Genas metilinimas profilis skrandžio vėžinių audinių pagal auglio vietą, kad skrandžio

Genų metilinimas aprašymą skrandžio vėžinių audinių pagal auglio vietą skrandyje pervežimas tezės
Background
Už Yra daug informacijos dėl promotoriaus regionuose skirtingų genų, susijusių skrandžio kancerogenezėje metilinimo. Tačiau yra daug informacijos apie tai, kaip tai epigenetinius procesas skiriasi kilmės skirtingose ​​vietose skrandžio auglių nebuvimas.
Šio tyrimo tikslas yra įvertinti metilinimo profilius į MLH1
, "MGMT
, ir DAPK-1
genų vėžinių audinių iš skirtingų skrandžio svetainėse.
metodai
Mėginiai buvo įsigytas iš 81 pacientų, sergančių skrandžio adenokarcinoma, kuris buvo atlikta operacija dėl skrandžio vėžio Lietuvos sveikatos mokslų universitetas ligoninės Kauno klinikų 2009 -2012. Genų metilinimas buvo tiriamas su metilinimo konkrečių PGR. Tyrimas buvo patvirtinta Lietuvos Biomedicininių tyrimų etikos komitetas.
Rezultatai
nuo metilinimo dažnis vėžinių audinių iš viršutinio, vidurinio ir apatinės trečdaliai skrandyje buvo 11,1, 23.1, ir 45,4%, atitinkamai, už MLH1
; 22,2, 30,8 ir 57,6%, atitinkamai, už MGMT
; ir 44,4, 48,7, ir 51,5%, atitinkamai, už DAPK-1. MLH1
ir MGMT
metilinimas buvo pastebėta dažniau apatiniame trečdalyje skrandžio nei viršutinio trečdalio (p
< 0,05).
Viduriniame trečdalyje, DAPK-1
promotoriaus metilinimo buvo susijęs su daugiau-progresavusia liga limfmazgiai (N2-3, palyginti su N0-1 [p
= 0,02]) bei pažangių naviko stadijos (III etapas, o ne etapais I-II [p
= 0,05]). MLH1 parsisiųsti ir MGMT
metilinimas koreliuoja atvirkščiai, kai auglys buvo apatiniame trečdalyje skrandį (koeficientas, -0,48; p pervežimas = 0,01). DAPK-1 parsisiųsti ir MLH1
metilinimas koreliuoja atvirkščiai navikuose viduryje trečdalis skrandį (koeficientas, -0,41; p pervežimas = 0,01).
Išvada
geno promotoriaus metilinimo priklauso nuo skrandžio naviko vietą.
Raktiniai žodžiai
skrandžio vėžys MLH1
DAPK-1
MGMT
Metilinimas faktai
skrandžio vėžys yra rimta sveikatos problema. Nuslėpė klinikinių pažanga ligos reiškia, kad ši liga paprastai diagnozuojama jos vėlesniuose etapuose, todėl prastos prognozės, nepaisant naujų gydymo galimybių, kurios atsirado neseniai.
Daugiau nei 90% skrandžio vėžio atvejų diagnozuojama kaip adenokarcinoma [1 ]. Nuo 1965, skrandžio adenokarcinoma buvo suskirstyti į du pagrindinius tipus, paplitusia ir žarnyno (pagal Lauren [2]). Šie du histologiniai tipai skiriasi savo etiologies ir prognozės. Žarnyno ir skrandžio adenokarcinoma dažnai yra lėtinė infekcija pasekmė su Helicobacter pylori
, kai normalus skrandžio gleivinė transformuoja ūmaus pabaigoje lėtiniu gastritu, žarnyno metaplazijos ir displazija [3]. Difuzinis adenokarcinoma yra agresyvesnis nei žarnyno tipo, nes jos formavimas nepriklauso nuo gastritas arba metaplazijos procesų [4].
Nauji moksliniai duomenys rodo, kad skrandžio adenokarcinoma prognoze priklauso ne tik nuo jo histologinis tipas, bet taip pat dėl naviko vietą į skrandį. Proksimalinės navikai (kilmės į Cardia), kurie paprastai sudaro reaguojant į gastroezofaginio rūgštis /tulžies refliukso [5], dabar atskirti kaip atskirą ir agresyvesniu formos skrandžio adenokarcinoma, kuri skiriasi nuo distalinio skrandžio navikų.
