Gene metiliranje profil želučane kanceroznog tkiva prema tumora stranice u stomach

gen metilacije profil želučane kanceroznog tkiva prema tumora mjestu u želucu
apstraktna pregled Pozadina pregled postoji znatan informacije o metilaciju regije promotora različitih gena koji su uključeni u želučanom karcinogeneze. Međutim, postoji nedostatak informacija o tome kako to epigenetičko proces se razlikuje u tumorima koje nastaju na različitim mjestima u želucu.
Cilj ovog istraživanja je procijeniti metilaciju profile MLH1 Netlogu, MGMT
, i DAPK-1 pregled geni u kancerogenih tkiva iz različitih želučanih mjestima. pregled metoda
Uzorci su dobiveni iz 81 pacijenata oboljelih želuca adenokarcinom koji je operiran zbog karcinoma želuca u litavskom Sveučilišta Health Sciences bolnica Kaunas klinike u 2009. godini -2012. Gene metilacije se ispitaju metilacije specifičan PCR. Istraživanje je odobreno od strane Litvanski Biomedical Research etičkog povjerenstva. | Rezultati
frekvencijama metilacije u kancerogenih tkiva iz gornje, srednje i donje trećine želuca bila 11.1, 23.1, i 45.4%, odnosno, za MLH1 pregled; 22,2, 30,8 i 57,6%, odnosno, za pregled MGMT; i 44,4, 48,7 i 51,5%, odnosno, za DAPK-1. MLH1 pregled and MGMT pregled metilacije zabilježeno je češće u donjoj trećini trbuhu nego u gornjoj trećini (p Netlogu < 0,05).
Na srednjoj trećini, DAPK-1 pregled promotor metilacije se odnose na više-uznapredovale bolesti u limfnim čvorovima (N2-3 u usporedbi s N0-1 [p Netlogu = 0,02]) i uznapredovalom stadiju tumora (stadij III umjesto faze i-II [p pregled = 0,05]). MLH1 pregled and MGMT pregled metilacije korelaciji obrnuto, kada je tumor bio smješten u donjoj trećini želucu (koeficijent, -0,48; p
= 0,01). DAPK-1 pregled and MLH1 pregled metilacije u korelaciji je obrnuto kod tumora u srednjoj trećini želuca (koeficijent, -0,41; p
= 0,01). Pregled Zaključak pregled gena promotora metilacije ovisi o želučani lokacija tumora. pregled Ključne riječi pregled, raka želuca MLH1 pregled DAPK-1 pregled MGMT pregled Metilacija Pozadina pregled, raka želuca je ozbiljan zdravstveni problem. Skriveni klinički tijek bolesti znači da je ta bolest obično se dijagnosticira u svojim kasnim fazama, što dovodi do slabe prognoze, bez obzira na nove mogućnosti liječenja koje su se pojavile u zadnje vrijeme.
Više od 90% karcinoma želuca dijagnosticira kao adenokarcinoma [1 ]. Od 1965, želuca adenokarcinom je podijeljen u dva glavna tipa, difuzno i ​​crijevna (prema Lauren [2]). Ove dvije histološka tipa razlikuju u svojoj etiologiji i prognoze. Crijevnih i želučanih adenokarcinoma su često posljedica kronične infekcije s Helicobacter pylori pregled, kada je normalno želučane sluznice pretvara u akutnim krajem kronični gastritis, crijevne metaplazije i displazije [3]. Difuzna adenokarcinom je agresivniji od crijevne tipa, jer je njegova tvorba ne ovisi o gastritisa ili metaplazije procesa [4].
