Gene metilációs profilját gyomor rákos szövet a daganat helyén a gyomorban

Gene metilációs profilját gyomor rákos szövet a daganat helyén a gyomorban katalógusa Abstract katalógusa Háttér katalógusa Jelentős információt a metilációs a promoter régiók különböző gének gyomor kialakulásában. Van azonban az információ hiánya, hogy ezt hogyan epigenetikus folyamat különbözik kiinduló daganatok különböző helyeken a gyomorban.
A vizsgálat célja az is, hogy értékelje a metilációs profilokat az MLH1 katalógusa, MGMT
, és DAPK-1 katalógusa gének rákos szövetekben különböző gyomor oldalakon. katalógusa módszerek katalógusa mintákat szerzett 81 szenvedők gyomor adenokarcinóma műtéten átesett gyomorrák a litván University of Health Sciences Kórház Kaunas klinikák 2009 -2012. Gene metiláció vizsgáltuk, metiláció-specifikus PCR-rel. A tanulmány által jóváhagyott litván Biomedical Research Etikai Bizottság. Katalógusa Eredmények katalógusa A frekvenciákat metiláció a rákos szövetekben a felső, középső és alsó harmada a gyomor volt 11,1, 23,1, és 45,4% -kal, a PMS1- katalógusa; 22,2, 30,8, és 57,6% -kal, az MGMT
; és 44,4, 48,7, és 51,5% -kal, az DAPK-1. PMS1- katalógusa és MGMT katalógusa metilációs figyeltek gyakrabban az alsó harmadában a gyomorban, mint a felső harmadában (p katalógusa < 0,05).
A középső harmadában, DAPK-1 katalógusa promoter metiláció kapcsolatban állt több előrehaladott betegségben a nyirokcsomókban (N2-3 képest N0-1 [p katalógusa = 0,02]) és a fejlett tumorstádium (színpad, hanem a III szakaszaiban I-II [p = katalógusa 0,05]). PMS1- katalógusa és MGMT katalógusa metiláció korrelált fordítottan amikor a daganat található, az alsó harmadában a gyomorban (együttható -0,48; p katalógusa = 0.01). DAPK-1 katalógusa és PMS1- katalógusa metiláció korrelált fordítottan tumorokban középső harmadában a gyomorban (együttható -0,41; p katalógusa = 0.01). Katalógusa Következtetés katalógusa gén promoter metiláció függ a gyomor tumor helyét. katalógusa Kulcsszavak katalógusa gyomorrák PMS1- katalógusa DAPK-1 katalógusa MGMT katalógusa Metiláció Háttér katalógusa gyomorrák komoly egészségügyi probléma. A rejtett klinikai haladás, a betegség azt jelenti, hogy ez a betegség jellemzően diagnosztizálták annak késői szakaszában, ami rossz prognózis, annak ellenére, hogy az új kezelési lehetőségek merültek utóbbi időben.
Több, mint 90% -át a gyomor rákos megbetegedések diagnosztizáltak adenocarcinoma [1 ]. 1965 óta, gyomor adenokarcinóma osztották két fő típusa van, a diffúz és a bél (a Lauren [2]). Ez a két szövettani típusnál különböznek etiológiájú és prognózisok. Vékonybél és a gyomor adenokarcinómája gyakran következménye a krónikus fertőzés Helicobacter pylori
, amikor a szokásos gyomornyálkahártya átalakul akut késői krónikus gastritis, az intesztinális metaplázia, és diszplázia [3]. Diffúz adenokarcinóma sokkal agresszívabb, mint a bél típusú, mert a kialakulása nem függ gastritis vagy metaplasia eljárások [4].
Legújabb tudományos adatok azt mutatják, hogy a prognózis a gyomor adenokarcinóma nem csak attól függ a szövettani típus, hanem a tumor helyen, a gyomorban. Proximal daganatok (származó cardia), amelyek általában válaszként gastrooesophagealis savas /epe reflux [5], melyek már különálló és agresszívebb formája gyomor adenokarcinóma, amelyek eltérnek a gyomor distalis tumorok. Katalógusa Amennyiben disztális gyomorrák sorolható egyedi? Kohorsz vizsgálatok kimutatták, hogy a kockázat a rosszindulatúvá válás előtti állapot, az úgynevezett "atrófiás gastritis, fejlődik a rák szerint változik a helyszín az elváltozás a gyomorban. A relatív kockázata gyomorrák előforduló betegek corpus-predomináns gasztritisz magasabb, mint azoknál, akik túlnyomórészt antrális gyomorhurut [6]. Vajon ez a tény jelzi a különböző rákkeltő folyamatokat a gyomorban antrumban és corpus? Nincsenek adatok sem zárják ki, vagy megerősíteni.
