Utnyttja kraften i toppmodern teknik och analys av "big data", forskare vid den nybildade Arizona COVID-19 Genomics Union (ACGU) vill bättre förstå hur detta virus kan utvecklas, hur det överförs, och hur det rör sig genom den allmänna befolkningen. Denna molekylära epidemiologiska metod kombinerar traditionella epidemiologiska metoder med evolutionär modellering baserad på högupplöst analys av virusets genom.
ACGU kommer att sekvensera prover från COVID-19-patienter för att analysera virusets genetiska koder, spåra dess olika stammar, visa varifrån varje prov kommer, där det kan ha överförts, och - möjligen - avslöja detaljer som kan ge kritisk information för diagnostik, antivirala läkemedelsmål, och vaccinutveckling.
Endast genom att använda genomisk sekvensering och avancerade analyser, kan vi börja förstå denna sjukdom på molekylär nivå, letar efter nycklar för att låsa upp dess mysterier. Vi har förmågan att sekvensera genomet för varje stam från varje patient - det är vad vi arbetar mot. "
Dr David Engelthaler, Meddirektör och docent i TGens division för patogener och mikrobiomer, infektionssjukdomsgrenen i Flagstaff känd som TGen North
Dr Engelthaler är Arizona tidigare statliga epidemiolog och statliga biodefense -koordinator. Han var tidigare med CDC, och har lett utredningar av lokala, nationella och internationella sjukdomsutbrott i över 25 år, från och med Arizona's hantavirusutbrott 1993-94. Han kommer att samordna den nya ACGU:s genomiska sekvensering av SARS-CoV-2-viruset, som orsakar covid-19-sjukdomen.
Unionens andra grundare är två av Arizona ledande forskare inom infektionssjukdomar:Dr. Paul Keim och Dr. Michael Worobey.
Dr Keim är en världsexpert inom patogener som pest och mjältbrand. Han arbetade med FBI för att knäcka fallet "miltbrandbokstäver" i kölvattnet av den 11 september. På NAU, han är Regents professor i biologi, har en stol i mikrobiologi, och är verkställande direktör för Pathogen and Microbiome Institute (PMI). Han är en framstående professor vid TGen, Meddirektör för TGen North, och kommer att fungera som direktör för ACGU.
"Genomsekvenser är idealiska för distribuerade vetenskapliga forskningsinsatser och Arizona Union kommer att förlita sig mycket på nationella och globala studier för att spåra sjukdomen. Ändå, det är kritiskt att regionala experter engagerar sig i denna process för att maximera fördelarna för medborgare i Arizona, sa Dr Keim.
Dr Worobey är chef för University of Arizona Department of Ecology and Evolutionary Biology, och är världsberömd för sitt arbete med virala pandemier. Med hjälp av genomisk epidemiologi, han har definitivt spårat ursprung och global spridning av hiv, och bestämde också varför 1918 års "spanska influensapandemi" dödade miljoner unga vuxna.
"Molekylär analys av virus ger avgörande ledtrådar om hur pandemier börjar och hur man bekämpar dem, "sade Dr Worobey." Vi kommer att dra nytta av Arizona rikedom av talang och infrastruktur i denna strävan. "
Arizona COVID-19 Genomics Union liknar andra grupper över hela världen, arbetar för att få fotfäste på detta nya coronavirus. Snabb delning av data och analys har varit, och fortsätter att vara, kritisk för vetenskaplig, medicinsk och folkhälsoförståelse för pandemin. Ironiskt, USA:s första epicentrum för COVID-19, Seattle, är också hem för NextStrain, internethemmet för genomspårning av detta och andra patogener.
Konsortiet av forskare i Arizona hoppas att deras regionala sekvensering kommer att ge Arizona vårdgivare och politiska beslutsfattare en fördel när det gäller att svara på denna pandemi.
Som NextStrain, ACGU kommer att offentliggöra sina resultat; öppet tillgängligt för epidemiologer och virologer världen över.
Läckande tarm och rymdflygning - mekanismen avslöjad
E. coli superbug sprider sig genom dålig toaletthygien,
Forskare utvecklar peptider som återställer balansen i tarmbakterier och vänder åderförkalkning
Rotavirus spelar roll i utvecklingen av typ 1 -diabetes
Genetiskt justerade tarmbakterier minskar risken för kolorektal cancer hos möss, finner studie
Studie avslöjar antivirala effekter av curcumin
Irritabel tarmsjukdom ökar risken för demens
Forskare har länge undersökt sambandet mellan tarmen och hjärnan. Nu, en ny studie visar att äldre vuxna med kronisk inflammation i matsmältningskanalen kan utveckla demens mer än sju år tidigare än d
Mjölksyrabakterier och tarmbakterier bidrar till hälsofördelar med råg,
studie visar Att äta råg har många hälsofördelar. En ny studie från universitetet i Östra Finland visar nu att både mjölksyrabakterier och tarmbakterier bidrar till hälsofördelarna med råg. Publicerad
Nytt verktyg registrerar och spårar tillväxt av mikrobiomer
Under de senaste åren har det mänskliga mikrobiomet har vunnit enorm popularitet på grund av dess roll i att forma sin hälsa. Det är viktigt för mänsklig utveckling, näring, och immunitet. Det är därf