Zadnjih znanstveni podaci pokazuju da je prognoza želučanog adenokarcinoma ne ovisi samo o njegovoj histološki tip, ali i na lokacije tumora u želucu. Proksimalni tumori (podrijetlom iz kardija), koji se obično stvaraju kao odgovor na gastroezofagealni kiselina /žuč refluks [5], sada su odvojeni kao zasebne i agresivnog oblika želučanog adenokarcinoma, koje se od distalnih tumora želuca. Pregled trebao distalnog rak želuca biti klasificiran kao jedinstvena? Kohortne studije su pokazale da je rizik od premalignog stanju, pod nazivom 'atrofični gastritis', razviti u rak razlikuje se ovisno o mjestu lezije u želucu. Relativni rizik od karcinoma želuca javljaju u bolesnika s corpus-dominantnim gastritis je veća nego u onih s pretežno antralnim gastritis [6]. Da li ta činjenica ukazuje različite kancerogene procese u želucu antruma i korpusa? Nema podataka u bilo isključiti ili potvrditi.
Epigenetske izmjene igraju središnju ulogu u želučanom karcinogeneze [7]. Ovi procesi, kao što je metilacijom CpG otoka gen promotorska područja, uzrokuju reverzibilna strukturne promjene u DNA, koja je pak mijenjaju ekspresiju gena. [8] DNA metilacije događa kada je metilna skupina (-CH 3) prenosi se na 5 th položaj citozina [9].
Prethodnog pilot studija u našim istraživanjima skupine pokazala je da je frekvencija metiliranje MLH1 pregled promotor razlikuje u korpusu i sekundarnom želučanog tkiva pogođene pangastritis. Primijetili smo da je ovaj epigenetičko proces je znatno češća u antralnim gastritisa tkivima nego u korpusu [10], dok je stupanj atrofični gastritis je slična u obje regije. Nejasno je da li ta tendencija je također vrijedi i kancerogenih tkiva.
Dvije skupine gena su odabrani za ovaj metilacije analizu. Prva grupa (MLH1 pregled i MGMT pregled) sadrži dva gena koji kodiraju proteine ​​koji su uključeni u popravak mutacija i drugih DNK lezija prije daljnje diobe stanica, a druga grupa sadrži gen tumora supresije (DAPK-1
) koja kodira protein koji inducira apoptozu u prisutnosti jake genomske defekta.
MLH1 pregled (mutL homolognog 1, rak debelog crijeva, tip nonpolyposis 2 (E. coli pregled)) gena odvija na 3p21 .3 mjesto. Protein gen kodiran identificira DNK pogreške koje se pojavljuju nakon replikacije. Hipermetilacija od MLH1 pregled, promotora, a ne mutacije uzrokovane promjenama u funkciju proteina, je odgovoran za mikrosatelitne nestabilnosti u rakom želuca [11]. Prema literaturi, MLH1 pregled metilacije je odgovoran za crijevni oblik raka želuca i ranom stadiju bolesti [12-16].
Funkciju MGMT (O 6-methylguanine-DNA- mctiltransfcrazu) je uklanjanje alkil skupina iz o 6 položaju gvanin [17]. Poremećaj funkcije MGMT može uzrokovati pojavu mutacija. Znanstvene publikacije pokazuju da Metiliranje MGMT pregled promotora gena je jedan od patogenetskih putova u raka želuca. Konkretno, gen metilacije se pripisuje naprednom stadiju bolesti [18], a također se pripisuje prognozu siromašnija bolesti [19].
DAPK-1
(smrt povezana s protein-kinaze 1) gena je jedan od tri DAPK pregled obitelji gena koji kodiraju o kalcij /kalmodulinu ovisan serin-treonin protein kinaza. Funkcija DAPK-1 proteina je usko povezana s različitim apoptoze putovima i DAPK-1 pregled Hipermetilacija je pokazano da se pojavljuju u čvrste i hematološke tumore.