Jei distalinio skrandžio vėžio būti klasifikuojami kaip unikalus? Kohortos tyrimai parodė, kad ikivėžinių būklės rizika, vadinama "atrofinė gastritas" virsta vėžiu skiriasi atsižvelgiant į iš skrandžio pažeidimo svetainėje. Santykinė rizika skrandžio vėžys pasireiškia pacientams, sergantiems Corpus-svarbiausiam gastritas yra didesnis nei tie, daugiausia antralinių gastritas [6]. Ar šis faktas rodo skirtingus kancerogeninių procesus skrandyje antralinėje dalyje ir corpus? Nėra duomenų į bet neįtraukti arba patvirtinti.
Epigenetiniai modifikacijos vaidinti pagrindinį vaidmenį skrandžio kancerogenezėje [7]. Šie procesai, pavyzdžiui, CpG salos geno promotoriaus regionuose metilinimo sukelti grįžtamąjį struktūrinius pokyčius DNR, kuri, savo ruožtu, keisti genų ekspresiją [8]. DNR metilinimas atsitinka, kai metilo grupė (-CH 3) perkeliama į 5 -oji citozinu pozicija [9].
Ankstesnę bandomąjį tyrimą mūsų tyrimų grupės parodė, kad metilinimas dažnio MLH1
rengėjas skiriasi Corpus ir antralinių skrandžio audinių nukentėjo pangastritis. Pastebėjome, kad ši epigenetinius procesas yra žymiai dažnesnis į antralinių gastritas audinių negu tekstyno [10], tuo tarpu atrofinį gastritas laipsnis yra panašus abiejuose regionuose. Neaišku, ar ši tendencija taip pat tiesa, vėžinių audinių.
Dvi grupės genų buvo pasirinktas šis metilinimo analizei. Pirmoji grupė (MLH1 parsisiųsti ir "MGMT
) yra du genus, kurie koduoja baltymus dalyvauja remonto mutacijų ir kitų DNR pažeidimų prieš tolesnį ląstelių dalijimąsi, o antrasis grupė yra naviko slopina geno (DAPK-1
), koduojantis baltymą, kuris indukuoja apoptozę stipraus genomo defekto būvimas.
MLH1
(mutL homologas 1, storosios žarnos vėžys, nonpolyposis 2 tipo (E.coli
)) genas pasireiškia tuo 3p21 .3 lokusas. Genas-koduojamas baltymas identifikuoja DNR klaidų, kurios atsiranda po replikacija. Hypermethylation iš MLH1
rengėjas, o ne mutacijų sukelia pokyčius baltymo funkciją, yra atsakinga už mikrosatelitiniai nestabilumo skrandžio vėžio [11]. Pasak literatūros, MLH1
metilinimas yra atsakinga už žarnyno forma skrandžio vėžio ir ankstyvos stadijos ligos [12-16].
Į MGMT (O 6-metilguaninas-DNA- funkcija metiltransferazė) yra pašalinti alkilo grupė iš P 6 pozicijos guanino [17]. Sutrikimų MGMT funkcijos gali sukelti mutacijų atsiradimą. Mokslinės publikacijos rodo, kad MGMT
geno promotoriaus metilinimo yra vienas iš patogeneziniam kelius skrandžio vėžio. Visų pirma, genų metilinimas yra priskirta pažengęs ligos [18], ir taip pat priskiriamas prie skurdesnių ligos prognozę [19].
DAPK-1
(mirties susijusių baltymų kinazės 1) genas yra vienas iš trijų DAPK
šeimos genų, koduojančių kalcio /kalmodulino priklausoma serino-treonino proteinkinazių. Iš DAPK-1 baltymo funkcija yra glaudžiai susijęs su įvairių apoptozę kelius ir DAPK-1
hypermethylation buvo įrodyta, kad pasitaiko kietų ir hematologinių navikų.
Skrandžio vėžys yra ne išimtis. Geno promotoriaus metilinimo taip pat būdinga adenokarcinoma šią vietą. Ankstesniame tyrime, mūsų grupė nustatė atvirkštinį ryšį tarp DAPK-1
ir MLH1
metilinimo [20]. Mes tikriname čia hipotezę, kad skirtingų genų metilinimo profiliai atsirasti vėžinių audinių skrandžio pagal naviko vietoje (viršutinio, vidurinio arba apatinis trečdalis).
