Helicobacter pylorigenotypes azonosított gyomor biopsziás mintáiban jordániai beteg

Helicobacter pylori katalógusa genotípusok azonosított gyomor biopsziás mintáiban jordániai beteg katalógusa Abstract katalógusa Háttér katalógusa A genetikai sokféleség Helicobacter pylori katalógusa lehet elemezni két különböző szinten: a genom közötti eltérések származó törzsek különböző egyének, és az eltérő baktérium populációk egyéni gazda. Számoltunk be először a H. pylori katalógusa genotípusok jordániai betegek gyomor-bélrendszeri betegségek. Katalógusa módszerek katalógusa Felső endoszkópos vizsgálatot végeztek 250 beteg tünetei a gyomor-bélrendszeri betegségek. Több gyomor biopsziás mintákat vettünk a antrumból. Minden biopsziák teszteltük PCR-rel a H. pylori
virulencia géneket vacA
, cagA
, és ICEA katalógusa, és 151 vizsgáltuk szövettani.
Eredmények
biopsziák pozitív H. pylori
PCR voltak 110/250 (44%), és a szövettani 117/151 (77,5%), és ezek az eredmények nagymértékben asszociálnak (p
< 0,02). Az elemzések a virulencia gének kiderült, hogy iceA2 katalógusa (73,6%) volt az uralkodó genotípus, a vacA katalógusa s2 allél gyakrabban azonosították, mint a vacA katalógusa s1 allél, míg a cagA katalógusa genotípus alacsony volt (26,4 %). A jelenléte bizonyos genotípusok kapcsolatban állhat egymással, de a jelenléte bizonyos genotípusok nem szignifikánsan kapcsolódik a kor vagy a nem a beteg. Katalógusa Következtetés
Az eredmények szemléltetik a földrajzi jellegű genetikai sokféleségének H. pylori
, mint az azonosított genotípusok hasonlóak jelentett a szomszédos országokban. Ez a tanulmány a kiindulási adatok a H. pylori katalógusa genotípusok azonosított gyomor biopsziás mintákban Jordan szolgáló erőteljes epidemiológiai eszköz leendő vizsgálatok, hogy jobban megértsék a genetikai sokféleség a kórokozó. Katalógusa Háttér katalógusa Helicobacter pylori
egy gyomor kórokozó, amely krónikusan fertőz több mint a fele az összes ember a világon. A fejlődő országokban 70-90% -át a lakosság hordoz H. pylori katalógusa; szinte az összes ilyen a fertőzést megelőzően 10 év [1]. A fejlett országokban a prevalencia alacsonyabb, 25-től 50% (8) [1], mivel a jobb társadalmi-gazdasági körülmények között az elmúlt néhány évtizedben. [2] Ezért H. pylori fertőzés katalógusa fejlődő országokban hozzájárulhat a gyermekkori alultápláltság és növeli a kockázatát vagy súlyosságát a fertőzés egyéb gyomor-bélrendszeri kórokozók, mint például a Vibrio cholerae katalógusa [3]. A legtöbb fertőzött egyén tünetmentes, vagy krónikus gyomorhurut [1, 4]. A különbségek a betegség kimenetele lehet az eredménye, számos tényező, amelyek magukban foglalják; fogadó tényezők, a környezeti tényezők és a különbségek a prevalenciája vagy expressziós bakteriális virulencia faktorok [4, 5]. A genetikai sokféleség a H. pylori katalógusa lehet elemezni két különböző szinten: a genom közötti eltérések származó törzsek különböző egyének, és az eltérő baktérium populációk egyedi host [6]. Segítségével véletlenszerűen amplifikált polimorf DNS-PCR-rel és DNS-ujjlenyomat, azt már kimutatták, hogy a törzsek nem kapcsolt fertőzött betegek egyedi ujjlenyomatok, míg izolált törzsek családtagok volt nagyon hasonló, bár nem azonos minták [7]. Ezek az eredmények azt sugallta, hogy között megfigyelt különbségek törzsek megfertőzheti az egyes családtagok történt elsődleges fertőzés után. Ilyen genetikai diverzitás figyelhető között H. pylori katalógusa virulencia géneket; cagA
, vacA
, és ICEA
.
