Aprovechando el poder de la tecnología de punta y el análisis de "macrodatos", Los investigadores de la recién formada Unión de Genómica COVID-19 de Arizona (ACGU) quieren comprender mejor cómo puede estar evolucionando este virus, cómo se transmite, y cómo se está moviendo entre la población en general. Este enfoque epidemiológico molecular combina métodos epidemiológicos tradicionales con modelos evolutivos basados en análisis de alta resolución del genoma del virus.
ACGU secuenciará muestras de pacientes con COVID-19 para analizar los códigos genéticos del virus, rastrear sus diferentes cepas, mostrar de dónde proviene cada muestra, donde pudo haber sido transmitido, y, posiblemente, revelar detalles que podrían proporcionar información crítica para el diagnóstico, objetivos de fármacos antivirales, y desarrollo de vacunas.
Solo mediante el uso de secuenciación genómica y análisis avanzados, ¿Podemos comenzar a comprender completamente esta enfermedad a nivel molecular, buscando claves para desvelar sus misterios. Tenemos la capacidad de secuenciar el genoma de cada cepa de cada paciente, para eso estamos trabajando ".
Dr. David Engelthaler, Codirector y profesor asociado de la División de Patógenos y Microbiomas de TGen, la rama de enfermedades infecciosas en Flagstaff conocida como TGen North
El Dr. Engelthaler es ex epidemiólogo estatal y coordinador estatal de biodefensa de Arizona. Anteriormente estuvo con el CDC, y ha dirigido investigaciones de locales, brotes de enfermedades nacionales e internacionales durante más de 25 años, comenzando con el brote de hantavirus de 1993-94 en Arizona. Coordinará la secuenciación genómica del nuevo ACGU del virus SARS-CoV-2, que causa la enfermedad COVID-19.
Los otros cofundadores de la Unión son dos de los principales científicos de enfermedades infecciosas de Arizona:el Dr. Paul Keim y el Dr. Michael Worobey.
El Dr. Keim es un experto mundial en patógenos como la peste y el ántrax. Trabajó con el FBI para resolver el caso de las "letras de ántrax" a raíz del 11 de septiembre. En NAU, es profesor de Biología Regents, tiene una cátedra de microbiología, y es Director Ejecutivo del Instituto de Patógenos y Microbiomas (PMI). Es profesor distinguido en TGen, Codirector de TGen North, y se desempeñará como Director de la ACGU.
"Las secuencias del genoma son ideales para los esfuerzos de investigación científica distribuida y la Unión de Arizona dependerá en gran medida de estudios nacionales y mundiales para rastrear la enfermedad. No obstante, Es fundamental que los expertos regionales participen en este proceso para maximizar los beneficios para los ciudadanos de Arizona, "dijo el Dr. Keim.
El Dr. Worobey es el director del Departamento de Ecología y Biología Evolutiva de la Universidad de Arizona, y es mundialmente conocido por su trabajo sobre pandemias virales. Usando epidemiología genómica, definitivamente ha rastreado los orígenes y la propagación mundial del VIH, y también determinó por qué la pandemia de "influenza española" de 1918 mató a millones de adultos jóvenes.
"El análisis molecular de los virus proporciona pistas cruciales sobre cómo comienzan las pandemias y cómo combatirlas, ", dijo el Dr. Worobey." Aprovecharemos la riqueza de talento e infraestructura de Arizona en este esfuerzo ".
La Unión de Genómica COVID-19 de Arizona es similar a otros grupos en todo el mundo, trabajando para afianzarnos en este nuevo coronavirus. El intercambio rápido de datos y análisis ha sido, y sigue siendo, crítico a científico, comprensión médica y de salud pública de la pandemia. Irónicamente, el primer epicentro estadounidense de COVID-19, Seattle, también es el hogar de NextStrain, el hogar de Internet para el seguimiento del genoma de este y otros patógenos.
El consorcio de científicos de Arizona espera que su secuencia regional les dé a los proveedores de atención médica de Arizona y a los encargados de formular políticas públicas una ventaja para responder a esta pandemia.
Como NextStrain, ACGU hará públicos sus hallazgos; abiertamente disponible para epidemiólogos y virólogos de todo el mundo.
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