O Investigador Principal e o Diretor Administrativo do subsídio, que é intitulado "Uma investigação baseada na genômica dos determinantes dos resultados de doenças infecciosas polimicrobianas, "é David Rasko, PhD, Professor de Microbiologia e Imunologia e Cientista do IGS. Os investigadores da equipe incluirão:Claire M. Fraser, PhD, o Professor de Medicina Dotado do Reitor, Microbiologia e Imunologia, e Diretor da IGS, e Owen R. White, PhD, Professor de Epidemiologia e Saúde Pública, Diretor de Bioinformática e Diretor Associado da IGS.,
O GCID usa abordagens de genômica e bioinformática em grande escala para investigar a biologia de patógenos, virulência, evasão imunológica, interações micróbio-micróbio, bem como interações hospedeiro-microbioma. Os projetos de pesquisa científica enfocam as inter-relações hospedeiro / micróbio de diversas bactérias, fungos, e parasitas. A equipe interdisciplinar participará da pesquisa GCID, incluindo professores internacionalmente reconhecidos do Institute for Genome Sciences, o Departamento de Microbiologia e Imunologia e o Centro para Desenvolvimento de Vacinas e Saúde Global (CVD) da UMSOM e seus colaboradores de longa data.
"A equipe do GCID tem estado na vanguarda da aplicação de técnicas genômicas para o avanço da compreensão científica dos agentes de doenças infecciosas nos últimos 15 anos, e esta renovação da concessão do NIAID nos permitirá implementar abordagens genômicas no estudo de interações hospedeiro-patógeno-microbioma, "disse o Dr. Fraser.
A bolsa do NIAID apoiará programas de pesquisa que se concentram em três áreas. Uma área de pesquisa envolve estudar as interações de várias bactérias entre si, bem como o hospedeiro e o microbioma associado, que é liderado pelo Dr. Rasko, Dr. Fraser, e Herve S.G. Tettelin, PhD, Professor Associado de Microbiologia e Imunologia e Cientista do IGS. A segunda área inclui pesquisas sobre a análise genômica e transcriptômica de patógenos fúngicos interagindo com o hospedeiro, que será liderado por Vincent M. Bruno, PhD, Professor Associado de Microbiologia e Imunologia e Cientista da IGS. A terceira área de pesquisa inclui um projeto de pesquisa genômica integrada em doenças tropicais parasitárias que será liderado por Julie C. Dunning Hotopp, PhD, Professor Associado de Microbiologia e Imunologia e Cientista da IGS, David Serre, PhD, Professor Associado de Microbiologia e Imunologia e Cientista da IGS; e Joana C. Silva, PhD, Professor Associado de Microbiologia e Imunologia e Cientista da IGS
"Esta concessão nos permite integrar o estudo de vários patógenos em sistemas modelo e com amostras humanas de uma forma que seja mais representativa dos processos de infecção natural, o que fornecerá maior compreensão e insights mais aprofundados sobre essas interações, "disse o Dr. Rasko.
O centro também oferece suporte a um núcleo de tecnologia, um núcleo de gerenciamento de dados e um núcleo administrativo. Os projetos incluem genoma completo e sequenciamento de genoma direcionado, perfil de transcriptoma por RNA-seq, perfil da comunidade rRNA, e metagenômica e sequenciamento metatranscriptômico com foco nas interações dos micróbios entre si, o hospedeiro e o microbioma residente. O sequenciamento será realizado em várias plataformas, incluindo Illumina MiSeq e HiSeq, Oxford Nanopore Technology e os sistemas Pacific Biosciences.
"A integração da genômica com a medicina diagnóstica e clínica avançou nossa compreensão biológica de doenças e saúde, "diz E. Albert Reece, MD, PhD, MBA, Vice-presidente de Assuntos Médicos da Universidade de Maryland, e John Z. e Akiko K. Bowers Distinguished Professor e Reitor da University of Maryland School of Medicine. "Esta doação do NIAID promoverá novas colaborações entre disciplinas dentro dos centros clínicos e de pesquisa na Escola de Medicina, bem como com as comunidades internacionais de doenças infecciosas. "
Além dos projetos de pesquisa, IGS estabelecerá workshops e continuará iniciativas educacionais para expandir a compreensão de como aplicar a genômica a questões de pesquisa de alta prioridade que impactam a saúde global.
A IGS já recebeu doações como Centro de Genoma para Doenças Infecciosas (GCID), uma doação de cinco anos financiada pelo NIAID (2014-2019); um Centro de Sequenciamento de Genoma para Doenças Infecciosas (GSCID); um contrato de cinco anos financiado pelo NIAID (2009-2014), e os investigadores principais também tiveram funções de Investigador Principal no Centro de Sequenciação Microbial (MSC) financiado pelo NIAID, um contrato de cinco anos (2004-2009). Esta concessão U19 com o número U19 AI110820 será válida por cinco anos até 2024, representando vinte anos de pesquisa de ponta em ciências genômicas.
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