UMSOM genomo mokslų institutas gauna 17,5 milijono dolerių stipendiją infekcinių ligų tyrimams

Merilendo universiteto Medicinos mokyklos (UMSOM) Genomo mokslų institutui (IGS) iš Nacionalinio alergijos ir infekcinių ligų instituto (NIAID) buvo skirta 17,5 mln. metų.

Pagrindinis dotacijos tyrėjas ir pagrindinis administracijos direktorius, kuris pavadintas „Genomika pagrįstas polimikrobinių infekcinių ligų rezultatų veiksnių tyrimas“, "yra Davidas Rasko, Daktaras, Mikrobiologijos ir imunologijos profesorius bei IGS mokslininkas. Komandos tyrėjai bus:Claire M. Fraser, Daktaras, dekano apdovanotas medicinos profesorius, Mikrobiologija ir imunologija, ir IGS direktorius, ir Owenas R. White'as, Daktaras, Epidemiologijos ir visuomenės sveikatos profesorius, Bioinformatikos direktorius ir IGS asocijuotasis direktorius,

GCID naudoja didelio masto genomikos ir bioinformatikos metodus, kad ištirtų patogenų biologiją, virulentiškumas, imuniteto vengimas, mikrobų ir mikrobų sąveika, taip pat šeimininko ir mikrobiomo sąveika. Moksliniuose tyrimuose daugiausia dėmesio skiriama įvairių bakterijų šeimininkų ir mikrobų tarpusavio santykiams, grybai, ir parazitai. Tarpdalykinė komanda dalyvaus GCID tyrime, įskaitant tarptautiniu mastu pripažintą Genomo mokslų instituto dėstytoją, Mikrobiologijos ir imunologijos departamentas ir UMSOM vakcinų kūrimo ir pasaulinės sveikatos centras (CVD) ir jų ilgamečiai bendradarbiai.

„GCID komanda per pastaruosius 15 metų buvo pirmaujanti taikydama genominius metodus, siekdama pagerinti mokslinį supratimą apie infekcinių ligų sukėlėjus, ir šis NIAID dotacijos atnaujinimas leis mums toliau taikyti genomikos metodus tiriant šeimininko, patogeno ir mikrobiomos sąveiką, “ - sakė daktaras Freizeris.

NIAID dotacija bus skirta mokslinių tyrimų programoms, kuriose daugiausia dėmesio skiriama trims sritims. Viena tyrimų sritis apima kelių bakterijų tarpusavio sąveikos, taip pat šeimininko ir susijusio mikrobiomo, tyrimą, kuriam vadovauja dr. Rasko, Daktaras Freizeris, ir Herve S. G. Tettelinas, Daktaras, Mikrobiologijos ir imunologijos docentas ir IGS mokslininkas. Antroji sritis apima grybelinių patogenų, sąveikaujančių su šeimininku, genomo ir transkriptominės analizės tyrimus, kuriam vadovaus Vincentas M. Bruno, Daktaras, Mikrobiologijos ir imunologijos docentas ir IGS mokslininkas. Trečioji tyrimų sritis apima integruotą parazitinių tropinių ligų genomikos tyrimų projektą, kuriam vadovaus Julie C. Dunning Hotopp, Daktaras, Mikrobiologijos ir imunologijos docentas ir IGS mokslininkas, Davidas Serre, Daktaras, Mikrobiologijos ir imunologijos docentas ir IGS mokslininkas; ir Joana C. Silva, Daktaras, Mikrobiologijos ir imunologijos docentas ir IGS mokslininkas

„Ši dotacija leidžia mums integruoti daugelio ligų sukėlėjų tyrimą į modelines sistemas ir į žmogaus mėginius taip, kad labiau atspindėtų natūralius infekcijos procesus, kuri suteiks daugiau supratimo ir išsamesnio supratimo apie šią sąveiką, “ - sakė daktaras Rasko.

Centras taip pat palaiko technologijų branduolį, duomenų valdymo branduolys ir administracinis branduolys. Projektai apima visą genomą ir tikslinę genomo seką, transkripto profiliavimas pagal RNR-seq, rRNR bendruomenės profiliavimas, metagenomika ir metatranskriptominė seka, daugiausia dėmesio skiriant mikrobų sąveikai tarpusavyje, šeimininkas ir rezidento mikrobiomas. Sekos bus atliekamos naudojant kelias platformas, įskaitant „Illumina MiSeq“ ir „HiSeq“, „Oxford Nanopore Technology“ ir „Pacific Biosciences“ sistemos.

„Genomikos integravimas į diagnostinę ir klinikinę mediciną pagerino mūsų biologinį supratimą apie ligas ir sveikatą, “ - sako E. Albertas Reece'as, MD, Daktaras, MBA, Merilendo universiteto medicinos reikalų viceprezidentas, ir Johnas Z. ir Akiko K. Bowersas, Merilando universiteto medicinos mokyklos profesorius ir dekanas. „Ši NIAID dotacija paskatins naują bendradarbiavimą tarp disciplinų medicinos mokyklos klinikiniuose ir tyrimų centruose, taip pat su tarptautinėmis infekcinių ligų bendruomenėmis “.

Be mokslinių tyrimų projektų, IGS kurs seminarus ir tęs švietimo iniciatyvas, siekdama išplėsti supratimą, kaip taikyti genomiką svarbiausiems mokslinių tyrimų klausimams, darantiems įtaką pasaulio sveikatai.

IGS anksčiau yra gavusi dotacijas, kaip Genomų infekcinių ligų centras (GCID), NIAID finansuojamą penkerių metų dotaciją (2014–2019 m.); infekcinių ligų genomo sekos nustatymo centras (GSCID); NIAID finansuojama penkerių metų sutartis (2009–2014 m.), ir pagrindiniai tyrėjai taip pat atliko pagrindinius tyrėjų vaidmenis NIAID finansuojamame mikrobų sekos centre (MSC), penkerių metų sutartis (2004-2009 m.). Ši U19 dotacija numeriu U19 AI110820 bus teikiama penkerius metus iki 2024 m. atstovaujanti dvidešimties metų pažangiausiems genomo mokslų tyrimams.

• Tyrimas lygina motinos pieno vartojimą su mišiniu vaikams, kuriems persodinta kaulų čiulpų
• Tyrimas suteikia naujos vilties pacientams, sergantiems dekompensuota ciroze