Metodai Viesbutis The tyrimo buvo patvirtintas Lietuvos regioninės biomedicininių tyrimų etikos komitetas. Visi pacientai pasirašė informuoto sutikimo formą. Pacientai gydomi Lietuvos sveikatos mokslų universitetas ligoninė (LUHSH) Kauno klinikose 2009-2012 dalyvavo tyrime. Skrandžio audinio mėginiai buvo imami iš visų dalykų su morfologiškai patvirtino I etapas-III adenokarcinoma. Tyrimas gyventojai sudarė 81 pacientai (34 vyrų ir 47 moterų), kurių vidutinis amžius 68 metai (nuo 23-87 metų; standartinis nuokrypis [SD] 11,75). Devynių pacientų navikai buvo viršutinio trečdalio skrandžio, tie iš 39 ligonių buvo viduriniame trečdalyje, ir tie, 33 pacientai buvo apatiniame trečdalyje skrandį. Skrandžio audinio mėginiai buvo imami iš operacijos metu naviko svetainėse. Šios medžiagos buvo nedelsiant užšaldomos skystame azoto ir saugomi -80 ° C temperatūroje, kol analizės. Tyrimo metu buvo gauti pacientų klinikiniai duomenys (amžius diagnozės, lyties) ir morfologiniai duomenys (naviko invazija pagal į TNM klasifikaciją, histologinis tipas pagal Lauren klasifikavimo ir diferenciacijos laipsnis pagal Pasaulio sveikatos organizacijos klasifikaciją) iš medicininių įrašų.
metilinimas konkrečių polimerazės grandininės reakcijos (MSP)
DNR buvo išskirta iš 25-30 mg šaldytų audinio naudojant ZS Genomo DNR ™ audinių mini Prep komplektas (Zymo Analizė, JAV), atsižvelgiant į gamintojo instrukcijas. Metilinimo statusas MLH1
, "MGMT
ir DAPK-1
rengėjai nulėmė gydant DNR bisulfitu, naudojant EZ DNR metilinimas Gold Kit ™ (Zymo moksliniai tyrimai), pagal gamintojo instrukcijas , Žmogaus genomo DNR iš periferinio kraujo limfocitų, gydomi bisulfitu, buvo naudojamas kaip neigiama kontrolė. Žmogaus genomo DNR elgiamasi in vitro
su SssI metiltransferazei (New England Biolabs, JK) buvo naudojamas kaip teigiama kontrolė. Metilinimo statusas vykdytojų buvo aptiktas su JEP.
Už denatūruotu ir nedenatūruotą DNR sekų pradmenis, yra išvardyti 1 PGR buvo atliekama bendra reakcijos tūrio 20 įxL lentelėje, kuriame yra 10 pL Maxima® Hot Start PGR magistro sumaišykite su karštojo užvedimo Taq DNR polimerazė
(Thermo Fisher Scientific, JAV) ir 10 mikromolių kiekvieno pradmens (Metabion INTERNATIONAL AG, Vokietija). MSP buvo atlikta 38-40 ciklų denatūruojant 94 ° C temperatūroje 30 S, atkaitinimo 1 min, esant temperatūros tinkamas individualiam geno, ir pratęsiant 72 ° C temperatūroje 1 min. PGR produktai buvo atskirtos 3,5% agarozės gelyje (1 pav.). Kai tiek Metilinti ir nedenatūruotą signalai pasirodė gelio, genas buvo laikomas methylated.Table 1 naudojami MSP
gruntas vardo
Persiųsti seka Gruntai
Nemokama Grįžtamieji seka

Skelbimo numeris
MLH1
metilo
TATATCGTTCGTAGTATTC [GenBank: NG_0071092]
TCCGACCCGAATAAACC
[40]
MLH1
nemetilintas
TTTTGATGTAGATGTTTTATTAGGGT [GenBank: NG_0071092 ]
TACCACCTCATCATAACTACC
[40]
MGMT
metilo
TTTCGACGTTCGTAGGTTTTCGC [GenBank: NG_000010.11]
GCACTCTTCCGAAAACGAAAC G
[40]
MGMT
nemetilintas
TTTGTGTTTTGATGTTTGTAGGTTTTTGT [GenBank: NG_000010.11]
AACTCCACACTCTTCCAAAAACAAAACA
[40]
DAPK-1
denatūruotas
GGATAGTCGGATCGAGTTAACGTC [GenBank: NG_029883.1]
CCCTCCCAAACGCCG
[ ,,,0],40]
DAPK-1
nemetilintas
GGAGGATAGTTGGATTGAGTTAATGTT [GenBank: NG_029883.1]
CAAATCCCTCCCAAACACCAA
[40]
BP
bazinių porų
pav. 1 tipiniai mėginiai JEP analizuoja DNR mėginių, paimtų iš skrandžio vėžio audiniuose
Matematinė-statistinė duomenų analizė
Statistinė duomenų analizė buvo atlikta su SPSS Statistics 19 programinės įrangos paketo ( "IBM SPSS Inc., JAV). Kiekybiniai savybės buvo aprašyta aritmetinis vidurkis ir standartinis nuokrypis. Stjudento t
-test buvo naudojama patikrinti lygių priemonėmis hipotezę. Χ
2 kriterijus ir tikslus Fišerio testas buvo naudojamas patikrinti statistinį hipotezę nepriklausomybės dviejų kintamųjų. Koreliacijos tarp kintamųjų buvo įvertinta apskaičiuojant Spearman koeficientą. p
< 0,05 buvo laikomas reikšmingu.