Želučani rak nije iznimka. Gene promotor metilacije je također tipično za adenokarcinoma u ovom mjestu. U ranijem istraživanju, naša grupa je pronašao obrnutu povezanost između DAPK-1 Netlogu i MLH1 pregled metilacije [20]. Mi smo testirali tu hipotezu da različiti gen metilacije profili pojaviti u kancerogenih tkiva u želucu prema mjestu tumora (gornji, srednji ili niži treći). Pregled Metode
studija je odobren od strane litvanskog regionalnog Biomedical Etičko povjerenstvo istraživanja. Svi su bolesnici potpisali obrazac informiranog pristanka. Bolesnici liječeni u litavskom University of Sciences bolnice zdravstvu (LUHSH) Kaunas klinike u 2009-2012 su sudjelovali u istraživanju. Uzorci Želudac tkiva uzeti su iz svih predmeta s morfološki potvrdio faza I-III adenokarcinoma. Istraživanje populacija sastojala se od 81 bolesnika (34 muškaraca i 47 žena) s medijanom dobi od 68 godina (raspon 23-87 godina; standardna devijacija [SD] 11,75). Tumori devet pacijenata su u gornjoj trećini želuca, oni od 39 pacijenata bila je u srednjoj trećini, a oni od 33 pacijenata bila je u donjoj trećini želuca. Uzorci tkiva želuca su prikupljeni iz tumorskih mjestima tijekom operacije. Ovi materijali su odmah zamrznute u tekućem dušiku i pohranjeni na -80 ° C do analize. Tijekom istraživanja, dobiveni su klinički podaci pacijenata (starost u vrijeme dijagnoze, spol) i morfološke podatke (invazija tumora prema klasifikaciji TNM, histološka tipa prema klasifikaciji Lauren i stupanj diferencijacije prema klasifikaciji Svjetske zdravstvene organizacije) iz medicinske dokumentacije.
metilacije specifične lančane reakcije polimeraze (MSP) pregled, DNA je izvađen iz 25-30 mg smrznutog tkiva pomoću ZS Genomska DNA ™ tkiva Mini Prep Kit (Zymo Research, USA), u skladu s upute proizvođača. Metilacija status MLH1
, MGMT
i DAPK-1 pregled promotore je određena tretiranjem DNA s bisulfita, koristeći EZ DNA metilacije Gold ™ (Kit Zymo Research), u skladu s uputama proizvođača , Ljudske genomske DNA iz limfocita iz periferne krvi, pomiješa se s bisulfitom, korištena je kao negativna kontrola. Ljudske genomske DNA pomiješa In vitro pregled s SssI metiltransferaze (New England Biolabs, UK) je bio korišten kao pozitivna kontrola. Metilacija položaj promotora je detektirano MSP.
Početnici za metilirani i nemetiliranih sljedova DNA su prikazani u Tablici 1. PCR je izvršena u ukupnom volumenu reakcije od 20 uL, koji sadrži 10 ul Maxima® hot start PCR Master Mix sa hot start Taq pregled, DNA polimeraze (Thermo Fisher Scientific, USA) i 10 uM svakog primera (Metabion International AG, Njemačka). MSP izvođeno 38-40 ciklusa denaturacije pri 94 ° C za 30 s, žarenja 1 min na temperaturi prikladnoj za pojedinog gena, te na 72 ° C tijekom 1 min. PCR produkti su razdvojeni pomoću 3,5% agaroza gel elektroforezom (Sl. 1). Kada i metilni i unmethylated signali pojavio na gel, gen se smatra methylated.Table 1 Primeri korišteni za MSP pregled Primer imena
Naprijed slijed pregled
obrnutim redosljedom pregled
Referentni broj
MLH1 pregled metilirani pregled TATATCGTTCGTAGTATTC [GenBank: NG_0071092] pregled TCCGACCCGAATAAACC pregled [40] pregled MLH1 pregled nemetiliran pregled TTTTGATGTAGATGTTTTATTAGGGT [GenBank: NG_0071092 ] pregled TACCACCTCATCATAACTACC pregled [40] pregled MGMT pregled metilirani pregled TTTCGACGTTCGTAGGTTTTCGC [GenBank: NG_000010.11] pregled GCACTCTTCCGAAAACGAAAC G pregled [40] pregled MGMT
