Nykyisen koronavirustaudin 2019 (COVID-19) pandemian alkaessa käänteiskopioijaentsyymipolymeraasiketjureaktio (RT-PCR) ammuttiin etusijalle kultaisena standardina tämän infektion diagnosoinnissa. Tätä testiä käytetään enimmäkseen positiivisen/negatiivisen tuloksen tuottamiseen, mutta sitä voidaan käyttää myös arvioimaan viruskuormitus testatussa näytteessä, jos syklin kynnys (Ct), tai rajapistettä (Cp) tutkitaan.
Useimmissa tapauksissa SARS-CoV-2-infektio viruskuormituksen kinetiikka osoittaa ensin jyrkästi lisääntyvän viruskuorman, ennen oireiden kehittymistä, jota seurasi hidas lasku. Virusviljelmät ovat onnistuneita vain, jos näytteellä on alhainen Ct -arvo (alle 27), kun se on yli 35, virus on tuskin kasvatettavissa, osoittaa vähäistä leviämisriskiä. Kuitenkin, on vaikea verrata suoraan eri populaatioiden viruskuormia, erilaisten määritysten ja menetelmien käytön vuoksi, jotka vaikuttavat Ct.
Tämän vuoksi tässä tutkimuksessa keskityttiin Ct:hen kaikissa näytteissä rutiininäytteenottopopulaatiosta, kaikki testattu yhdessä hollantilaisessa aluelaboratoriossa. Tavoitteena oli löytää ero eri potilasryhmien välillä, mukaan lukien sairaalahoito, GP, sairaskoti, terveydenhuollon työntekijät, ja potilaat, jotka on testattu kansanterveystestauskeskuksissa, sekä ikäryhmien välillä, suhteessa viruskuormaan ja oireiden esiintymisaikaan.
Tutkimukseen osallistui yli 270 000 potilasta, käyttämällä vain ensimmäistä tulosta. Jos positiivisia tuloksia oli useita, ensimmäistä käytettiin, onko positiivinen vai negatiivinen. Noin 9% oli positiivisia. Ensimmäisessä aallossa, yli neljännes testeistä tehtiin sairaalapotilaille, mutta tämän ryhmän osuus toisessa aallossa oli vain alle 1%, yli 80% on peräisin Alankomaiden kansanterveystestausjärjestelmästä.
Korkeammat Ct -arvot (pienemmät viruskuormat) hengitysteiden näytteissä liittyivät näytteisiin, jotka saatiin ensimmäisellä aallolla. Kuitenkin, tällä aallolla, Ct -arvot olivat alhaisemmat kansanterveyspotilailla kuin yleislääkäripotilailla, potilaille, jotka eivät ole sairaalahoidossa, ja sairaanhoitajien hoitokodeissa. Toisen aallon alkaessa hoitokodin asukkaiden ja yleislääkäripotilaiden Ct -arvot olivat alhaisemmat.
Kun ikäryhmitellään seuraaviin luokkiin, nimittäin, 0-12 vuotta, 12-17 vuotta, 18-29 vuotta, 30-49 vuotta, 50-59 vuotta, 60-69 vuotta, 70-79 vuotta, ja yli 79 vuotta, tutkimus osoittaa, että ikääntyminen liittyy suurempaan prosenttiosuuteen positiivisista ja suuremmista viruskuormista. Nuoremmilla potilailla oli paljon todennäköisemmin Ct -arvot yli 30.
Noin kolmanneksella alle 12 -vuotiaista lapsista oli Ct yli 30, mutta vain puolet muista potilaista. Ct-arvojen mediaani oli 4 kertaa korkeampi nuorin ryhmässä verrattuna vanhimpaan, mikä vastaa 16-kertaista viruskuorman vähenemistä.
Kun sekä oireiden alkamisaika että testaus oli tiedossa, ikääntymisen havaittiin liittyvän alempiin Ct -arvoihin, milloin tahansa oireiden alkamisen ja testauksen välillä. Tämä havaittiin huolimatta siitä, että viruskuorma kasvoi tämän ajanjakson kasvaessa.
