Helicobacter pylorigenotypes identificirani u želučanim uzorka biopsije iz Jordanski patients

Helicobacter pylori pregled genotipova identificirane u želučanim uzorka biopsije iz jordanskih pacijenata pregled apstraktne pregled pozadine
genetske raznolikosti Helicobacter pylori
može se analizirati na dva različita razine: genomska razlika između sojeva koji potječu iz različitih pojedinaca, a varijacije bakterijske populacije unutar pojedinog domaćina. Mi smo izvijestili prvi put na H. pylori pregled genotipova jordanskih bolesnika s bolesti probavnog sustava.
Metode pregled Gornja endoskopija je provedeno na 250 pacijenata sa simptomima bolesti probavnog sustava. Više želučane biopsije su primjerci uzeti iz antruma. Sve biopsije su testirani su PCR-om za H. pylori pregled virulencije geni Vaca Netlogu, CagA Netlogu i ICEA Netlogu i 151 ispitane su histologiju. Pregled Rezultati
biopsija pozitivnih H. pylori pregled pomoću PCR su 110/250 (44%), te histologiju 117/151 (77,5%), a ovi rezultati su vrlo povezani (P izvoznici < 0,02). Analize virulencije gena pokazala je da iceA2 pregled (73,6%) bio je dominantni genotip, u Vaca pregled s2 alel je češće prepoznaje nego u Vaca pregled S1 alela, dok je CagA pregled genotipa bila je niska (26,4 %). Prisutnost pojedinih genotipova može biti povezani jedni s drugima, ali prisutnost određenih genotipova nije bio značajno povezan s dobi ili spolu pacijenta. Pregled Zaključak
rezultati pokazuju geografske prirode genetske raznolikosti H. pylori pregled, jer su identificirani genotipovi su slične onima iskazane u susjednim zemljama. Ova studija pruža osnovne podatke H.pylori pregled genotipova identificirane u želučanim uzorka biopsije iz Jordana, koji služi kao snažan epidemiološke alat za buduće istrage kako bi se bolje razumiju genetičku raznolikost ovog patogena. Pregled Pozadina pregled, Helicobacter pylori pregled je želučani patogen koji kronično zarazi više od polovice svih ljudi širom svijeta. U zemljama u razvoju, 70-90% stanovništva nosi H. pylori
; Gotovo svi ovi stječu infekcije prije dobi od 10 godina [1]. U razvijenim zemljama, prevalencija je niža, u rasponu od 25 do 50% (8) [1], zbog poboljšanih socioekonomskim uvjetima u posljednjih nekoliko desetljeća, [2]. Stoga H. pylori pregled infekcija u zemljama u razvoju može doprinijeti djetinjstva pothranjenosti i povećati rizik ili ozbiljnost infekcije drugih gastrointestinalnih patogenima kao što su Vibrio cholerae pregled [3]. Većina inficiranih osoba su asimptomatski ili imaju kronični gastritis [1, 4]. Razlike u ishodu bolesti može biti rezultat velikog broja faktora koji uključuju; faktori domaćina, okolišni čimbenici, te razlike u prevalenciji ili izraz bakterijskih čimbenika virulencije [4, 5]. Genetička raznolikost Helicobacter pylori pregled može se analizirati na dva različita nivoa: genomska varijacije između sojeva koji potječu iz različitih pojedinaca i varijacije bakterijske populacije u pojedinom domaćinu [6]. Korištenjem slučajno pojačan polimorfne DNA-PCR i DNA otiska, pokazalo se da je soja iz nesrodnih zaraženih pacijenata imali jedinstvene otiske prstiju, dok sojevi izolirani od članova obitelji je imao vrlo sličan, iako ne identični obrasci [7]. Ovi rezultati implicira da su razlike uočene između sojeva zaraziti pojedine članove obitelji došlo nakon primarne infekcije. Takva genetska raznolikost može uočiti kod H. pylori pregled virulencije gena; CagA pregled, Vaca pregled i ICEA pregled.