Egy vacuolating citotoxin hogy megsérül hámsejtek által kódolt vacA
gén [8, 9], amely tartalmaz legalább két variábilis részeit [10] . A Vacas
régió (amely kódolja a szignál peptid) létezik, mint az S1 vagy S2 allél típusok között típus S1 törzsek, altípusok S1A, S1B, és S1C azonosították [11]. Az m (középen) régióban fordul elő them1 vagy m2 allél típus között típus m2, két altípust azonosítottak, kijelölt m2a és M2B. Általában típusa S1 M1 és típusa S1 m2 törzsek termelnek magas és mérsékelten toxin, illetve, míg S2 m2 törzsek mutatnak csekély vagy novacuolating toxin aktivitását [10].
A ICEA
gén kódoló egy feltételezett korlátozás enzim, amely úgy tűnik, hogy indukált amikor H. pylori
találkozik hámsejtek mutatja allélikus variáció szerint pontmutáció, ami két allél típusok a iceA1
és iceA2
[6]. A tanulmány a H. pylori katalógusa fertőzött betegek alá, a felső gasztrointesztinális endoszkópia Jordánia jelentett magas előfordulási [12], és megerősítette, hogy a jelenléte szignifikáns összefüggést mutatott a gyomorhurut és a gyomorfekély. A jelenlegi vizsgálati jelentések először Jordánia H. pylori katalógusa genotípusok azonosított gyomor biopsziás mintákban. Katalógusa Módszerek katalógusa Betegek
Összesen 250 egymást követő beteg, aki ellátogatott Abdullah király Kórház, és a Princess Basma kórházban 2003. július 2004. május felső endoszkópia vontunk be a vizsgálatba. Ez a két tanítási kórházak kapcsolatban Jordan University of Science and Technology, ahol a vizsgálatot végezték. Biopsziás mintákat vettünk a antrumból. A tanulmány által jóváhagyott etikai bizottság az egyetem. Minden beteg aláírt egy írásos beleegyezést megelőzően a mintavétel, és minden klinikai mintákat vizsgáltunk undercode. Katalógusa adatok
A tájékoztatás a patológiai jelentés vagy a betegek fájlok rögzítették az egyes betegek, amely tartalmazza: a beteg kórházi száma , kor, nem, a történelem, a klinikai diagnózis alapján szövettan, endoszkópia, és a korábbi kezelés (pl anti-H. pylori katalógusa, három volt protonpumpa-gátlók vagy savkötők). A tünetek a betegek említették átesett a felső gasztrointesztinális endoszkópia a hasfájás, gyomortáji fájdalom, hányás, vagy gyomorégés.
Szövettani vizsgálatok
szövettani vizsgálat történt 151 (60,4%) antrális biopsziás minták. Öt egyedeire antrumból nyálkahártyát venni közepes csipesz. Két mintákat paraffinba ágyaztuk, és a paraffin metszeteket megfestjük hematoxilin-eozin és Giemsa módszerekkel. A nyálkahártya mintákat értékelték szövettanilag szerint a Sydney besorolás. Kódolt metszetet mikroszkópos egyetlen patológus segítségével nagyteljesítményű (nagyítás, × 400), és legalább öt nagy teljesítményű területeken vizsgáltuk. Katalógusa PCR-alapú genotipizálás három virulencia géneket Tanuld az összes 250 biopszia tesztelt PCR tároltuk -80 ° C hőmérsékleten 70% -os etanolban Eppendorf csövekben, amíg feldolgozásra. Ezek a biopsziák tartalmazza a 151 biopsziát, amelyeket teszteltünk, szövettanilag.
A biopsziás mintákat homogenizáltuk steril mikro mozsártörő, és a DNS-t extraháljuk Wizard genomiális DNS tisztító készletet (Promega, Madison, WI, USA), a gyártó utasításai tisztítására származó DNS állati szövet. A H. pylori jelenlétének katalógusa detektáltuk külön PCR-ek, amelynek célja a cagA
, vacA
s és m régiók és az ICEA
genotípusokat határoztuk meg külön iceA1
- és iceA2
-specifikus PCR-ek, mint a korábban leírt [13, 14]. Öt faj-specifikus primer készletek (alfa-DNS, Montreal, Kanada) amplifikálására alkalmaztuk erősen konzervált régiókon belül a megjelölt géneket.
