Gebruikmakend van de kracht van state-of-the-art technologie en "big data"-analyse, onderzoekers van de nieuw gevormde Arizona COVID-19 Genomics Union (ACGU) willen beter begrijpen hoe dit virus zich kan ontwikkelen, hoe het wordt overgedragen, en hoe het zich door de algemene bevolking beweegt. Deze moleculaire epidemiologische benadering combineert traditionele epidemiologische methoden met evolutionaire modellering op basis van analyse met hoge resolutie van het genoom van het virus.
ACGU zal monsters van COVID-19-patiënten sequencen om de genetische codes van het virus te analyseren, de verschillende stammen volgen, laat zien waar elk monster vandaan komt, waar het kan zijn verzonden, en - mogelijk - details onthullen die kritieke informatie kunnen opleveren voor diagnostiek, antivirale medicijndoelen, en vaccinontwikkeling.
Alleen door gebruik te maken van genomische sequencing en geavanceerde analyses, kunnen we deze ziekte op moleculair niveau volledig gaan begrijpen, op zoek naar sleutels om zijn mysteries te ontrafelen. We hebben het vermogen om het genoom van elke stam van elke patiënt te sequensen - dat is waar we naar toe werken."
Dr. David Engelthaler, Co-directeur en universitair hoofddocent van de Pathogen and Microbiome Division van TGen, de besmettelijke ziektetak in Flagstaff bekend als TGen North
Dr. Engelthaler is voormalig staatsepidemioloog en staatscoördinator voor biodefensie in Arizona. Hij was vroeger bij de CDC, en heeft geleid tot onderzoeken van lokale, al meer dan 25 jaar nationale en internationale ziekte-uitbraken, te beginnen met de uitbraak van het hantavirus in Arizona in 1993-94. Hij zal de nieuwe ACGU's genomische sequencing van het SARS-CoV-2-virus coördineren, die de ziekte COVID-19 veroorzaakt.
De andere medeoprichters van de Unie zijn twee van de meest vooraanstaande wetenschappers op het gebied van infectieziekten in Arizona:Dr. Paul Keim en Dr. Michael Worobey.
Dr. Keim is een wereldexpert op het gebied van ziekteverwekkers zoals pest en miltvuur. Hij werkte samen met de FBI om de zaak "anthrax letters" na 9/11 op te lossen. Bij NAU, hij is een regentenhoogleraar biologie, heeft een bijzondere leerstoel Microbiologie, en is uitvoerend directeur van het Pathogen and Microbiome Institute (PMI). Hij is Distinguished Professor aan TGen, Mede-directeur van TGen Noord, en zal dienen als directeur van de ACGU.
"Genoomsequenties zijn ideaal voor gedistribueerde wetenschappelijke onderzoeksinspanningen en de Arizona Union zal sterk afhankelijk zijn van nationale en wereldwijde studies om de ziekte op te sporen. Desalniettemin, het is van cruciaal belang dat regionale experts deelnemen aan dit proces om de voordelen voor de burgers van Arizona te maximaliseren, " zei dr. Keim.
Dr. Worobey is het hoofd van de afdeling Ecologie en Evolutionaire Biologie van de Universiteit van Arizona, en is wereldberoemd vanwege zijn werk over virale pandemieën. Met behulp van genomische epidemiologie, hij heeft de oorsprong en wereldwijde verspreiding van hiv definitief gevolgd, en stelde ook vast waarom de pandemie van de "Spaanse griep" in 1918 miljoenen jonge volwassenen doodde.
"Moleculaire analyse van virussen levert cruciale aanwijzingen op over hoe pandemieën beginnen en hoe ze te bestrijden, "zei Dr. Worobey. "We zullen bij dit streven profiteren van de rijkdom aan talent en infrastructuur van Arizona."
De Arizona COVID-19 Genomics Union is vergelijkbaar met andere groepen over de hele wereld, werken om voet aan de grond te krijgen met dit nieuwe coronavirus. Snelle uitwisseling van gegevens en analyse is en blijft, kritisch voor wetenschappelijke, medisch en volksgezondheidsbegrip van de pandemie. Ironisch, het eerste Amerikaanse epicentrum van COVID-19, Seattle, is ook de thuisbasis voor NextStrain, het internethuis voor het volgen van het genoom van deze en andere pathogenen.
Het consortium van wetenschappers uit Arizona hoopt dat hun regionale sequencing zorgaanbieders en openbare beleidsmakers in Arizona een voorsprong zal geven bij het reageren op deze pandemie.
Zoals NextStrain, ACGU zal haar bevindingen openbaar maken; openlijk beschikbaar voor epidemiologen en virologen over de hele wereld.
Darmversterkend voedsel kan wereldwijd een einde maken aan ondervoeding bij kinderen
Ontdekking van 100 nieuwe genen kan helpen bij onderzoek naar pigmentatieziekten
Overdracht van SARS-CoV-2 van moeder op baby tijdens de zwangerschap mogelijk, maar zeldzaam
Bepaling van zuurneutraliserend vermogen voor OTC-antacida
RNA-sequencing biedt nieuwe inzichten in het microbioom
De ziekte van Parkinson kan worden voorkomen door darmmicroben
GSK-3-remmers zijn veelbelovend bij de behandeling van coronavirusinfecties
Onderzoekers in de Verenigde Staten hebben een nieuwe benadering voorgesteld voor de behandeling van infectie met coronavirussen, zoals het ernstige acute respiratoire syndroom coronavirus 2 (SARS-CoV
Onderzoek zegt bij SARS-CoV-2 hondeninfectie,
overdracht onwaarschijnlijk Een nieuwe studie gepubliceerd op de preprint-server bioRxiv* in september 2020 blijkt dat honden ziek zijn geworden en sterven aan een mysterieuze luchtweginfectie, vaak
Groeiproblemen bij premature baby's geassocieerd met veranderde darmbacteriën
Premature babys die niet groeien zoals verwacht of gedijen, kunnen problemen hebben met de ontwikkeling van hun microbioom, suggereert een nieuwe studie. Een team van onderzoekers van het Ann &Rober