A vakuolirajući citotoksin da ozlijedi epitelne stanice kodiran Vaca pregled gena [8, 9], koji sadrži najmanje dva varijabilnih komponenti [10] , The Vacas
regija (koji kodira signalni peptid) postoji kao S1 ili S2 alelskih vrsta, među tipa soja S1, podtipova s1a, s1b i s1c su identificirani [11]. M (srednja) regija se pojavljuje kao them1 ili vrsti aleličke m2, kod tipa m2, dva podtipa su identificirani, označen M2A i m2b. Općenito, tip s1 m1 i tip sojevi s1 m2 proizvode visoke i umjerene razine toksina, odnosno, dok S2 m2 sojevi pokazuju malo ili novacuolating toksina aktivnost [10].
ICEA
gena koji kodira za urođeni ograničenje enzim, koji izgleda da se inducirati pri H. pylori pregled naiđe na epitelne stanice prikazuje varijaciju alela prema točkastom mutacijom, što je rezultiralo u dvije alelne vrste, iceA1 pregled i pregled iceA2 [6]. Studija H. pylori pregled infekcije u bolesnika podvrgnutih gornji gastrointestinalni endoskopije u Jordanu izvijestio visoku prevalenciju [12], te je potvrdio da je njegova prisutnost bila značajno povezana s gastritis i peptički ulkus. Sadašnje studije za prvi put u Jordanskoj H. pylori
genotipovi su identificirani u želučanom biopsijom uzorka. Metode
Pacijenti
ukupno 250 uzastopnih bolesnika koji je posjetio kralj Abdullah bolnici, a princeza Basma bolnica u razdoblju od srpnja 2003. do svibnja 2004. godine, za endoskopskog su upisani u studiju. Ove dvije nastavne bolnice su povezane s Jordan Sveučilištu znanosti i tehnologije, u kojima je provedeno istraživanje. Uzorci biopsije su uzeti iz antruma. Studija je odobren od strane Etičkog povjerenstva Sveučilišta. Svaki pacijent potpisalo pristanak prije Prikupljanje uzoraka, a svi klinički uzorci su ispitani undercode pregled podataka
informacije sadržane u izvješćima s patologijom ili dosijea pacijenata zabilježen je kod svakog pacijenta, koji je uključivao:. Pacijentovo bolnica broj , dob, spol, povijest, klinička dijagnoza temelji na histologiju, endoskopije, i prethodne obrade (npr anti-H. pylori pregled, tri su imali inhibitora protonske pumpe ili antacida). Simptomi prijavljene od strane pacijenata koji su se podvrgnuli gornjeg gastrointestinalnog endoskopiju su bolovi u trbuhu, epigastričan bol, povraćanje, ili žgaravica.
Histološki pregledi
Histološki pregled je provedeno na 151 (60,4%) antralni uzorka biopsije. Pet primjerci iz antralnom sluznice uzeti su sa srednjim pincetom. Dva uzorka su uklopljena u parafin, te su parafinske sekcije su obojene hematoksilin-eozinom korištenjem i Giemsa metode. Sluznice Uzorci su histološki prema klasifikaciji Sydney. Kodirane pločice su mikroskopski strane jednog patologa pomoću velike snage (povećanje, × 400), a najmanje pet polja visoke snage su ispitani. Pregled, PCR-bazirane genotipizacija tri virulencije gena pregled Sve 250 biopsija testiranu pomoću PCR su pohranjeni na -80 ° C u 70% etanolu u efendorf cijevi do obrade. Ove biopsije uključila je 151 biopsija koje su testirane histologiju.
Uzorak biopsije su homogenizirane sterilnom mikro tučak, a DNA je dobivena pomoću čarobnjaka Genomska DNA pročišćavanje kit (Promega, Madison, WI, USA), slijedeći upute proizvođača za pročišćavanje DNK iz životinjskog tkiva. Prisutnost H. pylori pregled detektira se posebnim PCR usmjerene na CagA Netlogu, Vaca pregled s i m regije i ICEA pregled genotipova su određene posebnim iceA1 Netlogu - i iceA2
specifična PCR kao što je prethodno opisano [13, 14]. Pet vrsta specifične primer setovi (alfa DNA, Montreal, Kanada) su korišteni za pojačavanje jako konzervirane regije unutar navedenih gena.
