Ekspresija gena analiza Helicobacter pylori zaražen i high-sol dijeta miševa tretiranih želuca modelu tumora: identifikaciju CD177 kao novog prognostički faktor u bolesnika s želuca cancer

Gene Expression analizu Helicobacter pylori
-infected i high-sol prehrana obrađen mišji model želučani tumor: identifikacija CD177 kao novi prognostički faktor u bolesnika s karcinomom želuca
apstraktne pregled pozadine pregled Helicobacter pylori pregled (H. pylori pregled) infekcije i prekomjerno sol usisni poznati su kao važni čimbenici rizika za rak želuca kod ljudi. No, interakcija tih dvaju čimbenika s profila genske ekspresije tijekom želučane karcinogeneze ostaju nejasni. U ovom istraživanju, istražili smo globalno izražavanje gena povezanih s želučanom karcinogeneze i prognozi ljudskog karcinoma želuca pomoću modela miša.
Metode
Za pronalaženje gena kandidata koji su uključeni u želucu karcinogeneze, mi prvo konstruirao miša kancerogen inducirani želuca tumorski model u kombinaciji s H. pylori
infekcije i high-sol dijeta. C57BL /6J miševima je N pregled -metil-N pregled -nitrosourea u vodi za piće, te žrtvovani nakon 40 tjedana. Životinje od kombinacije skupine bile su cijepljene s H. pylori Netlogu te hranjeni high-sol dijeta. Gene Expression profili u žljezdani želudac od miševa su pod istragom oligonukleotidne microarray. Drugo, ispitali smo dostupnost gena kandidata kao prognostički faktor za ljudskim pacijentima. Imunohistokemijska analiza CD177, jednog od gore regulirano gena, provedena je u ljudskim naprednim uzoraka raka želuca procijeniti povezanost s prognozom. | Rezultati
mnogostrukosti želučane tumor kancerogen tretiranih miševa značajno je povećan za kombinaciju H. pylori
infekcije i high-sol dijeta. U analizi microarray, 35 i više 31 nego dva puta regulira prema gore i geni regulirani dolje, odnosno, otkrivene su u H. pylori
-infection i high-sol dijeta u kombinaciji skupini u usporedbi sa drugim skupinama. Kvantitativna RT-PCR potvrđena značajno prekomjerna ekspresija dviju gena kandidata, uključujući Cd177
i Reg3g
. Na imunohistokemijske analize CD177 u ljudskim naprednim uzoraka raka želuca, prekomjerna ekspresija bila je očita u 33 (60,0%) od 55 slučajeva, značajno koreliraju s povoljnim prognozu (P pregled = 0.0294). Multivarijatna analiza uključujući kliničkopatološkim čimbenicima kao kovarijable pokazale visoku ekspresiju CD177 da bude neovisan prognostički čimbenik za ukupno preživljenje.
Zaključci pregled Ovi rezultati ukazuju na to da je naš model miša u kombinaciji s H. pylori pregled infekcije i visoke soli dijetu je korisno za profila genske ekspresije u želučanom karcinogeneze, pružajući dokaz da CD177 je roman prognostički čimbenik za rak želuca. Ovo je prvo izvješće pokazuje prognostičkog korelacija između ekspresije CD177 i krutog ponašanja tumora. Rak pregled Ključne riječi pregled Cd177 želudac Helicobacter pylori pregled Microarray Salt Pozadina pregled, karcinom želuca je četvrti najčešći karcinom i drugi vodeći uzrok od karcinoma povezanih smrti u svijetu [1]. Helicobacter pylori pregled (H. pylori pregled) sada je priznat kao jedan od glavnih faktora rizika za kronični gastritis razvoj i rak želuca [2]. Osim toga, sredine i faktori također se pokazalo da utjecaja želučane karcinogeneze i soli (natrijev klorid, NaCl) i slana hrana su od posebnog značenja, na temelju dokaza iz više epidemioloških i eksperimentalnim studijama [3-6]. Dakle, u kombinaciji izloženost H. pylori pregled infekcije i prekomjeran unos soli, kako se čini vrlo važno za razvoj i progresiju želučanih tumora, iako detaljnih mehanizama, osobito u pogledu profila genske ekspresije, ostaje da se razjasni.