Epigenetikai módosítások központi szerepet játszanak a gyomor karcinogenezis [7]. Ezek a folyamatok, mint például a metiláció CpG-szigetek gén promoter régiókat, okozhat reverzibilis szerkezeti változások a DNS-t, amely viszont módosítja génexpresszió [8]. DNS metiláció akkor jelentkezik, amikor egy metilcsoport (-CH 3) át a 5 th helyzetét citozin [9].
Egy előző kísérleti tanulmány által a kutatócsoport kimutatta, hogy a frekvencia a metilezése a PMS1- katalógusa promoter különbözik a corpus és antrális gyomor szövetek által érintett pangastritis. Észrevettük, hogy ez a folyamat epigenetikai szignifikánsan gyakoribb az antrális gyomor szövetek, mint a corpus [10], míg a mértéke sorvadásos gyomorhurut hasonló mindkét régióban. Nem tisztázott, hogy ez a tendencia is igaz a rákos szövetekben.
Két géncsoportok választottak erre a metiiációs elemzésre. Az első csoport (MLH1
és MGMT
) tartalmaz két gén fehérjéket kódoló részt javításával mutációk és más DNS-léziók előtt a további sejtosztódást, és a második csoport tartalmaz egy tumor-visszaszorító gént (DAPK-1
) proteint kódoló apoptózist indukál jelenlétében súlyos genomiális hiba.
a MLH1 katalógusa (mutL homológja 1, vastagbélrák, nonpolyposis 2. típusú (E. coli
)) gén fordul elő a 3p21 0,3 locus. A gén által kódolt fehérje azonosítja a DNS hibák jelennek replikáció után. Hipermetilációja az MLH1 katalógusa promoter és nem mutáció által okozott változások a fehérje funkcióját, a felelős a mikroszatellita instabilitás gyomorrákban [11]. A szakirodalom szerint, MLH1
metiláció felelős a bél formájában gyomorrák és a korai szakaszában a betegség [12-16].
A funkciója MGMT (O 6-metilguanin-DNS- metiltranszferáz), hogy távolítsa el az alkil-csoportot a O 6 pozíciójában guanin [17]. Zavar az MGMT funkció okozhat a megjelenése mutációk. Tudományos közlemények jelzik, hogy a metilezést a MGMT katalógusa gén promotere az egyik patogenetikai utak gyomorrák. Különösen gén metiláció tulajdonítják az előrehaladott betegség [18], és az is tudható, hogy a szegényebb betegség prognózisa [19].
A DAPK-1 katalógusa (halál-asszociált protein kináz 1) gén egyike a három DAPK katalógusa család kódoló gének kalcium /kalmodulin-függő szerin-treonin protein-kinázok. A funkció a DAPK-1 fehérje szorosan összefügg a különféle apoptózis utak, és DAPK-1
hipermetiláció kimutatták, hogy előfordul a szilárd és hematológiai tumorokat.
Gyomorrák nem kivétel. Gén promoter metiláció is jellemző adenocarcinoma ezen a helyen. Egy korábbi vizsgálatban, a csoport talált egy fordított összefüggést DAPK-1 katalógusa és PMS1- katalógusa metiláció [20]. Teszteljük itt azt a hipotézist, hogy a különböző gén metilációs profilokat előforduló rákos szövetekben a gyomorban szerint a tumor helyére (felső, középső vagy alsó harmadában). Katalógusa Módszerek katalógusa A tanulmány által jóváhagyott litván Regionális Biomedical kutatási Etikai Bizottság. Minden beteg írásos beleegyezését formában. Kezelt betegeknél a litván University of Health Sciences Hospital (LUHSH) Kaunas klinikák 2009-2012 vett részt a vizsgálatban. Gyomor szöveti mintát vettünk minden témában morfológiailag megerősítette szakasz I-III adenocarcinoma. A vizsgálati populáció 81 beteg (34 férfi és 47 nő), a medián életkora 68 év volt (tartomány 23-87 év; szórás [SD] 11,75). A daganatok kilenc beteg a felső harmadában a gyomor, azokat 39 beteg volt a középső harmadában, illetve 33 beteg volt, az alsó harmadában a gyomorban. A gyomor szöveti mintákat gyűjtöttünk a tumor a műtét során. Ezeket az anyagokat azonnal lefagyasztottuk folyékony nitrogénben, és -80 ° C-ig elemzést. A vizsgálat során a betegek klinikai adatok (életkor a diagnózis, nem) és morfológiai adatok (tumor invázió szerint a TNM osztályozás, szövettani típus szerint Lauren osztályozás és mértéke szerinti differenciálás az Egészségügyi Világszervezet besorolása) kaptuk orvosi feljegyzések.
