De hoofdonderzoeker en de administratieve kerndirecteur voor de subsidie, met de titel "A Genomics Based Investigation of the Determinants of Polymicrobial Infectious Disease Outcomes, " is David Rasko, doctoraat, Hoogleraar Microbiologie en Immunologie en Wetenschapper bij IGS. Teamonderzoekers zijn onder meer:Claire M. Fraser, doctoraat, de bijzonder hoogleraar geneeskunde van de decaan, Microbiologie en Immunologie, en directeur van IGS, en Owen R. White, doctoraat, Hoogleraar Epidemiologie en Volksgezondheid, Directeur van Bioinformatica en Associate Director van IGS.,
De GCID gebruikt grootschalige genomica- en bioinformatica-benaderingen om de biologie van pathogenen te onderzoeken, virulentie, immuun ontduiking, microbe-microbe interacties evenals gastheer-microbioom interacties. Wetenschappelijke onderzoeksprojecten richten zich op gastheer/microbe-interrelaties van diverse bacteriën, schimmels, en parasieten. Het interdisciplinaire team zal deelnemen aan het GCID-onderzoek, inclusief internationaal erkende faculteit van het Institute for Genome Sciences, de afdeling Microbiologie en Immunologie en het UMSOM Centre for Vaccine Development and Global Health (CVD) en hun jarenlange medewerkers.
"Het GCID-team heeft de afgelopen 15 jaar een voortrekkersrol gespeeld bij het toepassen van genomische technieken om het wetenschappelijke begrip van infectieziekteverwekkers te vergroten, en deze verlenging van de NIAID-subsidie zal ons in staat stellen om genomics-benaderingen verder in te zetten in de studie van gastheer-pathogeen-microbioom-interacties, "zei Dr. Fraser.
De NIAID-subsidie ondersteunt onderzoeksprogramma's die zich op drie gebieden richten. Eén onderzoeksgebied omvat het bestuderen van de interacties van meerdere bacteriën met elkaar, evenals met de gastheer en het bijbehorende microbioom, die wordt geleid door Dr. Rasko, Dr. Fraser, en Herve S.G. Tettelin, doctoraat, Universitair hoofddocent microbiologie en immunologie en wetenschapper bij IGS. Het tweede gebied omvat onderzoek naar de genomische en transcriptomische analyse van schimmelpathogenen die in wisselwerking staan met de gastheer, die zal worden geleid door Vincent M. Bruno, doctoraat, Universitair hoofddocent microbiologie en immunologie en wetenschapper bij IGS. Het derde onderzoeksgebied omvat een geïntegreerd genomics-onderzoeksproject in parasitaire tropische ziekten dat zal worden geleid door Julie C. Dunning Hotopp, doctoraat, Universitair hoofddocent microbiologie en immunologie en wetenschapper bij IGS, David Serre, doctoraat, Universitair hoofddocent microbiologie en immunologie en wetenschapper bij IGS; en Joana C. Silva, doctoraat, Universitair hoofddocent microbiologie en immunologie en wetenschapper bij IGS
"Deze subsidie stelt ons in staat om de studie van meerdere pathogenen in modelsystemen en met menselijke monsters te integreren op een manier die meer representatief is voor natuurlijke infectieprocessen, die een beter begrip en meer diepgaand inzicht in deze interacties zullen opleveren, " zei dr. Rasko.
Het centrum ondersteunt ook een Technology Core, een Data Management Core en een Administratieve Core. De projecten omvatten het hele genoom en gerichte genoomsequencing, transcriptoomprofilering door RNA-seq, rRNA-gemeenschapsprofilering, en metagenomica en metatranscriptomische sequencing met een focus op de interacties van microben met elkaar, de gastheer en het residente microbioom. De sequencing zal worden uitgevoerd met behulp van meerdere platforms, inclusief de Illumina MiSeq en HiSeq, Oxford Nanopore Technology en de Pacific Biosciences-systemen.
"De integratie van genomica met diagnostische en klinische geneeskunde heeft ons biologische begrip van ziekten en gezondheid verbeterd, " zegt E. Albert Reece, MD, doctoraat, MBA, Vice President voor Medische Zaken aan de Universiteit van Maryland, en John Z. en Akiko K. Bowers Distinguished Professor en Dean van de University of Maryland School of Medicine. "Deze NIAID-beurs zal nieuwe samenwerkingen tussen disciplines binnen de klinische en onderzoekscentra van de School of Medicine bevorderen, evenals met internationale infectieziektegemeenschappen."
Naast de onderzoeksprojecten, IGS zal workshops opzetten en educatieve initiatieven voortzetten om het begrip uit te breiden over hoe genomics kan worden toegepast op onderzoeksvragen met hoge prioriteit die van invloed zijn op de wereldwijde gezondheid.
IGS heeft eerder subsidies ontvangen als een Genome Center for Infectious Diseases (GCID) een NIAID-gefinancierde vijfjarige subsidie (2014-2019); een centrum voor genoomsequencing voor infectieziekten (GSCID); een door het NIAID gefinancierd vijfjarig contract (2009-2014), en de hoofdonderzoekers hebben ook hoofdonderzoekersrollen gehad bij het door de NIAID gefinancierde Microbial Sequencing Center (MSC), een vijfjarig contract (2004-2009). Deze U19-beurs met nummer U19 AI110820 loopt vijf jaar tot 2024, staat voor twintig jaar baanbrekend onderzoek in genomische wetenschappen.
Langdurig gebruik van antibiotica bij prematuren bevordert resistente darmbacteriën
Darmbacterieprofiel kan darmschade voorspellen na radiotherapie
Prikkelbare darmziekte verhoogt het risico op dementie
Mensen met IBS-symptomen die waarschijnlijk een laag vitamine D-gehalte hebben,
Darmmicrobiota kan de ernst van COVID-19 voorspellen
Strategische voorbereiding van de pediatrische gezondheidszorg voor de tweede golf van de COVID-19-pandemie
Maagzuur begrijpen
Maagzuur, het brandende gevoel dat optreedt in de borst of de keel, is meestal een tijdelijk probleem - misschien heb je gekruid eten gegeten - maar voor sommige mensen, het kan chronisch zijn. Maagzu
Hoe massale screeningsinspanningen hebben geholpen bij het identificeren van meer gevallen van coeliakie bij kinderen
Uit een nieuw massascreeningprogramma van schoolgaande kinderen in Italië bleek dat de algemene prevalentie van coeliakie in de afgelopen 25 jaar bijna is verdubbeld. Coeliakie Infographi
Penismicrobioom is reservoir voor bacteriële vaginose-geassocieerde bacteriën
Onder de seksueel overdraagbare aandoeningen (soas), bacteriële vaginose treft meer dan 20 procent van de vrouwen over de hele wereld. De aandoening komt voort uit de proliferatie van bepaalde bacteri