nemetiliran
TTTGTGTTTTGATGTTTGTAGGTTTTTGT [GenBank: NG_000010.11] pregled AACTCCACACTCTTCCAAAAACAAAACA pregled [40] pregled DAPK-1 pregled metilirani pregled GGATAGTCGGATCGAGTTAACGTC [GenBank: NG_029883.1] pregled CCCTCCCAAACGCCG pregled [ ,,,0],40] pregled DAPK-1 pregled nemetiliran pregled GGAGGATAGTTGGATTGAGTTAATGTT [GenBank: NG_029883.1] pregled CAAATCCCTCCCAAACACCAA
[40]
bb
parova baza pregled Sl. 1 Reprezentativni uzorci MSP analize DNK uzoraka uzetih iz želučanog tkiva raka
Matematičko-statističke analize podataka pregled, Statistička analiza podataka provedena je s SPSS Statistics 19 softverskog paketa (IBM SPSS Inc., USA). Kvantitativne osobine su opisali aritmetička sredina i standardna devijacija. Studentov t-test pregled se koristi za potvrdu hipoteze o jednakosti sredstava. Χ pregled 2 kriterij i Fisherov egzaktni test korišteni su za provjeru statističke hipoteze o nezavisnosti dviju varijabli. Korelacija između varijabli su ocijenjeni od strane izračuna Spearmanov koeficijent. p izvoznici < 0.05 je smatrana značajnom. Pregled Rezultati
frekvencijama promotora metilacije u kancerogenih tkiva iz gornjeg, srednjeg i donjeg trećine želuca bila 11,1, 23,1 i 45,4%, odnosno, za MLH1 pregled gena; 22,2, 30,8 i 57,6%, odnosno, za MGMT
gena; i 44,4, 48,7 i 51,5%, odnosno, za DAPK-1
gena. Metilacija MLH1 Netlogu i MGMT pregled gena opažena je češće u donjoj trećini trbuhu nego u gornjoj trećini (p izvoznici < 0,05).
Detaljni podaci dani su u tablici 2 . analiza podskupina seks-based otkrila da MLH1 pregled metilacije u tkivima oboljelih od raka u donjem trećem želucu je tipično ženske populacije (p pregled = 0,01), dok MGMT pregled metilacije je samo statistički značajna u muški skupina (p pregled = 0,03). Razlozi tih nalaza su nejasni, a zahtijevaju detaljnu analizu i daljnja istraživanja. Promotor metilacije analiziranih gena nije bio povezan s pacijenta age.Table 2. Raspodjela MLH1, MGMT
i DAPK-1 pregled metilacije u kancerogenih želučanog tkiva prema trbuhu stranice
želuca gornju trećinu kancerogena tkiva (9 pacijenata) M /U
Želudac srednje trećine kancerogena tkiva (39 bolesnika) M /U
želuca manji trećina kancerogena tkiva (33 bolesnika) M /U pregled pregled, p vrijednost
MLH1
1/8 pregled 9/30 pregled 15/18 pregled 0,05 pregled MGMT
2/7 pregled 12/27 pregled 19/14 pregled 0,01 pregled DAPK-1
4/5 pregled 19/20 pregled 17/16 pregled 0.93 pregled, M pregled metiliran alel, u
nemetilirani alel
dvije glavne kategorije histološki redoslijedu - crijevne i difuzne vrste tumora - odražavaju diferencijacije tumora i tendenciju na stanice raka da se razmnoži i širenja , Dakle, istražili smo moguće povezanost između frekvencijskim distribucijama DAPK-1 Netlogu, MLH1 Netlogu i MGMT pregled metilacije i Lauren klasifikaciji morfološka tumora. Rezultati su prikazani u tablici 3. Jer, samo mali broj pacijenata histološki potvrdila mješovita tipa adenokarcinom prema klasifikaciji Lauren (n pregled = 7), ova skupina je raspoređen u više agresivni difuznom obliku bolesti. Tablica 3. Raspodjela MLH1, MGMT, DAPK-1 pregled metilacije prema tumora stranice i patološke karakteristike
MLH1 M /u
MGMT M /u pregled
pregled DAPK-1 M /U
tumora histološke parametre
želuca gornja trećina kancerogenog tkiva
