Didesnis skaičius Helicobacter pylori CagA EPIYA C fosforilinimo vietų padidina skrandžio vėžio riziką, bet ne dvylikapirštės žarnos opa

Didesnis skaičius Helicobacter pylori
CagA EPIYA C fosforilinimo vietų padidina skrandžio vėžio riziką, bet ne dvylikapirštės žarnos opa
tezės
Background
Helicobacter pylori
infekcija yra viena iš labiausiai paplitusių infekcijų pasaulyje ir yra susijęs su skrandžio vėžio ir dvylikapirštės žarnos opa. buvo įrodyta, bakterinės virulentiškumo veiksniai, tokie kaip CagA padidinti abiejų ligų riziką. Tyrimai pasiūlė priežastinį vaidmenį CagA EPIYA polimorfizmas skrandžio kancerogenezėje, ir tai buvo įrodyta, kad būti geografiškai įvairi. Mes studijavo asociacijas tarp H. pylori
CagA EPIYA modelių ir skrandžio vėžio ir dvylikapirštės žarnos opa, į etniškai mišinyje su Vakarų gyventojų iš Brazilijos. CagA EPIYA buvo PGR nustatyta ir patvirtinta sekos. Iš 436 pacientų, iš viso buvo įtraukti, yra 188 su skrandžio vėžiu, 112 su dvylikapirštės žarnos opa ir 136 su gastritu.
Rezultatai Viesbutis The iš EPIYA C segmentų skaičius buvo reikšmingai susijęs su padidėjusia rizika susirgti skrandžio vėžiu (OR = 3,08 , 95% PI = 1,74-5,45, p < 10 -3), net pakoregavus amžių ir lytį. Didesnis skaičius EPIYA segmentui C taip pat buvo susijęs su skrandžio atrofijos (p = 0,04) ir žarnyno metaplazijos (p = 0,007). Be to, užsikrėtę CAG pacientai
A atmainos, turintys daugiau nei vieną EPIYA C segmentą parodė sumažėjo koncentraciją serume pepsinogen I, palyginti su tais, užsikrėtę padermių, kurių sudėtyje yra vienas ar mažiau EPIYA C pakartokite. Priešingu atveju, EPIYA C segmentų skaičius nebuvo susieti su dvylikapirštės žarnos opa.
Išvados
Mūsų rezultatai rodo, kad H. pylori infekcija
padermės daugiau nei vieną CagA EPIYA C motyvas buvo aiškiai susijęs su skrandžio vėžiu, bet ne su dvylikapirštės žarnos opa.
didesnio skaičiaus EPIYA C segmentuose taip pat buvo susijęs su skrandžio ikivėžinius pakitimus kaip parodė histologinių skrandžio atrofijos ir metaplastic pokyčius ir sumažėjęs kraujo serume pepsinogen I.
Background
Helicobacter pylori
kolonizuoja daugiau skrandį nei pusė pasaulio gyventojų ir yra susijęs su raidos sutrikimų, pavyzdžiui, kraujuojanti opa, skrandžio vėžys, skrandžio ir gleivine susijęs limfoidinio audinio limfoma [1-4]. Veiksniai, kurie lemia kelis asmenis plėtoti susijusias ligas, o užsikrėtusių žmonių dauguma liks simptomų, yra nežinomi, tačiau jie buvo intensyvaus mokslinių tyrimų. Tarp priimančiosios veiksnių, citokinų genų polimorfizmas buvo įrodyta, kad padidinti skrandžio vėžio riziką, ypač IL1B
-31, IL1RN
ir TNFa
-307 vieno nukleotido polimorfizmas Europos gyventojų, o IL1RN
į Brazilijos gyventojų [5-9]. buvo stipriai tiriama patogenais įtempimo konkrečių veiksnių. Tarp jų, CagA baltymai yra priimta kaip rizikos veiksnys tiek pepsinė opa ir skrandžio vėžio [5, 10-12]. Be mūsų grupės, infekcija tyrimo H. pylori CAG
A teigiami padermės turėjo šansų santykis (OR) 11,9 skrandžio vėžio, tik suderinusi šeimininko polimorfizmas ir kitų kintamųjų, o stipriausias priimančiosios veiksnys buvo IL1RN
2 alelis, kurio iš arba 1,9 [5].
