Iskorištavajući moć najsuvremenije tehnologije i analizu "velikih podataka", istraživači iz novoosnovane unije za genomiku COVID-19 u Arizoni (ACGU) žele bolje razumjeti kako se ovaj virus može razvijati, kako se prenosi, i kako se kreće kroz opću populaciju. Ovaj molekularni epidemiološki pristup kombinira tradicionalne epidemiološke metode s evolucijskim modeliranjem temeljenim na analizi genoma virusa visoke rezolucije.
ACGU će slijediti uzorke pacijenata s COVID-19 kako bi analizirao genetske kodove virusa, pratiti njegove različite sojeve, pokazati odakle svaki uzorak potječe, tamo gdje je možda prenesen, i - eventualno - otkriti detalje koji bi mogli pružiti kritične informacije za dijagnostiku, mete antivirusnih lijekova, i razvoj cjepiva.
Samo korištenjem genomskog sekvenciranja i naprednih analiza, možemo li u potpunosti razumjeti ovu bolest na molekularnoj razini, tražeći ključeve za otključavanje njegovih misterija. Imamo mogućnost sekvenciranja genoma svakog soja od svakog pacijenta - to je ono na čemu radimo. "
Dr. David Engelthaler, Ko-direktor i izvanredni profesor TGen-ovog odjela za patogene i mikrobiome, grana zaraznih bolesti u Flagstaffu poznata kao TGen North
Dr. Engelthaler je bivši državni epidemiolog u Arizoni i državni koordinator za biološku obranu. Prije je bio u CDC -u, i vodio je istrage o lokalnim, nacionalne i međunarodne epidemije bolesti više od 25 godina, počevši od izbijanja hantavirusa u Arizoni 1993.-94. On će koordinirati genomski niz novih ACGU virusa SARS-CoV-2, što uzrokuje bolest COVID-19.
Ostali suosnivači Unije dva su vodeća znanstvenika zaraznih bolesti u Arizoni:dr. Paul Keim i dr. Michael Worobey.
Dr. Keim je svjetski stručnjak za patogene poput kuge i antraksa. Radio je s FBI -om na rješavanju slučaja "slova antraksa" nakon 11. rujna. U NAU -u, on je regentski profesor biologije, drži obdarenu katedru iz mikrobiologije, i izvršni je direktor Instituta za patogene i mikrobiome (PMI). On je ugledni profesor na TGenu, Sudirektor TGen North, i obnašat će dužnost direktora ACGU -a.
"Genomski nizovi idealni su za raspodijeljene znanstvene istraživačke napore, a Arizona Union će se u velikoj mjeri oslanjati na nacionalne i globalne studije za praćenje bolesti. Ipak, od ključne je važnosti da se regionalni stručnjaci uključe u ovaj proces kako bi se povećale koristi za građane Arizone, “rekao je dr. Keim.
Dr. Worobey voditelj je Odjela za ekologiju i evolucijsku biologiju Sveučilišta Arizona, i svjetski je poznat po svom radu na virusnim pandemijama. Koristeći genomsku epidemiologiju, definitivno je pratio podrijetlo i širenje HIV -a u svijetu, te je također utvrdilo zašto je pandemija "španjolske gripe" 1918. ubila milijune odraslih osoba.
"Molekularna analiza virusa daje ključne naznake o tome kako pandemije počinju i kako se s njima boriti, "rekao je dr. Worobey." U ovom ćemo nastojanju iskoristiti bogatstvo talenta i infrastrukture Arizone. "
Genomska unija Arizone COVID-19 slična je drugim grupama širom svijeta, rade na uporištu na ovom novom koronavirusu. Brza razmjena podataka i analiza bila je i nastavlja biti, kritično za znanstveni rad, medicinsko i javno zdravstvo razumijevanje pandemije. Ironično, prvi američki epicentar COVID-19, Seattle, također je dom za NextStrain, internetski dom za praćenje genoma ovog i drugih patogena.
Konzorcij znanstvenika iz Arizone nada se da će njihov regionalni redoslijed dati pružateljima zdravstvene zaštite u Arizoni i kreatorima javnih politika prednost u odgovoru na ovu pandemiju.
Kao i NextStrain, ACGU će objaviti svoje nalaze; otvoreno dostupan epidemiolozima i virolozima diljem svijeta.