Nutzung der Leistungsfähigkeit modernster Technologie und "Big Data"-Analyse, Forscher der neu gegründeten Arizona COVID-19 Genomics Union (ACGU) möchten besser verstehen, wie sich dieses Virus entwickelt, wie es übertragen wird, und wie es sich durch die allgemeine Bevölkerung bewegt. Dieser molekularepidemiologische Ansatz kombiniert traditionelle epidemiologische Methoden mit evolutionären Modellen, die auf einer hochauflösenden Analyse des Virusgenoms basieren.
ACGU wird Proben von COVID-19-Patienten sequenzieren, um die genetischen Codes des Virus zu analysieren. verfolgen seine verschiedenen Stämme, zeigen, woher jede Probe stammt, wo es möglicherweise übermittelt wurde, und – möglicherweise – Details preisgeben, die kritische Informationen für die Diagnose liefern könnten, antivirale Wirkstoffziele, und Impfstoffentwicklung.
Nur durch den Einsatz von Genomsequenzierung und fortgeschrittenen Analysen, können wir beginnen, diese Krankheit auf molekularer Ebene vollständig zu verstehen, auf der Suche nach Schlüsseln, um seine Geheimnisse zu entschlüsseln. Wir haben die Möglichkeit, das Genom jedes Stamms von jedem Patienten zu sequenzieren – darauf arbeiten wir hin."
Dr. David Engelthaler, Co-Direktor und außerordentlicher Professor der Pathogen and Microbiom Division von TGen, die Abteilung für Infektionskrankheiten in Flagstaff, bekannt als TGen North
Dr. Engelthaler ist Arizonas ehemaliger State Epidemiologe und State Biodefense Coordinator. Er war früher bei der CDC, und leitete Untersuchungen von lokalen, nationale und internationale Krankheitsausbrüche seit über 25 Jahren, beginnend mit dem Hantavirus-Ausbruch 1993-94 in Arizona. Er wird die genomische Sequenzierung des SARS-CoV-2-Virus durch den neuen ACGU koordinieren. die die COVID-19-Krankheit verursacht.
Die anderen Mitbegründer der Union sind zwei der führenden Wissenschaftler für Infektionskrankheiten in Arizona:Dr. Paul Keim und Dr. Michael Worobey.
Dr. Keim ist ein weltweiter Experte für Krankheitserreger wie Pest und Milzbrand. Er arbeitete mit dem FBI zusammen, um den Fall der „Anthrax-Briefe“ nach dem 11. September zu knacken. Bei NAU, er ist Regents Professor für Biologie, Inhaber einer Stiftungsprofessur für Mikrobiologie, und ist Executive Director des Pathogen and Microbiome Institute (PMI). Er ist ein Distinguished Professor am TGen, Co-Direktor von TGen Nord, und wird als Direktor der ACGU fungieren.
„Genomsequenzen sind ideal für verteilte wissenschaftliche Forschungsbemühungen und die Arizona Union wird sich stark auf nationale und globale Studien verlassen, um die Krankheit zu verfolgen. Es ist wichtig, dass sich regionale Experten an diesem Prozess beteiligen, um den Nutzen für die Bürger von Arizona zu maximieren, " sagte Dr. Keim.
Dr. Worobey ist der Leiter des Department of Ecology and Evolutionary Biology der University of Arizona, und ist weltweit bekannt für seine Arbeit zu viralen Pandemien. Mit genomischer Epidemiologie, er hat die Ursprünge und die weltweite Verbreitung von HIV definitiv verfolgt, und stellte auch fest, warum die "Spanische Influenza"-Pandemie von 1918 Millionen junger Erwachsener tötete.
„Die molekulare Analyse von Viren liefert entscheidende Hinweise darauf, wie Pandemien beginnen und wie sie bekämpft werden können. " sagte Dr. Worobey. "Wir werden bei diesem Unterfangen von Arizonas Talentreichtum und Infrastruktur profitieren."
Die Arizona COVID-19 Genomics Union ist anderen Gruppen auf der ganzen Welt ähnlich. daran arbeiten, bei diesem neuen Coronavirus Fuß zu fassen. Der schnelle Austausch von Daten und Analysen wurde und ist weiterhin kritisch für wissenschaftliche, medizinisches und öffentliches Gesundheitsverständnis der Pandemie. Ironisch, das erste US-Epizentrum von COVID-19, Seattle, ist auch die Heimat von NextStrain, das Internet zu Hause für die Genomverfolgung dieses und anderer Krankheitserreger.
Das Konsortium von Wissenschaftlern aus Arizona hofft, dass ihre regionale Sequenzierung den Gesundheitsdienstleistern und politischen Entscheidungsträgern in Arizona einen Vorteil bei der Reaktion auf diese Pandemie verschafft.
Wie NextStrain, ACGU wird seine Ergebnisse veröffentlichen; Epidemiologen und Virologen weltweit offen zugänglich.
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