Метилирования гена профиль желудочного раковой ткани в зависимости от локализации опухоли в профиле stomach

метилирования гена желудка раковой ткани в зависимости от локализации опухоли в желудке
Аннотация
Справочная информация
Существует значительный объем информации о метилирования промоторных областей различных генов, участвующих в желудочном канцерогенезе. Тем не менее, существует недостаток информации о том, как этот процесс отличается эпигенетические в опухолях, происходящих на различных участках в желудке.
Целью данного исследования является оценка метилирования профили MLH1
, MGMT
, и DAPK-1
генов в раковых тканях из разных сайтов желудка
.
методов Образцы были приобретены у 81 пациентов, страдающих желудка аденокарциномы, перенесших операцию по поводу рака желудка в литовского университета медицинских наук Больница Каунас клиники в 2009 году -2012. Метилирования гена исследовали с специфической в ​​отношении метилирования ПЦР. Исследование было одобрено Комитетом по этике научных исследований Литовский биомедицинской по.
Результаты
Частоты метилирования в раковых тканях из верхней, средней и нижней трети живота были 11,1, 23,1 и 45,4%, соответственно, для MLH1
; 22,2, 30,8 и 57,6%, соответственно, для MGMT
; и 44,4, 48,7 и 51,5%, соответственно, для DAPK-1. MLH1
и MGMT
метилирование наблюдается чаще в нижней трети желудка, чем в верхней трети (р
&ЛТ; 0,05).
В средней трети, DAPK-1
промотор метилирование был связан с более продвинутой болезни в лимфатических узлах (N2-3 по сравнению с N0-1 [р
= 0,02]) и продвинутой стадии опухоли (стадия III, а не стадии I-II [р
= 0,05]). MLH1
и MGMT
метилирование коррелирует обратно, когда опухоль была расположена в нижней трети желудка (коэффициент, -0,48; р = 0,01
). DAPK-1
и MLH1
метилирование обратно коррелировала в опухолях в средней трети желудка (коэффициент, -0,41; р = 0,01
).
Вывод
промотор гена метилирование зависит от того, желудочный местоположение опухоли.
Ключевые слова
рак желудка MLH1
DAPK-1
MGMT
Метилирование фон
рака желудка является серьезной проблемой здравоохранения. Скрытое клинический ход болезни означает, что это заболевание, как правило, диагностируется в его поздних стадиях, что приводит к плохим прогнозам, несмотря на новые возможности лечения, которые появились в последнее время.
Более чем 90% случаев рака желудка диагностируются как аденокарциномы [1 ]. С 1965 года, аденокарциномы желудка была разделена на два основных типа, диффузный и кишечный (по Lauren [2]). Эти два гистологических типов различаются по их этиологией и прогнозы. Желудочно-кишечные и желудочные аденокарциномы часто являются следствием хронической инфекции с Helicobacter Pylori
, когда нормальная слизистая оболочка желудка трансформируется в острый конец хронический гастрит, кишечной метаплазией и дисплазией [3]. Диффузный аденокарциномы является более агрессивной, чем тип кишечника, потому что его формирование не зависит от процессов гастрит или метаплазии [4].
Последние научные данные показывают, что прогноз аденокарциномы желудка зависит не только от ее гистологического типа, но и на локализация опухоли в желудке. Проксимальные опухоли (происходящих в кардии), которые обычно образуются в ответ на гастроэзофагеальной кислота /рефлюкса желчи [5], теперь разделены в качестве отдельного и более агрессивной формой аденокарциномы желудка, которые отличаются от дистальных опухолей желудка.
Если дистальной рак желудка быть классифицирован как уникальный? Когорта исследования показали, что риск предраковых состояния, называется "атрофический гастрит", развивается в рак различается в зависимости от места поражения в желудке. Относительный риск развития рака желудка происходит у пациентов с Corpus преобладанием гастрита выше, чем в тех, с преимущественно антрального гастрита [6]. Означает ли этот факт различные канцерогенные процессы в антральном желудка и тела? Там нет никаких данных, чтобы либо исключить или подтвердить это.
Эпигенетических модификаций играют центральную роль в желудочном канцерогенезе [7]. Эти процессы, такие как метилирование CpG островков в гене промоторов, вызывают обратимые структурные изменения в ДНК, которые, в свою очередь, модифицируют экспрессию гена [8]. Метилирование ДНК происходит, когда метильной группы (-CH <суб> 3) переносится на 5 й позиции цитозина [9].
A пилотное исследование нашей исследовательской группы показали, что частота метилирования MLH1
промотор отличается в корпусных и антрального желудка тканях, пораженных пангастрит. Мы заметили, что этот эпигенетические процесс значительно чаще в антральном гастрите тканях, чем в корпусе [10], в то время как степень атрофический гастрит подобна в обоих регионах. Остается неясным, является ли верно и раковых тканей эта тенденция.
Были выбраны две группы генов для этого анализа метилирования. Первая группа (MLH1
