Helicobacter pylorigenotypes nustatytos skrandžio biopsijos iš Jordanijos patients

Helicobacter pylori
genotipų nustatytas skrandžio biopsijos iš Jordanijos pacientų
tezės
Background Viesbutis The genetinės įvairovės Helicobacter pylori pervežimas gali būti analizuojama dviem skirtingais lygiai: genomo variantas tarp kilę iš skirtingų asmenų padermių, o bakterijų populiacijų kitimas per atskiro kompiuterio. Mes pranešė pirmą kartą H. pylori
genotipų Jordanijos pacientams, sergantiems virškinimo trakto ligomis.
Metodai
Aukštutinė endoskopija buvo atliktas 250 pacientai, kuriems pasireiškia virškinimo trakto ligų. Keli skrandžio biopsijos mėginiai buvo paimti iš antralinėje dalyje. Visi biopsijos buvo išbandyti PGR už H. pylori
virulentiškumo genų Vaca
, CagA
ir ICEA
ir 151 buvo išbandyti histologiją.
Rezultatai Viesbutis The biopsijų teigiamų H. pylori
PGR buvo 110/250 (44%), ir histologiją 117/151 (77,5%), o šie rezultatai buvo labai susijęs (p
< 0,02). Analizė virulentiškumo genų atskleidė, kad iceA2
(73,6%) buvo dominuojantis genotipas, kad Vaca
s2 alelis buvo dažniau nustatyti nei Vaca
s1 alelio, o CagA
genotipas buvo mažas (26,4 %). Tam tikrų genotipų buvimas gali būti susijęs su viena su kita, bet tam tikrų genotipų buvimas nebuvo reikšmingai susijęs su amžiumi, arba lytį pacientui.
Išvada
rezultatai rodo, geografinę pobūdį genetinei įvairovei H.pylori
, kaip nustatyti genotipus yra panašūs į tuos, pranešė kaimyninėse šalyse. Šis tyrimas suteikia pradinius duomenis H. pylori
genotipų nustatytas skrandžio biopsijos iš Jordanijos, tarnauja kaip galingas epidemiologinės priemonė būsimiems tyrimams, siekiant geriau suprasti genetinę įvairovę šio patogeno.
Faktai
Helicobacter pylori
yra skrandžio patogenas, kad chroniškai užkrečia daugiau kaip pusė visų žmonių visame pasaulyje. Besivystančiose šalyse 70-90% gyventojų vykdo H. pylori
; beveik visi iš jų užsikrečia iki 10 metų [1] amžiaus. Išsivysčiusiose šalyse paplitimas yra mažesnis, jis svyruoja nuo 25 iki 50% (8) [1], dėl pagerėjusių socialinėmis ir ekonominėmis sąlygomis per pastaruosius kelis dešimtmečius [2]. Todėl H. pylori
infekcija besivystančiose šalyse gali prisidėti prie vaikystės mitybos ir padidinti riziką ar sunkumą infekcijos kitų virškinimo trakto ligų sukėlėjų, pvz Vibrio cholerae
[3]. Dauguma infekuotųjų yra besimptomė arba sergate lėtiniu gastritu [1, 4]. Į ligos baigtį skirtumai gali būti dėl įvairių veiksnių, į kuriuos įtrauktos numerių rezultatas; priimančiosios veiksniai, aplinkos veiksniai, o skirtumai paplitimą ar išraiška bakterijų virulentiškumo veiksnių [4, 5]. Genetinė įvairovė H. pylori
gali būti analizuojama dviem skirtingais lygmenimis: genomo variantas tarp kilę iš skirtingų asmenų padermių, o bakterijų populiacijų kitimas per individualaus priimančiosios [6]. Naudojant atsitiktinai papildyta polimorfinės DNR PGR ir DNR pirštų atspaudų, tai buvo įrodyta, kad kamienai iš nesusijusių infekuotų pacientų unikalius pirštų atspaudus, o išskirtų iš šeimos narių turėjo labai panašus, nors nėra identiški modeliai [7]. Šie rezultatai leido suprasti, kad pastebėtas tarp kamienų užkrėsti individualius šeimos narius skirtumai įvyko po pirminės infekcijos. Tokia genetinė įvairovė galima pastebėti tarp H. pylori
virulentiškumo genų; CagA
, Vaca
ir ICEA
.