SARS-CoV-2 PCR Cp -arvojen jakautuminen eri ikäryhmissä (n =18.290) Jokainen väri vastaa yhtä tiettyä ikäryhmää, joka testattiin rutiininomaisesti 1. tammikuuta-1. joulukuuta. Kullekin ryhmälle raportoitu Cp- arvoja käytettiin tiheyspisteen laskemiseen, jonka käyrän alla oleva alue laskee yhteen.Tässä varhaisessa tutkimuksessa viruskuorman jakautumisesta monille potilaille on selvää, että viruskuormitus on aina suurin ikääntyneillä potilailla, sukupuolesta tai oireiden alkamisesta riippumatta. Uudelleen, tämän infektion suhteen testattu populaatio oli erilainen ensimmäisessä ja toisessa aallossa. Ja kolmanneksi, Toisen aallon näytteillä oli suurempi mediaani viruskuorma.
Syy testattujen populaatioiden muutokseen on testauspolitiikan muutos, joka keskittyi sairaalahoidossa oleviin potilaisiin ensimmäisellä aallolla, mutta siirryttiin yleisempaan testaukseen kapasiteetin parantuessa, toisen aallon aikana.
Havainto alhaisesta viruskuormasta nuoremmilla potilailla ei vastaa aiempia tutkimuksia, osoittaa tämän tutkimuksen ainutlaatuisen merkityksen, jossa käytettiin tietoja yli kahdesta 600 alle 20 -vuotiasta potilasta ja noin 240 alle 12. Kuitenkin, ne tarjoavat useita vastuuvapauslausekkeita. Yhdelle, vaikeus ottaa nenänielun tai suun nielun näytteenotto kivuttomasti lapsilla on saattanut johtaa korkeampaan prosenttiosuuteen nenän tai turbinate-näytteistä, hämmentäviä tuloksia.
Tämä näkökohta on tutkittava perusteellisesti, aikaisemmat tutkimukset antoivat ristiriitaisia havaintoja siitä, onko näytekappaleilla pienempi viruskuorma. Toiseksi, suurin osa nuoremman ikäryhmän potilaista oli riittävän vanhoja sietääkseen toimenpiteen.
Selitykset, kuten korkeampi testauskynnys lapsille tai rajoitettu testaus, eivät näytä pitävän vettä, koska viruskuormien lisääntyminen iän myötä pysyy vakaana vuoden ajan. Sen sijaan, voi olla tärkeää tutkia isäntäsolureseptorin jakautumista ja ilmentymistä, angiotensiiniä konvertoiva entsyymi 2 (ACE2), lapsilla, erilainen immuniteetti lapsilla, erot mikrobiomissa, ja olemassa oleva koronavirusimmuniteetti.
Lopuksi, antigeenitestauksen suhteellista herkkyyttä polymeraasiketjureaktiotestille (PCR) on tutkittava suhteessa tämän tutkimuksen tuloksiin. Koska lähes kolmanneksella lapsista Ct -arvot olivat yli 30, antigeenitestin herkkyys voi olla pienempi tässä ryhmässä.
Tutkimus tuo esiin, kuinka tärkeää on käyttää monenlaisia potilaita, suurella määrällä, yhdestä laboratoriosta, jotta voidaan paremmin paljastaa todellinen muutos testatussa potilasryhmässä ja viruskuorman jakautumisessa. Lasten alhaiset viruskuormat tukevat väitettä, että tällä ikäryhmällä ei ole keskeistä roolia viruksen leviämisessä. Tarvitaan lisää tutkimusta ymmärtääkseen, miten tämä liittyy yskään ja muihin epidemiologisiin parametreihin, jotka vaikuttavat myös tartuntaan.
medRxiv julkaisee alustavia tieteellisiä raportteja, joita ei ole vertaisarvioitu, ja siksi, ei pidä pitää ratkaisevana, ohjaa kliinistä käytäntöä/terveyteen liittyvää käyttäytymistä, tai käsitellään vakiintuneina tietoina.