и УПР
) содержит два гена, которые кодируют белки, участвующие в репарации мутаций и других повреждений ДНК, прежде чем дальнейшее деление клеток, а вторая группа содержит ген подавления роста опухолей (DAPK-1
), кодирующий белок, который индуцирует апоптоз в присутствии тяжелой геномной дефекта.
MLH1
(MutL гомолог 1, рак толстой кишки, типа неполипозным 2 (E.coli
)) гена происходит в 3p21 .3 локус. Ген-кодируемый белок выявляет ошибки ДНК, которые появляются после репликации. Гиперметилирование MLH1
промотора, а не мутации вызваны изменениями в функции белка, отвечает за нестабильности микросателлитных при раке желудка [11]. Согласно литературным данным, MLH1
метилирование отвечает за кишечной формы рака желудка и на ранней стадии заболевания [12-16].
Функция MGMT (O 6-метилгуанин-ДНК- метилтрансферазы) должен удалить алкильную группу из O 6 положении гуанина [17]. Нарушение функции MGMT может привести к возникновению мутаций. Научные публикации свидетельствуют о том, что метилирование MGMT
промотора гена является одним из патогенетических путей при раке желудка. В частности, ген метилирование связывается с продвинутой стадией заболевания [18], а также связано с прогнозом заболевания хуже [19].
The DAPK-
1 (смерть ассоциированных с протеинкиназы 1) гена является одним из трех DAPK
семейных генов, кодирующих кальций /кальмодулин-зависимой серин-треонин протеинкиназы. Функция белка DAPK-1 тесно связано с различными путями с апоптозом, и DAPK-1
гиперметилирование Было показано, что происходит в твердых и гематологических опухолей.
Рак желудка не является исключением. промотор гена метилирование также характерно для аденокарциномы в этом месте. В более раннем исследовании, наша группа обнаружена обратная связь между DAPK-1
и MLH1
метилирования [20]. Мы испытываем здесь гипотезу о том, что различные профили метилирования гена встречаются в раковых тканях в желудке в зависимости от локализации опухоли (верхней, средней или нижней трети).
Методы
Исследование было одобрено литовским регионального медико-биологических Комитет по этике исследований. Все пациенты подписали форму информированного согласия. В исследовании принимали участие пациентов, получавших в университете Литвы медицинских наук больницы (LUHSH) Каунас клиники в 2009-2012 годах. Образцы тканей желудка были взяты у всех испытуемых с морфологически подтвержденной стадией I-III аденокарциномы. Исследуемая популяция состояла из 81 пациентов (34 мужчин и 47 женщин) со средним возрастом 68 лет (диапазон 23-87 лет; стандартное отклонение [SD] 11,75). Опухоли девяти пациентов были в верхней трети желудка, те из 39 пациентов были в средней трети, и те из 33 пациентов были в нижней трети желудка. Образцы тканей желудка были собраны из опухолевых участков во время операции. Эти материалы немедленно замораживали в жидком азоте и хранили при -80 ° С до анализа. В ходе исследования были получены клинические данные пациентов (возраст на момент постановки диагноза, пола) и морфологические данные (инвазия опухоли по классификации TNM, гистологического типа по классификации Lauren, и степень дифференциации в соответствии с классификацией Всемирной организации здравоохранения) из медицинской документации.
метилирования конкретных полимеразной цепной реакции (MSP)
ДНК экстрагировали из 25-30 мг замороженной ткани с использованием ткани ZS геномную ДНК ™ Mini Prep Kit (Zymo Research, США), в соответствии с инструкции изготовителя. Статус метилирования MLH1
, MGMT
и DAPK-1
промоутеры определяли путем обработки ДНК с бисульфит, используя EZ метилирование ДНК Gold Kit ™ (Zymo Research), в соответствии с инструкциями изготовителя , Человеческой геномной ДНК из лимфоцитов периферической крови, обрабатывают раствором бисульфита, использовали в качестве отрицательного контроля. Человеческой геномной ДНК, обрабатывали в пробирке с услугой SssI метилтрансферазы (New England Biolabs, UK) использовали в качестве положительного контроля. Статус метилирования промоторов была обнаружена с МПВ.
Праймеры для метилированных и неметилированных ДНК-последовательностей, которые перечислены в таблице 1. ПЦР проводили в общем объеме реакционной смеси 20 мкл, содержащей 10 мкл Maxima® Hot Start ПЦР Master Mix с Hot Start Taq ДНК-полимеразы
(Thermo Fisher Scientific, США) и 10 мкМ каждого праймера (Metabion International AG, Германия). СМП проводили в течение 38-40 циклов денатурации при 94 ° С в течение 30 с, отжиг в течение 1 мин при температуре, подходящей для отдельного гена, и удлинение при 72 ° С в течение 1 мин. Продукты ПЦР разделяли на 3,5% агарозном геле (рис. 1). Когда оба метилированных и неметилированные сигналы появились на геле, ген считался methylated.Table 1 Праймеры, используемые для
MSp
Primer имени
Форвард последовательности