A vacuolating citotoksinas kad kenkia epitelio ląstelių yra koduojamas Vaca
geno [8, 9], kuriame yra ne mažiau kaip du kintamos dalys [10] , The Vacas regionas
(kuris koduoja signalinį peptidą) egzistuoja kaip s1 arba s2 alelių tipų, tarp tipo s1 padermių, potipių s1a, s1b ir s1c buvo nustatyta [11]. M (viduryje) regione atsiranda kaip them1 arba m2 alelių tipo, be tipo m2, buvo nustatyti du potipiai, paskirta M2a ir M2B. Apskritai, tipas S1 M1 ir tipo S1 m2 padermės gamina aukštos ir saikingas toksino, atitinkamai, o S2 m2 padermių rodo mažai arba novacuolating toksino veiklą [10].
ICEA
geną, kodavimą spėjamą apribojimas fermentas, kuris, atrodo, yra sukeltas, kai H. pylori
susiduria epitelio ląsteles rodo alelių variacijos pagal taškinės mutacijos, todėl dviejų alelių rūšims, iceA1 parsisiųsti ir iceA2
[6]. Iš H. pylori
infekcijos tyrimas pacientams, kuriems turi būti atlikti viršutinės virškinimo trakto endoskopija Jordanija pranešė didelį paplitimą [12], ir patvirtino, kad jo buvimas buvo reikšmingai susijęs su gastritu ir skrandžio opa. Dabartinės tyrimų ataskaitos pirmą kartą Jordanijoje H. pylori
genotipai nustatytos skrandžio biopsijos.
Metodai
Pacientai
250 pacientų eilės iš viso, kas lankėsi karalius Abdullah ligoninė ir princesė Basma ligoninė nuo 2003 liepos iki 2004 gegužės, atvykę endoskopinio buvo įtraukti į tyrimą. Šios dvi mokymo ligoninės susijęs su Jordan universiteto mokslo ir technologijos, kur buvo atliktas tyrimas. Biopsijos mėginiai buvo paimti iš antralinėje dalyje. Tyrimas patvirtino Etikos komiteto universitete. Kiekvienas pacientas pasirašo rašytinį informuoto sutikimo Prieš MĖGINIŲ ĖMIMAS, ir visi klinikiniai mėginiai buvo išbandytas undercode
Duomenų
pateiktą patologijos ataskaitos ar pacientų bylų buvo įrašytas kiekvienam pacientui informaciją, kuri įtraukta:. Paciento ligoninėje skaičių , amžius, lytis, istorija, klinikinė diagnozė remiantis histologiją, endoskopija ir ankstesnio gydymo (pvz anti-H. pylori
, trys turėjo protonų siurblio inhibitoriais ar antacidinių preparatų). Simptomai, apie kuriuos pranešta pagal pacientų, kuriems buvo atlikta viršutinės virškinimo trakto endoskopija buvo pilvo skausmas, epigastriumo skausmas, vėmimas, rėmuo.
Histologinių tyrimų
histologinis tyrimas buvo atliktas 151 (60,4%) antralinių biopsijos. Penki mėginiai iš Ertmė gleivinės buvo imtasi su vidutinių žnyplėmis. Du egzemplioriai buvo įdėta į parafiną ir parafino skyriai buvo dažomi hematoksilinu-eozino ir Giemsa metodus. Gleivinės mėginiai buvo įvertintas histologiškai pagal Sidnėjaus klasifikaciją. Užkoduotas skaidres buvo tiriami mikroskopiškai vieno patologas, naudojant didelės galios (priartinimas, × 400), ir buvo ištirta bent penkis didelės galios laukai.
PGR pagrįstas genotipo trijų virulentiškumo genų
Visi 250 biopsijos išbandyti PGR metodu buvo laikomi -80 ° C temperatūroje 70% etanolio EPPENDORF vamzdžių, kol bus perdirbamas. Šie biopsijos apėmė 151 biopsijų, kad buvo ištirti histologiją.
