Udnytte kraften i state-of-the-art teknologi og "big data" analyse, forskere ved den nydannede Arizona COVID-19 Genomics Union (ACGU) ønsker bedre at forstå, hvordan denne virus kan udvikle sig, hvordan det overføres, og hvordan det bevæger sig gennem den generelle befolkning. Denne molekylære epidemiologiske tilgang kombinerer traditionelle epidemiologiske metoder med evolutionær modellering baseret på analyse i høj opløsning af virusets genom.
ACGU vil sekvensere prøver fra COVID-19-patienter for at analysere virusets genetiske koder, spore dens forskellige stammer, vise, hvor hver prøve stammer fra, hvor det kan være blevet transmitteret, og - muligvis - afsløre detaljer, der kan give kritisk information til diagnostik, antivirale lægemiddelmål, og udvikling af vacciner.
Kun ved hjælp af genomisk sekventering og avancerede analyser, kan vi begynde fuldt ud at forstå denne sygdom på molekylært niveau, på udkig efter nøgler til at låse op for dets mysterier. Vi har evnen til at sekvensere genomet for hver stamme fra hver patient - det er det, vi arbejder hen imod. "
Dr. David Engelthaler, Meddirektør og lektor i TGens afdeling for patogener og mikrobiomer, den smitsomme sygdomsgren i Flagstaff kendt som TGen North
Dr. Engelthaler er Arizona's tidligere statsepidemiolog og statslige biologiske forsvarskoordinator. Han var tidligere hos CDC, og har ledet undersøgelser af lokale, nationale og internationale sygdomsudbrud i over 25 år, begyndende med Arizona's hantavirusudbrud 1993-94. Han vil koordinere den nye ACGU's genomiske sekventering af SARS-CoV-2-virussen, som forårsager COVID-19 sygdommen.
Unionens andre medstiftere er to af Arizona's førende forskere inden for infektionssygdomme:Dr. Paul Keim og Dr. Michael Worobey.
Dr. Keim er en verdensekspert i patogener som pest og miltbrand. Han arbejdede sammen med FBI for at knække sagen "miltbrand" i kølvandet på 11. september. På NAU, han er professor i biologi i regenter, har en stol i mikrobiologi, og er administrerende direktør for Pathogen and Microbiome Institute (PMI). Han er en fremtrædende professor ved TGen, Meddirektør for TGen North, og vil fungere som direktør for ACGU.
"Genom -sekvenser er ideelle til distribueret videnskabelig forskningsindsats, og Arizona Union vil i høj grad stole på nationale og globale undersøgelser for at spore sygdommen. Ikke desto mindre, det er kritisk, at regionale eksperter deltager i denne proces for at maksimere fordelene for borgere i Arizona, "sagde Dr. Keim.
Dr.Worobey er leder af University of Arizona Department of Ecology and Evolutionary Biology, og er verdenskendt for sit arbejde med virale pandemier. Ved hjælp af genomisk epidemiologi, han har endeligt sporet oprindelsen og verdensomspændende spredning af hiv, og fastslog også, hvorfor "spansk influenza" -pandemien fra 1918 dræbte millioner af unge voksne.
"Molekylær analyse af vira giver afgørende spor om, hvordan pandemier begynder, og hvordan man bekæmper dem, "sagde Dr. Worobey." Vi vil udnytte Arizona's rigdom af talent og infrastruktur i dette forsøg. "
Arizona COVID-19 Genomics Union ligner andre grupper over hele kloden, arbejder på at få fodfæste på denne nye coronavirus. Hurtig deling af data og analyse har været, og bliver ved med at være, kritisk for videnskabelig, medicinsk og folkesundhedsforståelse af pandemien. Ironisk, det første amerikanske epicenter for COVID-19, Seattle, er også hjemsted for NextStrain, internethjemmet til genomsporing af denne og andre patogener.
Konsortiet af forskere i Arizona håber, at deres regionale sekventering vil give Arizona sundhedsudbydere og politiske beslutningstagere en fordel i at reagere på denne pandemi.
Ligesom NextStrain, ACGU vil offentliggøre sine resultater; åbent tilgængelig for epidemiologer og virologer verden over.
Brug af FLUOstar Omega til at studere nye tarmbakterier, der kan påvirke vores helbred
Rapporterer etiketter på kommercielle kefirprodukter mikrobielle niveauer korrekt?
Metformin kan hjælpe utæt tarm
Mikrobiotamodulation og genetablering af eubiose kan hjælpe med at dæmme op for COVID-19-komplikationer
Forskning forbinder SARS-CoV-2 prævalens,
Forskning viser, hvordan tarmmikrober påvirker maveinfluenza
Tarmmikrobiom ændrer sig ved tilberedning af vegetabilske fødevarer,
siger ny undersøgelse Da forskere fra UC San Francisco og Harvard gik sammen om at finde ud af, hvordan tarmmikrobiomet påvirkes af madlavning, de fandt ud af, at der sker store ændringer hos menneske
Penis mikrobiom er reservoir for bakterielle vaginose-associerede bakterier
Blandt de seksuelt overførte infektioner (STIer), bakteriel vaginose påvirker mere end 20 procent af kvinderne over hele kloden. Tilstanden stammer fra spredning af visse bakterier i skeden. Tidlige
Fiskeslim kan være en potentiel kilde til antibiotika, finder undersøgelse
Med fremkomsten af multilægemiddelresistente bakterier og mangel på nye antibiotika, forskere har været på udkig efter nye molekyler, der kan bekæmpe disse patogener. Et team af forskere har nu iden