Аризонский союз геномиков COVID-19 изучит, как вирус может развиваться

Исследовательский институт трансляционной геномики (TGen), филиал "Города надежды", Институт патогенов и микробиома Университета Северной Аризоны, и кафедра экологии и эволюционной биологии Университета Аризоны создали союз, посвященный отслеживанию коронавируса COVID-19, об этом было объявлено сегодня.

Используя возможности новейших технологий и анализа "больших данных", исследователи из недавно созданного Союза геномиков COVID-19 в Аризоне (ACGU) хотят лучше понять, как этот вирус может развиваться, как он передается, и как он распространяется среди населения в целом. Этот молекулярно-эпидемиологический подход сочетает в себе традиционные методы эпидемиологии с эволюционным моделированием, основанным на анализе генома вируса с высоким разрешением.

ACGU будет секвенировать образцы от пациентов с COVID-19 для анализа генетических кодов вируса, отслеживать его различные штаммы, показать, откуда происходит каждый образец, где он мог быть передан, и - возможно - раскрыть детали, которые могут предоставить важную информацию для диагностики, мишени противовирусных препаратов, и разработка вакцины.

<цитата>

Только с помощью геномного секвенирования и расширенного анализа, можем ли мы начать полностью понимать эту болезнь на молекулярном уровне, ищет ключи, чтобы раскрыть его тайны. У нас есть возможность секвенировать геном каждого штамма от каждого пациента - это то, над чем мы работаем ».

Д-р Дэвид Энгельталер, Содиректор и доцент отдела патогенов и микробиома TGen, отделение инфекционных заболеваний в Флагстаффе, известное как TGen North

Доктор Энгельтхалер - бывший эпидемиолог штата Аризона и координатор биозащиты штата. Ранее он работал в CDC, и провел расследование местных, национальные и международные вспышки болезней более 25 лет, начиная со вспышки хантавируса в Аризоне в 1993-94 гг. Он будет координировать геномное секвенирование нового ACGU вируса SARS-CoV-2, который вызывает болезнь COVID-19.

Другими соучредителями Союза являются двое ведущих ученых-инфекционистов Аризоны:доктор Пол Кейм и доктор Майкл Воробей.

Доктор Кейм - мировой эксперт по таким патогенам, как чума и сибирская язва. Он работал с ФБР, чтобы раскрыть дело о «письмах сибирской язвы» после событий 11 сентября. В НАУ, он - регентский профессор биологии, заведует кафедрой микробиологии, и является исполнительным директором Института патогенов и микробиома (PMI). Он заслуженный профессор TGen, Со-директор TGen North, и будет исполнять обязанности директора ACGU.

«Последовательности генома идеально подходят для распределенных научных исследований, и Союз Аризоны будет во многом полагаться на национальные и глобальные исследования для отслеживания болезни. Тем не менее, крайне важно, чтобы региональные эксперты участвовали в этом процессе, чтобы максимизировать выгоды для граждан Аризоны, "сказал доктор Кейм.

Доктор Воробей - глава факультета экологии и эволюционной биологии Университета Аризоны. и всемирно известен своей работой по вирусным пандемиям. Используя геномную эпидемиологию, он окончательно проследил происхождение и распространение ВИЧ по всему миру, а также определило, почему пандемия «испанского гриппа» 1918 года унесла жизни миллионов молодых людей.

"Молекулярный анализ вирусов дает важные сведения о том, как возникают пандемии и как с ними бороться, - сказал доктор Вороби. - В этом деле мы будем использовать богатство талантов и инфраструктуру Аризоны ».

Союз геномиков Аризоны COVID-19 похож на другие группы по всему миру, работает над тем, чтобы закрепиться на этом новом коронавирусе. Быстрый обмен данными и анализ был, и продолжает быть, критично к научным, понимание пандемии в медицине и общественном здравоохранении. Как ни странно, первый эпицентр COVID-19 в США, Сиэтл, также является домом для NextStrain, Интернет-дом для отслеживания генома этого и других патогенов.

Консорциум ученых из Аризоны надеется, что их региональное секвенирование даст поставщикам медицинских услуг в Аризоне и лицам, определяющим государственную политику, преимущество в реагировании на эту пандемию.

Как NextStrain, ACGU опубликует свои выводы; открыто доступны эпидемиологам и вирусологам во всем мире.

• AGA публикует новое руководство по COVID-19 для гастроэнтерологов, лечащих пациентов с ВЗК
• Неправильная очистка клеток во время развития нервной системы может вызвать пожизненные поведенческие проб…