UMSOMs Institute for Genome Sciences mottar 17,5 millioner dollar tilskudd til forskning på smittsomme sykdommer

Institute for Genome Sciences (IGS) ved University of Maryland School of Medicine (UMSOM) ble tildelt 17,5 millioner dollar fra National Institute of Allergy and Infectious Diseases (NIAID) for å finansiere IGS Genome Center for Infectious Diseases (GCID) for ytterligere fem år.

Hovedetterforsker og administrativ kjernedirektør for tilskuddet, som har tittelen "A Genomics Based Investigation of the Determinants of Polymicrobial Infectious Disease Outfalls, "er David Rasko, PhD, Professor i mikrobiologi og immunologi og forsker ved IGS. Teametterforskere vil inkludere:Claire M. Fraser, PhD, dekanens begavede professor i medisin, Mikrobiologi og immunologi, og direktør for IGS, og Owen R. White, PhD, Professor i epidemiologi og folkehelse, Direktør for bioinformatikk og assisterende direktør i IGS.,

GCID bruker storskala genomikk og bioinformatikk for å undersøke patogenbiologi, virulens, immunundvikelse, mikrobe-mikrobe-interaksjoner så vel som vert-mikrobiom-interaksjoner. Vitenskapelige forskningsprosjekter fokuserer på vert/mikrobe -sammenhenger mellom forskjellige bakterier, sopp, og parasitter. Det tverrfaglige teamet vil delta i GCID -forskningen, inkludert internasjonalt anerkjent fakultet fra Institute for Genome Sciences, Institutt for mikrobiologi og immunologi og UMSOM senter for vaksineutvikling og global helse (CVD) og deres mangeårige samarbeidspartnere.

"GCID -teamet har vært i spissen for å anvende genomiske teknikker for å fremme vitenskapelig forståelse av smittsomme agenter de siste 15 årene, og denne fornyelsen av NIAID-tilskudd vil tillate oss å distribuere genomiske tilnærminger ytterligere i studiet av vert-patogen-mikrobiom-interaksjoner, "sa Dr. Fraser.

NIAID -tilskuddet vil støtte forskningsprogrammer som fokuserer på tre områder. Ett forskningsområde innebærer å studere samspillet mellom flere bakterier med hverandre, så vel som verten og tilhørende mikrobiom, som ledes av Dr. Rasko, Dr. Fraser, og Herve S.G. Tettelin, PhD, Førsteamanuensis i mikrobiologi og immunologi og forsker ved IGS .. Det andre området inkluderer forskning på genomisk og transkriptomisk analyse av sopppatogener som interagerer med verten, som vil bli ledet av Vincent M. Bruno, PhD, Førsteamanuensis i mikrobiologi og immunologi og forsker ved IGS. Det tredje forskningsområdet inkluderer et integrert genomisk forskningsprosjekt i parasittiske tropiske sykdommer som vil bli ledet av Julie C. Dunning Hotopp, PhD, Førsteamanuensis i mikrobiologi og immunologi og forsker ved IGS, David Serre, PhD, Førsteamanuensis i mikrobiologi og immunologi og forsker ved IGS; og Joana C. Silva, PhD, Førsteamanuensis i mikrobiologi og immunologi og forsker ved IGS

"Dette tilskuddet lar oss integrere studiet av flere patogener i modellsystemer og med menneskelige prøver på en måte som er mer representativ for naturlige smitteprosesser, som vil gi større forståelse og mer inngående innsikt i disse interaksjonene, "sa Dr. Rasko.

Senteret støtter også en teknologikjerne, en kjerne for datahåndtering og en administrativ kjerne. Prosjektene inkluderer hele genomet og målrettet genom -sekvensering, transkriptomprofilering av RNA-seq, rRNA -samfunnsprofilering, og metagenomikk og metatranscriptomisk sekvensering med fokus på interaksjonen mellom mikrober med hverandre, verten og det bosatte mikrobiomet. Sekvensering vil bli utført ved hjelp av flere plattformer, inkludert Illumina MiSeq og HiSeq, Oxford Nanopore Technology og Pacific Biosciences -systemene.

"Integrering av genomikk med diagnostisk og klinisk medisin har avansert vår biologiske forståelse av sykdommer og helse, "sier E. Albert Reece, MD, PhD, MBA, Visepresident for medisinske anliggender ved University of Maryland, og John Z. og Akiko K. Bowers Fremstående professor og dekan ved University of Maryland School of Medicine. "Dette NIAID -tilskuddet vil fremme nye samarbeid på tvers av fagområder innen kliniske og forskningssentre ved School of Medicine, så vel som med internasjonale infeksjonssamfunn. "

I tillegg til forskningsprosjektene, IGS vil etablere workshops og fortsette utdanningsinitiativer for å utvide forståelsen av hvordan man bruker genomikk til forskningsspørsmål med høy prioritet som påvirker global helse.

IGS har tidligere mottatt tilskudd som Genomsenter for smittsomme sykdommer (GCID), et NIAID-finansiert femårig tilskudd (2014-2019); et genom -sekvenseringssenter for smittsomme sykdommer (GSCID); en femårskontrakt finansiert av NIAID (2009-2014), og de ledende etterforskerne har også hatt hovedinspektørroller med NIAID-finansierte Microbial Sequencing Center (MSC), en femårskontrakt (2004-2009). Dette U19 -tilskuddet med nummer U19 AI110820 vil løpe i fem år fram til 2024, representerer tjue års banebrytende forskning innen genomisk vitenskap.

• Studie sammenligner bruk av morsmelk med formel hos barn som gjennomgikk beinmargstransplantasjon
• Studien gir nytt håp for pasienter med dekompensert skrumplever