Hovedundersøger og administrativ kernedirektør for tilskuddet, som har titlen "A Genomics Based Investigation of the Determinants of Polymicrobial Infectious Disease Outcomes, "er David Rasko, Ph.d., Professor i mikrobiologi og immunologi og videnskabsmand ved IGS. Teamforskere vil omfatte:Claire M. Fraser, Ph.d., dekanens begavede professor i medicin, Mikrobiologi og immunologi, og direktør for IGS, og Owen R. White, Ph.d., Professor i epidemiologi og folkesundhed, Direktør for bioinformatik og associeret direktør for IGS.,
GCID bruger store genomiske og bioinformatiske metoder til at undersøge patogenbiologi, virulens, immununddragelse, mikrobe-mikrobe-interaktioner samt vært-mikrobiom-interaktioner. Videnskabelige forskningsprojekter fokuserer på vært/mikrobe -indbyrdes forbindelser mellem forskellige bakterier, svampe, og parasitter. Det tværfaglige team vil deltage i GCID -forskningen, herunder internationalt anerkendt fakultet fra Institute for Genome Sciences, instituttet for mikrobiologi og immunologi og UMSOM Center for Vaccine Development and Global Health (CVD) og deres mangeårige samarbejdspartnere.
"GCID -teamet har været i spidsen for at anvende genomiske teknikker til at fremme videnskabelig forståelse af smitsomme sygdomsagenter i de sidste 15 år, og denne fornyelse af NIAID-tilskud vil give os mulighed for yderligere at implementere genomiske metoder i undersøgelsen af vært-patogen-mikrobiom-interaktioner, "sagde Dr. Fraser.
NIAID -tilskuddet støtter forskningsprogrammer, der fokuserer på tre områder. Et forskningsområde involverer at studere interaktionen mellem flere bakterier med hinanden samt værten og tilhørende mikrobiom, som ledes af Dr. Rasko, Dr. Fraser, og Herve S.G. Tettelin, Ph.d., Lektor i mikrobiologi og immunologi og videnskabsmand ved IGS .. Det andet område omfatter forskning i den genomiske og transkriptomiske analyse af svampepatogener, der interagerer med værten, som ledes af Vincent M. Bruno, Ph.d., Lektor i mikrobiologi og immunologi og videnskabsmand ved IGS. Det tredje forskningsområde omfatter et integreret genomisk forskningsprojekt om parasitiske tropiske sygdomme, der vil blive ledet af Julie C. Dunning Hotopp, Ph.d., Lektor i mikrobiologi og immunologi og videnskabsmand ved IGS, David Serre, Ph.d., Lektor i mikrobiologi og immunologi og videnskabsmand ved IGS; og Joana C. Silva, Ph.d., Lektor i mikrobiologi og immunologi og videnskabsmand ved IGS
"Dette tilskud giver os mulighed for at integrere undersøgelsen af flere patogener i modelsystemer og med menneskelige prøver på en måde, der er mere repræsentativ for naturlige infektionsprocesser, som vil give større forståelse og mere dybtgående indsigt i disse interaktioner, sagde Dr. Rasko.
Centret understøtter også en teknologikerne, en datastyringskerne og en administrativ kerne. Projekterne omfatter hele genomet og målrettet genomsekvensering, transkriptomprofilering af RNA-seq, rRNA -fællesskabsprofilering, og metagenomics og metatranscriptomic sekventering med fokus på mikrobernes interaktioner med hinanden, værten og det residente mikrobiom. Sekventeringen udføres ved hjælp af flere platforme, herunder Illumina MiSeq og HiSeq, Oxford Nanopore Technology og Pacific Biosciences -systemer.
"Integrering af genomik med diagnostisk og klinisk medicin har avanceret vores biologiske forståelse af sygdomme og sundhed, "siger E. Albert Reece, MD, Ph.d., MBA, Vice President for Medical Affairs ved University of Maryland, og John Z. og Akiko K. Bowers Fremstående professor og dekan ved University of Maryland School of Medicine. "Dette NIAID -tilskud vil fremme nye samarbejder på tværs af discipliner inden for kliniske og forskningscentre på School of Medicine, såvel som med internationale infektionssygdomme. "
Ud over forskningsprojekterne, IGS vil etablere workshops og fortsætte uddannelsesinitiativer for at udvide forståelsen for, hvordan man anvender genomik til forskningsspørgsmål med høj prioritet, der påvirker global sundhed.
IGS har tidligere modtaget tilskud som Genome Center for Infectious Diseases (GCID) et NIAID-finansieret femårigt tilskud (2014-2019); et genom -sekventeringscenter for infektionssygdomme (GSCID); en NIAID-finansieret femårig kontrakt (2009-2014), og de ledende efterforskere har også haft hovedundersøgelsesroller med det NIAID-finansierede mikrobielle sekventeringscenter (MSC), en femårig kontrakt (2004-2009). Denne U19 -bevilling med nummer U19 AI110820 løber i fem år frem til 2024, repræsenterer tyve års banebrydende forskning inden for genomisk videnskab.
Penis mikrobiom er reservoir for bakterielle vaginose-associerede bakterier
Brug af FLUOstar Omega til at studere nye tarmbakterier, der kan påvirke vores helbred
Forskere udvikler en tilgang til at vaccinere mod tarmbetændelse
Perfectus Biomed udstiller på IPS -konference i Liverpool
Diagnose af virusinfektioner ved hjælp af mikro- og nanoskala -teknologier
Transplantation af vaginal væske kan hjælpe med at behandle tilbagevendende bakteriel vaginose
Hvad kan gammel afføring fortælle os om udviklingen af det menneskelige tarmmikrobiom?
Gamle mikrobiota -oplysninger repræsenterer en vital ressource til at studere bakteriel udvikling og udforske den biologiske spredning af kroniske sygdomme gennem historien. Et internationalt team a
Undersøgelse beskriver den oprindelige baseline sunde tarmmikrobiomdatabase og overflodsprofil
En indledende baseline sund tarmmikrobiomdatabase og overflodsprofil er beskrevet i en undersøgelse offentliggjort den 11. september, 2019 i open-access journal PLOS ONE af Charles Hadley King fra Geo
Forskere identificerer en bakterie med anti-SARS-CoV-2-aktivitet in vitro:Dolosigranulum pigrum
Det alvorlige akutte respiratoriske syndrom coronavirus 2 (SARS-CoV-2) har smittet over 173,3 millioner mennesker verden over. Af disse, et betydeligt mindretal har været alvorlige eller kritiske, hvi