Statisztikai analízis katalógusa összefüggését a szövettani és PCR eredmények, és a szövetség között genotípusok elemeztük a Fisher-féle egzakt és chi-négyzet próbát statisztikai csomag társadalomtudományok (SPSS Inc. Chicago, Illinois USA). A különbséget az átlagos életkora férfiak és nők között számítottuk ki függetlenségét mintás t-próba. Katalógusa eredményei katalógusa diagnózisa H. pylori katalógusa alapult szövettan és PCR módszerrel.
Szövettani leletek
szövettani vizsgálata 151 biopszia során kiderült, hogy 117 (77,5%) beteg volt pozitív H. pylori katalógusa, tehát ténylegesen fertőzött, és 34 (22,5%) negatív volt.
virulenciatényezők katalógusa a jelenléte a cagA
, vacA katalógusa s és m régiók és a iceA1 katalógusa - és iceA2 katalógusa géneket vizsgáltunk minden 250 biopsziát. A biopszia, hogy PCR-pozitív, egy vagy több gén volt 110 (44%), illetve 140 (56%) negatív volt az összes gén.
A férfi: nő arány a vizsgált betegcsoport 58/110 (52,7 %) férfiak: 52/110 (47,3%) nő; (Átlagéletkor 42,03 + 15,135 év; tartomány 17-67 év). Katalógusa H. pylori genotípus
eredményei genotípus 110 biopszia táblázatban közöljük 1.Table 1 prevalenciája Helicobacter pylori katalógusa genotípusok észlelt 110 biopszia katalógusa genotípus Matton prevalenciája (%) Matton vacA katalógusa s1 katalógusa 34 (45,3) hotelben vacA katalógusa s2
41 (54,7) hotelben vacA katalógusa m1 katalógusa 23 (48,9) hotelben vacA katalógusa m2 katalógusa 24 (51,1) hotelben vacA katalógusa s1m1 katalógusa 12 (46,2 ) hotelben vacA katalógusa s2m2 katalógusa 12 (46,2) hotelben vacA katalógusa s1m2 katalógusa 2 (7.7) hotelben vacA katalógusa s2m1 katalógusa 0 (0.0) hotelben cagA Matton 29 (26,4) hotelben iceA1 Matton 0 (0.0) hotelben iceA2 Matton 81 (73,6) hotelben vacA genotípus
a méretek a amplifikált termékek vacA katalógusa s1 és s2 vacA katalógusa 259 bp és 286 bp volt. Az intenzitás a termékek között változott példányok. A vacA katalógusa s régiót amplifikáltuk 75/110 (68,2%) biopszia. Az S1 variáns volt kimutatható 34/75 (45,3%), vagy a 34/110 (30,9%), míg az S2 variáns, amely kimutatható volt 41/75 (54,7%), vagy a 41/110 (37,3%) mennyiségben a biopszia. A vacA katalógusa m régióban volt kimutatható 47/110 (42,7%) biopszia. Az M1 variáns volt kimutatható 23/47 (48,9%) vagy a 23/110 (20,9%), összehasonlítva m2 variáns kimutatható 24/47 (51%), vagy a 24/110 (21,8%).
Egy kombináció a vacA katalógusa s, és m régiók volt kimutatható 26/110 (23,6%) mennyiségben a biopsziák. Mindkét vacA katalógusa s1m1 és vacA katalógusa s2m2 mutattunk megközelítőleg azonos mennyiségben 12/26 (46,2%), a vacA katalógusa sm genotípus, illetve 12/110 (10,9%), míg vacA katalógusa s1m2 volt kimutatható csak 2/26 (7,7%) mennyiségben a vacA katalógusa sm genotípus, vagy 2/110 (1,8%). Egyik biopsziás minták mutatták a vacA katalógusa s2m1 genotípus, vagy többszörös genotípusok. Katalógusa cagA genotípus katalógusa A méret a cagA katalógusa amplifikált termék 349 bp. A cagA katalógusa genotípus volt kimutatható 29/110 (26,4%), és 81 (73,6%) negatív volt.