Visoka propusnost mikropostrojima tehnologija pruža snažan alat za sveobuhvatnu analizu gena, već primjenjuje za procjenu ekspresije gena uzorke u ljudskim uzorcima i životinjskim modelima želučanih poremećaja [7-16]. Iako su mnogi istraživači su bili usredotočeni na ekspresiju gena u H. pylori pregled tretiranih stanične linije želučani [17-19], rezultati u kulturi stanica ne moraju nužno korelirati s izrazom specifičnih gena u in vivo
mikro okolinu sadrži mnoštvo imunološki odgovori i strome-epitela interakcije u karcinomima. Kancerogen liječenih mongolskih gerbila su korišteni kao koristan životinjskom modelu H. pylori pregled -associated želučane karcinogeneze [20-24], a mi smo ranije izvijestili da je sinergističko interakcija između H. pylori pregled infekcije i visoke soli unos ubrzava kronične upale i razvoja tumora u želucima tih životinja [25, 26]. Nažalost, ne postoji dostupan za gerbila genoma, čime su otežali genetske i molekularne analize malo informacija. Dakle, pažnja je usmjerena na mišjim modelima [12, 13], te uspostavu mišjem modelu za rak želuca sadrži soli i H. pylori pregled izlaganja je potrebno za istraživanja usmjerenih gene koji su uključeni u želučanom karcinogeneze.
Prethodnih studija Microarray korištenjem modela štakora nije razlikovao i karakteriziraju profile ekspresije temelje na interakciji H. pylori pregled infekcije i unos soli. U ovom istraživanju ispitali smo ekspresiju gena u želučanoj sluznici u A H. pylori pregled -infected i high-sol dijeta tretirane mišjem modelu želučane tumorskog oligonukleotidne microarray i pronašli dva kandidata regulira prema gore gene uključujući Cd177 Netlogu i Reg3g
. Također smo istraživali ekspresiju CD177 u ljudskim naprednim želučanog karcinoma imunohistokemijski, a dobiveni dokazi kao potencijalni prognostički faktor za želučane karcinogeneze.
Metode
inokulacije s H. pylori
H. pylori
je pripremljen istim postupkom kao što je prethodno opisano [27, 28]. Ukratko, H. pylori pregled (Sydney soj 1) je inokuliran u Brucella agar ploče (Becton Dickinson, Cockeysville, MD, USA) koji sadrži 7% (v /v) toplinom inaktiviranog fetalnog goveđeg seruma (FBS), te inkubira na 37 ° C ° C pod microaerophilic uvjetima pri visokoj vlažnosti tijekom 2 dana. Zatim, bakterije koje rastu na pločama bila je uvedena u Brucella bujonu (Becton Dickinson) s dodatkom 7% (v /v) FBS-a i inkubirane su pod istim uvjetima 24 h. Nakon 24-satnog gladovanja, životinje su bile unutar gastrically inokulirani H. pylori
(1,0 × 10 8 jedinica koje tvore kolonije). Prije inokulacije, juha kulture H. pylori
su provjereni pod faznokontrastne mikroskopom za bakterijske obliku i pokretljivosti. Pregled životinje i eksperimentalni protokol
pedeset i šest specifičnih patogena bez muškarac, 5 ili 6 -week stari C57BL /6J miševa (CLEA Japan, Tokyo, Japan) su bili korišteni u ovom istraživanju. Sve životinje su smještene u plastičnim kavezima na tvrdo-chip posteljina u klimatiziranoj sobi s biohazard 12-satnom svjetlo /12-satnog ciklusa mraka, a omogućen slobodan pristup hrani i vodi tijekom. Pokus je odobren od strane Care odbora Instituta za istraživanje Aichi Cancer Center životinja, a životinje su zbrinuti u skladu s institucionalnim smjernicama, kao i smjernice za ispravno obavljanje pokusa na životinjama (vijeća za znanost Japana, 1. lipnja 2006. godine ).
eksperimentalni postupak je prikazan na slici 1A. Miševi su podijeljeni u 4 skupine (skupina A-D); 21, 5, 15 i 15 miševi su dodijeljeni A, B, C, i D grupa, respektivno, na početku pokusa. Životinje u grupi B i D bile su cijepljene s H. pylori
intra-gastrically na izmjenični tjedna (ukupno 7 puta), dok su miševi iz druge skupine bile su cijepljene s Brucella juha sama. dobili su svi miševi N pregled metil-N pregled -nitrosourea (mnu, Sigma Chemical, St. Louis, MO, USA) u vodi za piće u koncentraciji od 120 ppm na izmjenični tjedna (ukupna izloženost bila 5 tjedana) , Za ovu svrhu mnu Svježe je otopljen u destiliranoj vodi tri puta tjedno. Miševi grupe C i D dobio CE-2 dijetama (bazalna sadržaj natrija u 0,36%, CLEA Japan) koji sadrži 10% NaCl. Tijekom razdoblja izlaganja, jedna životinja grupe B, jednog od skupine C i šest skupini D umrli ili su postali umrtvljeni i oni su isključeni iz eksperimenta. Na 40 tjedana, ostale životinje su podvrgnute dubokoj anesteziji i laparotomije ekscizijom želuca. Slika 1 Eksperimentalni dizajn i patohistološke otkrića. A: Eksperimentalni dizajn. Pet-do šest tjedana starih muških C57BL /6J miševi su inokulirani s H. pylori
SS1 soja (Grupe B i D) ili Brucella bujona (skupina A i C). Sve životinje primile su 120 ppm mnu u vodi za piće na alternativni tjedana (ukupna izloženost, 5 tjedana). Miševi grupe C i D su dati bazalnu dijetu (CE-2) koji sadrži 10% NaCl. B: Patohistološke rezultati za mnu izazvanog miševa želučanih tumora. (A i b) Želučani adenom u pyloric područjem tretira mnu-a H. pylori pregled -infected miša (skupina B). (C i d) Želučani adenokarcinom vidjeti u skupini B Napomena visoke gustoće stanica i stanični i strukturnu atipiji. Bar = 200 (a i c) ili 100 um (b i d).