Statistička analiza
povezanosti histologiju i rezultata PCR, a povezanost između genotipova je analiziran pomoću Fisher-ov egzaktni i hi-kvadrat testovi statistički paket za društvene znanosti (SPSS Inc. Chicago, Illinois SAD). Razlika u srednjim godinama između muškaraca i žena je izračunata uzorka neovisnost t-testom. | Rezultati
Dijagnoza H. pylori pregled temelji se na histologiju i PCR metoda.
Histološki nalazi
Histološki pregled 151 biopsija pokazala je da je 117 (77,5%) bolesnika bilo je pozitivno na H. pylori
, pa su zapravo zaraženo, a 34 (22,5%) bili su negativni.
čimbenika virulencije pregled na prisutnost CagA
, Vaca pregled s i m regije i iceA1 pregled - i iceA2 pregled, geni su istraženi u svim 250 biopsija u. U biopsije koji su bili PCR pozitivan za jedan ili više gena je 110 (44%), a 140 (56%) bili su negativni za sve gene
muškarac. Ženski omjer populacije pacijenata bila je 58/110 (52,7 %) muškaraca: 52/110 (47,3%) žene; (Srednja dob 42.03 + 15,135 godina; raspon, 17 - 67 godina) pregled H. pylori genotipova
Rezultati genotipa u 110 biopsije su prikazani u tablici 1.Table 1. Prevalencija Helicobacter pylori otkriven
genotipova. u 110 biopsije pregled genotipa
pregled Učestalost (%)
Vaca pregled s1 pregled 34 (45,3) pregled Vaca pregled s2
41 (54,7) pregled Vaca pregled m1 pregled 23 (48,9) pregled Vaca pregled m2 pregled 24 (51,1) pregled Vaca pregled s1m1 pregled 12 (46,2 ) pregled Vaca pregled s2m2 pregled, 12 (46.2) pregled Vaca pregled s1m2 pregled 2 (7.7) pregled Vaca pregled s2m1 pregled 0 (0.0) pregled CagA
29 (26,4) pregled iceA1
0 (0.0) pregled iceA2
81 (73,6) pregled Vaca genotipova
Velicine umnoženi proizvodi za Vaca pregled S1 i Vaca pregled S2 259 bp i 286 bp respektivno. Intenziteti proizvoda varirala između jedinki. Vaca pregled s regija umnožena je u 75/110 (68,2%) biopsija. S1 varijanta je otkriven u 34/75 (45,3%), odnosno 34/110 (30,9%), u odnosu na s2 varijanti koja je otkrivena u 41/75 (54,7%), odnosno 41/110 (37,3%) od su biopsije. U Vaca pregled, m regija detektirana je u 47/110 (42,7%) biopsija. M1 varijanta je otkriven u 23/47 (48,9%) ili 23/110 (20,9%), u odnosu na m2 varijanti detektiran u 24/47 (51%), ili 24/110 (21,8%).
Kombinacija od Vaca pregled s, i m regije je otkriven u 26/110 (23,6%), od biopsija. Oba Vaca pregled s1m1 i Vaca pregled s2m2 otkrivene su u približno jednakim količinama u 12/26 (46,2%), od Vaca pregled sm genotipa ili 12/110 (10,9%), dok Vaca pregled s1m2 je otkriven samo u 2/26 (7,7%) od Vaca pregled sm genotip, odnosno 2/110 (1,8%). Niti jedan od biopsija pokazala je Vaca pregled s2m1 genotipa ili više genotipova. Pregled CagA genotip pregled Veličina CagA pregled povećani proizvod bio 349 bp. U CagA pregled, genotip je otkriven u 29/110 (26,4%), a 81 (73,6%) bili su negativni.
