Der Principal Investigator und Administrative Core Director für den Zuschuss, mit dem Titel "A Genomics Based Investigation of the Determinants of Polymicrobial Infectious Disease Outcomes, " ist David Rasko, Doktortitel, Professor für Mikrobiologie und Immunologie und Wissenschaftler am IGS. Zu den Ermittlern des Teams gehören:Claire M. Fraser, Doktortitel, der Stiftungsprofessor des Dekans für Medizin, Mikrobiologie und Immunologie, und Direktor der IGS, und Owen R. White, Doktortitel, Professor für Epidemiologie und öffentliche Gesundheit, Direktor für Bioinformatik und stellvertretender Direktor von IGS.,
Das GCID verwendet groß angelegte Genomik- und Bioinformatik-Ansätze zur Erforschung der Pathogenbiologie, Virulenz, Immunabwehr, Mikroben-Mikroben-Interaktionen sowie Wirt-Mikrobiom-Interaktionen. Wissenschaftliche Forschungsprojekte konzentrieren sich auf Wirt-Mikroben-Beziehungen verschiedener Bakterien, Pilze, und Parasiten. Das interdisziplinäre Team wird sich an der GCID-Forschung beteiligen, darunter international anerkannte Dozenten des Instituts für Genomwissenschaften, das Department of Microbiology and Immunology und das UMSOM Center for Vaccine Development and Global Health (CVD) und ihre langjährigen Mitarbeiter.
"Das GCID-Team war in den letzten 15 Jahren führend bei der Anwendung genomischer Techniken, um das wissenschaftliche Verständnis von Erregern von Infektionskrankheiten zu verbessern. und diese Verlängerung des NIAID-Stipendiums wird es uns ermöglichen, genomische Ansätze bei der Untersuchung von Wirt-Pathogen-Mikrobiom-Interaktionen weiter einzusetzen. " sagte Dr. Fraser.
Mit dem NIAID-Stipendium werden Forschungsprogramme unterstützt, die sich auf drei Bereiche konzentrieren. Ein Forschungsbereich umfasst die Untersuchung der Wechselwirkungen mehrerer Bakterien untereinander sowie mit dem Wirt und dem dazugehörigen Mikrobiom, die von Dr. Rasko geleitet wird, Dr. Fraser, und Herve S. G. Tettelin, Doktortitel, Associate Professor für Mikrobiologie und Immunologie und Wissenschaftler am IGS. Der zweite Bereich umfasst die Erforschung der genomischen und transkriptomischen Analyse von Pilzpathogenen, die mit dem Wirt interagieren, die von Vincent M. Bruno geleitet wird, Doktortitel, Assoziierter Professor für Mikrobiologie und Immunologie und Wissenschaftler am IGS. Der dritte Forschungsbereich umfasst ein integriertes Genomik-Forschungsprojekt zu parasitären Tropenkrankheiten, das von Julie C. Dunning Hotopp geleitet wird, Doktortitel, Assoziierter Professor für Mikrobiologie und Immunologie und Wissenschaftler am IGS, David Serre, Doktortitel, außerordentlicher Professor für Mikrobiologie und Immunologie und Wissenschaftler am IGS; und Joana C. Silva, Doktortitel, Assoziierter Professor für Mikrobiologie und Immunologie und Wissenschaftler am IGS
„Dieser Zuschuss ermöglicht es uns, die Untersuchung mehrerer Krankheitserreger in Modellsystemen und mit menschlichen Proben repräsentativer für natürliche Infektionsprozesse zu integrieren. die ein besseres Verständnis und tiefere Einblicke in diese Wechselwirkungen ermöglichen, " sagte Dr. Rasko.
Das Zentrum unterstützt auch einen Technologiekern, einen Datenverwaltungskern und einen Verwaltungskern. Die Projekte umfassen Whole Genome und Targeted Genom Sequencing, Transkriptom-Profiling durch RNA-Seq, rRNA-Community-Profiling, und Metagenomik und metatranskriptomische Sequenzierung mit Fokus auf die Interaktionen von Mikroben untereinander, der Wirt und das residente Mikrobiom. Die Sequenzierung wird auf mehreren Plattformen durchgeführt, einschließlich Illumina MiSeq und HiSeq, Oxford Nanopore Technology und die Pacific Biosciences-Systeme.
"Die Integration der Genomik in die diagnostische und klinische Medizin hat unser biologisches Verständnis von Krankheiten und Gesundheit verbessert. " sagt E. Albert Reece, MD, Doktortitel, MBA, Vizepräsident für medizinische Angelegenheiten der University of Maryland, und John Z. und Akiko K. Bowers Distinguished Professor und Dekan der University of Maryland School of Medicine. „Dieses NIAID-Stipendium wird neue fachübergreifende Kooperationen innerhalb der klinischen und Forschungszentren der School of Medicine fördern. sowie mit internationalen Gemeinschaften von Infektionskrankheiten."
Neben den Forschungsprojekten IGS wird Workshops einrichten und Bildungsinitiativen fortsetzen, um das Verständnis für die Anwendung der Genomik auf hochrangige Forschungsfragen mit Auswirkungen auf die globale Gesundheit zu erweitern.
IGS hat zuvor Stipendien als Genome Center for Infectious Diseases (GCID) und ein NIAID-finanziertes Fünfjahresstipendium (2014-2019) erhalten; ein Genomsequenzierungszentrum für Infektionskrankheiten (GSCID); ein NIAID-finanzierter Fünfjahresvertrag (2009-2014), und die leitenden Forscher hatten auch die Rolle des Principal Investigators beim NIAID-finanzierten Microbial Sequencing Center (MSC), einen Fünfjahresvertrag (2004-2009). Dieses U19-Stipendium mit der Nummer U19 AI110820 läuft fünf Jahre bis 2024, steht für zwanzig Jahre Spitzenforschung in den Genomwissenschaften.
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