Histološku procjenu
za histološki pregled, a želuci su fiksirane u 10% neutralno-puferirani formalin tijekom 24-h rezanjem duž uzdužne osi u trake jednake širine, i uklopljene u parafin. Četiri um debele sekcije su pripremljene i obojeni hematoksilinom i eozinom (H &E) za histološki promatranje. Tumori su klasificirani u adenoma i adenokarcinoma temelji na staničnoj i morfološkom atipiji i invazivnog rasta na submukoze kao što smo ranije izvijestili [21]. Pregled Priprema RNA i oligonukleotidne analiza Microarray pregled Ukupna RNA se ekstrahira iz cijele sluznice želuca, uključujući oba tumora i perifernog tkiva pomoću RNeasy Plus Mini Kit (Qiagen, Hilden, Njemačka) i njegovu kvalitetu pregleda sa sustavom mikročip za elektroforezu (i-chip SV1210; Hitachi Chemical, Tokyo, Japan). Uzorci kvalitetni odabrani su i skupljeni su za svaku skupinu kako bi se izbjeglo pojedinačne razlike za procjenu oligonukleotid mikropolja (grupa A, n = 3; B, n = 4, C, n = 6; D, n = 7). CodeLink Miš genoma Bioarray (Applied Microarrays, Tempe, AZ, USA) koji sadrži 35,587 sonde serije po čipu je korišten za analizu ekspresije gena profile. Hibridizacija, obradu i skeniranje provedene su Filgen, Inc (Nagoya, Japan), skeniranje fotografija podaci se analiziraju pomoću softverskog paketa (Microarray Data Analysis Tool, Filgen). Kompletan-veza hijerarhijska grupiranje ispitana je na četiri grupe pomoću kvalificirane sonda podskup (Filgen). Pregled Kvantitativna realnom vremenu RT-PCR ekspresije profila u miševa želucu pregled Relativna kvantitativne real-time RT-PCR pomoću StepOne real-time PCR System (tnom City, CA, USA) s mišem specifične gliceraldehid-3-fosfat dehidrogenaze (GAPDH
) gen kao interna kontrola. Nakon DNase liječenja Prvi lanci cDNA sintetiziran je iz ukupne RNA korištenjem Superscript vilo cDNA Synthesis Kit (Invitrogen, Carlsbad, CA, USA). PCR je postignuto u biti u skladu s uputama proizvođača, upotrebom QuantiTect SYBR Green PCR Kit (Qiagen). Nizovi primera za svaki gen su navedene u tablici 1. Specifičnost PCR reakcija je potvrđena pomoću programa krivulje taline koji se isporučuje s StepOne softver i elektroforeze uzorka PCR na 3% agaroznom gelu. Razina ekspresije mRNA su normalizirane na razini mRNA i GAPDH
a u usporedbi s kontrolnim miševima (grupa A) od strane ΔΔCT method.Table 1 sekvencijama za relativni kvantitativni u realnom vremenu RT-PCR
Gene
pregled Nizovi
duljina proizvoda
Pristupanje br.