metiiációspeeifikus polimeráz láncreakció (MSP) katalógusa DNS-t extraháltunk 25-30 mg fagyasztott szövetet a ZS genomi DNS ™ Tissue Mini Prep Kit (Zymo Research, USA) szerint a gyártó utasításait. A metilációs állapotát a MLH1 katalógusa, MGMT
, és DAPK-1
promoterek határoztuk kezelve a DNS-t hidrogén-szulfit, a EZ DNS metiláció Arany Kit ™ (Zymo Research) szerint a gyártó utasításai . Humán genomi DNS perifériás vérből limfocitákat, kezelt biszulfit, használtuk negatív kontrollként. Humán genomiális DNS-kezelt in vitro
a SSSI metiltranszferáz (New England Biolabs, Egyesült Királyság) alkalmaztunk pozitív kontrollként. A metilációs állapotát a promoterek mutattuk MSP.
A primerek a metilált és metilálatlan DNS-szekvenciákat az 1. táblázatban felsorolt ​​PCR-t végeztünk egy teljes reakció-térfogat 20 jil, amely 10 ul Maxima® Meleg indítás PCR master Mix Hot Start Taq
DNS-polimerázt (Thermo Fisher Scientific, USA) és 10 uM mindegyik primerből (Metabion International AG, Németország). MSP végeztük 38-40 ciklus követett denaturálással 94 ° C-on 30 s, izzítás 1 percen át a hőmérséklet megfelelő az egyéni gén, és kiterjesztés 72 ° C-on 1 percig. A PCR-termékeket elkülönítettük 3,5% -os agaróz-gél-elektroforézissel (ábra. 1). Ha mindkét denaturált és metilálatlanok jelek jelentek meg a gél, a gén ítélték methylated.Table 1 alapozók használt MSP katalógusa Primer név Matton Előre szekvencia katalógusa
Fordított sorrendben katalógusa
Hivatkozási szám Matton PMS1- katalógusa denaturált katalógusa TATATCGTTCGTAGTATTC [GenBank: NG_0071092] katalógusa TCCGACCCGAATAAACC katalógusa [40] katalógusa PMS1- katalógusa metilálatlanok katalógusa TTTTGATGTAGATGTTTTATTAGGGT [GenBank: NG_0071092 ] katalógusa TACCACCTCATCATAACTACC katalógusa [40] katalógusa MGMT katalógusa denaturált katalógusa TTTCGACGTTCGTAGGTTTTCGC [GenBank: NG_000010.11] katalógusa GCACTCTTCCGAAAACGAAAC G katalógusa [40] katalógusa MGMT
metilálatlanok
TTTGTGTTTTGATGTTTGTAGGTTTTTGT [GenBank: NG_000010.11] katalógusa AACTCCACACTCTTCCAAAAACAAAACA katalógusa [40] katalógusa DAPK-1 katalógusa metilezett katalógusa GGATAGTCGGATCGAGTTAACGTC [GenBank: NG_029883.1] katalógusa CCCTCCCAAACGCCG Egy fiatal [ ,,,0],40] katalógusa DAPK-1 katalógusa metilálatlanok katalógusa GGAGGATAGTTGGATTGAGTTAATGTT [GenBank: NG_029883.1] katalógusa CAAATCCCTCCCAAACACCAA katalógusa [40] katalógusa bp katalógusa bázispár katalógusa ábra. 1 reprezentatív mintáit MSP elemzés DNS vett minták gyomorrák szövetekből
matematikai-statisztikai adatelemzés
Statisztikai adatok analízist végeztünk az SPSS Statisztika 19 szoftvercsomag (IBM SPSS Inc., USA). Mennyiségi tulajdonságok írtak le a számtani átlag és a szórás. Student-féle t-próba katalógusa használták, hogy ellenőrizze azt a hipotézist, egyenlő módon. A χ katalógusa 2 feltétel és Fisher-féle egzakt tesztet ellenőrzésére használt statisztikai hipotézis függetlenségének két változó. Összefüggések a változók kiszámításával értékeltük Spearman féle együttható. p katalógusa < 0,05 jelentősnek tekinthető. Katalógusa Eredmények katalógusa A frekvenciái promoter metiláció a rákos szövetekben a felső, középső és alsó harmada a gyomor volt 11,1, 23,1, és 45,4% -kal, az MLH1 katalógusa gén; 22,2, 30,8, és 57,6% -kal, az MGMT
gén; és 44,4, 48,7, és 51,5% -kal, a DAPK-1
gént. Metilálása a MLH1
és MGMT
gének volt megfigyelhető gyakrabban az alsó harmadában a gyomorban, mint a felső harmadik (p
< 0,05).