Povezanost između CagA i vacAs1 genotipova
CagA pregled, genotip je otkrivena u 8 /17 (47,1%) od Vaca pregled S1 genotip, u usporedbi sa samo 2/20 (10%) od Vaca pregled s2 genotip. pregled ICEA genotipa pregled Nijedan od 110 biopsija pokazala da ICEA pregled 1 genotipa, dok je 81 (73,6%) pokazali su iceA2
genotip. IceA2 pregled amplifikacije da bi se dobio oba 229 bp i 334 bp fragmenata, ova razlika u veličini fragment je zbog prisutnosti 105 bp na - okvir amplikona prikazanog na 334 bp fragment koji je prisutna u 229 bp fragment je [ ,,,0],15].
povezanost između genotipova i spola pregled Iako su pojedini genotipovi otkriti više u jednom seks od drugih, njihova prisutnost nije bila značajno povezana s dobi ili spolu pacijenta. Genotipovi i detektirana više u muškaraca nego žena bili Vaca pregled s1 9/17 (53%), CagA
16/29 (55,2%), iceA2
45/81 (55,5%), Vaca pregled s1m1 7/12 (58,3%), a prikupljene Vaca pregled s1 CagA
genotipova 6/8 (75%). Genotipovi i detektirana više u žena su Vaca pregled s2 11/19 (65%), Vaca pregled m2 15/20 (75%), Vaca pregled s2m2 8/11 (72,7%), a Kombinirani Vaca pregled s2 CagA
genotipova 2/2 (100%). U Vaca pregled m1, a Vaca pregled s1m2 genotipova otkrivene su u približno jednaku količinu u oba spola pregled Statistička analiza pregled sveukupnih pozitivnih rezultata PCR su vrlo povezani (P izvoznici < 0,02). S Rezultati histologiju. Analiza podataka je pokazala značajnu povezanost između simultanog otkrivanju oba CagA Netlogu i Vaca pregled S1 genotipova (P pregled = 0,026), kombinacija oba Vaca pregled S1 i na Vaca pregled m1 genotipova (P izvoznici < 0.0001), a kombinacija oba Vaca pregled, S2 i Vaca pregled genotipova m2 (P izvoznici &0.0001). S druge strane, nije zabilježena nikakva veza između detekcije oba Vaca pregled, S2 i CagA pregled genotipova (P
= 0,102), detekciju više od jednog genotipa s bilo dob i spol (p
> 0,05), kombinacija oba Vaca pregled s1 a Vaca pregled m2 genotipova (P izvoznici > 0,05), a kombinacija oba Vaca pregled S2 i Vaca
M1 genotipova (P izvoznici > 0,05). pregled Rasprava pregled ovog istraživanja izvješća o Vaca pregled, CagA Netlogu i ICEA pregled genotipova H. pylori pregled koje su identificirane u želučanim biopsijama. Iako su svi sojevi nositi kopiju gena Vaca s bilo S1 ili S2 sekvence signala, Vaca pregled s regija umnožena je u 75/110 (68,2%) biopsija. Slični rezultati su prijavili drugim studijama koje ukazuju da mogu postojati dodatni potporodice s i m genotipova pored već poznatog [16].
Dominantni genotip u 110 biopsije koji su bili pozitivni na H. pylori
pomoću PCR, bio iceA2 pregled (73,6%), nakon čega slijedi Vacas
genotipa (68,2%); 34 (45,3%) od njih bili su Vaca pregled S1 alel, a 41 (54,7%) bilo je Vaca pregled s2 alela, dok je CagA pregled, genotip je bio pojačan samo u 29/110 (26,4%) od su biopsije. Naši rezultati su u skladu s drugih studija provedena na izraelske djece [13], a egipatski bolesnika [15], gdje je CagA pregled genotip prijavljenih u 28%, a 36% respektivno. Sličnost genotipova utvrđenih u tri studije može objasniti primarni geografskom utjecaju važan u prilagodbi organizma prema okolišu i klimatskim uvjetima [13], bez obzira na očite razlike domaćina u stilu života u dvije susjedne zemlje. Bliska sličnost sojeva u susjednim zemljama također je bio prijavljen u Bangladešu i Calcutti, Indija [3, 17], što je vrlo vjerojatno s obzirom na blizinu dviju zemalja, sličnim fiziološkim sredinama i životnim stilovima domaćina.
