Začiatok súčasnej pandémie koronavírusovej choroby 2019 (COVID-19) videl, že reverzná transkriptázová polymerázová reťazová reakcia (RT-PCR) vyniká na výslnie ako zlatý štandard diagnostiky tejto infekcie. Tento test sa väčšinou používa na dosiahnutie pozitívneho/negatívneho výsledku, ale môže sa použiť aj na odhad vírusovej záťaže v testovanej vzorke, ak je prah cyklu (Ct), alebo sa preverí prechodový bod (Cp).
Vo väčšine prípadov infekcie SARS-CoV-2, kinetika vírusovej záťaže najskôr ukazuje prudký nárast vírusovej záťaže, predtým, ako sa objavia príznaky, nasleduje pomalý pád. Vírusové kultúry sú úspešné iba vtedy, ak má vzorka nízku hodnotu Ct (pod 27), keď je nad 35, vírus je ťažko kultivovateľný, čo naznačuje nízke riziko šírenia. Avšak, je ťažké priamo porovnať vírusovú záťaž v rôznych populáciách, v dôsledku použitia rôznych testov a metód, ktoré majú vplyv na Ct.
Súčasná štúdia sa preto zamerala na Ct vo všetkých vzorkách z populácie rutinných vzoriek, všetko testované v jednom holandskom regionálnom laboratóriu. Cieľom bolo nájsť rozdiel medzi rôznymi skupinami pacientov, vrátane hospitalizácie, GP, sanatórium, zdravotnícki pracovníci (HCW), a pacienti testovaní v testovacích centrách verejného zdravia, ako aj medzi vekovými skupinami, vzhľadom na vírusovú záťaž a obdobie, počas ktorého symptómy existovali.
Štúdia zahŕňala viac ako 270, 000 pacientov, použiť iba prvý výsledok. Ak by bolo viac pozitívnych výsledkov, bol použitý prvý, či už pozitívne alebo negatívne. Pozitívnych bolo asi 9%. V prvej vlne, viac ako štvrtina testov bola vykonaná pre nemocničných pacientov, ale táto skupina tvorila v druhej vlne iba necelé 1%, pričom viac ako 80% pochádza z holandského systému testovania verejného zdravia.
Vyššie hodnoty Ct (nižšie vírusové záťaže) v respiračných vzorkách boli spojené so vzorkami získanými v prvej vlne. Avšak, v tejto vlne, Hodnoty Ct boli nižšie u pacientov s verejným zdravím ako u všeobecných lekárov, u ne hospitalizovaných pacientov, a HCW v domovoch dôchodcov. S nástupom druhej vlny, obyvatelia opatrovateľských domov a pacienti všeobecných lekárov vykazovali nižšie hodnoty Ct.
Keď sú rozdelené podľa veku do nasledujúcich kategórií, totiž 0-12 rokov, 12-17 rokov, 18-29 rokov, 30-49 rokov, 50-59 rokov, 60-69 rokov, 70-79 rokov, a viac ako 79 rokov, štúdia ukazuje, že postupujúci vek je spojený s vyšším percentom pozitív a vyššou vírusovou záťažou. U mladších pacientov bola oveľa väčšia pravdepodobnosť, že budú mať hodnoty Ct nad 30.
Asi tretina detí mladších ako 12 rokov mala Ct nad 30, ale iba polovica ostatných pacientov. Medián hodnôt Ct bol v najmladšej skupine 4-krát vyšší v porovnaní s najstarším, čo zodpovedá 16-násobnému zníženiu vírusovej záťaže.
Keď bol známy čas nástupu symptómov a testovanie, Ukázalo sa, že zvyšujúci sa vek súvisí s nižšími hodnotami Ct, v akomkoľvek intervale medzi nástupom symptómu a testovaním. Toto bolo pozorované napriek skutočnosti, že vírusová záťaž sa zvyšovala s predĺžením tohto intervalu.
Distribúcia hodnôt Cp SARS-CoV-2 PCR v rôznych vekových skupinách (n =18 290) Každá farba zodpovedá jednej konkrétnej vekovej skupine, ktorá bola rutinne testovaná v období od 1. januára do 1. decembra. Pre každú skupinu je frekvencia hlásených Cp- hodnoty sa použili na výpočet skóre hustoty, ktorého plocha pod krivkou sa rovná 1.V tejto najskoršej štúdii distribúcie vírusovej záťaže u širokého spektra pacientov, je zrejmé, že vírusová záťaž je vždy najvyššia u starších pacientov, nezávisle od pohlavia alebo od nástupu symptómov. Opäť populácia testovaná na túto infekciu bola v prvej a druhej vlne odlišná. A po tretie, vzorky v druhej vlne mali vyšší medián vírusovej záťaže.
Dôvodom zmeny v testovaných populáciách je posun v testovacej politike, ktorá sa zamerala na hospitalizovaných pacientov v prvej vlne, ale so zlepšenou kapacitou prešiel na všeobecnejšie testovanie, počas druhej vlny.
Zistenie nízkych vírusových záťaží u mladších pacientov nie je v súlade s predchádzajúcimi štúdiami, ukazuje jedinečný význam tejto štúdie, ktorá použila údaje z viac ako 2, 600 pacientov mladších ako 20 rokov, a okolo 240 pod 12. Avšak, ponúkajú niekoľko vylúčení zodpovednosti. Pre jedného, obtiažnosť bezbolestného odberu vzoriek z nosohltanu alebo orofaryngu u detí mohla viesť k vyššiemu percentuálnemu počtu vzoriek z nosa alebo zo strednej časti turbinátu, vitalizácia výsledkov.
Tento aspekt je potrebné dôkladne preskúmať, pretože predchádzajúce štúdie poskytli protichodné zistenia, či tieto vzorky majú zníženú vírusovú záťaž. Za druhé, väčšina pacientov v mladšej vekovej skupine bola dostatočne stará na to, aby zákrok znášala.
Vysvetlenia, ako napríklad vyšší testovací prah pre deti alebo obmedzené testovanie, zrejme nezachytávajú vodu, pretože nárast vírusovej záťaže s vekom zostáva počas jedného roka štúdie stabilný. Namiesto toho môže byť dôležité študovať distribúciu a expresiu receptora hostiteľskej bunky, angiotenzín konvertujúci enzým 2 (ACE2), u detí, diferenciálna imunita u detí, rozdiely v mikrobióme, a už existujúcu imunitu voči koronavírusu.
Nakoniec, vzhľadom na výsledky tejto štúdie je potrebné preskúmať relatívnu citlivosť testovania antigénu na testovanie polymerázovej reťazovej reakcie (PCR). Pretože takmer tretina detí mala hodnoty Ct nad 30, citlivosť testu na antigén môže byť v tejto skupine nižšia.
Štúdia poukazuje na dôležitosť využívania údajov od širokého spektra pacientov, vo vysokých počtoch, z jedného laboratória, aby sa lepšie odhalil skutočný posun v testovanej populácii pacientov a distribúcii vírusovej záťaže. Nízka vírusová záťaž u detí podporuje tvrdenie, že táto veková skupina nehrá kľúčovú úlohu v šírení vírusu. Bude potrebný ďalší výskum, aby sa pochopilo, ako to súvisí s kašľom a inými epidemiologickými parametrami, ktoré tiež ovplyvňujú prenos.
medRxiv vydáva predbežné vedecké správy, ktoré nie sú predmetom vzájomného hodnotenia, a preto, by nemali byť považované za presvedčivé, viesť klinickú prax/správanie súvisiace so zdravím, alebo sa s nimi zaobchádza ako so zavedenými informáciami.