Rezultatai
nuo promotoriaus metilinimo dažnis vėžinių audinių iš viršutinio, vidurinio ir žemesnio trečdaliai skrandyje buvo 11,1, 23,1 ir 45,4%, atitinkamai, už MLH1
geno; 22,2, 30,8, ir 57,6%, atitinkamai, už MGMT
geno; ir 44,4, 48,7, ir 51,5%, atitinkamai, už DAPK-1
geno. Metilinimas iš MLH1
ir MGMT
genų buvo pastebėtas dažniau apatinėje trečdalį skrandžio negu viršutinis trečdalis (psl
< 0,05).
Išsamius duomenis yra pateikiamas 2 lentelėje . Lytis pagrindu pogrupių analizė parodė, kad MLH1
metilinimas yra vėžio audiniuose apatinio trečiosios skrandžio buvo tipiškas moterų tarpe (p
= 0,01), o MGMT
metilinimas buvo tik statistiškai reikšmingas patinas grupėje (p
= 0,03). Šių išvadų priežastys yra neaiškios, ir reikalauja išsamios analizės ir tolesnius tyrimus. Projekto rengėjas metilinimas analizuojamų genų nebuvo susiję su pacientų age.Table 2 pasiskirstymas MLH1, MGMT pervežimas ir DAPK-1
metilinimo į vėžinių skrandžio audinių pagal skrandžio svetainėje
skrandžio viršutinis trečdalis vėžinio audinio (9 pacientai) M /V
Skrandžio viduryje trečdalis vėžio audinio (39 pacientai) M /V
Skrandis mažiau trečdalis vėžio audinio (33 pacientai) M /V

psl
vertė
MLH1
1/8
9/30
15/18
0,05
MGMT
2/7
12/27
19/14
0,01
DAPK-1
4/5
19/20
17/16
0.93
m
metilo alelis U
nedenatūruotą alelio
dviejų pagrindinių histologinis klasifikavimo kategorijas - žarnyno ir pasklidųjų tipų navikais - atspindi naviko diferenciacija ir vėžinių ląstelių tendenciją daugintis ir plisti , Todėl mes įvertino galimus ryšius tarp dažnių paskirstymo DAPK-1
, MLH1
ir MGMT
metilinimo ir Lauren morfologinis naviko klasifikacija. Rezultatai pateikti 3 lentelėje Kadangi tik nedidelis skaičius pacientų buvo histologiškai patvirtinta mišrią tipo adenokarcinoma pagal Lauren klasifikavimo (n
= 7), ši grupė buvo paskirtas į daugiau agresyvaus difuzinio ligos forma. 3 pasiskirstymas MLH1, MGMT, DAPK-1
metilinimas pagal auglio vietą ir patologinių savybių

MLH1 M /U
MGMT "M /V


DAPK-1 M /U
naviko histologiniai parametrai

skrandžio viršutinės trečią vėžinio audinio
Skrandžio viduryje trečdalis vėžio audinių

Skrandžio mažesnis trečdalis vėžio audinių
Skrandžio viršutinis trečdalis vėžio audinių
Skrandžio viduryje trečdalis vėžio audinių
Skrandis mažiau trečdalis vėžio audinių
Skrandžio viršutiniame trečią vėžinio audinio
Skrandžio viduryje trečdalis vėžio audinių
Skrandis mažiau trečdalis vėžio audinių
Žarnų tipas
0/3
6/16
7/10
1/2
5/17
8/11
3/0
12/10
10/7
Difuzinė tipo
1/5
3/14
8/8
1/5
7/10
11/5
1/5
7/10
7 /9
psl
value
0.45
0.48
0.61
0.57
0.22
0.21
0.02
0.41
0.39
T1
0/1
1/2
2/4
0/1
1/2
4/2
1/0
2/1
4/2
T2
0/2
2/2
2/3
0/2
1/3
3/2
1/1
0/4
3/2
T3
0/2
5/11
8/9
1/1
4/12
10/7
1/1
6/10
7/10
T4
1/3
1/15
3/2
1/3
6/10
2/3
1/3
11/5
3/2
p