Želudac srednje trećine kancerogena tkiva pregled
Želudac niže trećina kancerogena tkiva
Želudac gornja trećina kancerogena tkiva
Želudac srednje trećine kancerogena tkiva
želuca manji trećina kancerogena tkiva
Želudac gornja trećina kancerogenog tkiva
Želudac srednje trećine kancerogena tkiva
želuca manji trećina kancerogena tkiva
crijeva tip pregled 0/3 pregled 6/16 pregled 7/10 pregled 1/2 pregled 5/17 pregled 8/11 pregled 3/0 pregled 12/10 pregled 10/7 pregled difuznu tipa
1/5 pregled 3/14 pregled 8/8 pregled 1/5 pregled 7/10 pregled 11/5 pregled 1/5 pregled 7/10 pregled 7 /9 pregled p pregled value
0.45
0.48
0.61
0.57
0.22
0.21
0.02
0.41
0.39
T1
0/1
1/2
2/4
0/1
1/2
4/2
1/0
2/1
4/2
T2
0/2
2/2
2/3
0/2
1/3
3/2
1/1
0/4
3/2
T3
0/2
5/11
8/9
1/1
4/12
10/7
1/1
6/10
7/10
T4
1/3
1/15
3/2
1/3
6/10
2/3
1/3
11/5
3/2
p pregled value
0.7
0.17
0.83
0.62
0.88
0.84
0.59
0.06
0.67
N0
0/4
5/9
6/4
2/2
4/10
5/5
3/1
4/10
6/4
N1
0/2
2/4
3/5
0/2
2/4
5/3
0/2
2/4
4/4
N2
0/2
1/6
3/2
0/2
1/6
3/2
1/1
2/5
1/4
N3
1/0
1/11
3/7
0/1
5/7
6/4
0/1
11/1
6/4
p pregled vrijednost
0,29 pregled 0.33
0,48 pregled 0,36 pregled 0,66 pregled 0,95 pregled 0,27 pregled 0,01 pregled 0,46 pregled M pregled metiliranim alela , u
nemetilirani alel pregled Prema našim podacima, metiliranje DAPK-1
promotor bio je češći u intestinalni tipa želučanog adenokarcinoma. Međutim, to je bio samo trend, jer rezultati nisu bili statistički značajna (p pregled = 0,06). Analiza podskupina prema mjestu tumora pokazala je da je frekvencija DAPK-1
promotora metilacije značajno vezana za crijevne kanceroznog tkiva kada je tumor otkriven u gornjoj trećini želuca (p
= 0,02 Tablica 3). Ne povezanost između metilacijom MLH1
ili MGMT Netlogu i vrsti tumora prema klasifikaciji Lauren. Pregled Također smo analizirali povezanost između metilacije učestalosti istih gena i invazije tumora u zid želuca (kategorija T). Metilacija gena MLH1
i MGMT pregled nije bio povezan s T kategoriju klasifikacije TNM od kancerogenog tkiva u bilo kojem dijelu želuca. Češće metilacija DAPK-1 Netlogu zabilježeno je u uznapredovalih tumora u srednjoj trećini trbuha, ali to nije bila statistički značajna (p pregled = 0,06), iako je ovaj trend treba istražiti u budućnosti.
veza između gena promotora metilacije i uključenosti limfnih čvorova je analiziran, ali nije otkrila značajnu povezanost između metilacije MLH1 Netlogu i MGMT pregled, promotori i status tumora limfnih čvorova. Međutim, apoptoza vezanih gena DAPK-1 pregled češće metilira u kancerogenih tkiva u kategoriji N3 klasifikacije TNM (kada tumorske metastaze se nalaze u ≥ 7 regionalnih limfnih čvorova) nego u onima u N0-2 kategorije (p pregled = 0,05). Analiza podskupina pokazala je da je ova udruga bila značajna samo u kancerogenih tkiva u srednjoj trećini želuca (p
= 0,01).
Kada su tumori bili klasificirani prema TNM sustavu, nije uočena povezanost između metiliranje tih gena i fazi tumora. Međutim, potrebna je preciznija analiza podskupina pokazala da je metilacije MLH1 pregled promotor skloni biti češća u kancerogenih tkiva u srednjoj trećini želuca u fazi I-II tumora nego u fazi III tumori (p
= 0,06). Epigenetske Promjene u DAPK pregled gena nađene su značajno češće u želučanom kancerogenog tkiva iz srednje trećine želuca u fazi III tumora nego u fazi Tumori I-II (p pregled = 0,05).
