L'Istituto per le scienze del genoma dell'UMSOM riceve una sovvenzione di 17,5 milioni di dollari per la ricerca sulle malattie infettive

L'Istituto per le scienze del genoma (IGS) presso l'Università del Maryland School of Medicine (UMSOM) ha ricevuto 17,5 milioni di dollari dall'Istituto nazionale di allergie e malattie infettive (NIAID) per finanziare l'IGS Genome Center for Infectious Diseases (GCID) per altri cinque anni.

Il ricercatore principale e il direttore del nucleo amministrativo per la sovvenzione, che si intitola "Un'indagine basata sulla genomica dei determinanti degli esiti delle malattie infettive polimicrobiche, "è David Rasko, dottorato di ricerca, Professore di Microbiologia e Immunologia e Scienziato presso IGS. Gli investigatori del team includeranno:Claire M. Fraser, dottorato di ricerca, il professore di medicina del preside, Microbiologia e Immunologia, e Direttore dell'IGS, e Owen R. White, dottorato di ricerca, Professore di Epidemiologia e Sanità Pubblica, Direttore della Bioinformatica e Direttore Associato di IGS.,

Il GCID utilizza approcci genomici e bioinformatici su larga scala per studiare la biologia dei patogeni, virulenza, evasione immunitaria, interazioni microbio-microbi e interazioni ospite-microbioma. I progetti di ricerca scientifica si concentrano sulle interrelazioni ospite/microbo di diversi batteri, fungo, e parassiti. Il team interdisciplinare parteciperà alla ricerca GCID, tra cui docenti riconosciuti a livello internazionale dall'Istituto per le scienze del genoma, il Dipartimento di Microbiologia e Immunologia e il Centro UMSOM per lo sviluppo di vaccini e la salute globale (CVD) e i loro collaboratori di lunga data.

"Il team GCID è stato in prima linea nell'applicazione di tecniche genomiche per far progredire la comprensione scientifica degli agenti di malattie infettive negli ultimi 15 anni, e questo rinnovo della sovvenzione NIAID ci consentirà di implementare ulteriormente gli approcci genomici nello studio delle interazioni ospite-patogeno-microbioma, " ha detto il dottor Fraser.

La sovvenzione NIAID sosterrà programmi di ricerca incentrati su tre aree. Un'area di ricerca prevede lo studio delle interazioni di più batteri tra loro, nonché l'ospite e il microbioma associato, che è guidato dal Dr. Rasko, Dottor Fraser, e Herve S.G. Tettelin, dottorato di ricerca, Professore Associato di Microbiologia e Immunologia e Scienziato presso IGS.. La seconda area comprende la ricerca sull'analisi genomica e trascrittomica dei patogeni fungini che interagiscono con l'ospite, che sarà condotto da Vincent M. Bruno, dottorato di ricerca, Professore Associato di Microbiologia e Immunologia e Scienziato presso IGS. La terza area di ricerca include un progetto di ricerca genomica integrato nelle malattie tropicali parassitarie che sarà guidato da Julie C. Dunning Hotopp, dottorato di ricerca, Professore Associato di Microbiologia e Immunologia e Scienziato presso IGS, David Serre, dottorato di ricerca, Professore Associato di Microbiologia e Immunologia e Scienziato presso IGS; e Joana C. Silva, dottorato di ricerca, Professore Associato di Microbiologia e Immunologia e Scienziato presso IGS

"Questa sovvenzione ci consente di integrare lo studio di più agenti patogeni in sistemi modello e con campioni umani in un modo più rappresentativo dei processi di infezione naturali, che forniranno una maggiore comprensione e approfondimenti su queste interazioni, " ha detto il dottor Rasko.

Il centro supporta anche un Technology Core, un nucleo di gestione dei dati e un nucleo amministrativo. I progetti includono l'intero genoma e il sequenziamento mirato del genoma, profilo del trascrittoma mediante RNA-seq, profilazione della comunità di rRNA, e metagenomica e sequenziamento metatrascrittomico con particolare attenzione alle interazioni dei microbi tra loro, l'ospite e il microbioma residente. Il sequenziamento verrà eseguito utilizzando più piattaforme, inclusi Illumina MiSeq e HiSeq, Tecnologia Oxford Nanopore e sistemi Pacific Biosciences.

"L'integrazione della genomica con la medicina diagnostica e clinica ha fatto progredire la nostra comprensione biologica delle malattie e della salute, " dice E. Albert Reece, dottore, dottorato di ricerca, MBA, Vicepresidente per gli affari medici presso l'Università del Maryland, e John Z. e Akiko K. Bowers Distinguished Professor e Dean della University of Maryland School of Medicine. "Questa sovvenzione NIAID promuoverà nuove collaborazioni tra le discipline all'interno dei centri clinici e di ricerca della School of Medicine, così come con le comunità internazionali di malattie infettive".

Oltre ai progetti di ricerca, IGS organizzerà workshop e continuerà iniziative educative per ampliare la comprensione di come applicare la genomica a questioni di ricerca ad alta priorità che hanno un impatto sulla salute globale.

IGS ha precedentemente ricevuto sovvenzioni come Centro Genoma per le Malattie Infettive (GCID) una sovvenzione quinquennale finanziata dal NIAID (2014-2019); un Centro di sequenziamento del genoma per le malattie infettive (GSCID); un contratto quinquennale finanziato dal NIAID (2009-2014), e gli investigatori principali hanno anche avuto ruoli di investigatore principale con il Microbial Sequencing Center (MSC) finanziato dal NIAID, contratto quinquennale (2004-2009). Questa borsa di studio U19 con il numero U19 AI110820 avrà una durata di cinque anni fino al 2024, che rappresentano vent'anni di ricerca all'avanguardia nelle scienze genomiche.

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