CAG
priklauso CAG
PAI (patogeniškumas sala), kad kodai IV tipo sekrecijos sistema (T4SS) susijęs su padidėjusia sekrecija IL -8, labai stiprus uždegimą sukeliančių chemokino kad dalyvauja gastritas sukeltos Helicobacter pylori
infekcijos. T4SS yra taip pat atsakingas už CagA baltymų įeiti į skrandžio epitelio ląsteles, kur CagA fosforilinamas dėl tirozino liekana per fosforilinimo motyvų į carboxi-terminalas kintamos srities, baltymo. Šie motyvai yra apibrėžiamas kaip EPIYA (Glu-Pro-Ile-Tyr-Ala) A, B, C ir D, atsižvelgiant į skirtingus gretutinių aminorūgščių. CagA baltymų beveik visada turi EPIYA A ir B segmentus, kurie po to nė vieno, dviejų ar trijų C segmentams padermių cirkuliuojančių Vakarų šalyse arba D segmentą, į Rytų Azijos šalyse. EPIYA C ir D yra pagrindiniai svetainėse fosforilinimo CagA. Fosforilinamos CagA suformuoja fizinį kompleksą su SHP-2 fosfatazės ir sukelia nenormalius ląstelių signalus, padedančią dereguliavimo ląstelių augimą, ląstelių į mobilųjį kontakto ir ląstelių migraciją, pailgėjimas epitelio ląstelių ir didinimui epitelio ląstelių apyvarta, kurios didina pažeistų ląstelių riziką įsigyti ikivėžinių genetinius pakeitimus. Keliamoji D tipo EPIYA ar keliomis C pakartoja yra susijęs su padidėjusia SHP-2 fosfatazės aktyvumo sukeltos CagA [13, 14], kuri kelia galimybė, kad infekcijos CagA padermės, turinčios didesnį skaičių EPIYA C segmentus nuteikia, kad ikivėžinius pakitimus ir skrandžio vėžio.
Tiesą sakant, ši hipotezė buvo išbandytas Rytų šalyse, tačiau tyrimo rezultatai prieštaringi. Azuma kt
. [15] nustatė, padidėjo dalis EPIYA D padermių tarp pacientų, sergančių atrofinį gastritu ir skrandžio vėžio, tačiau kiti autoriai nesugebėjo atkurti šiuos rezultatus [16, 17]. Be to, Vakarų gyventojų, reikšmingas ryšys tarp skrandžio vėžio ir padidėjusio EPIYA C motyvų skaičius gali būti įrodytas dviejuose tyrimuose [18, 19], o gal nei nedaug įtrauktų pacientų kitų tyrimų [20-22], arba regioninių /etninės skirtumai kaip jau įrodyta, kitais Helicobacter pylori
virulentiškumo žymenų [23, 24]. Be to, neatitikimai taip pat buvo įrodytas tyrimų įvertinančių EPIYA C motyvų skaičių ir dvylikapirštės žarnos opa [19, 25], kuris nusipelno giliai tyrimus, nes dvylikapirštės žarnos opa ir skrandžio vėžys yra nesuderinami H. pylori
-associated ligos.
Todėl mes įvertinta, ar padaugėjo CagA EPIYA C fosforilinimo motyvai yra susijęs su skrandžio vėžiu ir /arba dvylikapirštės žarnos opa, įskaitant didelio serijos pacientams išvengti šališkumo ir leisti koreguoti amžiaus ir lyties Vakarų gyventojų iš Brazilijos. Nuo dvylikapirštės žarnos opa ir skrandžio karcinoma yra nesuderinami ligos ir CAG
A yra rizikos veiksnys tiek sąlygų, mes taip pat įvertino, ar EPIYA C segmentų padermių, išskirtų iš pacientų, sergančių dvylikapirštės žarnos opa numeris skyrėsi nuo kitų padermių izoliuotas nuo skrandžio vėžiu sergantiems pacientams. Kadangi skrandžio atrofinių ir metaplastic pokyčiai - ikivėžinių pakitimų - bloginti kad pepsinogen I (SGN) vyriausiasis ir gleivinių kaklo ląstelių tekstyno ir fundic liaukų gamybą, mes įvertino, ar didesnis skaičius EPIYA C motyvų buvo susijęs su serumu pepsinogen lygiais.