обратной последовательности

номер

MLH1
метилированный
TATATCGTTCGTAGTATTC [GenBank: NG_0071092]
TCCGACCCGAATAAACC
[40]
MLH1
неметилированным
TTTTGATGTAGATGTTTTATTAGGGT [GenBank: NG_0071092 ]
TACCACCTCATCATAACTACC
[40]
MGMT
метилированный
TTTCGACGTTCGTAGGTTTTCGC [GenBank: NG_000010.11]
GCACTCTTCCGAAAACGAAAC G
[40]
MGMT
неметилированным
TTTGTGTTTTGATGTTTGTAGGTTTTTGT [GenBank: NG_000010.11]
AACTCCACACTCTTCCAAAAACAAAACA
[40]
DAPK-1
метилируется
GGATAGTCGGATCGAGTTAACGTC [GenBank: NG_029883.1]
CCCTCCCAAACGCCG управлением
[ ,,,0],40]
DAPK-1
неметилированным
GGAGGATAGTTGGATTGAGTTAATGTT [GenBank: NG_029883.1]
CAAATCCCTCCCAAACACCAA
[40]
п.н.
пар оснований
рис. 1 представитель образцы МПВ анализа образцов ДНК, взятых из тканей рака желудка
анализ математико-статистических данных
Анализ статистических данных проводили с помощью пакета программного обеспечения SPSS Statistics 19 (IBM SPSS Inc., США). Количественные свойства были описаны среднее арифметическое и стандартное отклонение. т Студенческий
-test был использован для проверки гипотезы о равных средств. Χ
2 критерий и точный критерий Фишера были использованы для проверки статистической гипотезы о независимости двух переменных. Корреляция между переменными оценивали путем расчета коэффициента Спирмена. р
&л; 0,05 был признан значительным.

