Hlavný vyšetrovateľ a hlavný administratívny riaditeľ grantu, s názvom „Genomické skúmanie determinantov výsledkov polymikrobiálnych infekčných chorôb, „je David Rasko, PhD., Profesor mikrobiológie a imunológie a vedec na IGS. Vyšetrovatelia tímu budú zahŕňať:Claire M. Fraser, PhD., dekanom obdarený profesor medicíny, Mikrobiológia a imunológia, a riaditeľ IGS, a Owen R. White, PhD., Profesor epidemiológie a verejného zdravia, Riaditeľ bioinformatiky a zástupca riaditeľa IGS.,
GCID používa na skúmanie biológie patogénov rozsiahle genomické a bioinformatické prístupy, virulencia, únik imunity, interakcie mikrób-mikrób, ako aj interakcia hostiteľ-mikrobióm. Projekty vedeckého výskumu sa zameriavajú na vzájomné vzťahy hostiteľ/mikrób rôznych baktérií, huby, a parazitmi. Interdisciplinárny tím sa zúčastní výskumu GCID, vrátane medzinárodne uznávanej fakulty z Inštitútu pre vedy genómu, Katedra mikrobiológie a imunológie a Centrum UMSOM pre vývoj vakcín a globálne zdravie (CVD) a ich dlhoroční spolupracovníci.
„Tím GCID je za posledných 15 rokov v popredí aplikácie genómových techník na zlepšenie vedeckého porozumenia pôvodcov infekčných chorôb, a toto obnovenie grantu NIAID nám umožní ďalšie nasadenie genomických prístupov pri štúdiu interakcií hostiteľ-patogén-mikrobióm, “povedal doktor Fraser.
Grant NIAID bude podporovať výskumné programy, ktoré sa zameriavajú na tri oblasti. Jedna oblasť výskumu zahŕňa štúdium interakcií viacerých baktérií medzi sebou navzájom, ako aj s hostiteľom a súvisiacim mikrobiómom, pod vedením Dr. Raska, Dr. Fraser, a Herve S. G. Tettelin, PhD., Docent mikrobiológie a imunológie a vedec na IGS. Druhá oblasť zahŕňa výskum genomickej a transkriptomickej analýzy hubových patogénov interagujúcich s hostiteľom, ktorý povedie Vincent M. Bruno, PhD., Docent mikrobiológie a imunológie a vedec na IGS. Tretia oblasť výskumu zahŕňa integrovaný projekt výskumu genomiky v oblasti parazitických tropických chorôb, ktorý bude viesť Julie C. Dunning Hotopp, PhD., Docent mikrobiológie a imunológie a vedecký pracovník IGS, David Serre, PhD., Docent mikrobiológie a imunológie a vedec na IGS; a Joana C. Silvu, PhD., Docent mikrobiológie a imunológie a vedec na IGS
„Tento grant nám umožňuje integrovať štúdium viacerých patogénov do modelových systémov a do ľudských vzoriek spôsobom, ktorý je reprezentatívnejší pre prirodzené infekčné procesy, ktoré poskytnú lepšie porozumenie a hlbšie vhľady do týchto interakcií, “povedal doktor Rasko.
Stredisko tiež podporuje technologické jadro, jadro správy údajov a jadro správy. Projekty zahŕňajú celý genóm a cielené sekvenovanie genómu, transkriptómové profilovanie pomocou RNA-seq, profilovanie komunity rRNA, a metagenomiky a metatranskriptomického sekvenovania so zameraním na vzájomné interakcie mikróbov, hostiteľ a rezidentný mikrobióm. Sekvenovanie sa bude vykonávať pomocou viacerých platforiem, vrátane Illumina MiSeq a HiSeq, Technológia Oxford Nanopore a systémy Pacific Biosciences.
„Integrácia genomiky s diagnostickou a klinickou medicínou zlepšila naše biologické chápanie chorôb a zdravia, “hovorí E. Albert Reece, MD, PhD., MBA, Viceprezident pre lekárske záležitosti na University of Maryland, a John Z. a Akiko K. Bowers významný profesor a dekan Lekárskej fakulty Univerzity Marylandu. „Tento grant NIAID bude podporovať novú spoluprácu naprieč odbormi v rámci klinických a výskumných centier na Lekárskej fakulte, ako aj s medzinárodnými komunitami infekčných chorôb. “
Okrem výskumných projektov IGS zorganizuje workshopy a bude pokračovať v vzdelávacích iniciatívach s cieľom rozšíriť chápanie toho, ako aplikovať genomiku na výskumné otázky s vysokou prioritou, ktoré majú vplyv na globálne zdravie.
IGS predtým získala granty ako Genome Center for Infectious Disease (GCID) a päťročný grant financovaný NIAID (2014-2019); Centrum sekvenovania genómu pre infekčné choroby (GSCID); päťročná zmluva financovaná NIAID (2009-2014), a vedúci vyšetrovatelia mali tiež úlohy hlavného vyšetrovateľa v Centre mikrobiálneho sekvenovania (MSC) financovanom NIAID, päťročnú zmluvu (2004-2009). Tento grant U19 s číslom U19 AI110820 bude trvať päť rokov do roku 2024, predstavuje dvadsať rokov špičkového výskumu v genomických vedách.
Označenie potenciálnych molekulárnych prediktorov reakcie na biologické terapie pri ulceróznej kolitíde
Ulcerózna kolitída
Črevné bakteriálne zmeny ovplyvňujú výsledky liečby lupusu v tehotenstve
Pacienti na imunoterapiách by mali konzumovať viac vlákniny,
Vedci vyvinuli 3D tlačenú pilulku, ktorá vzorkuje baktérie nachádzajúce sa v čreve
Rybí sliz by mohol byť potenciálnym zdrojom výskumu nálezov antibiotík
Označenie potenciálnych molekulárnych prediktorov reakcie na biologické terapie pri ulceróznej kolitíde
Niekoľko jedincov trpiacich chorobami čriev, ako je ulcerózna kolitída, nereaguje na konvenčne používané biologické terapie. V takých prípadoch, prispôsobená predikcia reakcie na terapiu by bola prosp
Tiopuríny by mohli pomôcť zastaviť replikáciu vírusov v ľudských koronavírusoch
Vedci z Katedry mikrobiológie a imunológie, Dalhousie University, Univerzita v Calgary, a Katedra biochémie a molekulárnej biológie, Univerzita Britskej Kolumbie, Kanada, pracoval s ľudskými koronavír
Huby a baktérie v čreve môžu rovnako ovplyvniť ľudské zdravie a závažnosť chorôb
Črevnému mikrobiómu sa venovala veľká pozornosť, ale nový výskum ukazuje, že huby v čreve sú tiež dôležitým mikroorganizmom vo fungovaní a zdraví čriev, čo potom vplýva na zdravie človeka.