rezultatai Viesbutis The iš pacientų charakteristikos parodytos 1 lentelėje H. pylori
specifinę URE
A ir 16S rRNR
buvimas buvo sėkmingai patvirtinta PGR visi mokėsi atmainos ir CAG
A projekto užbaigimo buvo teigiami, bent vienas, kuris metodas taikomas visose strains.Table 1 pacientui charakteristikos ir platinti CagA EPIYA genotipų pagal H. pylori
-associated ligų

gastritas 136 (%)
Skrandžio vėžys 188 (%)
dvylikapirštės žarnos opa 112 (%)

amžiaus vidurkis (SD)
52,5 (16,9)
62,3 (13,9)
43,5 (15,1)
vyriškosios lyties
48 (35,3)
114 (60,6)
53 (47,3)
EPIYA-AB "
3 (2,2)
3 (1.6)
4 (3.6)
EPIYA-ABC
108 (79,4)
107
(56,9) 93 (83,0)
EPIYA-ABCC
21
(15,4) 65 (34,6)
15 (13,4)
EPIYA-ABCCC
4 (3.0)
13 (6,9)
0 (0.0)
SD, standartinis nuokrypis
nustatymas CagA EPIYA modelio pervežimas PGR amplifikacijos produktų iš visų CAG
A teigiamų padermių parodė skirtingus modelius 3 'kintamasis regionas CAG pervežimas A. elektroforezės gelis atstovaujanti įvairių CagA EPIYA tipų parodyta paveiksle 1. PGR rezultatai patvirtino sekos yra septyniasdešimt penki atsitiktinai atrinktų PGR produktų iš pacientų kiekvienoje grupėje. 1 pav elektroforezė tipinius mėginius su kiekviena iš šių CagA EPIYA tipų pacientams, kurių H. pylori -associated ligas. 1 skiltis: 100 BP standartas; 2 skiltis: EPIYA-AB; Stulpeliai 3, 8, 11 ir 12: EPIYA-ABC; 4 skiltis: EPIYA-ABC "+" -ABCCC; ir kolonos 5 13: EPIYA-ABCC; 6 skiltis: EPIYA ABCCC; 7 skiltis: EPIYA-ABCC + -ABCCC; 9 skiltis: EPIYA-ABC "+" -ABCC + -ABCCC; 10 skiltis:. EPIYA-ABC "+" -ABCC
Nėra EPIYA D buvo rastas H. pylori pervežimas padermių studijavo. Iš EPIYA genotipų pasiskirstymas parodytas 1 lentelėje
asociacija tarp EPIYA C segmentų ir skrandžio vėžio ir dvylikapirštės žarnos opa pervežimas kolonizacija numerių H. pylori
CagA teigiamų padermių, turinčių du ar tris EPIYA C motyvai buvo dažniau pastebėti (p < 10 -3) ir skrandžio vėžio (78/188, 41,5%) negu gastritas (25/136, 18,4%) pacientams. Asociacija išliko stipriai reikšmingas net pakoregavus pagal amžių ir lytį, naudojant logistinę regresiją (2 lentelė). Hosmer-Lemeshow tyrimas parodė gerą fitneso modelio (Chi kvadratu = 3,98, 8 laisvės laipsnių, p = 0,86, su 10 žingsnių). Priešingu atveju, EPIYA C segmentų skaičius nebuvo susieti su dvylikapirštės žarnos opa (2 lentelė) .table 2 asociacija tarp skaičių CagA EPIYA C motyvų ir H. pylori
-associated ligos

vienmatės analizės

Dispersinės analizės

psl
arba

95% PI
psl
Skrandžio vėžys UAB - didėjant amžiui
< 10-3
1,04
1,03-1,06
< 10-3 UAB - moteriškosios lyties
< 10-3
0,29
0,18-0,48
< 10-3 UAB - Aukštos rizikos EPIYA (ABCC arba ABCCC)
< 10-3
3.08
1,74-5,45
< 10-3
dvylikapirštės žarnos opa UAB - didėjant amžiui
< 10-3
1.03
1,02-1,05
< 10-3 UAB - moteriškosios lyties
0,04 pervežimas 1,26 pervežimas 0,73 - 2,18
0,41 UAB - Aukštos rizikos EPIYA (ABCC arba ABCCC)
0,29 UAB -
- CR.LT - Viesbutis The Hosmer-Lemeshow tyrimas parodė gerą tinkamumą skrandžio vėžio modelis (8 laisvės laipsnius, p = 0,86, su 10 žingsnių) ir dvylikapirštės žarnos opa (8 laisvės laipsnius, p = 0,25, 10 žingsnių).