Результаты Частоты метилирования промотора в раковых тканях из верхней, средней и нижней трети желудка были 11,1, 23,1 и 45,4%, соответственно, для MLH1
гена; 22,2, 30,8 и 57,6%, соответственно, для MGMT
гена; и 44,4, 48,7 и 51,5%, соответственно, для гена DAPK-1
. Метилирование
MLH1 и MGMT
генов наблюдается чаще в нижней трети желудка, чем в верхней трети (р
&л; 0,05).
Подробные данные приведены в таблице 2 . анализ подгрупп по половому признаку показал, что MLH1
метилирования в опухолевых тканях в нижней трети живота было характерно для женского населения (р = 0,01
), в то время как MGMT
метилирование было только статистически значимым в мужская группа (р
= 0,03). Причины этих выводов не ясны, и требуют детального анализа и дальнейших исследований. Промотор метилирование анализируемых генов не был связан с пациентом age.Table 2 Распределение MLH1, MGMT
и DAPK-1
метилирования в раковых тканях желудка в зависимости от локализации желудка

Желудок верхнюю треть раковая ткань (9 пациентов) M /U

Желудок средней трети раковой ткани (39 пациентов) M /U

Желудок нижней трети раковая ткань (33 больных) M /U

значение р


MLH1

1/8
9/30
15/18
0,05
MGMT

2/7
12/27
19/14
0.01
DAPK-1

4/5
19/20
17/16
0,93
M
метилированный аллель, U
неметилированную аллель
двух основных гистологической классификации категорий - кишечные и диффузные типы опухолей - отражают дифференциацию опухоли и склонность раковых клеток к пролиферации и распространения , Таким образом, мы оценили возможные ассоциации между частотой распределений DAPK-1
, MLH1
и MGMT
метилирования и классификации морфологическое опухоли Лорен. Результаты представлены в таблице 3. Поскольку только небольшое количество пациентов имели гистологически подтвердили смешанного типа аденокарциномы согласно классификации Lauren (п
= 7), эта группа была назначена в более агрессивной форме диффузного заболевания. Таблица 3 Распределение MLH1, MGMT, DAPK-1
метилирование согласно месту локализации опухоли и патологических характеристик

MLH1 M /U


MGMT M /U


DAPK-1 M /U


Опухолевые гистологические параметры

Желудок верхней трети раковой ткани

Желудок средней трети раковая ткань

Желудок нижней трети раковая ткань

Желудок верхняя треть раковая ткань

Желудок средней трети раковая ткань

Желудок нижней трети раковая ткань

Желудок верхней трети раковой ткани

Желудок средней трети раковой ткани

Желудок нижней трети раковая ткань

Кишечный тип
0/3
6/16
7/10
1/2
5/17
8/11
3/0
12/10
10/7
Диффузный тип
1/5
3/14
8/8
1/5
7/10
11/5
1/5
7/10
7 /9
р
value
0.45
0.48
0.61
0.57
0.22
0.21
0.02
0.41
0.39
T1
0/1
1/2
2/4
0/1
1/2
4/2
1/0
2/1
4/2
T2
0/2
2/2
2/3
0/2
1/3
3/2
1/1
0/4
3/2
T3
0/2
5/11
8/9
1/1
4/12
10/7
1/1
6/10
7/10
T4
1/3
1/15
3/2
1/3
6/10
2/3
1/3
11/5
3/2
р
value
0.7
0.17
0.83
0.62
0.88
0.84
0.59
0.06
0.67
N0
0/4
5/9
6/4
2/2
4/10
5/5
3/1
4/10
6/4
N1
0/2
2/4
3/5
0/2
2/4
5/3
0/2
2/4
4/4
N2
0/2
1/6
3/2
0/2
1/6
3/2
1/1
2/5
1/4
N3
1/0
1/11
3/7
0/1
5/7
6/4
0/1
11/1
6/4
Значение р

