologi och Institutionen för medicinsk och forskningsteknologi. Detta storskaliga testinitiativ kommer gradvis att ökas för att så småningom kunna köra så många som 20, 000 tester per dag under de närmaste månaderna. Detta kommer att möjliggöra mycket bredare tillgång till tester i Maryland genom samordning med Baltimore stad och State Health Department.

Vår stat fortsätter att marschera alla verktyg i arsenalen för folkhälsa för att bekämpa spridningen av detta virus, inklusive expertisen i vårt universitetssystem. Att öka vår testförmåga är avgörande framåt, och jag vill tacka Institute for Genome Sciences och Department of Pathology vid University of Maryland School of Medicine för samarbetet med oss ​​i ett försök att avsevärt utöka COVID-19-testning här i Maryland. "

Larry Hogan, Maryland guvernör

Patientproven kommer att bearbetas på robotplattformar med automatiserad teknik inrymt i ett laboratorium vid UMSOM Institute for Genome Sciences (IGS). Den nya statliga finansieringen skulle möjliggöra inköp av ytterligare plattformar för att underlätta en ökning av testkapaciteten. Analys av proverna kommer att ske vid University of Maryland Pathology Associates (UMPA), CLIA/CAP -ackrediterad, som drivs av UMSOM Department of Pathology.

"Ett stort hinder vi står inför är inte att förstå omfattningen av asymptomatisk sjukdom i Maryland -befolkningen, "sa Dr Jarrell." Att ha bred tillgång till test med hög genomströmning kommer att visa oss var sjukdomen är och hur den sprider sig. Det är den vägledning vi behöver för att kontrollera denna pandemi mer effektivt tills ett vaccin kan utvecklas. "

Staten är i stort behov av ökade coronavirus -tester, och School of Medicine har redan den tidiga infrastrukturen på plats, när det gäller vår teknik och vetenskapliga expertis för att hjälpa till att minska testgapet. Denna finansiering som vi tillhandahåller kommer att göra det möjligt för oss att bättre spåra virusets spridning och ge snabbare diagnoser och behandlingar till de som behöver det. "

Dean Reece, Executive Vice President for Medical Affairs, University of Maryland, och John Z. och Akiko K. Bowers Distinguished Professor

Medan 18 laboratoriepersonal för närvarande behövs för att bearbeta högst 3, 000 prover per dag i IGS -anläggningen, ökar till 20, 000 prover per dag skulle omfatta 60 laboratoriepersonal som arbetar tre 8-timmars skift under en 24-timmarsperiod. Denna ökning av personal och provtestning kommer att ske under några månader.

"Inledningsvis kommer vi att kalla in extra tekniker som för närvarande arbetar hemifrån. Ramping upp till en full personal kommer att göras över tiden, "sade Dr Fraser." Jag är säker på att många av våra laboratoriepersonal skulle vara ivriga att återvända på plats för att arbeta för en så värdefull strävan. "

De flesta patienter i staten måste vänta i en vecka eller mer på att kommersiella kläder ska returnera sina resultat på grund av en eftersläpning av tester och begränsad kapacitet och kapacitet. Anläggningen vid UMSOM skulle kunna returnera resultaten till patienter och läkare inom 24 till 48 timmar, ökar handläggningstiden dramatiskt.

Analys av testprover från patienter som misstänks ha COVID-19 är en komplex flerstegsprocess som innebär att först överföra en del av provet till en inaktiveringslösning och extrahera dess RNA, som innehåller den virusgenetiska koden. RNA omvandlas sedan till DNA och amplifieras med användning av CDC -rekommenderad analys. Laboratoriet vid UMSOM fakultets praktikplats avgör slutligen om patientens prov innehåller det nya coronaviruset. Automatisering av dessa steg är avgörande för att öka laboratorieförmågan att testa tusentals prover per dag.

"Vi har nu implementerat en omkonfigurering av IGS-laboratoriet för att fastställa denna testkapacitet med hög genomströmning, "sa Jacques Ravel, Doktorsexamen, Professor i mikrobiologi och immunologi och associerad direktör vid Institute for Genome Sciences vid UMSOM. "I nära samarbete med övervakningen av institutionen för patologi, UMPA -laboratoriet kunde få myndighetsgodkännande för att vi ska kunna bearbeta prover som ska testas under övervakning av UMPA, medlem i UMSOM -fakultetspraxis. "

Dr Ravel noterade att Mike Humphrys, Direktör för Microbiome Service Laboratory (MSL) på IGS, har lett denna ansträngning, och hans tidigare erfarenhet som CDC-laboratorieforskare och expertis var nyckeln till detta arbete. MSL, arbetar med sitt laboratorieteam, omplanerade och omprogrammerade robotplattformarna för att hantera specifika uppgifter relaterade till COVID-19-testning, en uppgift som de startade i slutet av februari efter att det blev klart att viruset sprider sig utanför Kina. Maskinerna hade tidigare använts för forskningsstudier för att karakterisera bakterierna som utgör det mänskliga mikrobiomet.

Testanläggningen vid University of Maryland Pathology Associates har certifierats av den federala regeringen för att utföra laboratorieutvecklade tester. Dessa tester, kallas LDT, består av en typ av diagnostiskt test som är utformat för att utföras och användas i ett enda laboratorium, ligger ofta på ett sjukhus. För COVID-19-testning, UMSOM Department of Pathology planerar att söka tillstånd för nödanvändning från FDA och skickar sedan in data till byrån för att verifiera testets prestanda både för att upptäcka verkliga positiva resultat för viruset och riktiga negativa resultat som tyder på att viruset inte är närvarande.

"Vi har redan förmågan att utföra tester hos patienter som är inlagda vid University of Maryland Medical Center för att testa för COVID-19, "sa Dr Stass." Detta nya finansieringsinitiativ, dock, kommer att förbättra vår förmåga att nå djupare in i samhället och hjälpa till att tillhandahålla utökade tester som desperat behövs för att hjälpa till att få epidemin under kontroll i staten Maryland. Den förbättrade testförmågan kommer också att utnyttjas på längre sikt för att säkerställa en hållbar övervakning av COVID-19 i hela Maryland. "

• Kvinnor födda med kejsarsnitt har större risk för fetma och diabetes
• AGA publicerar ny COVID-19-vägledning för gastroenterologer som behandlar patienter med IBD