Az egyesület közötti cagA és vacAs1 genotípusok katalógusa A cagA katalógusa genotípus volt kimutatható 8 /17 (47,1%) mennyiségben a vacA katalógusa S1 genotípus, összehasonlítva a csak 2/20 (10%) mennyiségben a vacA katalógusa S2 genotípus.
ICEA genotípus
Egyik 110 biopsziák mutatta a ICEA Pg: 1 genotípus, míg 81 (73,6%) mutatott iceA2 katalógusa genotípus. A iceA2
amplifikációs engedett mind a 229 bp és 334 bp fragmenseket, ez a különbség a fragmens mérete miatt a jelenléte egy 105 bp - frame fragmentum jelen a 334 bp méretű fragmens hiányzik a 229 bp méretű fragmenst [ ,,,0],15].
az egyesület a genotípusok között és a nemek katalógusa Bár egyes genotípusokat inkább egy szex, mint a másik, jelenlétük nem volt szignifikáns összefüggés az életkor, vagy nemi beteg. A genotípus, hogy találtak több, mint a nőké volt a vacA katalógusa s1 17/09 (53%), cagA
16/29 (55,2%), iceA2
45/81 (55,5%), vacA
s1m1 7/12 (58,3%), és az egyesített vacA
S1 cagA
genotípusok 6/8 (75%). A genotípusok, hogy találtak több nőstényeknél voltak vacA
s2 11/19 (65%), vacA
m2 15/20 (75%), vacA
s2m2 8/11 (72,7%), és az egyesített vacA
S2 cagA
genotípusok 2/2 (100%). A vacA katalógusa m1, valamint vacA katalógusa s1m2 genotípusokat megközelítőleg azonos mennyiségű mindkét nemnél. Katalógusa Statisztikai analízis katalógusa Az összességében pozitív PCR eredmények nagymértékben asszociálnak (P katalógusa < 0,02) és szövettani eredményeket. Az adatok elemzése szignifikáns összefüggést a szimultán kimutatása mind cagA katalógusa és vacA katalógusa s1 genotípus (P = 0,026 katalógusa), a kettő kombinációja a vacA katalógusa s1 és a vacA katalógusa m1 genotípus (p
< 0,0001), és a kettő kombinációja a vacA
S2 és a vacA
m2 genotípus (p
< 0,0001). Másrészt, nincs összefüggés volt megfigyelhető között kimutatását mind a vacA
S2 és cagA
genotípus (p
= 0,102), az észlelési egynél több genotípus akár kora vagy neme (P
&0,05), a kombináció mind a vacA
S1 és a vacA
m2 genotípus (p
&0,05), és a kettő kombinációja a vacA
S2 és a vacA
m1 genotípus (P katalógusa > 0,05). katalógusa Megbeszélés katalógusa a jelen tanulmány beszámol a vacA katalógusa, cagA katalógusa, és Icea katalógusa genotípusok H. pylori katalógusa hogy azonosítottak gyomor biopszia. Bár az összes törzs hordoz egy példányát a vacA, akár az S1 vagy S2 szignálszekvenciák, a vacA
s régiót amplifikáltuk 75/110 (68,2%) biopsziák. Hasonló eredményeket más vizsgálatokban közölt jelezvén, hogy további alcsalád S és m genotípusok mellett ismert is létezhetnek [16].
A túlnyomó genotípus a 110 biopsziák volt pozitív a H. pylori
PCR volt, a iceA2
(73,6%), ezt követi a vacas
genotípus (68,2%); 34 (45,3%) ezek közül a vacA katalógusa s1 allél, és 41 (54,7%) volt a vacA katalógusa s2 allél, míg a cagA katalógusa genotípus erősített csak 29/110 (26,4%) a a biopszia. Eredményeink összhangban vannak más vizsgálatok az izraeli gyerekek [13], és az egyiptomi betegeknél [15], ahol a cagA katalógusa genotípus számoltak be 28%, illetve 36% -kal. A hasonlóság a genotípusok azonosított három tanulmány is magyarázható elsődleges földrajzi hatása fontos az alkalmazkodás a szervezet a környezet és az éghajlati viszonyok [13], annak ellenére, hogy a nyilvánvaló fogadó életmódbeli eltérések a két szomszédos ország. A szoros hasonlóságot törzsek a szomszédos országokban is beszámoltak Bangladesben és Indiában, Kalkuttában a [3, 17], ami elég valószínű, figyelembe véve a közvetlen közelében a két országban a hasonló fiziológiai környezetben, és életmódjának a gazda.