0,29
0,33
0,48
0,36
0,66
0.95
0,27
0.01
0.46
M
метилированного аллеля , U
неметилированную аллель
по нашим данным, метилирование промотора
DAPK-1 был более частым в кишечном типа аденокарциномы желудка. Тем не менее, это всего лишь тенденция, потому что результаты не были статистически значимыми (р = 0,06
). Анализ подгруппы в соответствии с локализацией опухоли показал, что частота DAPK-1
метилирования промотора была в значительной степени связано с кишечным раковой ткани, когда опухоль была обнаружена в верхней трети желудка (р
= 0,02, таблица 3). Ни одна ассоциация не была выявлена ​​между метилирования MLH1
или MGMT
и типа опухоли по классификации Lauren.
Мы также проанализировали связь между частотой метилирования одних и тех же генов и опухолевой инвазии в стенку желудка (категория Т). Метилирование генов MLH1
и MGMT
не был связан с категорией T от TNM классификации раковой ткани в любой части желудка. Более частое метилирование DAPK-1
наблюдалась в поздних стадиях раковых заболеваний в средней трети желудка, но это не было статистически значимым (р = 0,06
), хотя эта тенденция следует изучить в будущем.
корреляция между промотора гена метилирования и поражения лимфатических узлов анализировали, но не выявили значимую связь между метилирования MLH1
и MGMT
промоутеров и статус опухолевого поражения лимфатических узлов. Тем не менее, связанных с апоптозом генов DAPK-1
был чаще метилируется в раковых тканях в категории N3 по классификации TNM (когда метастазы опухолей обнаруживается в ≥ 7 региональных лимфатических узлов), чем у тех, кто в N0-2 категория (р = 0,05
). Анализ подгрупп показал, что эта ассоциация была значительной только в раковых тканях средней трети желудка (р
= 0,01).
Когда опухоли были классифицированы в соответствии с системой TNM, мы не обнаружили никакой связи между метилирование этих генов и стадии опухоли. Однако более точный анализ подгрупп показал, что метилирование MLH1
промотора имели тенденцию быть более частыми в раковых тканей в средней трети желудка в стадии опухолей I-II стадии, чем в III опухоли (р <бр> = 0,06). Эпигенетические изменения в DAPK
гена были обнаружены значительно чаще в желудочном раковой ткани от средней трети желудка в стадии опухоли III, чем в стадии опухолей I-II (р = 0,05
).
Результаты нашего исследования показывают обратную корреляцию между метилирования MLH1
и MGMT
генов в раковых тканях желудка, когда опухоль была расположена в нижней трети желудка (коэффициент, -0,48; р = 0,01
). Обратная корреляция между метилирования DAPK
и MLH1
была также продемонстрирована в раковой ткани в средней трети желудка (коэффициент, -0,41; р = 0,01
).
Обсуждение <бр> MLH1

по данным литературы, частота MLH1
метилирования в раковых тканях желудка колеблется от 14 до 43% [12-16]. Эти большие различия в частоте MLH1
метилирование можно отнести к различным географическим регионам, в частности, рассматривались исследований. Анатомическое распределение желудка опухолевых участков, как известно, отличаются в разных географических регионах. В тех регионах, где заболеваемость H. Pylori
инфекции высока (Восточная Европа, Восточная Азия), noncardial или дистальный рак желудка диагностируется чаще всего. Тем не менее, в Западной и Северной Европе, где число H. pylori-
инфицированных людей довольно низок, число проксимальных рака желудка высока. В научной литературе сообщается, что метилирование MLH1
промотора в тканях рака желудка значительно, связанные с H. Pylori
фактора вирулентности, кодируемого геном vacs1
[21]. Этот ген, который, как правило, обнаруживается в бактериальный геном, провоцирует более ресурсоемких воспалительную реакцию и связано с повышенным риском развития рака желудка у больных с атрофическим гастритом [22]. Хроническое воспаление слизистой оболочки желудка, которое характеризуется слизистый инфильтрацией полиморфно-ядерных лейкоцитов, макрофагов и Т-и В-лимфоцитов, приводит к высвобождению активных форм кислорода (ROS) из активированных клеток воспаления. ROS вызывает повреждение ДНК и отсутствие надлежащей функции ремонта несоответствие системы [23]. Это многоэтапный процесс, который зависит от интенсивности воспаления. Метилирование MLH1
промотора происходит в поздней стадии атрофический гастрит, кишечная метаплазия [10, 24].
Эта закономерность подтверждается также данными из исследования пациентов из Западной и Северной Европы [13] , Почти одна треть пациентов были диагностированы с проксимального (кардиального) рака желудка, а частота MLH1
метилирования составила 14,2%. Это эпигенетическое изменение также чаще обнаруживается в дистальной желудка раковой ткани [13]. Результаты нашего исследования показывают, что возникновение MLH1
метилирования в желудка увеличивается ткани рака от верхней и средней трети желудка до нижней трети, и 11,1, 23,1 и 45,4%, соответственно. Как и в литературе, мы также показали, что эта эпигенетическое изменение происходит значительно чаще в нижней трети желудка, чем в ее проксимальной трети, и этот эффект более выражен в женской части населения. Причина различий, связанных с секс остается неясным, необходимы дальнейшие исследования.
Некоторые данные показали, что метилирование MLH1
промотор обнаруживается значительно чаще в кишечном типа раковых тканей желудка (по классификации Lauren) чем в диффузной типа [15, 16]. Наши результаты показывают, что распределение этого эпигенетического изменения является одинаковым во всех типах опухолей по классификации Lauren.
Мы не обнаружили существенной связи между метилирования MLH1
и Т и N критериев для раковых тканей в любой части желудок. Отдельный анализ по месту локализации опухоли показало, что эпигенетические изменения (MLH1
метилирование), как правило, чаще в раковой ткани от средней трети желудка, когда на стадии опухолей I-II стадии, чем в опухолях III (р <бр> = 0,06). Этот результат, возможно, не было статистически значимым, так как число пациентов с ранними стадиями заболевания была относительно невелика.
Мы не нашли никаких опубликованных анализ взаимосвязи между этим эпигенетические изменения и T, N и критерии стадии в соответствии с Место опухоли в желудке. Тем не менее, опубликованные данные свидетельствуют о том, что, в общем, метилирование MLH1
в раковых тканях обнаруживается чаще, когда региональные лимфатические узлы не участвуют [14].
MGMT