Veća prevalencija (67% ili više) od CagA pregled genotipa na H. pylori pregled je bio prijavljen u Europi, Srednjoj i Južnoj Americi, i istočnoj Aziji [15]. U Vaca pregled s2 alel detektiran je u manje od 30% u promatranom stanovništva u većini tih zemalja. Stope prevalencije ovog genotipa sličnom je istraživanju (54,7%) su prijavili u Egiptu (50%) [15], dok je više stope (65%) su prijavili u izraelskoj studiji [11]. Studija u Kuvajtu su izvijestili da su Vaca pregled, S1 i S2 vrste otkrivene u približno jednake brojeve u biopsijama koje su dobivene od bolesnika srednje-istočnog podrijetla, a afrički Arapi su uglavnom bili zaraženi s tipom s2 [18]. Studija genotipova u četiri različite zemlje izvijestio da je CagA Netlogu i Vaca pregled s1ml iceA1 pregled genotipova prevladavaju iu Japanu i Koreji [14], a CagA pregled, Vaca pregled s1m1 , iceA2 pregled genotipova često su identificirani u SAD-u, dok je CagA pregled, Vaca pregled s1m1, iceA2 pregled genotipovi su dominantna u Kolumbiji. Isto istraživanje pokazuje veću prevalenciju Vaca pregled S1 nego Vaca pregled s2 genotipa i visoka prevalencija u CagA pregled genotip; Međutim, prevalencija je iceA1 Netlogu i iceA2 pregled genotipova varirati među tim zemljama. Istraživanje provedeno u Engleskoj je izvijestio da je Vaca pregled s1m1 genotip je utvrđeno da je manje čest u Engleskoj [19], a prevlast iceA1 pregled alela, CagA Netlogu i prisutnost Vaca pregled m1 aleli su primijećeni. Turski sojevi pregledane pretežno posjedovao CagA
, Vaca pregled s1m1 ili Vaca pregled m2 genotipova, koji su tipične genotipova sojeva iz zapadnih zemalja [20]. Dominacija u Vaca pregled SL /m1 aleličke kombinaciju i visoka prevalencija u CagA pregled gena (87%) su također izvijestili u Estoniji H. pylori pregled sojeva [21].
Temelju prisutnost kombinacija od Vaca pregled s, a m alele, na Vaca pregled s1 alela bila je značajno povezana s Vaca pregled m1 (P izvoznici < 0.0001), a isto udruženje je zabilježeno između u Vaca pregled, S2 i Vaca pregled m2 (P izvoznici &0.0001) aleli. Međutim, otkrivanje oba Vaca pregled S1 i Vaca pregled m2 alela bila neovisna jedan o drugom (P Netlogu > 0,05). U Vaca pregled s1m2 genotip je otkriven tek u 2/26 (7,7%) od Vaca pregled sm kombinaciji. Osim toga, nije bilo značajnu povezanost između Vaca pregled, S2 i Vaca pregled M1, što znači da je otkrivanje svakog alela bila je nezavisna od drugih (P izvoznici > 0,05). Ovaj nalaz može objasniti izostanak kombiniranom S2 /m1 genotipa iz izolata u studiji koja je ranije [22, 23] prijavljenih. Međutim, prvi slučaj Vaca pregled s2m1 H. pylori pregled izolat bio prijavljen u duodenalni ulkus pacijenta iz Južne Afrike [24].