A részletes adatokat a 2. táblázatban megadott . a nemi alapú alcsoport analízis kimutatta, hogy MLH1 katalógusa metiláció a rákos szövetekben az alsó harmada gyomor jellemző volt a női lakosság (p katalógusa = 0.01), míg a MGMT katalógusa metiláció csak statisztikailag szignifikáns a hím csoportban (p = katalógusa 0,03). Ennek okait eredmények nem egyértelműek, és a szükséges részletes elemzése és a további vizsgálatok. A promoter metiláció a vizsgált gének nem volt összefüggésben a betegre age.Table 2 megoszlása ​​PMS1-, MGMT katalógusa, és DAPK-1 katalógusa metiláció rákos gyomor szövetekben szerint gyomor helyén
Gyomor felső harmadában rákos szövet (9 beteg) M /U Matton gyomor középső harmada rákos szövet (39 beteg) M /U Matton gyomor alsó harmada rákos szövet (33 beteg) M /U katalógusa
p
érték Matton PMS1- Matton 1/8 katalógusa 30/09 katalógusa 15/18 katalógusa 0,05 katalógusa MGMT Matton 07/02 katalógusa 12/27 katalógusa 19/14 katalógusa 0,01 katalógusa DAPK-1 Matton 05/04 katalógusa 19/20 katalógusa 17/16 katalógusa 0,93
M
metilezett allél, U
metilálatlan allél katalógusa a két fő szövettani osztályozás kategóriák - intesztinális és diffúz típusú tumorok - tükrözi a differenciálódás a tumor és az a tendencia a rákos sejtek szaporodását és terjedését . Ezért megvizsgáltuk a lehetséges összefüggést a gyakorisági eloszlását, DAPK-1 katalógusa, PMS1- katalógusa, és MGMT katalógusa metiláció és a Lauren morfológiai tumor besorolás. Az eredményeket a 3. táblázatban mutatjuk be mert csak egy kis számú betegnél szövettanilag igazolt kevert típusú adenocarcinoma szerint Lauren besorolás (N
= 7), ez a csoport volt rendelve a agresszívebb diffúz formában a betegség. 3. táblázat megoszlása ​​PMS1-, MGMT, DAPK-1 katalógusa metiláció a daganat helyén és patológiai jellemzői
PMS1- M /U
MGMT M /U katalógusa
katalógusa DAPK-1 M /U
tumor szövettani paraméterek
gyomor felső harmada rákos szövet Matton gyomor középső harmadában rákos szövetek katalógusa
Gyomor alsó harmada rákos szövet Matton gyomor felső harmada rákos szövet Matton gyomor középső harmadában rákos szövet Matton gyomor alsó harmada rákos szövet Matton Gyomor felső harmada rákos szövet Matton gyomor középső harmadában rákos szövet Matton gyomor alsó harmada rákos szövet Matton intesztinális típusú katalógusa 0/3 katalógusa 16/06
10/07
1/2 katalógusa 17/05 katalógusa 11/08 katalógusa 3/0 katalógusa 10/12 katalógusa 07/10 katalógusa diffúz típusú katalógusa 05/01 katalógusa 14/03 katalógusa 8/8 katalógusa 05/01 katalógusa 10/07 katalógusa 05/11 katalógusa 05/01 katalógusa 10/07 katalógusa 7 /9 katalógusa p katalógusa value
0.45
0.48
0.61
0.57
0.22
0.21
0.02
0.41
0.39
T1
0/1
1/2
2/4
0/1
1/2
4/2
1/0
2/1
4/2
T2
0/2
2/2
2/3
0/2
1/3
3/2
1/1
0/4
3/2
T3
0/2
5/11
8/9
1/1
4/12
10/7
1/1
6/10
