Apurahan johtava tutkija ja hallinnollinen ydinjohtaja, jonka otsikko on "Genomics Based Investigation of the Determinants of Polymicrobial Infectious Disease Results, "on David Rasko, PhD, Mikrobiologian ja immunologian professori ja tutkija IGS:ssä. Ryhmän tutkijat ovat:Claire M.Fraser, PhD, dekaanin lääketieteen professori, Mikrobiologia ja immunologia, ja IGS:n johtaja, ja Owen R.White, PhD, Epidemiologian ja kansanterveyden professori, Bioinformatiikan johtaja ja IGS:n apulaisjohtaja,
GCID käyttää laajamittaisia genomiikan ja bioinformatiikan lähestymistapoja patogeenibiologian tutkimiseen, virulenssi, immuunipuolustus, mikrobi-mikrobi-vuorovaikutukset sekä isäntä-mikrobiomi-vuorovaikutukset. Tieteelliset tutkimushankkeet keskittyvät eri bakteerien isäntien ja mikrobien välisiin suhteisiin, sienet, ja loisia. Tieteidenvälinen tiimi osallistuu GCID -tutkimukseen, mukaan lukien kansainvälisesti tunnustettu tiedekunta Genomitieteiden instituutista, mikrobiologian ja immunologian osasto ja UMSOM-rokotekehitys- ja globaaliterveyskeskus (CVD) ja heidän pitkäaikaiset yhteistyökumppaninsa.
"GCID -tiimi on ollut eturintamassa soveltamalla genomitekniikoita tartuntatautien tieteellisen ymmärtämisen edistämiseksi viimeisten 15 vuoden aikana, ja tämä NIAID-apurahan uusiminen antaa meille mahdollisuuden käyttää edelleen genomiikan lähestymistapoja isäntä-patogeeni-mikrobiomi-vuorovaikutusten tutkimuksessa, "sanoi tohtori Fraser.
NIAID -apurahalla tuetaan tutkimusohjelmia, jotka keskittyvät kolmeen osa -alueeseen. Yksi tutkimusalue sisältää useiden bakteerien vuorovaikutuksen tutkimisen keskenään sekä isännän ja siihen liittyvän mikrobiomin, jota johtaa tohtori Rasko, Fraser, ja Herve S.G. Tettelin, PhD, Mikrobiologian ja immunologian apulaisprofessori ja tiedemies IGS:ssä. jota johtaa Vincent M.Bruno, PhD, Mikrobiologian ja immunologian apulaisprofessori ja tutkija IGS:ssä. Kolmas tutkimusalue sisältää integroidun genomiikan tutkimushankkeen parasiittisista trooppisista sairauksista, jota johtaa Julie C.Dunning Hotopp, PhD, Mikrobiologian ja immunologian apulaisprofessori ja tutkija IGS:ssä, David Serre, PhD, Mikrobiologian ja immunologian apulaisprofessori ja tutkija IGS:ssä; ja Joana C.Silva, PhD, Mikrobiologian ja immunologian apulaisprofessori ja tutkija IGS:ssä
"Tämän apurahan avulla voimme integroida useiden patogeenien tutkimuksen mallijärjestelmiin ja ihmisnäytteisiin tavalla, joka edustaa paremmin luonnollisia infektioprosesseja, joka antaa lisää ymmärrystä ja syvällisempää tietoa näistä vuorovaikutuksista, "sanoi tohtori Rasko.
Keskus tukee myös teknologiaydintä, tiedonhallintaydin ja hallinnollinen ydin. Hankkeet sisältävät koko genomin ja kohdennetun genomin sekvensoinnin, RNA-seq:n transkriptiprofilointi, rRNA -yhteisön profilointi, ja metagenomiikka ja metatranskriptinen sekvensointi, jossa keskitytään mikrobien vuorovaikutukseen toistensa kanssa, isäntä ja asukas mikrobiomi. Sekvensointi suoritetaan useilla alustoilla, mukaan lukien Illumina MiSeq ja HiSeq, Oxford Nanopore Technology ja Pacific Biosciences -järjestelmät.
"Genomiikan yhdistäminen diagnostiseen ja kliiniseen lääketieteeseen on parantanut biologista ymmärrystämme sairauksista ja terveydestä, "sanoo E. Albert Reece, MD, PhD, MBA, Marylandin yliopiston lääketieteen varapresidentti, ja John Z. ja Akiko K. Bowers, arvostettu professori ja dekaani Marylandin yliopiston lääketieteellisestä korkeakoulusta. "Tämä NIAID -apuraha edistää uutta yhteistyötä eri tieteenalojen välillä lääketieteellisen korkeakoulun kliinisissä ja tutkimuskeskuksissa, samoin kuin kansainvälisten tartuntatautien kanssa. "
Tutkimusprojektien lisäksi mm. IGS perustaa työpajoja ja jatkaa koulutusaloitteita laajentaakseen ymmärrystä siitä, miten genomiikkaa voidaan soveltaa tärkeisiin tutkimuskysymyksiin, jotka vaikuttavat maailmanlaajuiseen terveyteen.
IGS on aiemmin saanut apurahoja tartuntatautien genomikeskuksena (GCID) NIAID-rahoitteisena viisivuotisena apurahana (2014-2019); tartuntatautien genomin sekvensointikeskus (GSCID); NIAID-rahoitteinen viisivuotinen sopimus (2009-2014), ja johtavilla tutkijoilla on myös ollut päätutkijarooleja NIAID-rahoitteisen mikrobien sekvensointikeskuksen (MSC) kanssa, viiden vuoden sopimus (2004-2009). Tämä U19 -apuraha numerolla U19 AI110820 kestää viisi vuotta vuoteen 2024, edustaa kaksikymmentä vuotta huippututkimusta genomitieteissä.