, nes jis gali būti spekuliuojama, kad EPIYA C numeris motyvais didėja didėjant amžiui, mes taip pat sukonstravo modelį su EPIYA C numeris buvo priklausomas kintamasis ir amžių, lytį ir H. pylori
-associated ligų nepriklausomų covariables. Padidėjo EPIYA C segmentai nebuvo susieti su amžiumi (p = 0.13), lyties (p = 0.66) ir dvylikapirštės žarnos opa (p = 0.29), bet liko susijęs su skrandžio vėžio (p < 10 -3, arba = 2.81; 95% PI = 1,64 - 4,82.)
asociacijos tarp mišrių padermės kolonizacijos ir ligų
Mišrūnė padermės infekcija buvo stebimas 57 (13.08%) pacientų, ir tai buvo žymiai dažnesni pacientams, sergantiems skrandžio vėžiu (38/188, 20,2%) nei tie, gastritas (14/136, 10,3%) su arba skrandžio karcinoma 2,21 (95% PI = 1,10 iki 4,50). Priešingu atveju, mišri infekcija buvo rečiau pastebėtas dvylikapirštės žarnos opa sergantiems pacientams (5/112, 4,5%) su tendencija į neigiamas asociacijas (p = 0,09).
Asociacija tarp EPIYA C segmentų ir SGN koncentracija serume skaičių
Apie pepsinogen Aš koncentracija kraujo serume buvo žymiai didesnis (p = 0,01) dvylikapirštės žarnos opa (vidurkis 161,67 ± 102,36 g /l), nei gastritas (100,37 ± 70,85 g /L).
užsikrėtę CagA pacientai padermės, turinčios du ar trys EPIYA C segmentai parodė sumažėjęs SGN, lyginant su tais, su infekcijos CagA padermės, turinčios ≤ 1 EPIYA C segmentą (dvylikapirštės žarnos opa: 179,67 ± 83,30 vs 67,01 ± 34,30, atitinkamai, p = 0,02 ir gastritas: 109,26 ± 85,61 vs 57.55 ± 34.61, atitinkamai, p = 0,01).
asociacija tarp EPIYA C kartojasi ir skrandžio histologinių pakitimų bei navikų klasifikaciją numeriais
padaugėjo EPIYA C segmentuose buvo susijęs su ikivėžinius pakitimus buvimą, arba atrofija ( p = 0,04) arba žarnyno metaplazija (p = 0,007), bet ne su kitomis histologinių parametrų. Be to, pagal padermių vežančių padidėjo EPIYA C motyvai infekcija nebuvo susieti su žarnyno ar difuzinio naviko tipo (p = 0,34).
Diskusijos pervežimas Šiame tyrime vertinant didelę seriją paciento, mes parodė, kad tie, užsikrėtę iki CagA teigiamų H. pylori
padermių, turinčių daugiau nei vieną EPIYA C motyvas yra ne tris kartus kartus padidėjo rizika susirgti skrandžio vėžiu. Mūsų tyrimo privalumai yra pakankamas imties dydis, nustatyti padermių priimdama PGR su patvirtinimu sekos ir tikslinimo veikiančių veiksnių pagal logistinės regresijos analizė.
CagA laikomas svarbiu bakterijų virulentiškumo faktorius susijęs su tiek skrandžio adenokarcinoma ir dvylikapirštės žarnos opa, [2, 5, 11, 12, 26]. Skaičius ir modelis fosforilinimo motyvai atrodo toliau sluoksniuoti riziką, susijusią su atskirų kamienų [18, 27].