7/10
T4
1/3
1/15
3/2
1/3
6/10
2/3
1/3
11/5
3/2
p katalógusa value
0.7
0.17
0.83
0.62
0.88
0.84
0.59
0.06
0.67
N0
0/4
5/9
6/4
2/2
4/10
5/5
3/1
4/10
6/4
N1
0/2
2/4
3/5
0/2
2/4
5/3
0/2
2/4
4/4
N2
0/2
1/6
3/2
0/2
1/6
3/2
1/1
2/5
1/4
N3
1/0
1/11
3/7
0/1
5/7
6/4
0/1
11/1
6/4
p katalógusa érték katalógusa 0,29 katalógusa 0.33 katalógusa 0.48 katalógusa 0.36 katalógusa 0.66 katalógusa 0.95 katalógusa 0,27 katalógusa 0.01 katalógusa 0.46 katalógusa M katalógusa denaturált allél U
metilálatlanok allél katalógusa a mi adataink szerint, metiláció a DAPK-1 katalógusa promoter gyakoribb volt intesztinális típusú gyomor adenokarcinóma. Ez azonban csupán egy tendencia, mert az eredmények nem voltak statisztikusan szignifikáns (p
= 0,06). Alcsoport elemzést szerint a daganat helyét kiderült, hogy a frekvencia DAPK-1 katalógusa promoter metiláció szignifikáns összefüggést a bél rákos szövet, amikor a daganat kimutatható volt a felső harmadában a gyomorban (p = 0,02 katalógusa; táblázat 3). Nem egyesület azonosították között metilációját MLH1 katalógusa vagy MGMT katalógusa, és a daganat típusa szerint Lauren besorolás. Katalógusa Vizsgáltuk az összefüggést a metilációs gyakorisága azonos gének és a tumor behatolt a gyomor falán (T kategória). A metiláció gének PMS1- katalógusa és MGMT katalógusa nem járt együtt a T kategóriában a TNM besorolás a rákos szövet bármely része a gyomor. Gyakoribb metiláció a DAPK-1 katalógusa volt megfigyelhető az előrehaladott tumoros középső harmadában a gyomor, de ez nem volt statisztikailag szignifikáns (p = 0,06 katalógusa), bár ez a tendencia meg kell vizsgálni a jövőben.
a korreláció gén promoter metiláció és nyirokcsomó-érintettség elemezték, de nem mutatott szignifikáns összefüggést a metilációs az MLH1 katalógusa és MGMT katalógusa promóterek és a tumor nyirokcsomó-státusz. Azonban az apoptózis kapcsolatos gén DAPK-1 katalógusa ben gyakrabban metilezzük a rákos szövetekben a N3 kategória a TNM osztályozás (amikor a daganat áttétet található ≥ 7 regionális nyirokcsomók), mint azokban a N0-2 kategória (p katalógusa = 0.05). Egy alcsoport analízis azt mutatta, hogy ez az összefüggés csak jelentős a rákos szövetekben a középső harmadában a gyomorban (p katalógusa = 0.01).
Amikor a daganat szerint osztályoztuk a TNM rendszer nem találtunk összefüggést a metilációs ezen gének és a tumor szakaszban. Azonban pontosabb elemzést az alcsoportok kimutatta, hogy a metilációs az MLH1 katalógusa promoter jellemzően gyakrabban rákos szövetekben középső harmadában a gyomor I-II daganatok, mint a színpadi III daganatok (p
= 0,06). Epigenetikai változások a DAPK katalógusa gént szignifikánsan gyakrabban a gyomor rákos szövetet a középső harmadában a gyomor III-as stádiumú tumorokban, mint a I-II daganatok (p katalógusa = 0.05).