Biopsijos mėginiai buvo homogenizuoti sterilia mikro grūstuvu ir DNR buvo išskirta naudojant vedlį Genomo DNR gryninimo rinkinį (PROMEGA, Madison, WI, JAV), vadovaujantis gamintojo instrukcijomis už DNR gryninimo iš gyvūnų audinių. Iš H. buvimas pylori
buvo aptikti atskirų projekto užbaigimo, kuriomis siekiama CagA
, Vaca
S ir M regionai ir ICEA
genotipų buvo nustatomas atskiru iceA1 CR.LT - ir iceA2
specifinę PGR reakcijų, kaip aprašyta anksčiau [13, 14]. Penki rūšims būdingas gruntas rinkiniai (alfa DNR, Monrealis, Kanada) buvo naudojamas sustiprinti labai užkonservuotas per nurodytą genų.
Statistinė analizė Viesbutis The asociacijos tarp histologiją ir PGR rezultatus, ir tarp genotipų asociacija buvo analizuojami naudojant Fišerio tikslusis ir chi kvadrato testai statistinis paketas socialiniams mokslams (SPSS Inc. "Čikaga, Ilinojus JAV). Vidutinio amžiaus vyrų ir moterų skirtumas buvo apskaičiuojamas nepriklausomybė imties t-testą.
Rezultatai
diagnozė H. pylori
buvo grindžiamas histologiją ir metodas. PGR
Histologiniai išvados
histologinis ištyrimas iš 151 biopsijų atskleidė, kad 117 (77,5%) pacientų buvo teigiami H. pylori pervežimas, todėl iš tikrųjų buvo užsikrėtę, ir 34 (22,5%) buvo neigiami.
virulentiškumo veiksniai
buvimą CagA
, Vaca
s ir m regionai ir iceA1 CR.LT - ir iceA2
genai buvo tiriama visų 250 biopsijų. Kad biopsijos, kad buvo PGR teigiamas dėl vienos ar daugiau genų buvo 110 (44%), ir 140 (56%) buvo neigiami visų genų
Apgaubiama:. Moterų santykis iš pacientų populiacijos buvo 58/110 (52,7 %) vyrai: 52/110 (47,3%) moterys; (Amžiaus vidurkis 42.03 + 15,135 metų; asortimentą, 17 - 67 metų)
H. pylori genotipai Viesbutis The genotipui nustatyti rezultatai 110 biopsijų pateikti lentelėje 1.Table 1 Paplitimas Helicobacter pylori
genotipai nustatytas. 110 biopsijų
genotipo

paplitimas (%)
Vaca
S1
34 (45,3)
Vaca
S2
41 (54,7)
Vaca
M1
23 (48,9)
Vaca
m2
24 (51,1)
Vaca
s1m1
12 (46,2 )
Vaca
s2m2
12 (46,2)
Vaca
s1m2
2 (7,7)
Vaca
s2m1
0 (0.0)
CagA
29 (26,4)
iceA1
0 (0.0)
iceA2
81 (73,6)
Vaca genotipai
dydžių amlifikuoti gaminiai Vaca
S1 ir Vaca
s2 yra 259 bp ir 286 bp atitinkamai. Atitinkamų produktų intensyvumas svyravo nuo egzempliorių. Vaca
-ai regionas buvo sustiprina 75/110 (68,2%) biopsijų. S1 variantas buvo aptikta 34/75 (45,3%), arba 34/110 (30,9%), palyginti su s2 variantų, kuriuos buvo aptiktas 41/75 (54,7%), arba 41/110 (37,3%) iš kad biopsijos. Į Vaca
m regionas buvo aptiktas 47/110 (42,7%) biopsijų. M1 variantas buvo aptiktas 23/47 (48,9%) arba 23/110 (20,9%), palyginti su m2 variantu aptikta 24/47 (51%), arba 24/110 (21,8%).
Derinys iš Vaca
s, ir m regionai buvo aptiktas 26/110 (23,6%) iš biopsijos. Tiek Vaca
s1m1 ir Vaca
s2m2 buvo aptikta maždaug lygiomis dalimis į 12/26 (46,2%), iš Vaca
SM genotipu arba 12/110 (10,9%), o Vaca
s1m2 buvo aptiktas tik 2/26 (7,7%) iš Vaca
sM genotipu ar 2/110 (1,8%). Nė vienas iš biopsijos parodė Vaca
s2m1 genotipą ar kelis genotipus.