Tai buvo įrodyta, kad Helicobacter pylori
CagA EPIYA modeliai turi didelę geografinę kintamumą ir atidžiai stebėti modelius istoriniai žmogaus migracija. EPIYA D yra būdingas Azijos EPIYA modelį, kuris beveik nepasireiškia Vakarų H. pylori
padermių [28]. Brazilai sudaro unikalų Vakarų gyventojų, nes, nepaisant daugelio kilmės ir dėl to gausybės fenotipo išvaizdos, nebuvo dideliu laipsniu etninių grupių veisimo ir todėl dauguma žmonių negali būti priskirta bet steigėjų grupėms remiantis genetinis fonas, o jie atlieka apie 33% genų iš kiekvienos iš pagrindinių rasių, kad istoriškai sudaro šalies (baltųjų, afrikiečių ir indėnai) [29]. Su šiuo fone, būtų galima tikėtis, kad radote CagA EPIYA D susidaro H. pylori
padermių, nes ji buvo aptikta tarp Amerikos indėnų (laikantis teorijos, kad iš pradžių žmonės iš Azijos apgyvendintoje Amerikas migruoja iš Rytų Azijos ), bet mes neaptiko jokio EPIYA D mūsų gyventojų.
Deja, yra keletas tyrimų atžvilgiu tarp EPIYA C numerį ir H. pylori
susijusių ligų Vakarų populiacijų prieštaringi rezultatai tarp jų asociacijos. Basso kt
. [19] parodė, kad didesnis skaičius EPIYA segmentui C buvo susijęs su skrandžio karcinoma baltaodžių populiacijos iš Italija, panašiai kaip ir Yamaoka ir kt
rezultatus. [18] vertinant amerikiečių pacientus iš Teksaso. Priešingu atveju, ne asociacija buvo pastebėtas, kai Kolumbijos pacientai buvo vertinamos pagal Yamaoka tyrime [18] pagal rezultatus, gautus Acosta ir kt
. [22], o Sicinschi kt
. [21] pastebėjo ryšį tarp padidėjusio EPIYA C segmentų ir ikivėžinius pakitimus. Be to, ne įtikinamų rezultatų paskelbė Argent kt
. [20] vertinant 44 štamus iš Afrikos pacientų autoriai parodė tendenciją jungtis į asociacijas tarp CagA su dviem ar daugiau EPIYA C segmentų ir skrandžio vėžio.
Šie skirtumai gali būti paaiškinti skirtingų studijų dizaino, imties dydį, gyventojų skaičių ir geografinę įvairovę H . pylori
žymekliai patogeniškumo, ryšium su CagA EPIYA modelio, pabrėždama studijuoja įvairiuose geografiniuose regionuose poreikį.
šio tyrimo rezultatai parodė, kad didesnis skaičius EPIYA C segmentų yra susijęs su skrandžio vėžiu bei pasirengimo -malignant pažeidimai, atrofijos ir žarninės metaplazijos iš corpus gleivinės pacientams, sergantiems gastritu grupėje. Pagal susitarimą su šiomis išvadomis, mes taip pat parodė, kad koncentraciją serume SGN buvo dvigubai sumažėjo pacientų, užkrėstų CAG
A-teigiamų kamienų su dviem ar trimis EPIYA C motyvais. Kadangi SGN yra išskiriami vyriausiųjų ląstelių ir gleivinių kaklo ląstelių Corpus ir fundic liaukų, serumo PGI lygiai atspindi funkcinę ir morfologiškai statusą oxyntic skrandžio gleivinės; Taigi, skrandžio atrofinių /metaplastic pokyčiai susilpnėjusiu SGN serume [30, 31]. Nors Corpus gleivinė pacientams, sergantiems H. pylori
susijęs dvylikapirštės žarnos opa yra arba šiek tiek ar ne uždegimas, SGN serume taip pat sumažėjo ir dvylikapirštės žarnos opa pacientų, užkrėstų padermių, turinčių aukštąjį skaičių EPIYA C segmentus.