value
0.7
0.17
0.83
0.62
0.88
0.84
0.59
0.06
0.67
N0
0/4
5/9
6/4
2/2
4/10
5/5
3/1
4/10
6/4
N1
0/2
2/4
3/5
0/2
2/4
5/3
0/2
2/4
4/4
N2
0/2
1/6
3/2
0/2
1/6
3/2
1/1
2/5
1/4
N3
1/0
1/11
3/7
0/1
5/7
6/4
0/1
11/1
6/4
p
vertė
0,29
0,33
0,48
0,36
0,66
0,95
0,27
0,01
0.46
m
denatūruotą alelio U
nedenatūruotą alelio
pagal mūsų duomenis, metilinimas iš DAPK-1 pervežimas rengėjas buvo dažnesnės žarnyno tipo skrandžio adenokarcinoma. Tačiau tai buvo tik tendencija, nes rezultatai nebuvo statistiškai reikšmingas (p
= 0,06). A pogrupio analizė pagal naviko vietą buvo atskleista, kad DAPK-1
promotoriaus metilinimo dažnis buvo reikšmingai susiję su žarnyno vėžinio audinio, kai navikas buvo aptiktas viršutinio trečdalio skrandžio (p
= 0,02; lentelėje 3). Nėra asociacija buvo nustatyta tarp MLH1
arba MGMT
metilinimo ir naviko tipą Pagal Lauren klasifikacija.
Mes taip pat analizavo tarp metilinimo dažnis tų pačių genų bei naviko invazijos asociaciją į skrandžio sieną (T kategorijos). Genų MLH1 parsisiųsti ir MGMT
nebuvo susijęs su T kategorijoje TNM klasifikaciją vėžinių audinių bet skrandžio dalis metilinimas. Dažnesnis metilinimo DAPK-1
buvo pastebėtas pažangių navikų viduriniame trečdalyje skrandžio, tačiau tai nebuvo statistiškai reikšmingas (p
= 0,06), nors ši tendencija turėtų būti išnagrinėtos ateityje.
buvo analizuojami tarp geno promotoriaus metilinimo ir limfos-mazgo dalyvavimo koreliacija, tačiau neatskleidė reikšmingas ryšys tarp į MLH1
metilinimo ir MGMT
vykdytojų ir naviko limfos-mazgo būklę. Tačiau apoptozė susijusių genų DAPK-1
buvo dažniau metilinti vėžinių audinių N3 kategorijoje TNM klasifikaciją (kai naviko metastazių randama ≥ 7 regioninių limfmazgių), negu tiems į N0-2 kategorija (p
= 0,05). A pogrupio analizė parodė, kad ši asociacija buvo reikšmingas tik vėžinių audinių viduriniame trečdalyje skrandžio (p
= 0,01).
Kai navikai buvo klasifikuojami pagal TNM sistemos, neradome asociaciją tarp metilinimas iš šių genų ir naviko etape. Tačiau, tiksliau analizė pogrupių parodė, kad iš MLH1
promotoriaus metilinimas linkusios būti dažniau vėžinių audinių viduriniame trečdalyje skrandžio etape I-II navikai nei etape III navikai (p
= 0,06). Epigenetiniai pokyčiai į DAPK
geno buvo aptikta žymiai dažniau skrandžio vėžinių audinių iš viduriniame trečdalyje skrandžio etape III navikai nei etape I-II navikai (psl
= 0,05).
Rezultatus mūsų tyrimo rezultatai parodė, atvirkštinis ryšys tarp į MLH1
metilinimo ir MGMT
genų skrandžio vėžio audiniuose, kai auglys buvo apatiniame trečdalyje skrandžio (koeficiento, -0,48; p = 0,01
). Atvirkštinis ryšys tarp DAPK
ir MLH1
metilinimo taip pat buvo įrodytas vėžinių audinių viduriniame trečdalyje skrandį (koeficientas, -0,41; p pervežimas = 0,01).
