Главный исследователь и главный административный директор по гранту, который называется «Исследование детерминант исходов полимикробных инфекционных заболеваний на основе геномики», "- Давид Раско, Кандидат наук, Профессор микробиологии и иммунологии и научный сотрудник IGS. В состав следователей группы войдут:Клэр М. Фрейзер, Кандидат наук, профессор медицины декана, Микробиология и иммунология, и директор IGS, и Оуэн Р. Уайт, Кандидат наук, Профессор эпидемиологии и общественного здравоохранения, Директор по биоинформатике и заместитель директора IGS.,
GCID использует крупномасштабные подходы к геномике и биоинформатике для исследования биологии патогенов, вирулентность иммунное уклонение, микробно-микробные взаимодействия, а также взаимодействия хозяин-микробиом. Научно-исследовательские проекты сосредоточены на взаимоотношениях хозяев и микробов различных бактерий, грибы и паразиты. Междисциплинарная команда примет участие в исследовании GCID, включая международно признанные преподаватели Института геномных наук, Департамент микробиологии и иммунологии и Центр разработки вакцин и глобального здравоохранения (ССЗ) UMSOM и их давние сотрудники.
"Команда GCID была в авангарде применения геномных методов для улучшения научного понимания возбудителей инфекционных заболеваний в течение последних 15 лет, и это продление гранта NIAID позволит нам и дальше применять подходы геномики к изучению взаимодействий хозяин-патоген-микробиом, "сказал доктор Фрейзер.
Грант NIAID будет поддерживать исследовательские программы по трем направлениям. Одна область исследований включает изучение взаимодействия нескольких бактерий друг с другом, а также с хозяином и связанным с ним микробиомом. который возглавляет д-р Расько, Доктор Фрейзер, и Эрве С.Г. Теттелин, Кандидат наук, Доцент микробиологии и иммунологии и научный сотрудник IGS. Вторая область включает исследования геномного и транскриптомного анализа грибковых патогенов, взаимодействующих с хозяином, который возглавит Винсент М. Бруно, Кандидат наук, Доцент микробиологии и иммунологии и научный сотрудник IGS. Третье направление исследований включает комплексный проект исследования геномики паразитарных тропических болезней, который будет возглавлять Джули С. Даннинг Хотопп, Кандидат наук, Доцент микробиологии и иммунологии и научный сотрудник IGS, Дэвид Серр, Кандидат наук, Доцент микробиологии и иммунологии и научный сотрудник IGS; и Джоана С. Силва, Кандидат наук, Доцент микробиологии и иммунологии и научный сотрудник IGS
«Этот грант позволяет нам интегрировать изучение множества патогенов в модельных системах и с образцами людей таким образом, чтобы это было более репрезентативно для естественных инфекционных процессов, что обеспечит лучшее понимание и более глубокое понимание этих взаимодействий, "сказал доктор Раско.
Центр также поддерживает технологическое ядро, ядро управления данными и административное ядро. Проекты включают полногеномное и целевое секвенирование генома, профилирование транскриптома с помощью RNA-seq, профилирование сообщества рРНК, и метагеномика и метатранскриптомное секвенирование с акцентом на взаимодействия микробов друг с другом, хозяин и резидентный микробиом. Секвенирование будет выполняться с использованием нескольких платформ, включая Illumina MiSeq и HiSeq, Oxford Nanopore Technology и системы Pacific Biosciences.
"Интеграция геномики с диагностической и клинической медициной продвинула наше биологическое понимание болезней и здоровья, "говорит Э. Альберт Рис, Доктор медицины, Кандидат наук, MBA, Вице-президент по медицинским вопросам Университета Мэриленда, а также Джон З. и Акико К. Бауэрс, заслуженный профессор и декан медицинского факультета Университета Мэриленда. «Этот грант NIAID будет способствовать новому сотрудничеству в различных дисциплинах в клинических и исследовательских центрах Медицинской школы, а также с международными сообществами инфекционистов ".
Помимо исследовательских проектов, IGS организует семинары и продолжит образовательные инициативы для расширения понимания того, как применять геномику для решения высокоприоритетных исследовательских вопросов, влияющих на глобальное здоровье.
IGS ранее получал гранты как Центр генома инфекционных заболеваний (GCID), пятилетний грант (2014-2019), финансируемый NIAID; Центр секвенирования генома для инфекционных заболеваний (GSCID); пятилетний контракт (2009-2014), финансируемый NIAID, ведущие исследователи также выполняли функции главных исследователей в Центре микробного секвенирования (MSC), финансируемом NIAID, пятилетний контракт (2004-2009). Этот грант U19 под номером U19 AI110820 будет действовать в течение пяти лет до 2024 года. представляет двадцать лет передовых исследований в области геномных наук.