GAPDH
5'-AACGGATTTGGCCGTATTG-3 'pregled 140 pregled NM_008084 pregled, 5'-TTGCCGTGAGTGGAGTCATA-3 'pregled Cd177
5'-AGGGGTGCCACTCACTGTTA-3' pregled 128 pregled NM_026862 pregled 5'-CCGATTGTTTTGGAGTCACC-3 pregled Reg3g
pregled, 5'-GTATGGATTGGGCTCCATGA-3 'pregled 106 pregled NM_011260 pregled 5'-GATTCGTCTCCCAGTTGATG-3' pregled Muc13
5'-CCTAATCCCTACGCAAACCA-3 '
124 pregled NM_010739 pregled 5'-TCTGCCCATTTCTCCTTGTC-3 'pregled GAPDH pregled gliceraldehid-3-fosfat dehidrogenaze, Reg3g pregled regeneraciju otočića izveden iz proteina 3 gama, Muc13
mucina 13.
pacijenti i uzorci tumora
ukupno 55 slučajeva primarnog uznapredovalog karcinoma želuca, kirurški reseciranih na rak Aichi Centar bolnice (Nagoya, Japan) između 1995. i 2002. godine, istraživali su nakon dobivanja informirani pristanak. Istraživanje je odobrilo Etičko povjerenstvo Aichi Cancer Center. Svi bolesnici bili su muškarci, a srednja dob i srednja perioda praćenja bili su 58,6 ± 10,2 godina i 83 tjedana, odnosno. Niti je primio preoperativna kemoterapija ili radioterapija. Karcinomi s susjedna tkiva sluzi su fiksirane i uronjeni u parafin i seciran za bojenje s H &E. Klasifikacija tumora inscenacije i dijagnozi naprednim slučajevima su izrađene prema japanskoj klasifikaciji želuca karcinomi [29]. Karcinomi napali muskularis propria (T2 za TNM klasifikacija), a subserosa (T3), ili serosa i peritonejsku šupljinu (T4A), ponekad uključuje susjednih organa (T4b).
Imunohemije koristi ljudski rak želuca tkiva
ispitali smo ekspresiju CD177, za koje je bila dostupna komercijalna primarna protutijela, u ljudskim tkivima, imunohistokemijski želučanog karcinoma. Nakon inhibiciju Aktivnost endogene peroksidaze uranjanjem u 3% -tnom otopinom vodikovog peroksida /metanol, dohvat antigen je provedena s 10 mM citratnom puferu (pH 6,0), u mikrovalnoj pećnici kroz 10 minuta pri 98 ° C. Zatim, sekcije su inkubirane s mišjim monoklonskim anti-CD177 antitijela (klon 4C4, razrijeđen 1: 100, Abnova, Taipei, Taiwan). Bojenje za CD177 provedena je pomoću Vectastain Elite ABC Kit (Vector Laboratories, Burlingame, CA, USA) i vezanje vizualizirati sa 0,05% 3,3'-diaminobenzidin. Rezultati CD177 imunološkim u maligne stanice su klasificirani u četiri stupnja; ocjena 0 (nitko 0-10% pozitivnih stanica), stupanj 1 (slabo, 10-30%), stupanj 2 (umjerena, 30-60%) i 3. stupnja (jaka, više od 60%) na temelju udjela obojene stanice, a slučajevi pokazuju umjerena do jaka bojenja su smatrane pozitivnim.
statistička analiza pregled Hi-kvadrat test s Bonferroni korekcije se koristi za procjenu broj slučajeva želuca tumora. Kvantitativne vrijednosti uključujući mnogostrukosti tumora i relativne ekspresije mRNA prikazani kao prosjek ± SD ili SE, te razlike između srednjih vrijednosti su statistički analizirani ANOVA ili Kruskal-Wallis testa nakon kojeg slijedi Tukey testom višestruke usporedbe. Sveukupno preživljenje procijenjena je pomoću Kaplan-Meier metodi i log-rank test za usporedbu. Korelacija između CD177 izražavanja i kliničkopatološkim faktori su analizirani ANOVA ili Hi-kvadrat test. Multivarijatna analiza provedena je ispitati da li CD177 prekomjerna ekspresija bila samostalna prognostički čimbenik pomoću Cox proporcionalnog rizike regresijski model. P
vrijednosti < 0,05 smatrane su statistički značajnima. Pregled Rezultati pregled učestalost i mnogostrukosti želučane tumora
učinkovitu broj miševa i promatranih učestalosti i mnogostrukosti želučane tumora prikazani su u tablici 2. Tumori razvijene u sluznici želuca svih liječenih mnu-grupa (grupe AD) (Slika 1B). U visokim soli skupina dijeta obrađen (skupine C i D), incidencija želučane tumora u skupini D (H. pylori pregled -infected 100%) bio je značajno veći nego u skupini C (ne-om; 50,0 %) (P pregled i 0.05). U bazalnim dijeta skupina (skupine A i B), incidencija je također povećan za H. pylori