Diskusijos
MLH1

pagal literatūroje MLH1
metilinimo į vėžinių skrandžio audinių dažnis svyruoja nuo 14 iki 43% [12-16]. Šie pločio svyravimai MLH1
metilinimo dažnis gali būti priskirta prie skirtingų geografinių regionų laikomos visų pirma su tyrimais. Anatominė paskirstymas skrandžio naviko vietų yra žinoma, kad skiriasi skirtingose ​​geografinėse regionuose. Regionuose, kuriuose H. pylori
infekcijos dažnis aukštas (Rytų Europa, Rytų Azija), noncardial arba distalinio skrandžio vėžys diagnozuojamas dažniausiai. Tačiau, Vakarų ir Šiaurės Europoje, kur H. pylori-
užsikrėtusių žmonių skaičius yra gana mažas, proksimalinės skrandžio vėžio, skaičius yra didelis. Mokslinėje literatūroje praneša, kad iš MLH1
promotoriaus metilinimo skrandžio vėžio audiniuose yra gerokai susijęs su Helicobacter pylori
virulentiškumo faktorius, kurį koduoja vacs1 pervežimas geno [21]. Šis genas, kuris paprastai yra aptikta bakterijos genomo, provokuoja daugiau-intensyvų uždegiminio atsako ir yra susijęs su padidėjusia rizika skrandžio vėžio pacientams, sergantiems atrofinio gastrito [22]. Lėtinis skrandžio gleivinės uždegimas, kuris yra būdinga tai, kad gleivinės infiltracija polimorfonuklearinių leukocitų, makrofagų ir T ir B limfocitų, veda į reaktyviųjų deguonies formų (ROS) iš aktyvuotų uždegiminių ląstelių išleidimo. ROS sukelti DNR pažeidimus ir tinkamai funkcija neatitikimas remonto sistema [23] stoką. Tai yra daugiapakopį procesą, kad priklauso nuo uždegimo intensyvumo. Iš MLH1
promotoriaus metilinimo įvyksta vėlai atrofinį gastritu, žarnyno Metaplasia [10, 24].
Tai dėsningumas taip pat remia duomenų iš pacientų iš Vakarų ir Šiaurės Europoje tyrimą [13] , Beveik trečdalis ligonių buvo diagnozuotas proksimalinės (Sirdies) skrandžio vėžys, o MLH1
metilinimo dažnis buvo 14,2%. Tai epigenetinius kaita taip pat dažniau aptinkama distalinės skrandžio vėžinių audinių [13]. Mūsų tyrimo rezultatai rodo, kad MLH1
metilinimo skrandžio vėžio audinių didėja nuo viršutinės ir viduriniame trečdalyje skrandžio į apatinę trečią kartą, ir buvo 11,1, 23,1 ir 45,4%, atitinkamai rezultatus. Kaip ir literatūros, mes taip pat parodė, kad tai Epigenetiniai pasikeičia žymiai dažniau apatiniame trečdalyje skrandžio nei jo proksimalinės trečdalį, ir šis poveikis yra labiau išreikštas moterų tarpe. Dėl sekso susijusių skirtumų priežastis yra neaiški, tolesni tyrimai reikalingi.
Kai kurie duomenys parodė, kad MLH1
promotoriaus metilinimo aptinkamas žymiai dažniau žarnyno tipo vėžinių skrandžio audinių (pagal Lauren klasifikaciją) nei difuzinio tipo [15, 16]. Mūsų rezultatai rodo, kad šio epigenetinio pokyčių pasiskirstymas yra panašus visoje naviko rūšis pagal Lauren klasifikacija.
Neradome reikšmingas ryšys tarp MLH1
metilinimo ir T ir N kriterijų vėžinių audinių bet dalis skrandis. Atskiras analizė pagal auglio vietą parodė, kad epigenetinius kaita (MLH1
metilinimas) linkę būti dažnesni vėžinių audinių iš viduriniame trečdalyje skrandyje, kai etape I-II navikai negu III etapas navikai (p
= 0,06). Šis rezultatas galėjo būti statistiškai reikšmingas, nes pacientams su ankstyvos stadijos ligą, buvo palyginti nedaug.