magas előfordulási (67% vagy több) a cagA katalógusa genotípus H. pylori katalógusa jelentették Európában, Közép- és Dél-Amerikában és Kelet-Ázsiában. [15] A vacA katalógusa s2 allél volt kimutatható kevesebb, mint 30% -ban a vizsgált népesség ezen országok többségében. Prevalencia ez a genotípus hasonlóan a jelenlegi vizsgálat (54,7%) számoltak be Egyiptomban (50%) [15], míg a magasabb (65%) számoltak be az izraeli tanulmány [11]. Egy tanulmány Kuvait számolt be, hogy vacA katalógusa S1 és S2 típusú mutattunk körülbelül egyenlő számban biopszia betegektől nyert Közép-Kelet-eredetű, míg az afrikai arabok elsősorban fertőzött a s2 típusa [18]. A tanulmány a genotípusok négy különböző országban számolt be, hogy a cagA katalógusa, és vacA katalógusa s1ml iceA1 katalógusa genotípusok voltak túlsúlyban a Japánban és Koreában [14], és a cagA katalógusa, vacA katalógusa s1m1 , iceA2 katalógusa genotípus gyakran azonosították az Egyesült Államokban, míg a cagA katalógusa, vacA katalógusa s1m1, iceA2 katalógusa genotípusok voltak túlsúlyban Kolumbiában. Ugyanez a tanulmány szerint nagyobb gyakorisága a vacA katalógusa s1, mint a vacA katalógusa s2 genotípus, és nagy gyakorisággal a cagA katalógusa genotípus; Azonban a gyakorisága a iceA1 katalógusa és iceA2 katalógusa genotípusok változott az országok között. A tanulmány Angliában számolt be, hogy a vacA katalógusa s1m1 genotípus találták, hogy kevésbé gyakori Angliában [19], míg a túlsúlya iceA1 katalógusa allélek cagA katalógusa, és a jelenléte vacA katalógusa m1 allélek volt megfigyelhető. Török törzsek vizsgált túlnyomórészt rendelkezett a cagA katalógusa, vacA katalógusa s1m1 vagy vacA katalógusa m2 genotípusok, melyek a tipikus genotípusok törzsek nyugati országokban [20]. Az uralkodó a vacA katalógusa sl /m1 allél kombináció, és nagy gyakorisággal a cagA katalógusa gén (87%) is jelentettek Észtország H. pylori törzsek katalógusa [21]. Összehasonlítás alapján a jelenléte kombinációjának a vacA katalógusa s és m allélek, a vacA
S1 allél szignifikánsan összefüggött a vacA
M1 (p
< 0,0001), és ugyanaz a társulás volt megfigyelhető között a vacA katalógusa s2 és a vacA katalógusa m2 (P katalógusa < 0,0001) allél. Azonban az észlelési mindkét vacA katalógusa S1 és vacA
m2 allélek volt független egymástól (p
> 0,05). A vacA
s1m2 genotípus volt kimutatható csak 2/26 (7,7%) mennyiségben a vacA katalógusa SM kombinációban. Ezen felül, nem volt szignifikáns összefüggés a vacA
S2 és vacA
M1, ami azt jelenti, hogy a kimutatási mindegyik allél független volt a többi (p
> 0,05). Ez a megállapítás talán megmagyarázza hiányában a kombinált s2 /m1 genotípus a izolátumok a tanulmány, amelyet korábban bejelentett [22, 23]. Ugyanakkor az első esetben a vacA katalógusa s2m1 H. pylori katalógusa izolátum beszámoltak egy nyombélfekély beteg Dél-Afrika [24].
