Aproveitando o poder da tecnologia de ponta e da análise de "big data", pesquisadores da recém-formada Arizona COVID-19 Genomics Union (ACGU) querem entender melhor como esse vírus pode estar evoluindo, como é transmitido, e como está se movendo pela população em geral. Esta abordagem epidemiológica molecular combina métodos tradicionais de epidemiologia com modelagem evolutiva baseada na análise de alta resolução do genoma do vírus.
ACGU irá sequenciar amostras de pacientes COVID-19 para analisar os códigos genéticos do vírus, rastrear suas diferentes linhagens, mostrar de onde cada amostra se origina, onde pode ter sido transmitido, e - possivelmente - revelar detalhes que podem fornecer informações críticas para diagnósticos, alvos de drogas antivirais, e desenvolvimento de vacinas.
Apenas usando sequenciamento genômico e análises avançadas, podemos começar a entender completamente esta doença a nível molecular, procurando por chaves para desvendar seus mistérios. Temos a capacidade de sequenciar o genoma de cada cepa de cada paciente - é para isso que estamos trabalhando. "
Dr. David Engelthaler, Co-Diretor e Professor Associado da Divisão de Patógenos e Microbiomas do TGen, o ramo de doenças infecciosas em Flagstaff conhecido como TGen North
Dr. Engelthaler é o ex-Epidemiologista Estadual e Coordenador Estadual de Biodefesa do Arizona. Ele estava anteriormente no CDC, e conduziu investigações de locais, surtos de doenças nacionais e internacionais por mais de 25 anos, começando com o surto de hantavírus do Arizona em 1993-94. Ele coordenará o novo sequenciamento genômico da ACGU do vírus SARS-CoV-2, que causa a doença COVID-19.
Os outros co-fundadores da Union são dois dos principais cientistas de doenças infecciosas do Arizona:Dr. Paul Keim e Dr. Michael Worobey.
O Dr. Keim é um especialista mundial em patógenos como a peste e o antraz. Ele trabalhou com o FBI para decifrar o caso das "cartas de antraz" após o 11 de setembro. Na NAU, ele é um professor regente de biologia, detém uma cadeira dotada em Microbiologia, e é Diretor Executivo do Pathogen and Microbiome Institute (PMI). Ele é um distinto professor da TGen, Co-Diretor da TGen North, e atuará como Diretor da ACGU.
“As sequências do genoma são ideais para esforços de pesquisa científica distribuídos e a União do Arizona dependerá fortemente de estudos nacionais e globais para rastrear a doença. é fundamental que os especialistas regionais se envolvam neste processo para maximizar os benefícios para os cidadãos do Arizona, "disse o Dr. Keim.
Dr. Worobey é o chefe do Departamento de Ecologia e Biologia Evolutiva da Universidade do Arizona, e é mundialmente conhecido por seu trabalho sobre pandemias virais. Usando epidemiologia genômica, ele rastreou definitivamente as origens e a disseminação mundial do HIV, e também determinou por que a pandemia de "gripe espanhola" de 1918 matou milhões de jovens adultos.
"A análise molecular de vírus fornece pistas cruciais sobre como as pandemias começam e como combatê-las, "disse o Dr. Worobey." Estaremos capitalizando a riqueza de talento e infraestrutura do Arizona neste empreendimento. "
A Arizona COVID-19 Genomics Union é semelhante a outros grupos em todo o mundo, trabalhando para ganhar uma posição sobre este novo coronavírus. O compartilhamento rápido de dados e análises tem sido, e continua a ser, crítico para o científico, compreensão médica e de saúde pública da pandemia. Ironicamente, o primeiro epicentro dos EUA de COVID-19, Seattle, também é o lar do NextStrain, a casa da Internet para rastreamento do genoma deste e de outros patógenos.
O consórcio de cientistas do Arizona espera que seu sequenciamento regional dê aos provedores de saúde do Arizona e aos formuladores de políticas públicas uma vantagem na resposta a esta pandemia.
Como NextStrain, A ACGU tornará suas descobertas públicas; disponível abertamente para epidemiologistas e virologistas em todo o mundo.
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