CagA genotipą Viesbutis The iš CagA
papildyta produkto dydis buvo 349 bp. Į CagA
genotipas buvo aptiktas 29/110 (26,4%) ir 81 (73,6%) buvo neigiami.
Tarp CagA ir vacAs1 genotipų Viesbutis The CagA
genotipas buvo nustatytas 8 asociaciją /17 (47,1%) iš Vaca
s1 genotipo, palyginti su vos 2/20 (10%) iš Vaca
s2 genotipas.
ICEA genotipo
Nė vienas iš 110 biopsijų atskleidę ICEA
1 genotipas, o 81 (73,6%) parodė iceA2
genotipą. IceA2
amplifikacija davė tiek 229 bp ir 334 bp fragmentus, tai skirtumas tarp: fragmentas yra dėl to, kad yra 105 bp buvimą - rėmo amplikono, esantis 334 bp fragmento, kad nėra kalbant apie 229 bp fragmento [ ,,,0],15].
tarp genotipų ir lyties
Nors kai genotipai buvo aptikta daugiau vienos lyties nei kiti, jų buvimas nebuvo reikšmingai susijęs su amžiumi, lytimi ar paciento asociacija. , Kurie buvo aptikti daugiau vyrų nei moterų buvo Vaca
S1 9/17 (53%), CagA
16/29 (55,2%) genotipai, iceA2
45/81 (55,5%), Vaca
s1m1 7/12 (58,3%), ir Kombinuotosios Vaca
S1 CagA
genotipai 6/8 (75%). , Kurie buvo aptikti daugiau moterų genotipų buvo Vaca
S2 11/19 (65%), Vaca
m2, 15/20 (75%), Vaca
s2m2 8/11 (72,7%), o į kombinuoto Vaca
S2 CagA
genotipai 2/2 (100%). Į Vaca
M1 ir Vaca
s1m2 genotipai buvo aptikta maždaug vienodo dydžio abiejų lyčių
Statistinė analizė
bendras teigiamas PGR rezultatus buvo labai susijęs (p
< 0,02). Su histologija rezultatai. Duomenų analizė parodė reikšmingą ryšį tarp vienu metu aptikti tiek CagA
ir Vaca
s1 genotipų (p
= 0,026), tiek šios Vaca
S1 ir Vaca
M1 derinys genotipai (p
< 0,0001), o tiek Vaca
s2 ir Vaca
m2 genotipų derinys (P
< 0,0001). Kita vertus, ne asociacija buvo pastebėtas tarp aptikti tiek į Vaca
s2 ir CagA
genotipų (P
= 0,102), daugiau nei vieno genotipo su abiejų amžiaus ar lyties nustatymo (p
> 0,05), iš derinys tiek Vaca
S1 o Vaca
m2 genotipai (P
> 0,05), o tiek Vaca
S2 ir Vaca derinys
m1 genotipai (P
> 0,05).
Diskusijos
Šio tyrimo ataskaitas apie Vaca
, CagA
ir ICEA
genotipų H. pylori
kad buvo nustatyta skrandžio biopsijos. Nors visi štamai atlikti iš Vaca geno kopiją, nei su s1 arba s2 signalų sekų, The Vaca
-ai regionas buvo sustiprina 75/110 (68,2%) biopsijų. Panašūs rezultatai buvo pranešta kitų tyrimai rodo, kad gali būti papildomų pošeimiai S ir M genotipų šalia žinomų tie [16].
Dominuojantis genotipas į 110 biopsijų, kad buvo teigiama H. pylori
PGR buvo iceA2
(73,6%), po to Vacas
genotipo (68,2%); 34 (45,3%) iš jų buvo Vaca
s1 alelio, ir 41 (54,7%) buvo Vaca
s2 alelis, o CagA
genotipas buvo papildyta tik 29/110 (26,4%) ir kad biopsijos. Mūsų rezultatai sutampa su kitų tyrimų atlikta Izraelio vaikams [13], ir Egipto pacientų [15], kur CagA
genotipas buvo pranešta 28% ir 36% atitinkamai. Iš genotipų nustatytų trijų tyrimų panašumo gali būti paaiškinti pirminio geografinės įtakos svarbus organizmo į aplinką ir klimato sąlygų [13] pritaikymo, nepaisant akivaizdžių šeimininko skirtumų gyvenimo stiliaus dviejų kaimyninių šalių. Glaudus panašumas padermių kaimyninėse šalyse, taip pat buvo pranešta, Bangladešas ir Kalkutoje, [3, 17] Indijoje, kuri yra gana tikėtina, atsižvelgiant į arti dviejų šalių, panašių fiziologinių aplinką bei gyvenimo būdo priimančiosios.