A szignifikáns összefüggést a vacA katalógusa s1 allél és cagA
genotípus (47,1%) vizsgálatunkban szintén jelentettek 50% -a izraeli és egyiptomi izolátum [13, 14]. Az egyesület több mint 85% -a az izolátumok számoltak be más országokban [15, 22], amely megerősíti, hogy a két marker szorosan összefügg. A tanulmány nem mutatott szignifikáns asszociáció a kimutatására két genotípus ugyanazon izolátum, mint például a cagA
a ICEA
2, a vacA
m2 allél a ICEA
2 genotípus, és a vacA
S2, m2 allélek a ICEA
2 azt jelzi, hogy az észlelési egy gén független volt a többi. Sőt, a detektálás a kombinált vacA
S1 m1, és ICEA
2 genotípusok néhány biopsziák elhanyagolható volt (P
&0,05), jelezve, hogy az észlelési ICEA katalógusa 2 független volt az vacA
genotípusok. Ugyanez eredményekről számoltak egy korábbi tanulmány [22]. Egyik törzsek több vac katalógusa A genotípus, amely jelentettek más országokban, mint Dél-Amerika északi [15]. Katalógusa nőstényeket gyakrabban hordozó vacA katalógusa s2, és a vacA katalógusa m2 genotípusok (65%, illetve 75% -kal) nagyobb, mint (42%, illetve 25%), a férfiaknál. A iceA2 katalógusa (55,5%), cagA katalógusa (55,2%), valamint vacA katalógusa s1 (53%) genotípusokat több, mint a nőké. A nemi beteg és a kimutatási egyes genotípusok vagy genotípusok kombinációjából nem mutatott szignifikáns összefüggést. Sőt, a H. pylori
genotípus (p
&0,05), és az észlelési egynél több genotípus nem volt szignifikáns kapcsolatot sem a kor vagy nem és a beteg.
Általános pozitív PCR-eredmények erősen asszociált (P katalógusa < 0,02) a szövettani eredmények. A különbségek a szövettan, és a PCR eredményeket lehet az oka a foltos eloszlása ​​a H. pylori
a gyomorban. Sőt, hamis negatív probléma lehet a genotípus-biopsziával, mivel néhány biopszia mutattak ki gátló vegyületek PCR [25]. Ezen túlmenően, a vizsgálat több többszörös biopszia szövettani képest egy PCR-rel növelte a lehetőségét a megállapítás a baktérium, és megmagyarázza a több pozitív kapott eredmények szövettan (77,5%), míg a PCR-t (44%). A kezeléseket a betegek a protonpumpa-inhibitorok, antacidumok, vagy anti-H. pylori katalógusa terápia vezethetett a negatív eredményt végzett vizsgálatok során ezeket a betegeket. [26] katalógusa Következtetés
jordán törzsek vizsgált túlnyomórészt rendelkezett iceA2 katalógusa allél, a vacA katalógusa s2 allél feltárt több, mint a vacA katalógusa s1 allél, míg a cagA katalógusa genotípus alacsony volt. A kimutatási egyes genotípusok kapcsolatban állhat egymással. Az eredmények szemléltetik a földrajzi jellegét genetikai diverzitás a H. pylori katalógusa, mint az azonosított genotípusok hasonlóak jelentett a szomszédos országokban.
Ez a tanulmány kiindulási keretet a H. pylori katalógusa genotípusok azonosított gyomor biopsziás mintákat, szolgáló hatékony járványügyi eszköz leendő vizsgálatok, hogy jobban megértsék a genetikai sokféleség a kórokozó. katalógusa nyilatkozatok katalógusa Köszönetnyilvánítás katalógusa a szerzők köszönetet mondanak a gasztroenterológus és a nővérek a Tanszék endoszkópos king Abdullah és Princess Basma kórházak, aki segített a mintagyűjtés. A tanulmány támogatásból/04 a Deanship piackutatási Jordan University of Science & Technológia.
Érdekütközés katalógusa A szerző (k) kijelentik, hogy nincsenek ellentétes érdekek. Katalógusa

• Kezelésére rosszindulatú gyomor kivezető elzáródás stentek: Az értékelés a bejelentett változók klinikai outcome
• A hatékonyság preoperatív PET /CT előrejelzésére gyógyíthatóság sebészetben lokálisan előrehaladott gyomorrák carcinoma