-infection (skupina A, 61,9% i grupe B, 100%), iako bez statističke značajnosti. U mnogostrukosti ukupnih tumora u oba H. pylori pregled -infected skupine (skupina B, 3,3 ± 1,0 tumori /miš i skupina D, 2.6 ± 1.1) bili su znatno veći od onih u nezaraženih skupine (grupe A, 0.9 ± 0,8 i skupina C, 1,0 ± 1,2) (p pregled i 0.05). Brojnost želučanog adenokarcinoma u skupini D (2,1 ± 1,4) bila je nešto veća od one u skupini B (1,8 ± 1,0), a značajno povećana u odnosu na vrijednost skupina C (0,8 ± 1,0) (P izvoznici < 0,05). Nasuprot tome, mnogostrukosti od adenoma u skupinama A i D (0,1 ± 0,4 i 0,4 ± 0,5, respektivno) bile su značajno niže nego u skupini B (1,5 ± 0,6) (P izvoznici < 0,05 i 0,01) .table 2 Incidencija i mnoštvo želučanih tumora na pregled Efektivni broj liječeni mnu miševa
Group
tretmana
incidencija (%)
mnogostrukosti (br. od tumor /miš)
adenom
karcinom
Ukupno tumor
adenom
karcinom
Ukupno tumor
pregled pregled 21 pregled mnu pregled 3 (14,3)
13 (61,9)
13 (61,9)
0,1 ± 0.4a pregled 0,8 ± 0,7 Netlogu 0,9 ± 0,8 pregled, b
4 pregled mnu + H. pylori
4 (100) b
4 (100)
4 (100) pregled, 1,5 ± 0,6 pregled, 1,8 ± 1,0 pregled, 3.3 ± 1.0c pregled C
14 pregled mnu + 10% NaCl
2 (14.3) pregled 6 (42,9) pregled, 7 (50,0) pregled, 0,2 ± 0,6 pregled, 0,8 ± 1,0 pregled, 1,0 ± 1,2 pregled, D pregled, 9 pregled mnu + H. pylori pregled + 10% NaCl
4 (44,4)
8 (88,8)
9 (100) d pregled 0,4 ± 0.5e pregled 2,1 ± 1.4D pregled 2.6 ± 1.1d pregled vrijednosti za mnogostrukosti izraženi kao prosjek ± SD. Incidencija se općenito procjenjuje Hi-kvadrat testa, nakon čega slijedi parnom analiza s Bonferroni korekcije. Multipliciteti su općenito analizirani pomoću ANOVA, zatim Tukey testom višestruke usporedbe. AP izvoznici < 0.01 vs pregled skupina B, BP izvoznici < 0.01 vs pregled skupina A, CP izvoznici < 0.05 vs pregled Group A, dP izvoznici < 0.05 vs pregled Group C, EP izvoznici < 0,05 vs. pregled Group B. pregled Ekspresija gena profiliranje u žljezdane želucima po oligonukleotid microarray Netlogu sa oligonukleotidima microarrays, u usporedbi s ne-zaražene i bazalni dijeta liječenih skupina (skupina a), 34 geni su up-regulirana i 169 podregulirani više od dva puta u H. pylori pregled -infected miševa (skupina B), 56 regulira prema gore i prema dolje 129 -regulated u visoko soli miševa tretiranih dijeta (skupina C), te 69 doreguliran i 214 reguliran dolje u kombiniranoj grupi (skupina D) (Slika 2). Uzeti zajedno, kao što je prikazano u tablici 3, otkrili smo da je 35 gena regulira prema gore i 31 geni podregulirani više od dva puta samo kombinacijom H. pylori pregled infekcije i visoke soli dijetu. Osim toga, hijerarhijska analiza klastera je provedena na četiri skupine s ukupno 303 kvalificiranih sonde koriste clustering algoritam potpuna-spojnice (Slika 3). Trideset jedan sonde uključujući Cd177 Netlogu, Reg3g Netlogu i Muc13 pregled potvrđeni da su unutar skupine od sondi regulira prema gore samo u grupe D. naknadne analize u ovom istraživanju bio je usmjeren na tim genima, jer je to se smatralo da su geni u kojem izraz je izmijenjen samo u kombinaciji grupi mogu biti povezani s želučanom karcinogeneze i napredovanja u ljudi. Slika 2 Globalna analiza gena u žljezdanog želuca liječenih mnu miševa pomoću oligonukleotidne mikročipa. O: Broj gena gore ili prema dolje regulira više od dva puta u trbuh liječenih mnu miševa. U Venna dijagramu, krugovi Up (lijevo) ili dolje regulirano (desno) gena u želucu liječenih mnu-miševa s H. pylori pregled infekcije, high-sol prehrani ili njihovom kombinacijom. Osjenčano područje predstavlja prema gore ili dolje regulirani geni više od dva puta samo kombinacije. B: Kvantitativna realnom vremenu RT-PCR analiza tri odabrana up-reguliranih gena (Cd177
, Reg3g
i Muc13
) u želucima tretiranih mnu miševa. Razina ekspresije gena u svakom uzorku normalizirani GAPDH pregled kao unutarnje kontrole pomoću ΔΔCT metodom. Relativni razinama su predstavljeni kao promjena X puta u odnosu na skupine A (fiksiran kao 1,0). Statistička analiza provedena je Kruskal-Wallis test za opću analizu i Tukey test za višestruke usporedbe. Barovi, SE; *, P izvoznici < 0,01 vs. pregled grupa A i < 0.05 vs pregled Group C; †, P izvoznici < 0.01 vs pregled, Grupa C. pregled Tablica 3 regulirani geni kombinacijom infekcije H. pylori i visoke soli u prehrani miša želučane sluznice pregled Pristupanje br.