Скорость метилирования в УПР
промоутер в ткани опухоли, увеличилось с верхней до нижней трети желудка (22,2, 30,8 и 57,6%, соответственно), и этот эффект более выражен в мужской части населения. Причина различий, связанных с секс остается неясным, необходимы дальнейшие исследования. Согласно литературным данным, MGMT
метилирование в раковых тканях желудка колеблется от 7 до 61% [13, 25-28]. Это широкое изменение можно было бы объяснить тем, что этот эпигенетические изменения обнаруживается чаще в дистальных ткани рака желудка, чем в проксимальных участках [18, 29].
Мы не обнаружили каких-либо существенных связей между MGMT
метилирования промотора и Т и N критериев или гистологического типа опухоли по классификации Lauren в любом месте исследуемого желудка. Потеря функции MGMT белка связано с опухолью распространился на лимфатические узлы [14, 18] и поздних стадиях заболевания [18, 30]. В нашем исследовании, число больных с ранними стадиями заболевания была сравнительно невелика, которая могла бы объяснить наши выводы.
DAPK-1

В этом исследовании частота DAPK-1
метилирования промотора не коррелируют с локализацией опухоли. Опубликованные данные показывают, что ее частота изменяется от 22 до 91% [28, 31-36]. По нашим данным, метилирование промотора
DAPK-1 был более частым в кишечном типе аденокарциномы желудка. Тем не менее, это всего лишь тенденция, поскольку эти различия не были значимыми (р = 0,06
). Анализ подгрупп в зависимости от локализации опухоли показало, что частота DAPK
метилирования промотора была значительно выше в тканях кишечника раковыми в верхней трети желудка. Мы не нашли упомянутые в литературе между DAPK-1
метилирования промотора и классификации опухоли в соответствии с Lauren ассоциации. Наши результаты следует интерпретировать критически из-за небольшого числа пациентов в этой подгруппе.
Мы отметили незначительную тенденцию, в которой DAPK-1
метилирование выявлялась чаще в средней трети желудка в более поздних стадиях раковых заболеваний, в соответствии с критерий Т (р
= 0,06). Мы также обнаружили, что, когда связанных с апоптозом генов DAPK-1
метилировали в ткани опухоли, опухоль была более вероятно, будет Н3 по классификации TNM (метастазы опухолей найдены в ≥ 7 регионарных лимфатических узлов), чем N0-2 ( р
= 0,05) и быть продвинутым опухоли (стадия III, а не стадии I-II; р = 0,05
). Анализ подгрупп показал, что эта ассоциация встречается в раковых тканях средней трети желудка (р-0,01), но не имеет существенного значения на других участках желудка. В исследовании, опубликованном в 2010 году показал, что метилирование проапоптотического гена DAPK-1
в раковых тканях желудка связано с распространением опухоли в лимфатических узлах [37], но мы не нашли какой-либо информации в упомянутом исследовании связывания эти данные в различных участках рака желудка локализаций.
Корреляция между статусом метилирования анализируемых генов
взаимоотношений между промоторной метилирования различных генов в раковых тканях желудка исследовали наше исследование. эти корреляции зависят ли на месте опухоли? Мы не нашли никакой информации в научной литературе о соотношении MGMT
и MLH1
