Inštitut za genomske znanosti UMSOM prejme 17,5 milijona dolarjev nepovratnih sredstev za raziskave nalezljivih bolezni

Inštitut za genomske znanosti (IGS) na Medicinski fakulteti Univerze v Marylandu (UMSOM) je od Nacionalnega inštituta za alergije in nalezljive bolezni (NIAID) prejel 17,5 milijona dolarjev za financiranje Genomskega centra IGS za nalezljive bolezni (GCID) za nadaljnjih pet leta.

Glavni raziskovalec in glavni upravni direktor za nepovratna sredstva, z naslovom "Genomsko zasnovana raziskava determinant izidov polimikrobnih nalezljivih bolezni," "je David Rasko, Doktor znanosti, Profesor mikrobiologije in imunologije ter znanstvenik na IGS. Raziskovalci ekipe bodo vključevali:Claire M. Fraser, Doktor znanosti, dekanov obdarjeni profesor medicine, Mikrobiologija in imunologija, in direktor IGS, in Owen R. White, Doktor znanosti, Profesor epidemiologije in javnega zdravja, Direktor bioinformatike in pridruženi direktor IGS.,

GCID uporablja obsežne genomske in bioinformatične pristope za raziskovanje biologije patogenov, virulenca, izogibanje imunosti, interakcije mikrob-mikrob in interakcije gostitelj-mikrobiom. Znanstvenoraziskovalni projekti se osredotočajo na medsebojne odnose različnih gostiteljev/mikrobov, glive, in paraziti. Interdisciplinarna ekipa bo sodelovala pri raziskavi GCID, vključno z mednarodno priznano fakulteto Inštituta za genomske znanosti, Oddelek za mikrobiologijo in imunologijo ter Center za razvoj cepiv in globalno zdravje (CVD) UMSOM ter njihovi dolgoletni sodelavci.

"Ekipa GCID je zadnjih 15 let v ospredju uporabe genomskih tehnik za napredovanje znanstvenega razumevanja povzročiteljev nalezljivih bolezni, in ta obnova štipendije NIAID nam bo omogočila nadaljnjo uporabo genomskih pristopov pri preučevanju interakcij gostitelja-patogena-mikrobioma, "je dejal dr. Fraser.

Nepovratna sredstva NIAID bodo podpirala raziskovalne programe, ki se osredotočajo na tri področja. Eno raziskovalno področje vključuje preučevanje medsebojnega delovanja več bakterij, pa tudi gostitelja in z njim povezanega mikrobioma, ki ga vodi dr. Rasko, Dr. Fraser, in Herve S.G. Tettelin, Doktor znanosti, Izredni profesor za mikrobiologijo in imunologijo ter znanstvenik na IGS. Drugo področje vključuje raziskave genomske in transkriptomske analize glivičnih patogenov, ki sodelujejo z gostiteljem, ki ga bo vodil Vincent M. Bruno, Doktor znanosti, Izredni profesor za mikrobiologijo in imunologijo ter znanstvenik na IGS. Tretje področje raziskav vključuje celosten raziskovalni projekt genomike pri parazitskih tropskih boleznih, ki ga bo vodila Julie C. Dunning Hotopp, Doktor znanosti, Izredni profesor za mikrobiologijo in imunologijo ter znanstvenik na IGS, David Serre, Doktor znanosti, Izredni profesor za mikrobiologijo in imunologijo ter znanstvenik na IGS; in Joana C. Silva, Doktor znanosti, Izredni profesor za mikrobiologijo in imunologijo ter znanstvenik na IGS

"Ta štipendija nam omogoča vključitev študije več patogenov v modelne sisteme in vzorce ljudi na način, ki je bolj reprezentativen za naravne procese okužbe, ki bodo zagotovili večje razumevanje in poglobljen vpogled v te interakcije, "je dejal dr. Raško.

Center podpira tudi tehnološko jedro, jedro za upravljanje podatkov in administrativno jedro. Projekti vključujejo celoten genom in ciljno zaporedje genoma, profiliranje transkriptomov z RNA-seq, profiliranje skupnosti rRNA, in metagenomika in metatranskriptomsko zaporedje s poudarkom na medsebojnem delovanju mikrobov, gostitelja in rezidenčnega mikrobioma. Zaporedje bo izvedeno na več platformah, vključno z Illumina MiSeq in HiSeq, Oxford Nanopore Technology in sistemi Pacific Biosciences.

"Integracija genomike z diagnostično in klinično medicino je izboljšala naše biološko razumevanje bolezni in zdravja, "pravi E. Albert Reece, MD, Doktor znanosti, MBA, Podpredsednik za medicinske zadeve na Univerzi v Marylandu, in John Z. in Akiko K. Bowers ugledni profesor in dekan Medicinske fakultete Univerze v Marylandu. "Ta štipendija NIAID bo spodbujala nova sodelovanja v različnih disciplinah v kliničnih in raziskovalnih centrih na Medicinski fakulteti, pa tudi z mednarodnimi skupnostmi nalezljivih bolezni. "

Poleg raziskovalnih projektov, IGS bo vzpostavil delavnice in nadaljeval izobraževalne pobude za razširitev razumevanja, kako uporabiti genomiko pri prednostnih raziskovalnih vprašanjih, ki vplivajo na svetovno zdravje.

IGS je prej prejel štipendije kot Genomski center za nalezljive bolezni (GCID), petletno donacijo, ki jo financira NIAID (2014–2019); Center za sekvenciranje genoma za nalezljive bolezni (GSCID); petletno pogodbo, ki jo financira NIAID (2009–2014), in vodilni preiskovalci so imeli tudi vlogo glavnega raziskovalca pri Centru za sekvenciranje mikrobov, ki ga financira NIAID (MSC), petletno pogodbo (2004-2009). Ta nepovratna sredstva U19 s številko U19 AI110820 bodo veljala pet let do leta 2024, predstavlja dvajset let vrhunskih raziskav v genomskih vedah.

• Študija primerja uporabo materinega mleka s formulo pri otrocih, ki so jim presadili kostni mozeg
• Študija ponuja novo upanje za bolnike z dekompenzirano cirozo