Étude :La distribution de la charge virale du SRAS-CoV-2 dans différentes populations de patients et groupes d'âge révèle que les charges virales augmentent avec l'âge. Crédit d'image :FamVeld/Shutterstock Le début de la pandémie actuelle de la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) a vu la réaction en chaîne par polymérase de la transcriptase inverse (RT-PCR) devenir l'étalon-or pour le diagnostic de cette infection. Ce test est principalement utilisé pour fournir un résultat positif/négatif, mais peut également être utilisé pour estimer la charge virale dans l'échantillon testé si le seuil de cycle (Ct), ou le point de croisement (Cp) est examiné.
Dans la plupart des cas d'infection par le SRAS-CoV-2, la cinétique de la charge virale montre d'abord une forte augmentation de la charge virale, avant l'apparition des symptômes, suivi d'une lente chute. Les cultures virales ne réussissent que si l'échantillon a une valeur Ct faible (inférieure à 27) alors que lorsqu'elle est supérieure à 35, le virus est difficilement cultivable, indiquant un faible risque de propagation. Cependant, il est difficile de comparer directement les charges virales dans différentes populations, en raison de l'utilisation de divers dosages et méthodes, qui ont un impact sur le Ct.
L'étude actuelle s'est donc concentrée sur le Ct dans tous les échantillons d'une population d'échantillonnage de routine, tous testés dans un laboratoire régional néerlandais. L'objectif était de trouver un différentiel entre les différents groupes de patients, y compris hospitalisé, GP, maison de repos, les travailleurs de la santé (TS), et les patients testés dans les centres de test de santé publique, ainsi qu'entre les tranches d'âge, en ce qui concerne la charge virale et la période pendant laquelle les symptômes ont existé.
L'étude comprenait plus de 270, 000 malades, en utilisant uniquement le premier résultat. S'il y avait plusieurs résultats positifs, le premier a été utilisé, qu'elles soient positives ou négatives. Environ 9 % étaient positifs. Dans la première vague, plus d'un quart des tests ont été effectués chez des patients hospitalisés, mais ce groupe ne représentait que moins de 1 % dans la deuxième vague, avec plus de 80% provenant du système de test de santé publique néerlandais.
Des valeurs de Ct plus élevées (charges virales plus faibles) dans les échantillons respiratoires étaient associées aux échantillons obtenus lors de la première vague. Cependant, dans cette vague, Les valeurs de Ct étaient plus faibles chez les patients en santé publique que chez les patients généralistes, chez les patients non hospitalisés, et les travailleurs de la santé dans les maisons de soins infirmiers. Avec le début de la deuxième vague, les résidents des maisons de soins infirmiers et les patients généralistes ont montré des valeurs de Ct plus faibles.
Lorsqu'ils sont stratifiés par âge dans les catégories suivantes, à savoir, 0-12 ans, 12-17 ans, 18-29 ans, 30-49 ans, 50-59 ans, 60-69 ans, 70-79 ans, et plus de 79 ans, l'étude démontre que l'avancée en âge est liée à un pourcentage plus élevé de séropositifs et à des charges virales plus élevées. Les patients plus jeunes étaient beaucoup plus susceptibles d'avoir des valeurs de Ct supérieures à 30.
Environ un tiers des enfants de moins de 12 ans avaient un Ct supérieur à 30, mais seulement la moitié des autres patients. Les valeurs médianes de Ct étaient 4 fois plus élevées dans le groupe le plus jeune que dans le groupe le plus âgé, ce qui correspond à une réduction de 16 fois de la charge virale.
Lorsque le moment de l'apparition des symptômes et le moment du test étaient connus, l'augmentation de l'âge s'est avérée être liée à des valeurs de Ct plus faibles, à n'importe quel intervalle entre l'apparition des symptômes et le test. Ceci a été observé malgré le fait que la charge virale augmentait avec une augmentation de cet intervalle.
Répartition des valeurs de Cp PCR du SRAS-CoV-2 au sein de différents groupes d'âge (n =18,290) Chaque couleur correspond à un groupe d'âge spécifique qui a été systématiquement testé au cours de la période du 1er janvier au 1er décembre. Pour chaque groupe, la fréquence des Cp- a été utilisé pour calculer un score de densité dont l'aire sous la courbe est égale à 1. Dans cette première étude sur la répartition de la charge virale chez un large éventail de patients, il est clair que la charge virale est toujours la plus élevée chez les patients plus âgés, indépendamment du sexe ou de l'apparition des symptômes. De nouveau, la population testée pour cette infection était différente dans les première et deuxième vagues. Et troisièmement, les échantillons de la deuxième vague avaient une charge virale médiane plus élevée.
La raison du changement dans les populations testées est le changement de politique de test, qui s'est concentré sur les patients hospitalisés dans la première vague, mais est passé à des tests plus généraux à mesure que la capacité s'améliorait, lors de la deuxième vague.
La découverte de faibles charges virales chez les patients plus jeunes n'est pas en accord avec les études antérieures, montrant l'importance unique de cette étude qui a utilisé les données de plus de 2, 600 patients de moins de 20 ans, et environ 240 en dessous de 12. Cependant, ils offrent plusieurs avertissements. Pour un, la difficulté d'effectuer un prélèvement nasopharyngé ou oropharyngé sans douleur chez les enfants peut avoir conduit à un pourcentage plus élevé de prélèvements nasaux ou du cornet moyen, vicier les résultats.
Cet aspect doit être étudié en profondeur, car des études antérieures ont donné des résultats contradictoires quant à savoir si ces échantillons ont une charge virale réduite. Deuxièmement, la plupart des patients du groupe d'âge plus jeune étaient assez vieux pour tolérer la procédure.
Des explications telles qu'un seuil de test plus élevé pour les enfants ou des tests restreints ne semblent pas tenir la route, puisque l'augmentation des charges virales avec l'âge se maintient au cours de l'année de l'étude. Au lieu, il peut être important d'étudier la distribution et l'expression du récepteur de la cellule hôte, l'enzyme de conversion de l'angiotensine 2 (ACE2), chez les enfants, immunité différentielle chez les enfants, différences dans le microbiome, et l'immunité préexistante contre les coronavirus.
Finalement, la sensibilité relative des tests antigéniques par rapport aux tests de réaction en chaîne par polymérase (PCR) doit être explorée en relation avec les résultats de cette étude. Étant donné que près d'un tiers des enfants avaient des valeurs Ct supérieures à 30, la sensibilité du test d'antigène peut bien être plus faible dans ce groupe.
L'étude met en évidence l'importance d'utiliser les données d'un large éventail de patients, en grand nombre, d'un seul laboratoire, afin de mieux découvrir le changement réel dans la population de patients testés et la répartition de la charge virale. Les faibles charges virales chez les enfants soutiennent l'affirmation selon laquelle ce groupe d'âge ne joue pas un rôle clé dans la propagation virale. Des recherches supplémentaires seront nécessaires pour comprendre comment cela est lié à la toux et à d'autres paramètres épidémiologiques qui affectent également la transmission.
medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, donc, ne doit pas être considéré comme concluant, guider la pratique clinique/le comportement lié à la santé, ou traités comme des informations établies.
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