Az eredmények Vizsgálatunk azt mutatják, fordított korrelációt a metilációs az MLH1 katalógusa és MGMT katalógusa gének gyomorrák szövetekben amikor a daganat található, az alsó harmadában a gyomorban (együttható -0,48; p = 0.01 katalógusa ). Egy fordított korrelációt metilációját DAPK katalógusa és PMS1- katalógusa is kimutatta a rákos szövet középső harmadában a gyomor (együttható -0,41; p katalógusa = 0.01). Katalógusa Vita
PMS1-
a szakirodalom szerint, a gyakorisága MLH1 katalógusa metiláció a rákos szövetekben gyomor mozog 14-43% [12-16]. Ezek nagy mértékben eltérnek a gyakorisága MLH1 katalógusa metiláció tudható be a különböző földrajzi térségek tekinthetők különösen a tanulmányok. Az anatómiai megoszlása ​​gyomor tumor oldalak ismert, hogy különböznek egymástól a különböző földrajzi régiókban. Azokban a régiókban, ahol az előfordulási H. pylori fertőzés katalógusa magas (Kelet-Európa, Kelet-Ázsia), noncardial vagy distalis gyomorrák diagnosztizálnak a leggyakrabban. Ugyanakkor Nyugat- és Észak-Európában, ahol a szám a H. pylori katalógusa fertőzött emberek meglehetősen alacsony száma, a proximális gyomor rák magas. A tudományos szakirodalomban leírtak, hogy a metilezést a MLH1 katalógusa promoter gyomorrák szövetekben jelentősen összefügg a H. pylori
virulencia faktor által kódolt vacs1
gén [21]. Ez a gén, amely tipikusan kimutatható a bakteriális genomban, provokál egy több-intenzív gyulladásos válasz és kapcsolatban van a fokozott kockázatát gyomorrák betegeknél atrófiás gastritis [22]. A krónikus gyomor- nyálkahártya-gyulladás, amelyet az jellemez, a nyálkahártya infiltrációja polimorfonukleáris leukociták, makrofágok, és a T és B limfociták, vezet a kibocsátás a reaktív oxigén (ROS) aktivált gyulladásos sejtek. ROS DNS-károsodást okoznak és hiányzik a megfelelő funkciót a mismatch repair rendszer [23]. Ez egy olyan többlépéses folyamat, amely attól függ, hogy az intenzitás a gyulladás. A metiláció az MLH1 katalógusa promoter előfordul egy késői szakaszában az atrophiás gastritis, intestinalis metaplasia [10, 24].
Ez következetes mintát is támogatja egy olyan vizsgálat a betegek a nyugati és észak-európai [13] . Közel egyharmada a betegnél a proximális (szívizom) gyomorrák, és gyakoriságát MLH1 katalógusa metiláció 14,2% volt. Ez epigenetikus változás is gyakrabban kimutatható disztális gyomor rákos szövet [13]. A vizsgálati eredmények azt mutatják, hogy az esemény a MLH1 katalógusa metiláció gyomorrákban szövetben növekszik a felső és középső harmadában a gyomor alsó harmadában volt, és 11,1, 23,1 és 45,4% volt. Amint az irodalomban, azt is megmutatta, hogy ez epigenetikai változás történik lényegesen gyakrabban az alsó harmadában a gyomor, mint a közelebbi harmadik, és ez a hatás sokkal kifejezettebb a női populációban. Ennek oka az a szex különbségeket nem tisztázott, további vizsgálatokra van szükség.
Egyes adatok arra utalnak, hogy a metilációs az MLH1 katalógusa promoter szignifikánsan gyakrabban a bél típusú rákos gyomor szövetek (a Lauren besorolás) mint a diffúz típusú [15, 16]. Eredményeink azt mutatják, hogy az eloszlás ezen epigenetikus változás hasonló volt a tumor típusok szerint Lauren osztályozás. Katalógusa Nem találtunk szignifikáns összefüggést a metilációját MLH1 katalógusa és a T és N kritériumok rákos szövetekben bármely részén a gyomor. Külön elemzés szerint a tumor helyére azt mutatta, hogy az epigenetikai változás (PMS1- katalógusa metiláció), inkább a gyakoribb rákos szövetet a középső harmadában a gyomorban, amikor az I-II daganatok, mint a színpadi III daganatok (p
= 0,06). Ez az eredmény nem lett volna statisztikailag jelentős, mert a betegek száma a betegség korai fázisában viszonylag kicsi volt. Katalógusa Találtunk nem megjelent elemzése a kapcsolat e epigenetikai változások és a T, N és színpadi szempontok szerint tumor helyén a gyomorban. Azonban publikált adatok azt mutatják, hogy általában, a metilezése MLH1
rákos szövetekben észlelhető gyakrabban, ha a regionális nyirokcsomók nem vesznek részt [14].