Rezultate našeg istraživanja pokazuju inverznu korelaciju između metilacije MLH1 Netlogu i MGMT pregled gena u želučanog tkiva raka kada je tumor bio smješten u donjoj trećini želuca (koeficijent, -0,48; p = 0,01 pregled ). Inverzna korelacija između metilacije DAPK Netlogu i MLH1 Netlogu također je pokazano u kancerogenog tkiva u srednjoj trećini želuca (koeficijent, -0,41; p
= 0,01). Pregled Rasprava
MLH1
Prema literaturi, učestalost MLH1 pregled metilacije u kancerogenih želučanog tkiva u rasponu od 14 do 43% [12-16]. Ove ogromne razlike u učestalosti MLH1 pregled metilacije može se pripisati različitim zemljopisnim regijama smatraju posebno studijama. Anatomska distribucija želučanih tumora stranica je poznato da se razlikuju u različitim zemljopisnim područjima. U područjima gdje je incidencija H. pylori pregled zaraze je visoka (Istočna Europa, Istočna Azija), noncardial ili distalni raka želuca se dijagnosticira najčešće. Međutim, u zapadnoj i sjevernoj Europi, gdje je broj H. pylori- pregled zaraženih osoba je vrlo niska, broj proksimalnih želučanih karcinoma je visoka. Znanstvena literatura navodi da je metilacije MLH1 pregled promotora u tkivu raka želuca značajno je povezana s H. pylori pregled čimbenika virulencije koji je kodiran vacs1
gena [21]. Ovaj gen, koji je obično, otkriven u bakterijskom genomu, izaziva više intenzivnom upalni odgovor i povezan s povećanim rizikom od raka želuca u bolesnika s atrofičnog gastritisa [22]. Kronična upala želučane sluznice, koji karakterizira sluznice infiltracija polimorfonuklearnih leukocita, makrofage i T i B limfociti, dovodi do otpuštanja reaktivnih vrsta kisika (ROS) od aktivirane inflamatornih stanica. ROS uzrokovalo oštećenje DNA i nedostatak odgovarajuće funkcije neslaganje popravak sustava [23]. To je postupak u više koraka koji ovisi o intenzitetu upale. Metilacije MLH1 pregled promotora javlja u kasnoj fazi atrofični gastritis, intestinalne metaplazije [10, 24].
Ovaj dosljedan uzorak je također podržano podacima iz studije pacijenata iz zapadne i sjeverne Europe [13] , Gotovo jedna trećina bolesnika s proksimalnim (srčane) karcinoma želuca dijagnosticiran, a učestalost MLH1 pregled metilacije je 14,2%. Ovaj epigenetičko promjena se također češće otkrivena u distalnom želučane kancerogenog tkiva [13]. Rezultati našeg istraživanja pokazuju da je pojava MLH1 pregled metilacije u želučanom povećava rak tkiva iz gornje i srednje trećine želuca do donje trećine, i bio je 11,1, 23,1 i 45,4%, respektivno. Kao što je u literaturi, također je pokazala da je ova epigenetičko dođe do promjene znatno češće u donjoj trećini želucu nego u proksimalnom trećine, a taj učinak je više izražen u ženskoj populaciji. Razlog za seks u vezi razlika je nejasno, daljnja istraživanja su potrebna.