Rezultatus šio tyrimo stiprinti potencialų vaidmenį CagA polimorfizmo į skrandžio vėžio išsivystymo susitarus su ankstesnių tyrimų [18, 19] rezultatais. Tačiau mes negalime atmesti galimybės, kad genetinė konstitucija priimančiosios daugiau nei bakterijos padermės, gali padidėti polinkis į atrofinį gastritas ir H. pylori
padermių vežančių vis daugiau EPIYA C kartojasi turės virš kitų padermių pranašumą į kolonizavimo naują skrandžio aplinką arba alternatyviai sudėtingesnę sąveiką abiejų mechanizmų.
atžvilgiu dvylikapirštės žarnos opa, taip pat tyrimų rezultatai yra prieštaringi [19, 25]. Mūsų rezultatai sutampa su tais, pranešė Basso kt
. [19], kuris taip pat nerado ryšio tarp ligos ir EPIYA C segmentų skaičiaus Italijos gyventojų. Pažymėtina, kad nė vienas pacientas su dvylikapirštės žarnos opa mūsų grupėje buvo kolonizuota CagA turintis tris EPIYA C segmentus. Kaip siūlė Yamaoka ir kt
. [18], ji yra įmanoma, kad padermės, kurių didesnio skaičiaus EPIYA segmentui C gali būti mažiau atspari rūgšties [18].
Mes taip pat įvertinta, ar kolonizavimo skirtingų kamienų (įvairiam infekcija) galėtų būti susietas su ligos rezultatų. Mes nustatėme, kad skrandžio vėžiu sergantiems pacientams buvo reikšmingai dažniau kolonizuoti mišrių padermių, o pacientams, sergantiems dvylikapirštės žarnos opa turėjo tendenciją mažiau mišrių padermės kolonizacijos. Viena galimybė yra ta, kad pacientams, sergantiems skrandžio vėžiu, turėtų sritis skrandžio gleivinės, rodančius vėžio transformaciją, pakaitomis su srityse atrofija, žarnyno metaplazijos, displazija, ir normalus gleivinės, kiekvienas jų, atstovaujantis mikroaplinkos, kurios būtų selektyviai naudinga mišrių infekcijų [32, 33 ].
išvadas
Taigi, mes nustatėme, kad infekcija H. pylori
CagA teigiamų padermės kelis EPIYA C pakartoja yra susijęs su skrandžio ikivėžinius pakitimus ir skrandžio vėžio, bet ne su dvylikapirštės žarnos opos etniškai įvairi, susimaišė, Vakarų gyventojai.
Nors infekcijos H. pylori CAG
A teigiamų padermių yra rizikos veiksnys tarpusavyje nesuderinamų ligų, skrandžio vėžio ir dvylikapirštės žarnos opa, CagA padermių, turinčių didesnio skaičiaus EPIYA C segmentai buvo susijęs su skrandžio vėžiu, bet ne su dvylikapirštės žarnos opa.
didesnio skaičiaus EPIYA C segmentuose taip pat buvo susijęs su skrandžio ikivėžinius pakitimus kaip parodė histologinių skrandžio atrofijos ir metaplastic pokyčius ir sumažėjęs kraujo serume pepsinogen I
metodų
> Pacientai
Mes įtraukėme 436 pacientams, užsikrėtusiems CAG
A-teigiamų kamienus H. pylori
(188 su skrandžio vėžiu, 112 su dvylikapirštės žarnos opa ir 136 su gastritas), tarp tų, kurie buvo pateikti endoskopijos iki išaiškinti simptomų, susijusių su viršutinės virškinimo trakto ar kas kilmę atlikta skrandžio operacija pašalinti skrandžio karcinoma universitetinės ligoninės /UFMG, Luxemburgo ir Mario Penna ligoninėse, Belo Horizonte, Brazilija. Dauguma įtrauktų asmenų (> 80%) buvo žemo socialinio ir ekonominio lygio su panašiais kultūriniais įpročiais, ir visi buvo gimtoji Minas Gerais valstijos su tautiečiais, maždaug 33% portugalų, 33% Amerikos indėnų ir 33% Afrikos Kilmės, vienodai dalyvauja kiekvieno dalyko [29].
tyrimas buvo patvirtinti tarnybinės etikos komitetų ir sutikimas buvo gautas iš visų pacientų. buvo atlikta transporto, kultūros ir mikrobiologinė identifikavimas bakterijų izoliatų, kaip aprašyta anksčiau [34, 35].
