Associação entre a metilação do promotor de RUNX3 e cancro gástrico: uma meta-análise
Resumo
fundo
relacionados com Runt factor de transcrição 3 (RUNX3) é um membro da família anão-domínio de factores de transcrição e tem sido relatada a ser um supressor de tumor candidato no câncer gástrico. No entanto, a associação entre a metilação do promotor RUNX3 e câncer gástrico permanece obscuro.
Métodos
Nós sistematicamente revisados estudos de metilação do promotor RUNX3 e câncer gástrico publicada em Inglês ou chinês de janeiro de 2000 a janeiro de 2011, e quantificadas a associação entre RUNX3 promotor metilação e câncer gástrico utilizando métodos meta-análise.
resultados Um total de 1740 amostras em 974 participantes de dezessete estudos foram incluídos na meta-análise. Observou-se uma associação significativa entre a metilação do promotor RUNX3 e câncer gástrico, com um rácio agregado de chances (OR) de 5,63 (IC 95% 3,15, 10,07). Houve heterogeneidade óbvia entre os estudos. análises de subgrupo (incluindo por tecido de origem, país e idade), meta-regressão foram realizadas para determinar a origem da heterogeneidade. Meta-regressão mostrou que a tendência nas RUP foi inversamente correlacionada com a idade. No viés de publicação foi detectado. As RUP para metilação RUNX3 em bem diferenciado vs cancros gástricos indiferenciadas
, e intestinal do tipo vs
do tipo difuso carcinomas foram 0,59 (95% CI: 0,30, 1,16) e CI 2,62 (95%: 1,33, 5,14), respectivamente. Não houve diferenças significativas na metilação RUNX3 em tecidos de câncer em relação à idade, sexo, estágio TNM, invasão de tumores em vaso sanguíneo ou ductos linfáticos, ou o estágio do tumor.
Conclusões
Esta meta-análise identificou uma forte associação entre a metilação do promotor de RUNX3 e cancro gástrico, confirmando o papel do RUNX3 como um gene supressor de tumor.
fundo
cancro gástrico é o segundo tumor gastrointestinal mais comum em todo o mundo. Embora sua incidência continua a diminuir ano após ano, continua a ser a segunda causa mais comum de mortes relacionadas ao câncer [1, 2].
Relacionados com Runt fator de transcrição 3 (RUNX3) é um membro da família de domínio runt da transcrição fatores, também conhecido como poliomavírus proteína de ligação potenciador 2 (PEBP2) /ligação do núcleo fatores (CBF) [3-5]. RUNX3 é conhecido um regulador de grandes vias de desenvolvimento, e recentemente foi classificado como um supressor de tumor candidato [3-5]. RUNX3 está localizado no cromossoma humano 1p36 região e desempenha um papel importante no factor de crescimento transformante (TGF) -β via de sinalização. Isto pode ocorrer, em parte, através da interacção com FOXO3a /FKHRL1, ambos dos quais são indispensáveis para a activação da proteína pro-apoptose Bim (mediador de morte celular de Bcl-2 que interage com), ou por meio da cooperação com membros da família de proteínas SMAD para induzir o TGF -β /SMAD via de outras formas [6, 7]. O gene RUNX3 é regulada através de três mecanismos principais: a perda de heterozigotia (LOH), mislocalization proteína, e a metilação do promotor de [3, 5, 8, 9]. O silenciamento dos CpGs na região promotora de genes regulados via hipermetilação é reconhecido como um dos mecanismos responsáveis pela perda de função do gene na hipótese de a progressão do tumor de dois bater de Knudson [10]. Numerosos estudos utilizando linhas de células, os animais knockout, e amostras de cancro humano primárias têm demonstrado um papel crucial para RUNX3 não só no desenvolvimento normal, mas também em neoplasias, especialmente cancros do estômago [3, 5, 11]. Estudos anteriores têm relatado o envolvimento de metilação do promotor de RUNX3 em muitos cancros, incluindo o colorrectal [12, 13], gástrica [14], da bexiga [15], da mama [16], do pulmão [17], oral [18], e os cancros da nasofaringe [19]. No entanto, o papel do RUNX3 na regulação do crescimento das células epiteliais gástricas e a sua actividade supressora de tumores em cancro gástrico devem ser esclarecidas. Levanon e seus colegas questionaram a relação causal entre a perda de expressão RUNX3 e câncer gástrico, e relataram que camundongos RUNX3 deficiente não desenvolveram hiperplasia gástrica ou tumores gástricos [20, 21]. Carvalho et al. refutado um papel de supressor de tumor do gene RUNX3 em carcinomas gástricos e de início precoce, com base na sua falta de expressão no epitélio gástrico não neoplásico histológica, embora pelo menos duas cópias do gene estavam presentes na grande maioria das células analisadas [ ,,,0],22]. No entanto, as associações entre metilação do promotor RUNX3 e câncer gástrico, na sua maioria foram investigadas em estudos com pequenos tamanhos de amostra, baixo poder estatístico, etnias específicas, ou outras limitações no desenho do estudo, levando a resultados conflitantes.
Meta-análise é um bem -established método para quantificar associações de genes de doenças mais precisamente, utilizando todos os dados publicados disponíveis, para aumentar o poder estatístico [23]. Nós, portanto, realizou uma meta-análise, usando todos os estudos disponíveis para definir melhor a associação entre a metilação do promotor RUNX3 e câncer gástrico.
Métodos
Estratégia de busca
Este estudo combinado envolveu procurando uma gama de bases de dados informatizadas, incluindo Medline , Blackwell, Cochrane Central, web of Science, e Ovídio, para artigos publicados em Inglês ou chinês de janeiro de 2000 a janeiro de 2011. O estudo utilizou uma estratégia assunto e palavra texto com (RUNX3 oU AML2 oU CBFA3 oU PEBP) e ((gástrica ou do estômago) e (câncer ou neoplasia)) como os termos de busca principais. A estratégia de busca foi adaptada para cada banco de dados para garantir que a pesquisa foi abrangente e não se limitando a ensaios clínicos randomizados.
Seleção dos estudos e extração de dados
Três revisores independentes (Fan, Hu e bandeja) selecionados os títulos e resumos identificados pela busca eletrônica para identificar estudos relevantes. artigos relevantes foram ainda examinadas para ver se eles preencheram os critérios de inclusão. As seções a referência de todos os artigos recuperados foram pesquisados para identificar os artigos mais relevantes. Uma busca citação foi realizada em todos os artigos incluídos usando o Science Citation Index. Potencialmente documentos relevantes foram obtidos e os artigos completos foram selecionados para inclusão por dois revisores independentes (FAN, Hu). Discordâncias foram resolvidas por discussão. Os estudos incluídos foram resumidos em formas de extração de dados. Autores foram contatados quando os dados relevantes foram faltando.
O nome do primeiro autor, ano de publicação, a origem dos pacientes do estudo, tamanho da amostra e estado de metilação do promotor RUNX3 no cancro gástrico humano e tecidos normais ou de controlo foram extraídos . Os critérios de inclusão foram os seguintes: os pacientes tiveram de ser diagnosticado com câncer de estômago e os estudos tinham que ter gene RUNX3 de dados promotor metilação de amostras de tecido. Foram excluídos os seguintes tipos de estudos: as experiências com animais, relatos de casos, artigos de revisão ou meta-análises e estudos com dados insuficientes análise dos dados
e síntese