Neradome paskelbtą analizę tarp šios epigenetinio kaitos ir T, N santykiams, ir sceniniai kriterijai pagal auglio vietą skrandyje. Tačiau paskelbti duomenys rodo, kad, apskritai, iš MLH1
į vėžinių audinių metilinimas yra aptinkamas dažniau, kai regioniniai limfmazgiai nedalyvauja [14].
MGMT
of metilinimo norma į MGMT
promotorius vėžinių audinių padidėjo nuo viršutinė į apatinę trečdalį skrandžio (22,2, 30,8, ir 57,6%, atitinkamai), ir šis poveikis yra labiau išreikštas vyrų populiacijos. Dėl sekso susijusių skirtumų priežastis yra neaiški, tolesni tyrimai reikalingi. Pasak literatūros, MGMT
metilinimas yra vėžio skrandžio audinių svyruoja nuo 7 iki 61% [13, 25-28]. Tai labai skiriasi galima paaiškinti tai, kad šis epigenetinius pokytis aptinkamas dažniau distalinės skrandžio vėžio audinio nei proksimaliniuose svetainių [18, 29].
Neradome reikšmingus ryšius tarp MGMT
promotoriaus metilinimo ir T ir N kriterijai arba pagal Lauren klasifikavimo bet kuriuo tiriamu skrandžio svetainėje histologinis tipas naviko. Priemonės, kuriomis MGMT baltymų funkcijos praradimas yra susijęs su naviko išplitęs į limfinių mazgų [14, 18] ir stadijose ligos [18, 30]. Mūsų tyrimo duomenimis, pacientams su ankstyvos stadijos liga skaičius buvo palyginti nedidelis, kuris galėtų paaiškinti mūsų išvadas.
DAPK-1
Šiame tyrime iš DAPK-1 pervežimas promotoriaus metilinimo dažnis nebuvo koreliuoja su naviko vietą. Paskelbti duomenys rodo, kad jo dažnis svyruoja nuo 22 iki 91% [28, 31-36]. Pagal mūsų duomenis, metilinimas iš DAPK-1 pervežimas rengėjas buvo dažnesnės žarnyno tipo skrandžio adenokarcinoma. Tačiau, tai buvo tik tendencija, nes skirtumai nebuvo reikšmingas (p
= 0,06). A pogrupio analizė pagal naviko vietą parodė, kad DAPK
promotoriaus metilinimo dažnis buvo žymiai didesnis žarnyno vėžinių audinių į viršutinį trečdalį skrandį. Neradome minimas literatūroje tarp DAPK-1 pervežimas promotoriaus metilinimo ir naviko klasifikavimo pagal Lauren asociacijas. Mūsų rezultatai turėtų būti aiškinami kritiškai, nes iš nedaugelio pacientų šio pogrupio.
Mes pažymėjo nedidelį tendenciją, kurioje DAPK-1
metilinimas buvo aptiktas dažniau viduriniame trečdalyje į daugiau pažangių navikų pilvo, pagal T kriterijus (p
= 0,06). Mes taip pat nustatė, kad, kai apoptozę susijusių genų DAPK-1
buvo metilinti vėžinių audinių, navikas buvo labiau tikėtina, kad būti N3 dėl TNM klasifikaciją (navikų metastazių rasti ≥ 7 regionų limfmazgių) nei N0-2 ( p
= 0,05) ir būti pažengęs navikas (III stadijos, o ne etapais I-II; p
= 0,05). A pogrupio analizė parodė, kad ši asociacija įvyksta vėžinių audinių iš viduriniame trečdalyje skrandžio (p-0,01), bet yra ne reikšmingas kitų skrandžio vietų. Paskelbtas 2010 atliktas tyrimas parodė, kad proapoptozinis genų DAPK-1
vėžinių skrandžio audinių metilinimas susijęs su naviko išplitimo į limfmazgius [37], tačiau neradome bet minėtame tyrime informaciją susiejant šios išvados skirtingose ​​vietose skrandžio vėžio lokalizacijų.
Koreliacija tarp metilinimo statuso analizuotų genų
tarp promotoriaus metilinimo skirtingų genų skrandžio vėžio audiniuose santykius buvo išnagrinėti mūsų studiją. Ar šie koreliacijos priklauso nuo naviko svetainėje? Mes nustatėme, kad neturi informacijos mokslinėje literatūroje, susijusius su MGMT parsisiųsti ir MLH1
promotoriaus metilinimo koreliacijos skrandžio adenokarcinoma audiniuose. Mūsų tyrimo rezultatai rodo, kad ten buvo atvirkštinė koreliacija tarp MLH1 parsisiųsti ir MGMT
vėžiu audiniuose, kai auglys buvo apatiniame trečdalyje skrandį (koeficientas, -0,48 metilinimo; p
= 0,01).