aukštojo paplitimas (67% ar daugiau) iš CagA
genotipo H. pylori
buvo pranešta Europoje, Centrinėje ir Pietų Amerikoje, ir Azijoje [15]. Į Vaca
S2 alelis buvo aptikta mažiau nei 30% tirtų gyventojų dauguma šių šalių. Paplitimas šio genotipo panaši į dabartinę studijų (54,7%) buvo pranešta Egipte (50%) [15], o didesni tarifai (65%) buvo pranešta Izraelio tyrimo [11]. Tyrimas Kuveitas pranešė, kad Vaca
S1 ir S2 rūšių buvo aptikta maždaug vienodas skaičius biopsijų iš pacientų Vidurio Rytų kilmės, o Afrikos arabai buvo daugiausia užkrėstų su s2 tipo [18]. Iš genotipų keturių skirtingų šalių tyrimas pranešė, kad CagA
ir Vaca
s1ml iceA1
genotipų vyravo tiek Japonijoje ir Korėjoje [14], ir CagA
, Vaca
s1m1 , iceA2
genotipai buvo dažnai nurodomas Jungtinėse Amerikos Valstijose, o CagA
, Vaca
s1m1, iceA2
genotipai vyravo Kolumbijoje. Tas pats tyrimas pranešė aukštesnio paplitimas Vaca
s1 nei į Vaca
s2 genotipo, bei aukšto paplitimas CagA
genotipo; Tačiau iš iceA1
paplitimas ir iceA2
genotipai svyravo tarp šių šalių. Atliktas tyrimas Anglijoje pranešė, kad Vaca
s1m1 genotipas buvo nustatyta, kad mažiau paplitęs Anglijoje [19], o iš iceA1
alelių, CagA
vyravimas, o Vaca
M1 buvimas buvo pastebėtas aleliai. Turkijos padermių nagrinėti daugiausia užėmė CagA
, Vaca
s1m1 arba Vaca
m2 genotipus, kurie buvo tipiškas genotipus kamienų iš Vakarų šalių [20]. Iš Vaca
SL /m1 alelių derinys vyrauja, aukšto paplitimas CagA
geno (87%), taip pat buvo pranešta Estija H. pylori
padermių [21].
Remiantis a iš Vaca
-ai kartu buvimas ir m aleliai, kad Vaca
S1 alelis buvo reikšmingai susijęs su Vaca
M1 (p
< 0,0001), o ta pati asociacija buvo pastebėtas tarp į Vaca
S2 o Vaca
m2 (P
< 0,0001) aleliai. Tačiau tiek Vaca
S1 ir Vaca
m2 alelių aptikimo buvo nepriklausomi vienas nuo kito (P
> 0,05). Į Vaca
s1m2 genotipas buvo nustatytas tik 2/26 (7,7%) iš Vaca
sm derinys. Be to, nebuvo reikšmingas ryšys tarp Vaca
s2 ir Vaca
m1, o tai reiškia, kad kiekvieno alelio aptikimo buvo nepriklausomi vienas nuo kito (p
> 0,05). Ši išvada gali paaiškinti kombinuotosios S2 /m1 genotipo nebuvimas tyrime išskirtų, kad buvo pranešta anksčiau [22, 23]. Tačiau pirmasis atvejis Vaca
s2m1 H. pylori
išskirto buvo pranešta apie dvylikapirštės žarnos opa pacientui iš Pietų Afrikos [24].