Simbol pregled
gena /proteina pregled
mnogostrukost promjene
regulira prema gore gene
XM_357640 pregled Igk-V8 pregled, Imunoglobulin kapa lanac varijabilne 8 (V8)
14,4 pregled XM_001472541 pregled Ighg pregled Imunoglobulin teški lanac (gama polipeptid)
9,2 pregled, NM_026862 pregled Cd177 pregled CD177 antigen pregled 7.3 pregled NM_011260 pregled Reg3g pregled regeneraciju otočića-izvedeni 3 gama pregled 6,1
NM_023137
UBD pregled ubikvitina D
4.3
XM_144817 pregled Igk-V34 pregled Imunoglobulin kapa lanac varijabilne 34 (V34)
4,1 pregled, NM_007675 pregled Ceacam10 pregled karcinoembrijski antigena vezanih stanične adhezije molekula 10 pregled 3.7 pregled NM_183322 pregled Khdc1a pregled KH domene sadrži 1A pregled 3.3
NM_011475
Sprr2i pregled Mali prolin-bogatih proteina 2I
3,2 pregled, NM_175165 pregled Tprg pregled Transformacija povezan s protein-63 regulira pregled 3.2
NM_175406 pregled Atp6v0d2
ATPaze, H + koji prevoze , lizosomskog V0 podjedinica D2
3,0 pregled, NM_009703 pregled Araf pregled, v-raf mišji sarkom 3611 virusnih onkogena homologni pregled 2.6
NM_026822
Lce1b
Kasno rožnatih omotnica 1B
2.5 pregled NM_016958 pregled Krt14 pregled keratinski 14 pregled 2.5 pregled NM_212487 pregled Krt78 pregled keratinski 78 pregled 2.4 pregled NM_009807 pregled Casp1 pregled kaspaze 1
2,4 pregled, NM_146037 pregled Kcnk13 pregled kalij kanal, potfamilija K, član 13 pregled 2.4 pregled NM_019450 pregled Il1f6 pregled interleukin 1 obitelj, član 6. pregled 2.3 pregled NM_008827 pregled PGF pregled placentni čimbenik rasta pregled 2.3
XM_893506
Klk12 pregled kalikreina u vezi-peptidaza 12 pregled 2.3 pregled NM_016887 pregled Cldn7 pregled Claudin 7
2,3 pregled, NM_029360 pregled Tm4sf5 pregled transmembranski 4 član superobitelji 5 pregled 2.2 pregled NM_172301 pregled Ccnb1 pregled ciklin B1 pregled 2.2 pregled NM_010739 pregled Muc13 pregled mucina 13, epitelne transmembranski pregled 2.2
NM_011165
Prl4a1
prolaktin obitelji 4, potfamilija a, član 1 pregled 2.2 pregled NM_010162 pregled EXT 1 pregled Exostoses (više) 1
2,2 pregled, NM_011704 pregled Vnn1
Vanin 1 pregled 2.1 pregled NM_011082 pregled Pigr pregled Polimerni imunoglobulina receptora pregled 2.1
NM_007769
Dmbt1
Izbrisano u zloćudnim tumorima mozga 1 pregled 2.1 pregled NM_022984 pregled retencije pregled resistin pregled 2.1 pregled NM_173037 pregled Tmco 7
transmembranski i smotan-coil domene 7 pregled 2.1
NM_009100 pregled Rptn pregled Repetin pregled 2.1 pregled NM_007630 pregled Ccnb2 pregled Ciklin B2 pregled 2.1 pregled NM_001081060 pregled Slc9a3 pregled otopljene tvari nosač obitelj 9 (natrij /vodika izmjenjivač), član 3. pregled 2.0 pregled NM_146588 pregled Olfr1030 pregled Njušni receptor 1030 pregled 2.0 pregled Down-regulirani geni
NM_008753 pregled Oaz1 pregled ornitin dekarboksilaze antizyme 1 pregled 0,31 pregled NM_027126 pregled Hfe2 pregled tipa Hemokromatoza 2 (maloljetnik) (humani homologni) pregled, 0,33 pregled NM_053206 pregled Magee2 pregled melanom antigen, obiteljski E, 2
0,33 pregled NM_010924 pregled Nnmt pregled nikotinamid N-metiltransferaza
0,41 pregled NM_026260 pregled Tctn3 pregled Tektonski član obitelji 3
0,41 pregled NM_181039 pregled Lphn1
