В начале нынешней пандемии коронавирусного заболевания 2019 года (COVID-19) полимеразная цепная реакция с обратной транскриптазой (ОТ-ПЦР) стала золотым стандартом для диагностики этой инфекции. Этот тест в основном используется для получения положительного / отрицательного результата, но также может использоваться для оценки вирусной нагрузки в исследуемом образце, если порог цикла (Ct), или точка пересечения (Cp) проверяется.
В большинстве случаев инфекции SARS-CoV-2, кинетика вирусной нагрузки сначала показывает резкое увеличение вирусной нагрузки, до появления симптомов, с последующим медленным падением. Вирусные культуры успешны только в том случае, если образец имеет низкое значение Ct (ниже 27), а когда оно выше 35, вирус трудно культивировать, что указывает на низкий риск распространения. Тем не мение, сложно напрямую сравнивать вирусные нагрузки в разных популяциях, из-за использования различных анализов и методов, которые влияют на Ct.
Таким образом, текущее исследование было сосредоточено на Ct во всех выборках из стандартной выборочной совокупности, все протестированы в одной голландской региональной лаборатории. Цель заключалась в том, чтобы найти разницу между различными группами пациентов, в том числе госпитализированы, GP, дом престарелых, медицинские работники (МР), и пациентов, прошедших тестирование в испытательных центрах общественного здравоохранения, а также между возрастными группами, в отношении вирусной нагрузки и периода, в течение которого существовали симптомы.
В исследование было включено более 270, 000 пациентов, используя только первый результат. Если было несколько положительных результатов, первый был использован, будь то положительный или отрицательный. Около 9% были положительными. В первой волне более четверти исследований было проведено для пациентов больниц, но во второй волне эта группа составила менее 1%, более 80% из них поступили от голландской системы тестирования общественного здравоохранения.
Более высокие значения Ct (более низкие вирусные нагрузки) в респираторных образцах были связаны с образцами, полученными в первой волне. Тем не мение, в этой волне, Значения Ct были ниже у пациентов из системы общественного здравоохранения, чем у пациентов общей практики. у не госпитализированных пациентов, и медработники в домах престарелых. С наступлением второй волны Жители домов престарелых и пациенты общей практики показали более низкие значения Ct.
При стратификации по возрасту на следующие категории, а именно, 0-12 лет, 12-17 лет, 18-29 лет, 30-49 лет, 50-59 лет, 60-69 лет, 70-79 лет, и старше 79 лет, исследование демонстрирует, что пожилой возраст связан с более высоким процентом положительных результатов и более высокой вирусной нагрузкой. У более молодых пациентов гораздо больше шансов иметь значения Ct выше 30.
Около трети детей младше 12 лет имели Ct выше 30, но только половина других пациентов. Медианные значения Ct были в 4 раза выше в самой молодой группе по сравнению с самой старшей, что соответствует 16-кратному снижению вирусной нагрузки.
Когда были известны и время появления симптомов, и время тестирования, Установлено, что увеличение возраста связано с более низкими значениями Ct, в любом интервале между появлением симптомов и тестированием. Это наблюдалось несмотря на то, что вирусная нагрузка увеличивалась с увеличением этого интервала.
Распределение значений Cp ПЦР SARS-CoV-2 в разных возрастных группах (n =18,290) Каждый цвет соответствует одной конкретной возрастной группе, которая регулярно тестировалась в период с 1 января по 1 декабря. Для каждой группы частота зарегистрированных Cp- Значения были использованы для расчета показателя плотности, при котором площадь под кривой в сумме равна 1.В этом самом раннем исследовании распределения вирусной нагрузки у широкого круга пациентов, ясно, что вирусная нагрузка всегда самая высокая у пожилых пациентов, независимо от пола или появления симптомов. Опять таки, Популяция, протестированная на эту инфекцию, была разной в первой и второй волнах. И в-третьих, образцы во второй волне имели более высокую медианную вирусную нагрузку.
Причиной изменения в тестируемых популяциях является изменение политики тестирования, которая была ориентирована на госпитализированных пациентов первой волны, но перешли к более общему тестированию по мере увеличения емкости, во время второй волны.
Обнаружение низкой вирусной нагрузки у более молодых пациентов не согласуется с более ранними исследованиями. показывая уникальную важность этого исследования, в котором использовались данные более чем двух, 600 пациентов в возрасте до 20 лет, и около 240 ниже 12. Однако они предлагают несколько заявлений об отказе от ответственности. Для одного, сложность проведения безболезненного взятия пробы из носоглотки или ротоглотки у детей могла привести к более высокому проценту пробы из носа или средней носовой раковины, искажение результатов.
Этот аспект требует тщательного изучения, поскольку более ранние исследования дали противоречивые результаты относительно того, имеют ли такие образцы сниженную вирусную нагрузку. Во-вторых, большинство пациентов младшей возрастной группы были достаточно взрослыми, чтобы переносить процедуру.
Такие объяснения, как более высокий порог тестирования для детей или ограниченное тестирование, не выдерживают никакой критики, поскольку увеличение вирусной нагрузки с возрастом сохраняется в течение одного года исследования. Вместо, может быть важно изучить распределение и экспрессию рецептора клетки-хозяина, ангиотензинпревращающий фермент 2 (ACE2), у детей, дифференциальный иммунитет у детей, различия в микробиоме, и ранее существовавший иммунитет к коронавирусу.
Наконец-то, Относительная чувствительность тестирования на антиген по сравнению с тестированием с помощью полимеразной цепной реакции (ПЦР) должна быть изучена в связи с результатами этого исследования. Поскольку почти у трети детей значения Ct превышали 30, Чувствительность теста на антиген вполне может быть ниже в этой группе.
Исследование подчеркивает важность использования данных от широкого круга пациентов, в большом количестве, из одной лаборатории, чтобы лучше выявить фактический сдвиг в популяции протестированных пациентов и распределении вирусной нагрузки. Низкая вирусная нагрузка у детей подтверждает утверждение о том, что эта возрастная группа не играет ключевой роли в распространении вируса. Потребуются дополнительные исследования, чтобы понять, как это связано с кашлем и другими эпидемиологическими параметрами, которые также влияют на передачу.
medRxiv публикует предварительные научные отчеты, не прошедшие рецензирование, и, следовательно, не следует рассматривать как окончательный, руководить клинической практикой / поведением, связанным со здоровьем, или рассматриваться как установленная информация.