Reikšmingas ryšys tarp Vaca
s1 alelio ir CagA
genotipas (47,1%) mūsų tyrime taip pat buvo pranešta 50% Izraelio ir Egipto izoliatų [13, 14]. Daugiau nei 85% izoliatų asociacija buvo pranešta kitose šalyse [15, 22], patvirtinantį, kad šie du žymenys yra glaudžiai susiję. Mūsų tyrimas parodė, kad reikšmingų asociaciją dviejų genotipų pačiu izoliato aptikti, pavyzdžiui, CagA
su ICEA
2 d Vaca
m2 alelio su ICEA
2 genotipo ir Vaca
S2, m2 aleliai su ICEA pervežimas 2 rodo, kad vieno geno aptikimas buvo nepriklausomi vienas nuo kito. Be to, vadovaujantis Kombinuotosios Vaca
s1 M1 atskleidimo ir ICEA
2 genotipai keletą biopsijų buvo nereikšmingas (p
> 0,05), nurodant, kad ICEA
2 aptikimo buvo nepriklausoma nuo Vaca
genotipus. Tie patys duomenys buvo pranešta pagal ankstesniame tyrime [22]. Nė vienas iš kamienų buvo daug VAC
A genotipų, kurie buvo pranešta kitose šalyse, pavyzdžiui, šiaurinėje Pietų Amerikos [15].
Moterys buvo dažniau vežančios Vaca
s2, o Vaca
m2 genotipas (65%, ir 75%, atitinkamai), lyginant su (42%, ir 25%) vyrų. IceA2
(55,5%), CagA
(55,2%), o Vaca
S1 (53%) genotipai buvo aptikta daugiau vyrų nei moterų. Paciento ir tam tikrų genotipų ar genotipų kombinacijos aptikimo lytis nebuvo reikšmingai susijęs. Be to, H. pylori
genotipai (P
> 0,05)., O daugiau nei vieną genotipo nustatymo neturėjo reikšmingos asociacijos arba amžiaus ar lyties paciento Viesbutis The bendras teigiamas PGR rezultatai labai susijęs (p
< 0,02) su Histologijos rezultatus. Į histologiją skirtumus ir PGR rezultatai gali būti dėl to, kad fragmentiškas platinimo H. pylori pervežimas į skrandį. Be to, klaidingų neigiamų rezultatų gali būti ir genotipo problema iš biopsijos, nes buvo rasta keletas biopsijos, kad yra junginiai slopina PGR [25]. Be to, testavimo daugiau kelis biopsijos pagal histologiją, palyginti su viena PGR būdu padidėjo rasti bakteriją galimybę, ir paaiškina, gautus terapijai (77,5%) daugiau teigiamus rezultatus, palyginti su PGR (44%). Pacientų su protonų siurblio inhibitoriais, antacidinių vaistų, ar anti-H procedūros. pylori
terapija gali sukelti neigiamų rezultatų atliktų šių pacientų [26]. bandymais
Išvada
Jordanijos padermių nagrinėti daugiausia užėmė iceA2
alelio, kad Vaca
s2 alelis buvo aptiko daugiau nei Vaca
s1 alelio, o CagA
genotipas buvo mažas. Tam tikrų genotipų aptikimo gali būti susijęs su viena su kita. Rezultatai parodyti geografinį pobūdį genetinei įvairovei H. pylori
, kaip nustatyti genotipus yra panašūs į tuos, pranešė kaimyninėse šalyse.
Šis tyrimas suteikia pradinę sistemą H. pylori
genotipai, nurodytą skrandžio biopsijos mėginius, aptarnaujančių kaip galingas epidemiologinės priemonė būsimiems tyrimams, siekiant geriau suprasti genetinę įvairovę šio patogeno.
deklaracijos
Padėka
autoriai padėkoti gastroenterologams ir slaugytojų iš Endoskopija departamento karalius Abdullah ir princesė Basma ligoninėse, kurie padėjo į mėginio paėmimo. Tyrimas parėmė dotacijos/04 nuo mokslinių tyrimų Deanship prie Jordano universiteto mokslo & Technologijos.
Konkuruojančių interesų
autoriaus (-ių) deklaruoja, kad jie neturi jokių konkuruojančių interesų.

Helicobacter pylorigenotypes nustatytos skrandžio biopsijos iš Jordanijos patients

tyrimai

tyrimai

Other Languages