Značajnu povezanost između Vaca pregled S1 alela i CagA
genotip (47,1%) u našoj studiji je također zabilježena u 50% izraelske i egipatske izolata [13, 14]. Udruga je više od 85% izolata je bio prijavljen u drugim zemljama [15, 22], što potvrđuje da su dva pokazatelja usko su povezani. Naša studija nije pokazala značajnu povezanost u otkrivanju dva genotipa u istom izolata kao što su CagA Netlogu s ICEA Netlogu 2, u Vaca pregled m2 alela s ICEA pregled 2 genotipa, a Vaca
S2, m2 alela s ICEA
2 pokazuje da je otkrivanje jednog gena bila nezavisna od drugih. Osim toga, detekcija kombiniranog Vaca pregled S1 m1, a ICEA
2 genotipova u nekoliko biopsija bila neznatna (P izvoznici > 0,05), što ukazuje da je otkrivanje ICEA Netlogu 2 je neovisan od Vaca
genotipova. Isti rezultati su iskazane po prethodnoj studiji [22]. Niti jedan od sojeva imala višestruku vac pregled A genotipova, koji su prijavili u drugim zemljama, kao što su sjeverne Južnoj Americi [15]. Pregled Žene su češće nošenje Vaca pregled, S2, a Vaca pregled m2 genotipovi (65% i 75%, redom) u odnosu na (42% i 25%) u muškaraca. IceA2 pregled (55,5%), CagA pregled (55,2%), a Vaca pregled s1 (53%) genotipova detektirana više u muškaraca nego žena. Spol pacijenta i otkrivanja nekih genotipova ili kombinacije genotipova nije značajno povezani. Štoviše, H. pylori
genotipova (P izvoznici > 0,05)., A za otkrivanje više od jednog genotipa imao značajnu povezanost s obje dob i spol pacijenta
ukupni pozitivni rezultati PCR bili vrlo povezani (P izvoznici < 0,02) s rezultatima modrilom. Razlike u histologiju i rezultati PCR može biti s obzirom na slučajan distribucije H. pylori
u želucu. Osim toga, lažni negativi možda je problem u genotipa od biopsije, jer su pronađene neke biopsije da sadrže spojeve koji inhibiraju PCR [25]. Osim toga, testiranje još više biopsije i histološka analiza u odnosu na jedan PCR-om povećava mogućnost pronalaženja bakteriju, i objašnjava više pozitivnih rezultata dobivenih histologiju (77,5%), u usporedbi s PCR (44%). Tretmani pacijenata s inhibitorima protonske pumpe, antacidima, ili anti-H. pylori pregled, terapija je vjerojatno dovelo do negativnih rezultata u provedenim ispitivanjima u tih bolesnika [26]. pregled Zaključak
jordanski sojevi ispituje pretežno posjedovao iceA2 pregled alela, Vaca pregled s2 alela bila je otkriti više nego u Vaca pregled S1 alela, dok je CagA pregled genotip bio je nizak. Detekcija određenih genotipova mogu biti povezani jedan s drugim. Rezultati pokazuju geografske prirode genetske raznolikosti H. pylori pregled, jer su identificirani genotipovi su slične onima iskazane u susjednim zemljama.
Ova studija daje osnovni okvir H. pylori
genotipovi identificiran u želučani uzorak biopsije, koji služe kao snažan epidemiološke alat za buduće istrage bolje razumjeti genetičku raznolikost ovog patogena. pregled Izjave pregled Zahvale pregled autori zahvaliti gastroenterologa i medicinske sestre u Odjelu za endoskopiju na kralja Abdullaha i Princess Trajna bolnice, koji su pomogli u prikupljanju uzoraka. Istraživanje je podržan od strane grant/04 od Deanship istraživanja u Jordan University of Science & Tehnologija.
Suprotstavljenih interesa pregled autor (i) izjavljuju da nemaju konkurentne interese. Pregled

• Liječenje malignog izlazna opstrukcija želuca s stentovi: Procjena prijavljenih varijabli klinički ishod
• Učinkovitost preoperativnoj PET /CT za predviđanje izlječivost u kirurgiji za lokalno uznapredovalim želučanog karcinoma