Neki podaci su pokazali da je metilacije MLH1 pregled promotor otkrije značajno češće u intestinalni tipa kancerogenih želučanog tkiva (prema klasifikaciji Lauren) nego u difuznom tipu [15, 16]. Naši rezultati pokazuju da je distribucija ovog epigenetičke promjena je sličan po vrstama tumora prema Lauren klasifikaciji. Pregled, pronašli smo značajnu povezanost između metilacije MLH1 Netlogu i T i N kriterija za kancerogenih tkiva u bilo kojem dijelu trbuh. Zasebna analiza prema mjestu tumora pokazalo je da je epigenetičko promjene (MLH1 pregled metilacije) skloni biti češća u kancerogenog tkiva iz srednje trećine želuca kad je u fazi I-II tumora nego u fazi III tumora (p
= 0,06). Ovaj rezultat ne mora biti statistički značajna, jer je broj bolesnika s ranom stadiju bolesti bio relativno mali. Pregled, pronašli smo objavljene analizu odnosa između ove epigenetičke promjene i T, N i kriteriji pozornici u skladu s tumor stranice u želucu. Međutim, objavljeni podaci pokazuju da je, općenito, metiliranje MLH1 pregled u kancerogenih tkiva otkrije češće kada regionalni limfni čvorovi nisu uključeni [14]. Pregled, MGMT
stopi od metilacije u MGMT pregled promotora kancerogenih tkiva povećan je sa gornje na donju trećinu želuca (22,2, 30,8 i 57,6%, respektivno), a taj učinak je više izražen u muškoj populaciji. Razlog za seks u vezi razlika je nejasno, daljnja istraživanja su potrebna. Prema literaturi je upravljanje pregled metilacija u kanceroznim tkivima želucu u rasponu od 7 do 61% [13, 25-28]. Ova široka varijacija može se objasniti činjenicom da je to epigenetičko promjene otkrivene češće u distalnom tkivu raka želuca nego na proksimalnim stranicama [18, 29]. Pregled, nije uočena značajna povezanost između MGMT pregled promotora metilacije i T i N kriteriji ili histološki tip tumora prema klasifikaciji Lauren u svakom ispitivanom želuca mjestu. Gubitak funkcije MGMT proteina je povezano s tumor širenja u limfne čvorove [14, 18] i uznapredovalim fazama bolesti [18, 30]. U našoj studiji, broj bolesnika s ranom stadiju bolesti relativno je mala, što bi moglo objasniti naše rezultate. Pregled DAPK-1
U ovoj studiji, učestalost DAPK-1
promotora metilacije nije u korelaciji s postavljanjem tumora. Objavljeni podaci pokazuju da je njegova frekvencija varira od 22 do 91% [28, 31-36]. Prema našim podacima, metiliranje DAPK-1
promotor bio je češći u probavnom vrsti želučanog adenokarcinoma. Međutim, to je bio samo trend, jer razlike nisu bile značajne (p pregled = 0,06). Analiza podskupina prema mjestu tumora pokazalo je da je frekvencija DAPK pregled promotora metilacije je značajno viša u intestinalnim kancerogena tkiva u gornjoj trećini želuca. Nismo pronašli udruge navedene u literaturi između DAPK-1
promotora metilacije i klasifikaciju tumora u skladu s Lauren. Naši rezultati treba tumačiti kritički, jer je od rijetkih bolesnika u ovoj skupini. Pregled Uočili smo da je marginalni trend u kojem DAPK-1 pregled metilacije se češće otkriven u srednjoj trećini želucu u naprednijim tumora, prema T kriterij (p pregled = 0,06). Također smo otkrili da kada se apoptoza vezanih gena DAPK-1 pregled je metiliran kancerogenih tkiva, tumor je više vjerojatno da će biti N3 o klasifikaciji TNM (metastaze tumora nalazi se u ≥ 7 regionalnih limfnih čvorova) nego N0-2 ( p pregled = 0,05) i biti napredni tumor (stadij III umjesto faze i-II, p pregled = 0,05). Analiza podskupina pokazala je da je ova udruga događa u kancerogenih tkiva iz srednje trećine želuca (p-0,01), ali nije značajan na drugim želuca stranicama. Istraživanje objavljeno u 2010. godini pokazalo je da metilacije pro-apoptoze gena DAPK-1 Netlogu u kancerogenih želučanog tkiva odnosi se na tumor proširio na limfne čvorove [37], ali nismo pronašli bilo kakve informacije u navedenom istraživanju povezivanje ovi nalazi na različitim mjestima lokalizacije raka želuca. pregled Korelacija između statusa metilacije analiziranih gena
odnose između promotora metilacije različitih gena u želucu tkivu raka su ispitani u našu studiju. Da li ti korelacije ovisi o mjestu tumora? Nismo našli podatke u znanstvenoj literaturi u pogledu povezanosti MGMT pregled and MLH1 pregled promotora metilacije u želucu adenokarcinoma tkiva. Rezultati našeg istraživanja pokazuju da postoji inverzna korelacija između metilacije MLH1 pregled i MGMT pregled u tkivu raka kada je tumor se nalazi u donjoj trećini želuca (koeficijent, -0,48; p pregled = 0,01).
