UMSOMs Institute for Genome Sciences får ett bidrag på 17,5 miljoner dollar för forskning om infektionssjukdomar

Institute for Genome Sciences (IGS) vid University of Maryland School of Medicine (UMSOM) tilldelades 17,5 miljoner dollar från National Institute of Allergy and Infectious Diseases (NIAID) för att finansiera IGS Genome Center for Infectious Diseases (GCID) för ytterligare fem år.

Huvudutredaren och administrativ kärnchef för bidraget, som har titeln "A Genomics Based Investigation of the determinants of Polymicrobial Infectious Disease Outfalls, "är David Rasko, Doktorsexamen, Professor i mikrobiologi och immunologi och forskare vid IGS. Teamutredare kommer att inkludera:Claire M. Fraser, Doktorsexamen, dekanens begåvade professor i medicin, Mikrobiologi och immunologi, och direktör för IGS, och Owen R. White, Doktorsexamen, Professor i epidemiologi och folkhälsa, Direktör för bioinformatik och associerad direktör för IGS.,

GCID använder storskalig genomik och bioinformatik för att undersöka patogenbiologi, virulens, immunförsvar, mikrobe-mikrobe-interaktioner samt värd-mikrobiom-interaktioner. Vetenskapliga forskningsprojekt fokuserar på samband mellan värd/mikrober mellan olika bakterier, svampar, och parasiter. Det tvärvetenskapliga teamet kommer att delta i GCID -forskningen, inklusive internationellt erkänd fakultet från Institute for Genome Sciences, institutionen för mikrobiologi och immunologi och UMSOM Center for Vaccine Development and Global Health (CVD) och deras mångåriga samarbetspartners.

"GCID -teamet har varit i framkant när det gäller att tillämpa genomiska tekniker för att främja vetenskaplig förståelse för smittsamma sjukdomar under de senaste 15 åren, och denna förnyelse av NIAID-bidrag kommer att tillåta oss att ytterligare implementera genomiska metoder i studien av värd-patogen-mikrobiom-interaktioner, sa Dr Fraser.

NIAID -bidraget kommer att stödja forskningsprogram som fokuserar på tre områden. Ett forskningsområde innefattar att studera samspelet mellan flera bakterier med varandra såväl som värden och tillhörande mikrobiom, som leds av Dr. Rasko, Dr Fraser, och Herve S.G. Tettelin, Doktorsexamen, Docent i mikrobiologi och immunologi och forskare vid IGS. Det andra området inkluderar forskning om genomisk och transkriptomisk analys av svamppatogener som interagerar med värden, som kommer att ledas av Vincent M. Bruno, Doktorsexamen, Docent i mikrobiologi och immunologi och forskare vid IGS. Det tredje forskningsområdet inkluderar ett integrerat genomiskt forskningsprojekt om parasitiska tropiska sjukdomar som kommer att ledas av Julie C. Dunning Hotopp, Doktorsexamen, Docent i mikrobiologi och immunologi och forskare vid IGS, David Serre, Doktorsexamen, Docent i mikrobiologi och immunologi och forskare vid IGS; och Joana C. Silva, Doktorsexamen, Docent i mikrobiologi och immunologi och forskare vid IGS

"Detta bidrag ger oss möjlighet att integrera studien av flera patogener i modellsystem och med mänskliga prover på ett sätt som är mer representativt för naturliga infektionsprocesser, vilket kommer att ge större förståelse och mer fördjupad insikt i dessa interaktioner, sa Dr Rasko.

Centret stöder också en teknikkärna, en datahanteringskärna och en administrativ kärna. Projekten inkluderar hela genomet och riktad genomsekvensering, transkriptomprofilering med RNA-seq, rRNA -community profilering, och metagenomik och metatranscriptomisk sekvensering med fokus på mikrobernas interaktioner med varandra, värden och den bosatta mikrobiomen. Sekvenseringen kommer att utföras med flera plattformar, inklusive Illumina MiSeq och HiSeq, Oxford Nanopore Technology och Pacific Biosciences -systemen.

"Integrering av genomik med diagnostisk och klinisk medicin har avancerat vår biologiska förståelse för sjukdomar och hälsa, "säger E. Albert Reece, MD, Doktorsexamen, MBA, Vice President for Medical Affairs vid University of Maryland, och John Z. och Akiko K. Bowers Framstående professor och dekan vid University of Maryland School of Medicine. "Detta NIAID -bidrag kommer att främja nya samarbeten mellan discipliner inom klinik- och forskningscentra vid School of Medicine, liksom med internationella samhällen för infektionssjukdomar. "

Förutom forskningsprojekten, IGS kommer att etablera workshops och fortsätta utbildningsinitiativ för att utöka förståelsen för hur man tillämpar genomik på högprioriterade forskningsfrågor som påverkar global hälsa.

IGS har tidigare fått bidrag som Genome Center for Infectious Diseases (GCID) ett NIAID-finansierat femårigt bidrag (2014-2019); ett Genomsekvenscenter för infektionssjukdomar (GSCID); ett NIAID-finansierat femårskontrakt (2009-2014), och de ledande utredarna har också haft huvudutredarroller med det NIAID-finansierade mikrobiella sekvenscentret (MSC), ett femårskontrakt (2004-2009). Detta U19 -bidrag med nummer U19 AI110820 löper i fem år fram till 2024, representerar tjugo års spetskforskning inom genomvetenskap.

• Studien jämför användning av bröstmjölk med formeln hos barn som genomgick benmärgstransplantation
• Studien erbjuder nytt hopp för patienter med dekompenserad cirros