Latrophilin 1 pregled 0,43 pregled NM_008312 pregled Htr2c pregled 5-hidroksitriptamina (serotonin) receptora 2C pregled 0,43 pregled NM_146667 pregled Olfr740 pregled Njušni receptora 740 pregled 0.44
NM_007550 pregled BLM pregled Bloom sindrom homologni (ljudski)
0,44
NM_011243 pregled RaRb pregled retinoičnom kiselinom receptora, beta pregled 0.44
NM_184052
IGF1
inzulinu sličan faktor rasta 1 pregled 0,45 pregled NM_013893 pregled Reg3d pregled regenerirajuća otočić-izvedeni 3 Delta pregled 0,46 pregled NM_008645 pregled Mug1 pregled Murinoglobulin 1 pregled 0,46
NM_029550 pregled Keg1 pregled bubrega izražen gen 1 pregled 0,46 pregled NM_019388 pregled CD86 pregled CD86 antigen pregled 0,46
NM_011316
Saa4
serum-amiloid A 4 pregled 0,47 pregled NM_007811 pregled Cyp26a1 pregled citokroma P450, obitelj 26, potfamilija a, polipeptid 1 pregled 0,47 pregled NM_011538 pregled Tbx6 pregled T-box 6 pregled 0.48
NM_011086 pregled Pip5k3 pregled fosfatidilinozitol-3-fosfat /fosfatidilinozitol 5-kinaze, tip III
0.48
NM_133723
Asph
Aspartate-beta-hydroxylase
0.48
NM_001081390
Palld
Palladin, citoskeleta protein povezan
0,48 pregled NM_007858 pregled Diap1 pregled Prozirnog homologni 1 (Drosophila) pregled, 0,48 pregled NM_053271 pregled Rims2 pregled Reguliranje sinaptičkih membrana eksocitozu 2 pregled, 0,48
NM_153163 pregled Cadps2 pregled ovise o Ca2 + aktivator protein za lučenje 2 pregled, 0,49 pregled NM_007541 pregled Bglap1 pregled kostiju gama karboksiglutamat proteina 1 pregled 0,49 pregled NM_031871 pregled Ghdc
domene GH3 sadrži pregled 0,49
NM_025545
Aptx
Aprataxin
0,49
NM_177322
Agtr1a
receptora angiotenzina II, tipa 1a pregled 0,49
NM_026872 pregled Ubap2 pregled ubikvitina protein povezan 2 pregled, 0,49 pregled NM_028045 pregled Erv3 pregled Endogeni retrovirusni slijed 3
0,49 pregled NM_011641 pregled Trp63 pregled Transformacija povezan s protein-63 pregled 0,49 pregled Slika 3 Hijerarhijska klastera analiza četiri eksperimentalne skupine liječenih mnu miševa. Expression podaci iz 303 kvalificiranih sondama (lijevo). Četiri eksperimentalne skupine su svrstane u dvije skupine (grupe A /C) i (Grupa B /D) na temelju sličnosti u izrazu uzoraka. Svaki redak predstavlja sondu, a svaki stupac predstavlja eksperimentalnu skupinu (skupine A-D). Kao što je prikazano u traku boja, zelena ukazuje na regulaciju; crvena označava dolje propisom; i crna pokazuje nikakve promjene. Trideset jedan sonde čine skupinu od sondi regulira prema gore samo u skupini D (desno).
Cijelog rezultate ove analize mikropolja su poslane i lako dostupna iz javnog baze podataka NCBI Gene Expression Omnibus (GEO) sa pristupni broj GSE29444 (uzorak broj: GSM728857-60). pregled kvantitativna realnom vremenu RT-PCR analiza profila genske ekspresije u mnu miševa tretiranih želudaca
Relativna kvantitativne real-time RT-PCR analiza tri odabrana nad- regulirani geni (Cd177 pregled, Reg3g pregled i Muc13
) u H. pylori pregled -infected i high-sol dijeta tretiranih miševa potvrdila povećanu ekspresiju Cd177 Netlogu i Reg3g Netlogu, kao što je prikazano na slici 2B, sa značajnim razlikama. Iako izraz razina Muc13 Netlogu u skupini D bila je veća nego u ostalim skupinama, nije bilo statistički značaj među njima (P pregled = 0,0712 u odnosu na pregled, skupina C).