Ovi rezultati nisu iznenađujući jer metilacije oba promotora gena češće je otkrivena u tkivima niže želuca [13, 29]. Međutim, proteini kodirani djelovati u različitim fazama karcinogeneze. MLH1 pregled promotor metilacije češće otkrije u ranoj fazi i manje agresivne želučanih tumora [12-16], dok MGMT pregled promotor metilacije je više tipičan kasni stupanj želuca adenokarcinoma i loše prognoze [18, 19] . pregled Više informacija je dostupno o povezanosti između promotora metilacije MLH1 Netlogu i DAPK-1 Netlogu. Visoka mikrosatelitne nestabilnost korelira obrnuta sa metiliranjem DAPK-1
promotora [12]. Naša istraživačka skupina identificirati inverzni, iako slab, korelacije između promotora metilacije DAPK-1 Netlogu i MLH1 Netlogu, regulira mikrosatelitni funkciju u kancerogenih želučanog tkiva [20]. Pregled Također smo otkrili da se dogodi ova korelacija u srednjoj trećini želuca. Inverzna korelacija između metilacije DAPK-1 Netlogu i MLH1 Netlogu također je identificiran u tkivu raka uzorkovane iz srednje trećine želuca. (Koeficijent, -0,41; p
= 0,01)
Specifična Nedostatak ovog istraživanja je u tome što je pod uvjetom da nema informacija o mRNA ekspresije analiziranih gena. Naš tim planira poduzeti ovo s kvantitativne PCR u budućem istraživanju. Trenutni rezultati su važni, ne samo zato što su proširiti naše razumijevanje želučane karcinogeneze, ali i iz kliničke perspektive. Postoji sve više dokaza da je gen metilacije u kancerogenih želučanog tkiva povezana s diferencijalnim osjetljivosti na kemoterapiju. Metilacije MLH1 pregled gena povezana s otpornošću na oksaliplatin kemoterapijom na bazi [38], te bolesnici s DAPK-1
metilacije pokazuju lošiju odgovor na fluorpirimidinom kemoterapijom na bazi [39].
Nadamo se da će naše istraživanje će dovesti do boljeg razumijevanja različitim putevima molekularne karcinogeneze u različitim dijelovima želuca. pregled Zaključak
Naši rezultati ukazuju da je epigenetičko proces, metiliranje gena promotora, u kancerogenog tkiva ovisi na mjestu želučane tumora pregled Kratice pregled bp.
parova baza
DAPK-1 pregled: pregled smrti povezane proteinska kinaza 1
LUHSH: pregled litvanski University of Health Sciences bolnice
M: pregled metiliran alel pregled
pregled MGMT pregled: pregled O 6-methylguanine-DNA-metiltransferaze
MC: pregled pozitivna metiliran kontrola pregled
pregled MC-: pregled negativna metiliran kontrola
MLH1 pregled: pregled mutL homologa 1, raka debelog crijeva, nonpolyposis tipa 2 (E. coli pregled)
mRNA: pregled messenger RNA
MSP: pregled metilacije specifične reakcije lanca polimeraze pregled
PCR: pregled, lančana reakcija polimeraze
ROS: pregled reaktivni kisikovi
U : pregled unmethylated alela
UC: pregled pozitivna nemetiliran kontrola
UC-: pregled negativna nemetiliran kontrola pregled

• Kliničko karakteristike i ishoda liječenja od hepatoid adenokarcinoma želuca, rijetka, ali jedinstven podvrsta raka želuca
• Podrijetlo i evolucijski plastičnost želučane slijepo crijevo u ježinci (Echinodermata: Echinoidea)