Histologija
Jei gastritas ir dvylikapirštės žarnos opa pacientų grupėje, endoskopiniai biopsijos mėginius antralinių ir oxyntic skrandžio gleivinės buvo gautas histologinis ir mikrobiologinio tyrimo. Antralinių ir oxyntic biopsijos mėginiai buvo nustatytas 10% formalinu ir įdėta į parafinas, ir 4-mkm storio histologiniai skyriai buvo tamsintas su carbolfuchsin H. pylori pervežimas tyrimo [35] ir hematoxycilin ir eozinu už histologinio vertinimo pagal atnaujintas Sidnėjus sistema [36]. Į skrandžio vėžiu sergantiems pacientams grupės, fragmentai buvo gauti iš skrandžio pašalinamas pašalintas skrandis po atidarymo jį išilgai didesnio kreivumo per vieną valandą po rezekcija. Navikas buvo klasifikuojami pagal Lauren [37].
Gavyba bakterijų DNR pervežimas bakterijos DNR, gauta iš 60 mm Petri lėkštelę augimo buvo išgauti naudojant QIAmp (Qiagen, Hilden, Vokietija) rinkinio pagal gamintojo rekomendacijas atlikus nedidelius pakeitimus , Distiliuotas vanduo buvo naudojamas kaip reakcijos kontrolės. DNR koncentracija buvo nustatoma pagal spektrometrija, naudojant NanoDrop 2000 ( "Thermo Scientific", Wilmington, NC) ir laikomas -20 ° C iki naudojimą.
Amplifikaoija H. pylori pervežimas specifinę URE pervežimas A ir 16S rRNR
genai
konkrečių URE
A ir 16S rRNR genų
buvimas buvo vertinami pagal Clayton et al.
[38] ir "Fox ir kt
. [39] atitinkamai. Standartinis Tx30a H. pylori
padermės buvo naudojamas kaip teigiama kontrolė, o Escherichia coli
kamienas ir distiliuoto vandens tiek buvo naudojami kaip neigiamos kontrolės.
Termocikleryje GeneAmp PGR sistema 9700 (taikoma BIOSYSTEMS Foster City , CA) buvo naudojamas visų reakcijų. Amlifikuoti produktai buvo atliekama elektroforezė 2% agarozės gelyje, nudažomi su etidžio bromido, ir analizuojami, atliekant ultravioletiniais spinduliais transiliuminatoriumi.
Amplifikaoija APG
geną
APG
genas buvo amplifikuotas priemonėmis iš dviejų anksčiau aprašytų pradmenų porų [40, 41]. H.pylori
padermė iš mūsų kolekcija (1010-95), žinoma, kad reikia CAG
A teigiamas, buvo naudojamas kaip teigiama kontrolė, o Tx30a H.pylori
padermės trūksta CAG
ir distiliuotas vanduo abu buvo naudojamas kaip neigiamos kontrolės. manoma, kad H. pylori
kamienai turi būti CAG
A-teigiamas, kai bent vienas iš dviejų reakcijų buvo teigiamas.
amplifikavimą 3 'kintamos srities, CAG
A
For PGR amplifikacija kryptimi nuo 3 'variabilios srities APG
geną (, kuriame yra EPIYA sekas), 20-100 ng DNR buvo pridėta 1% Taq DNR polimerazė buferinio tirpalo (KCl 50 mM ir Tris-HCl 10 mM), 1,5 mm MgCl 2, 100 mkm kiekvieno deoksinukleotido, 1,0 V Platina Taq DNR polimerazė (Invitrogen, San Paulas, Brazilija), o 10 pmol kiekvieno gruntas, kurių bendra tirpalo tūris 20 įxL. Naudojami gruntai anksčiau buvo aprašyta Yamaoka ir kt
. [27]. Reakcijos sąlygos buvo: 95 ° C temperatūroje 5 minutes, po to 35 ciklų 95 ° C temperatūroje 1 minutę, 50 ° C temperatūroje 1 minutę, ir 72 ° C temperatūroje 1 minutę, baigiant su 72 ° C 7 minutes. Amlifikuoti produktai buvo atliekama elektroforezė 1,5% agarozės gelyje, kad buvo tamsintas su etidžio bromido, ir analizuojami ultravioletinių spindulių šviesos transiliuminatoriumi. Reakcija davė produktus 500 iki 850 bp pagal EPIYA C. skaičius Ši metodika taip pat leidžia mišrios infekcijos aptikimo.