Imunohistokemijsku ekspresiju CD177 u čovjeka napredne želučani rak i korelacija s kliničkopatološkim faktora
na imunohistokemijske analize ljudskih tkiva raka želuca, CD177 je primijetio ne samo u membranama i cytoplasms od uvukle neutrofila, ali i želučanih stanica raka obje dobro i loše diferenciranim adenokarcinoma ( slika 4A). Stanice raka tipa stanica pečatnjak-prsten (2 slučaja) bili su negativni na CD177. Među 55 slučajeva raka želuca, umjereno do jako izražavanje CD177 opažena u 33 (60,0%) (Tablica 4). Slika 4 imunohistokemijski na CD177 u ljudskoj uznapredovalog raka želuca i korelaciji s ukupnom stopom preživljavanja. A: Imunohistokemijska analiza CD177 izražavanja u ljudskom tkivu karcinoma želuca. (A i b) Negativna bojenje (niti na slab) za CD177 u želučanog adenokarcinoma. CD177 izraz je prisutan samo u infiltracije neutrofila, dok maligne stanice dobro diferencirani (a) ili slabo diferencirani (b) karcinoma su negativni. Izvorni uvećanje, × 100 (umetnuta, × 400). (C i D) Napomena pozitivan (umjerena do jaka) izraz za CD177 u dobro diferencirani (c) ili slabo diferenciranih (d) želučanih stanica raka. Izvorni uvećanje, × 100 (umetnuta, × 400). B:. Usporedba Kaplan-Meier krivulje kumulativnog preživljavanja za CD177 negativnih i pozitivnih slučajeva raka želuca pregled Tablica 4 CD177 izraz u želučanom karcinomu i njegovu korelaciju s kliničkopatološkim faktora

predmetu broj
. CD177 Over-expression

Pvalue‡

Positive

Negative

Strong

Moderate

Weak

None

Gastric adenokarcinoma
55 pregled, 18 pregled, 15 pregled, 17 pregled 5
dobi pregled godina (prosjek ± SD)
55,3 ± 10,4 pregled 60,2 ± 8,13 pregled 59.8 ± 11,0 pregled 60,4 ± 13,0 pregled 0.5039 pregled histološke klasifikacije pregled Well /umjereno diferencirani tipa * pregled 21 pregled 6
9
4 pregled 2
0,1904 pregled slabo diferencirana tip /pečatni prsten stanica **
34 pregled, 12 pregled 6
13 pregled 3 pregled Dubina invazije † pregled T1-3
27
5
10 Netlogu 10 pregled 2 pregled 0.2011
T4 pregled 26. pregled 11 pregled 5
7
3 pregled limfnih čvor metastaze pregled N0 pregled 6
1 pregled 2 pregled, 2 pregled, 1 pregled 0,7869 pregled N1-3 pregled 49 pregled, 17 pregled 13
15 pregled 4 pregled * crijevna tipa Lauren je, ** tipa difuzna Lauren je, broj † Slučaj je smanjena na pedeset i tri, jer je dubina invazije nije klasificiran u dva slučaja, ‡ su provedena ANOVA i Hi-kvadrat test dobi i drugih čimbenika, odnosno.
perioda praćenja bolesnika u rasponu od 9 do 606 tjedna (medijan = 83 tjedana). Petogodišnje preživljenje za CD177 pozitivne i negativne su 39,4% i 18,2%, respektivno. Iz analize krivulja preživljavanja Kaplan-Meier, CD177 pozitivne ekspresija je povezana s boljim ukupno preživljavanje (P Netlogu = 0.0294, log-rank test) (slika 4b). Nije bilo statistički značajne korelacije CD177 izražavanja s dobi, histološka klasifikacija, dubine invazije i metastaziranja limfnog čvora (Tablica 4). Pregled, multivarijatne analize ukupnog preživljavanja ljudskih slučajeva raka želuca
Korištenje Cox proporcionalnih rizika modela , multivarijatna analiza kliničkopatološkim varijabli, uključujući i dobi pacijenta, tumora histološki klasifikacije, dubini invazije, limfnih čvorova metastaza, i izražavanja CD177 (Tablica 5), ​​otkrila je posljednji biti neovisni čimbenik za ukupno preživljavanje (P pregled = 0,0323) , Svi autori pročitali i odobrili konačnu rukopis. Pregled

• Kurkumin poboljšava izraz SCF /c-kit kroz prigušenje oksidativnim stresom i aktivacijom NF-kB u želučanom tkivu dijabetične gastropareze rats
• Nedostatak prehrana povećava rizik smrtnosti od raka želuca