метилирования промоторов в желудке аденокарциномы тканей. Результаты нашего исследования свидетельствуют о том, что существует обратная корреляция между метилирования MLH1
и MGMT
в тканях рака, когда опухоль располагалась в нижней трети желудка (коэффициент, -0,48; р
= 0,01).
Эти результаты не удивительно, потому что метилирование обоих промоторов генов чаще обнаруживается в раковых тканях нижнего желудка [13, 29]. Тем не менее, белки, кодируемые действуют на разных стадиях канцерогенеза. MLH1
промотор метилирование чаще обнаруживается на ранних стадиях и в менее агрессивной опухоли желудка [12-16], в то время как MGMT
промотор метилирование более характерна поздней стадии аденокарциномы желудка и бедных прогнозов [18, 19] .
Более подробная информация доступна об ассоциации между промотором метилирования MLH1
и DAPK-1
. Высокая нестабильность микросателлитная обратно коррелирует с метилированием DAPK-1
промотора [12]. Наша исследовательская группа выявила обратное, хотя и слабой, корреляции между промоутером метилирования DAPK-1
и MLH1
, регулируя функцию микросателлитный, в раковых тканях желудка [20].
Мы также обнаружили, что эта корреляция происходит в средней трети желудка. Обратная корреляция между метилирования DAPK-1
и MLH1
также идентифицированы в раковых тканях, взятых из средней трети желудка. (Коэффициент, -0,41; р = 0,01
)
Удельная ограничение этого исследования заключается в том, что не было представлено никакой информации о экспрессии мРНК анализируемых генов. Наша команда планирует провести это с количественной ПЦР в будущем исследовании. Текущие результаты важны не только потому, что они расширяют наше понимание рака желудка, но и с клинической точки зрения. Существует растущее доказательств того, что метилирования гена в раковых тканях желудка связана с дифференциальной чувствительностью к химиотерапии. Метилирование MLH1
гена связана с устойчивостью к оксалиплатина химиотерапии на основе [38], а также у пациентов с DAPK-1
метилирования показать худший ответ на фторпиримидинов химиотерапии на основе [39].

Мы надеемся, что наше исследование приведет к лучшему пониманию различных путей молекулярного канцерогенеза в различных отделах желудка.
Заключение
Наши результаты исследования показывают, что эпигенетические процесс, метилирование промоторов генов, в раковой ткани зависит по месту нахождения опухоли желудка
Сокращения
п.н.:.
пар оснований


DAPK-1
:
смерть ассоциированных протеинкиназа 1


LUHSH:
Литовский университет наук о здоровье больницы


M:
метилированный аллель
<бр>
MGMT
:
O 6-метилгуанин-ДНК-метилтрансферазы


MC:
положительный метилированный управления


MC-:
отрицательный контроль метилированный


MLH1
:
MutL гомолога 1, рак толстой кишки, неполипозного 2-го типа (E. палочки
)


мРНК:
матричная РНК


MSP:
метилирование специфических полимеразная цепная реакция


ПЦР:
полимеразная цепная реакция


ROS:
активные формы кислорода


U :
неметилированной аллеля


UC:
положительный контроль неметилированным


UC-:
отрицательный контроль неметилированным

• Клинико-патологические характеристики и исходы лечения аденокарциномы напоминающий печеночную ткань желуд…
• Происхождение и эволюционная пластичность желудка слепой кишки у морских ежей (иглокожих: Echinoidea)