Sekos iš 3 'kintamojo regione CAG
pervežimas didelę pogrupyje mėginiai (maždaug 75 pacientų kiekvienoje grupėje) buvo atsitiktinai parinktas sekos analizei, siekiant patvirtinti PGR rezultatus. PGR produktai buvo išvalytas su Wizard SV gelis ir PGR valymo sistema (Promega, Madison, MI) pagal gamintojo rekomendacijas. Išgrynintas produktai sekos naudojant BigDye ® Terminatorius v3.1 ciklas eilės nustatymas Kit ABI 3130 Genetic Analyzer (Applied Biosystems, Foster City, CA). Gauti sekos buvo sulyginta naudojant CAP3 seka asamblėjos programa (galima iš http:... //Pbil Univ-lyon1 FR /cap3 PHP). Po suderinimo, nukleotidų sekos buvo transformuota į aminorūgščių sekas naudojant Blastx programą (galima gauti iš: http:..... //Sprogimo ncbi NLM NIH valst /Aukštakrosnės CGI) ir, palyginti su sekomis pervedamos į GenBank. (http:.... //www ncbi NLM NIH valst /GENBANK /)
nustatymas SGN koncentracija serume Viesbutis The koncentracija serume SGN buvo nustatyti pacientams, sergantiems gastritas ir dvylikapirštės žarnos opa konkrečiu ELISA (BIOHIT, Helsinkis, Suomija) pagal gamintojo rekomendacijas.
statistinė analizė
imties dydis bent 112 dalykų kiekvienoje grupėje, siekiant parodyti 15% skirtumo tarp grupių su 80% galios, alfa 5% ir pasikliautinasis intervalas yra 95% buvo
apskaičiuojamas pagal Epi Info programos versija 3.5.1 (centrų ligų kontrolės ir prevencijos, Atlanta, GA). asociaciją tarp skaičių EPIYA C motyvai ir skrandžio vėžys iš pradžių buvo įvertintas pagal vieną požymį analizės ir kintamieji su p-reikšmė mažesnė nei 0,2 buvo įtraukti į galutinį modelį logistinę regresiją, kontroliuojant amžiaus ir lyties įtaka. Mes taip pat įvertino lytį ir amžių iš EPIYA C segmentų skaičiaus poveikį modeliu su EPIYA C yra priklausomas kintamasis, o amžius, lytis ir H. pylori
-associated ligos kaip nepriklausomi covariables numerį. Logistikos modelis fitneso buvo įvertinta Hosmer-Lemeshow testą. Kadangi PGI koncentracija paprastai nėra platinamas duomenys žurnalas pertvarkyta ir tapo normalus. Asociacijos buvo, todėl vertino Stjudento t testą (vidurkis ± standartinis nuokrypis). Asociacija tarp iš EPIYA C segmentų skaičiaus ir skrandžio uždegimas, atrofijos ir žarninės metaplazijos laipsnis buvo padaryta dvipusiu Mann-Whitney testas. Reikšmingumo lygis buvo nustatytas ap vertės ≤ 0,05.
Deklaracijų
Padėka
šis darbas buvo remiamas dotacijų iš CNPq, FAPEMIG ir INCT, Brazilija.
DMM, Queiroz yra finansuojamas pagal Šeštąją bendrosios programos Europos Sąjungos projekto turinio (INCO-CT-2006-032.136).
Autoriai pradinis pateikiami failai vaizdų
Žemiau išvardintos nuorodos į autorių originalus pateiktų failų vaizdų. 12866_2010_1347_MOESM1_ESM.pdf Autorių originalus failas 1 pav 12866_2010_1347_MOESM2_ESM.pdf Autorių originalaus failo 2 pav 12866_2010_1347_MOESM3_ESM.pdf Autorių originalaus failo 3 paveiksle

• Trūksta susitarimu tonometric ir skrandžio sulčių dalinis anglies dvideginio tension
• Downregulation jungiamojo audinio augimo faktoriaus slopina augimą ir invazija skrandžio vėžio ląsteles ir sumažina pilvaplėvės dissemination