I begynnelsen av den nåværende koronavirussyken 2019 (COVID-19) -pandemien så den omvendte transkriptase-polymerasekjedereaksjonen (RT-PCR) skyte frem som gullstandarden for diagnostisering av denne infeksjonen. Denne testen brukes hovedsakelig til å levere et positivt/negativt resultat, men kan også brukes til å estimere virusbelastning i den testede prøven hvis syklusterskelen (Ct), eller kryssingspunkt (Cp) undersøkes.
I de fleste tilfeller av SARS-CoV-2 infeksjon, viral belastningskinetikk viser først en bratt økning i viral belastning, før symptomene utvikler seg, etterfulgt av et sakte fall. Viralkulturer er bare vellykkede hvis prøven har en lav Ct -verdi (under 27), mens når den er over 35, viruset er knapt dyrkbart, som indikerer lav spredningsrisiko. Derimot, det er vanskelig å direkte sammenligne virusmengder i forskjellige populasjoner, på grunn av bruk av varierende analyser og metoder, som påvirker Ct.
Den nåværende studien fokuserte derfor på Ct i alle prøver fra en rutinemessig prøvetakingspopulasjon, alle testet på ett nederlandsk regionalt laboratorium. Målet var å finne en differensial mellom ulike pasientgrupper, inkludert sykehus, Fastlege, sykehjem, helsearbeidere (HCW), og pasienter testet på folkehelsesentre, så vel som mellom aldersgrupper, med hensyn til virusmengden og perioden symptomene eksisterte over.
Studien inkluderte over 270, 000 pasienter, bruker bare det første resultatet. Hvis det var flere positive resultater, den første ble brukt, enten positivt eller negativt. Omtrent 9% var positive. I den første bølgen, over en fjerdedel av testene ble utført for sykehuspasienter, men denne gruppen utgjorde bare mindre enn 1% i den andre bølgen, med over 80% fra det nederlandske folkehelsesystemet.
Høyere Ct -verdier (lavere viral belastning) i respiratoriske prøver var assosiert med prøver oppnådd i den første bølgen. Derimot, i denne bølgen, Ct -verdiene var lavere hos folkehelsepasienter enn hos fastlege -pasienter, hos pasienter som ikke er innlagt på sykehus, og HCW på sykehjem. Med begynnelsen av den andre bølgen, sykehjemsbeboere og fastlege -pasienter viste lavere Ct -verdier.
Når den er lagdelt etter alder i følgende kategorier, nemlig, 0-12 år, 12-17 år, 18-29 år, 30-49 år, 50-59 år, 60-69 år, 70-79 år, og over 79 år, studien viser at stigende alder er knyttet til en høyere prosentandel av positive og høyere virusmengder. De yngre pasientene var mye mer sannsynlig å ha Ct -verdier over 30.
Omtrent en tredjedel av barna under 12 år hadde Ct over 30, men bare halvparten av andre pasienter. Median Ct-verdier var 4 ganger høyere i den yngste gruppen sammenlignet med den eldste, som tilsvarer en 16 ganger reduksjon i virusbelastning.
Da både tidspunktet for symptomdebut og testing var kjent, økende alder ble funnet å være relatert til lavere Ct -verdier, med et hvilket som helst intervall mellom symptomdebut og testing. Dette ble observert til tross for at virusbelastningen økte med en økning i dette intervallet.
Fordeling av SARS-CoV-2 PCR Cp-verdier innen forskjellige aldersgrupper (n =18.290) Hver farge tilsvarer en spesifikk aldersgruppe som ble rutinemessig testet i perioden 1. januar-1. desember. For hver gruppe ble hyppigheten av rapporterte Cp- verdier ble brukt til å beregne en tetthetsscore som arealet under kurven summerer til 1.I denne tidligste studien av viral belastningsfordeling hos et bredt spekter av pasienter, det er klart at virusbelastningen alltid er høyest hos eldre pasienter, uavhengig av kjønn eller symptomdebut. En gang til, populasjonen som ble testet for denne infeksjonen var annerledes i den første og andre bølgen. Og for det tredje, prøver i den andre bølgen hadde en høyere median viral belastning.
Årsaken til endringen i testede populasjoner er endringen i testpolitikken, som fokuserte på sykehusinnlagte pasienter i den første bølgen, men gikk over til mer generell testing etter hvert som kapasiteten ble forbedret, i løpet av den andre bølgen.
Funnet av lav virusmengde hos yngre pasienter er ikke i samsvar med tidligere studier, viser den unike betydningen av denne studien som brukte data fra over 2, 600 pasienter under 20 år, og rundt 240 under 12. Imidlertid, de tilbyr flere ansvarsfraskrivelser. For en, vanskeligheten med å utføre nasofaryngeal eller orofaryngeal prøvetaking smertefritt hos barn kan ha ført til en høyere prosentandel av nese- eller mid-turbinatprøver, ødelegger resultatene.
Dette aspektet må undersøkes grundig, ettersom tidligere studier ga motstridende funn om slike prøver har redusert virusmengde. For det andre, de fleste pasientene i den yngre aldersgruppen var gamle nok til å tolerere inngrepet.
Forklaringer som en høyere testterskel for barn eller begrenset testing ser ikke ut til å holde vann, siden økningen i virusmengde med alderen holder seg stabil i løpet av ett år av studien. I stedet, det kan være viktig å studere fordelingen og uttrykket av vertscellereseptoren, angiotensinkonverterende enzym 2 (ACE2), hos barn, differensiell immunitet hos barn, forskjeller i mikrobiomet, og allerede eksisterende koronavirusimmunitet.
Endelig, den relative sensitiviteten til antigentesting overfor polymerasekjedereaksjon (PCR) -testing må undersøkes i forhold til resultatene av denne studien. Siden nesten en tredjedel av barna hadde Ct -verdier over 30, antigen test sensitivitet kan godt være lavere i denne gruppen.
Studien viser viktigheten av å bruke data fra et bredt spekter av pasienter, i høye tall, fra et enkelt laboratorium, for bedre å avdekke det faktiske skiftet i den testede pasientpopulasjonen og fordelingen av viral belastning. Den lave virusmengden hos barn støtter påstanden om at denne aldersgruppen ikke spiller en nøkkelrolle i virusspredning. Mer forskning vil være nødvendig for å forstå hvordan dette henger sammen med hoste og andre epidemiologiske parametere som også påvirker overføring.
medRxiv publiserer foreløpige vitenskapelige rapporter som ikke er fagfellevurdert og, derfor, skal ikke betraktes som avgjørende, veilede klinisk praksis/helserelatert atferd, eller behandles som etablert informasjon.