MGMT
Az arány a metilezése az MGMT katalógusa promoter a rákos szövetekben megnövekedett a felső az alsó harmadában a gyomor (22.2, 30.8, és 57,6% -kal), és ez a hatás sokkal kifejezettebb a férfi lakosság. Ennek oka az a szex különbségeket nem tisztázott, további vizsgálatokra van szükség. A szakirodalom szerint, MGMT
metilezés rákos gyomor szövetek között mozog 7-61% [13, 25-28]. Ez a széles variáció azzal a ténnyel magyarázható, hogy ez a epigenetikai változást észlel gyakrabban gyomor distalis rákos szövetet, mint közelebbi oldalak [18, 29]. Katalógusa nem találtunk szignifikáns összefüggést MGMT katalógusa promoter metiláció és a T és N kritériumok vagy a szövettani típusú daganat szerint Lauren osztályozás bármely vizsgált gyomor oldalon. A veszteség a MGMT protein funkció összefüggésben áll a daganat átterjedt a nyirokcsomók [14, 18] és a fejlett szakaszában a betegség [18, 30]. Tanulmányunkban a betegek száma a betegség korai fázisában viszonylag gyenge volt, ami megmagyarázza a megállapításokat. Katalógusa DAPK-1 Matton Ebben a vizsgálatban a gyakorisága DAPK-1 katalógusa promoter metiláció nem korrelált a tumor helyét. Publikált adatok azt mutatják, hogy a frekvencia változik 22-91% [28, 31-36]. Adataink szerint, metiláció a DAPK-1 katalógusa promoter gyakoribb volt a bél típusú gyomor adenokarcinóma. Ez azonban csupán a tendencia, mert a különbség nem volt szignifikáns (p = 0,06 katalógusa). Alcsoport elemzést szerint a daganat helyét mutatta, hogy a frekvencia DAPK katalógusa promoter metiláció szignifikánsan magasabb volt a bél rákos szövetekben a felső harmadában a gyomor. Nem találtunk egyesületek említett irodalom között DAPK-1 katalógusa promoter metiláció és a tumor besorolás szerint Lauren. Eredményeink kell értelmezni kritikusan, mert a kevés beteg ebben az alcsoportban. Katalógusa Megfigyeltük marginális trend, amelyben DAPK-1 katalógusa metiláció mutattunk gyakrabban középső harmadában a gyomor fejlettebb daganatok szerint a T kritérium (p = 0,06 katalógusa). Azt is tapasztaltuk, hogy ha a apoptózissal kapcsolatos gén DAPK-1
metileztük a rákos szövetekben, a tumor sokkal valószínűbb, hogy N3 a TNM osztályozás (tumor-metasztázisok talált ≥ 7 regionális nyirokcsomók), mint N0-2 ( p katalógusa = 0,05), valamint, hogy egy fejlett tumor (stage III helyett szakaszok I-II; p katalógusa = 0.05). Egy alcsoport-analízis azt mutatta, hogy ez a társulás fordul elő rákos szövetekben a középső harmadában a gyomor (p-0,01), de nem szignifikáns más gyomor oldalakon. A tanulmány kimutatta, hogy 2010 a metiláció a pro-apoptotikus gén DAPK-1 katalógusa rákos gyomor szövetekben kapcsolódik a tumor átterjedt a nyirokcsomók [37], de nem találtunk semmilyen információt az említett tanulmány összekötő ezek az eredmények a különböző oldalakon a gyomorrák lokalizációban.
közötti korreláció metilációs állapotát a vizsgált gének
közötti kapcsolatokat a promóter metilációs a különböző gének gyomorrák szöveteket vizsgáltak a tanulmány. Vajon ezek a korrelációk függenek a tumor helyén? Találtunk nincs információ a tudományos szakirodalomban a korreláció az MGMT katalógusa és PMS1- katalógusa promoter metiláció gyomor adenokarcinóma szövetekben. A vizsgálati eredmények azt mutatják, hogy volt egy fordított korrelációt metilációját MLH1 katalógusa és MGMT katalógusa rákos szövetekben, amikor a daganat található, az alsó harmadában a gyomorban (együttható -0,48; p katalógusa = 0,01).