Šie rezultatai yra ne stebina, nes abiejų genų skatinančių medžiagų metilinimas yra dažniau aptinkama mažesnis-skrandžio vėžio audinių [13, 29]. Tačiau baltymai užkoduota elgtis įvairiose stadijose kancerogenezėje. MLH1
rengėjas metilinimas dažniau aptinkami ankstyvosiose stadijose ir mažiau agresyvios skrandžio navikų [12-16], kadangi MGMT
rengėjas metilinimas yra labiau būdingas vėlyvos stadijos skrandžio adenokarcinomos ir prastos prognozės [18, 19] .
Daugiau informacijos apie tarp promotoriaus metilinimo MLH1
ir DAPK-1
asociacijos. Aukštos Mikrosatelitinis nestabilumas koreliuoja atvirkščiai su DAPK-1 pervežimas rengėjas [12] metilinimo. Mūsų tyrimų grupė nustatė atvirkštinė, nors silpnas, koreliacijos tarp promotoriaus metilinimo DAPK-1
ir MLH1
, reguliuojant mikrosatelitinio funkcijai atlikti, vėžinių skrandžio audinių [20].
Mes taip pat nustatė, kad ši koreliacija atsiranda viduriniame trečdalyje, skrandžio. Atvirkštinis ryšys tarp DAPK-1
ir MLH1
metilinimo taip pat buvo nustatyta vėžio audiniuose atrinktų iš viduriniame trečdalyje skrandį. (Koeficientas, -0,41; p = 0,01 pervežimas)
Konkretus apribojimas šio tyrimo yra tai, kad nėra informacijos apie mRNR ekspresijai tirtų genų buvo su sąlyga,. Mūsų komanda planuoja atlikti tai su kiekybine PGR į būsimą tyrimą. Dabartiniai duomenys yra svarbūs ne tik todėl, kad jie išplėsti mūsų supratimą apie skrandžio kancerogenezėje, bet ir iš klinikinės perspektyvos. Yra vis daugiau įrodymų, kad genų metilinimas yra vėžio skrandžio audinių yra susijęs su skirtingo jautrumo chemoterapijos. Metilinimas iš MLH1
geno yra susijęs su atsparumu oksaliplatinos pagrindu chemoterapijos [38], ir pacientams, sergantiems DAPK-1 pervežimas metilinimo rodo blogiau atsakymą į fluoropirimidino chemoterapija [39].
tikimės, kad mūsų tyrimas leis geriau suprasti įvairių būdų molekulinės kancerogenezėje įvairių dalių skrandį.
Išvada
Mūsų tyrimo rezultatai rodo, kad epigenetinius procesas, genų metilinimas vykdytojų, visų vėžinių audinių priklauso nuo skrandžio naviko vietą
Santrumpos
BP:.
bazinių porų
DAPK-1
: Rīga, mirtis susijusios baltymų kinazės 1
LUHSH: Rīga, Lietuvos sveikatos mokslų universitetas ligoninės
M: Rīga, metilo alelis


MGMT
: Rīga, P 6-Metilguaninas-DNR metiltransferazė
MC
teigiamas metilo kontrolė


MC-: Rīga, neigiama metilo kontrolė
MLH1
: Rīga, mutL homologas 1, storosios žarnos vėžio, nonpolyposis 2 tipo (E. coli
)
iRNR: Rīga, RNR
JEP: Rīga, metilinimas konkrečių polimerazės grandininė reakcija

PGR: Rīga, polimerazės grandininė reakcija
ROS: Rīga, reaktyvių deguonies rūšys
U : Rīga, nedenatūruotu alelio
UC: Rīga, teigiama nemetilintas kontrolė
UC-: Rīga, neigiama nemetilintas kontrolė

• Clinicopathologic charakteristikos ir hepatoid adenokarcinoma skrandžio, reta, bet unikalios potipio skrandžio cancer
• Kilmė ir evoliucinis plastiškumas skrandžio aklosios žarnos į jūros ežių (Echinodermata: Echinoidea)