Ezek az eredmények nem meglepőek, mert a metilezése mindkét gén promoterek gyakrabban érzékel az alsó gyomor rákos szövetekben [13, 29]. Azonban a kódolt fehérjék aktus különböző szakaszaiban kialakulásában. MLH1
promoter metiláció gyakrabban kimutatható a korai szakaszában, és a kevésbé agresszív a gyomor tumorok [12-16], mivel MGMT
promoter metiláció inkább jellemző a késői stádiumú gyomor adenokarcinómája és a gyenge prognózis [18, 19] .
További információ áll rendelkezésre az összefüggést a promóter metilációs a PMS1- katalógusa és DAPK-1 katalógusa. Nagy mikroszatellita instabilitás fordított arányban van a metilezése a DAPK-1
promóter [12]. A kutatócsoport azonosított egy inverze, bár gyenge, korreláció a promoter metiláció a DAPK-1 katalógusa és PMS1- katalógusa szabályozó mikroszatellit funkció, a rákos szövetekben gyomor [20]. Katalógusa Azt is megállapították, hogy ez a korreláció jelentkezik középső harmadában a gyomor. Fordított korrelációt metilezése DAPK-1 katalógusa és PMS1- katalógusa is azonosították rákos szövet mintavétel középső harmadában gyomor (együttható -0,41; p katalógusa = 0.01).
A konkrét korlátozása ennek a tanulmánynak, hogy nincs információ a mRNS expressziója a vizsgált gének biztosított. A csapat azt tervezi, hogy vállalja ezt a kvantitatív PCR egy későbbi tanulmány. A jelenlegi eredmények nemcsak azért fontos, mert mélyebben megérthetjük a gyomor carcinogenesis, hanem a klinikai szempontból. Van egy egyre több bizonyíték, hogy gén metiláció rákos gyomor szövetekben kapcsolatos differenciális érzékenység kemoterápia. Metiláció az MLH1 katalógusa gén kapcsolódik ellenállás oxaliplatin-alapú kemoterápiával [38], és a betegek DAPK-1 katalógusa metiláció mutatnak rosszabb válasz fluoropirimidin alapú kemoterápia [39]. Matton Reméljük, hogy a tanulmány vezet jobb megértéséhez a különböző utak molekuláris karcinogene- különböző részein a gyomrot. katalógusa Következtetés
a tanulmány eredményei azt mutatják, hogy az epigenetikus folyamat, a metilációs gén kezdeményezői rákos szövet függ a helyét a gyomor tumor. katalógusa rövidítések katalógusa bp: bázispár katalógusa
DAPK-1 katalógusa:
halál-asszociált protein kináz 1
LUHSH: katalógusa litván University of Health Sciences Kórház
M: katalógusa denaturált allél katalógusa
katalógusa MGMT katalógusa:
O 6-metilguanin-DNS-metil
MC: katalógusa pozitív denaturált kontroll katalógusa
MC-: katalógusa negatív denaturált kontroll
PMS1- katalógusa:
mutL homológ 1, vastagbélrák, nonpolyposis 2-es típusú (E. coli katalógusa)
mRNS: hírvivő RNS katalógusa
MSP: katalógusa metiláció-specifikus polimeráz láncreakció katalógusa Matton PCR: katalógusa polimeráz láncreakció
ROS: katalógusa reaktív oxigéngyökök
U
metilálatlanok allél
UC: katalógusa pozitív metilálatlanok kontroll
UC-: katalógusa negatív metilálatlanok kontroll katalógusa

• Klinikopatológiai jellemzőit és a kezelés eredményeit hepatoid adenocarcinoma a gyomor, egy ritka, de egyedi altípusa, gyomorrák
• Eredeti és evolúciós plaszticitás a gyomor vakbél a tengeri sün (Echinodermata: Echinoidea)