Učinek gen zmanjšanje izgub kromosomskih odkritih v želodčnih rakov

Učinek gen zmanjšanje izgub kromosomskih odkritih v želodcu raka
Abstract
Ozadje
stopnjo izgube heterozigotnosti (LOH), ki zmanjšuje odmerek genov in izvaja učinek celično škodljive je znano, da je parameter za genetsko uprizoritev želodčnega raka. Ta študija raziskati, če je bil učinek celico škodljive inducirano z znižanjem gena a-stopnja omejujoč dejavnik za dogodke LOH v dveh ločenih histološke vrste želodca raka, so razpršeni in črevesna-vrste.
Metode
patoloških osebki, pridobljeni od 145 bolnikov z rakom želodca so za raven LOH prek 40 mikrosatelitnih markerjev na osem, povezanimi z rakom kromosomov (3p, 4p, 5q, 8p, 9p, 13q, 17p in 18q) preverjajo.
Rezultati
Most v kromosomov, povezanimi z rakom je bilo ugotovljeno, da pripadajo genov slaba kromosomov in vsebuje nekaj želodčnih specifične gene, ki so bili močno izraženi. LOH A-Osnovna raven, ki vključuje eno ali ne kromosom je pogosta v želodcu raka razpršeno tipa. Kromosom 17, ki vsebuje relativno visoko gostoto genov je pogosto izgubil v raka črevesnih tipa, vendar ne v raka razpršeno tipa. Na visoki ravni LOH vključuje štiri ali več kromosomov večinoma je pogosto v želodcu raka s črevesno in mešano diferenciacije. Bolezen recidiva je običajno želodčnih raka z visoko stopnjo LOH prek obeh hematogenim (38%) in zunaj hematogenim (36%) poti in za primere ravni osnovni LOH preko ne-hematogenim progi (67%).
Sklepi
učinek celic škodljive zmanjševanja genske bolj prenaša v želodcu raka intestinalnega tipa kot pri rakih difuzna tipa, in izguba genov v velikih odmerkih pa je povezana z hematogenim metastaz.
Ozadje
želodca raka opraviti hypermutations v preprostih ponovitvene sekvence in neuravnotežen kromosomske izgub, in te genetske spremembe so zaznani kot mikrosatelitnih nestabilnost (MSI) in izgube heterozigotnosti (LOH), v tem zaporedju, z zelo polimorfne markerjev mikrosatelitnih [1-4]. Pathobiological obnašanje in prognoza želodca raka so bile povezane s stopnjo LOH in prisotnosti MSI [3-6]. Globina invazije in bezgavk metastaz so bistveno napredovala v primerih malih raka z visoko stopnjo LOH, in te histološke parametre kaže, da je linearno povezana z velikostjo raka za primere nizko stopnjo loh [7]. Ker je ena mikrosatelitni genotip podobno odkrita v celotnem kirurškega tkivo kot tudi endoskopski biopsije vzorcu [3, 7], je možno predvideti verjetnost ponovitve bolezni in določi ustrezen postopek resekcijo temelji na analizi mikrosatelitno od predobdelava biopsijo tkiva.
dve zadetki hipotezo, je predlagal, da se izguba kromosomskih in rezultat točke mutacija v biallelic inaktivacijo zaviralnih genov [8]. Kromosomske izgube, ki izvajajo škodljivo vpliva na rast celic so veliko manj prenašajo kot kromosomske dobičkov in dve genetski zadetki ki zagotavljajo prednost rasti bi zaščitili rak matičnih celic iz smrtnih loh dogodkov [9, 10]. Poleg tega so prejšnje študije predlaga, da se metilni gen-kontrolni regije z vse manj methylated na ravni LOH odvisni način v želodcu raka [11, 12] prek mehanizma nadomestil odmerek, ki vzdržuje gen ali prepisu odmerek v naslednjih ciklusih celic [9 ]. V zvezi z mehanizmom nadomestil odmerek, lahko kromosomska dobiček in LOH povezano demetilacija posledica odmerka kompenzacijska genetskih in epigenetskih odzivih na znižanje kromosomske odmerka [11-14]. Zato loh dogodkov v kombinaciji z učinkom celic škodljive in odziva odmerka kompenzacijska poleg zaviralnih genov deaktivacijo verjetno za določitev pathobiological vedenje raka matičnih celic.
Želodčnega raka, so bile razvrščene v dve ločeni histološke vrste , kar pomeni, da razpršeni in črevesne-vrste [15, 16]. Difuzna tipa raka so pogoste pri mladih, starih bolnikih, ki nimajo za predrakave lezije, ker so črevesne tipa raka pogosta pri starejših, starih bolnikih, povezanih z predrakavih intestinalno metaplazijo da podobna črevesne žleze [17]. Ob predpostavki, da so-mozga zarodne izvorne celice prilagajanju na želodcu tkiva okolju [18], se na novo določene matične celice, ki so potencialno niso povezana in invazivna v mladih posameznikov, razvije v raka razpršeno tipa. Črevesne tipa raka so pogoste med starimi let bolnikih, ki imajo dolgoročno prilagajanje izvornih celic novo fiksno na okolju želodca tkiva. V zvezi s tem se lahko glede LOH dogodek vpliva na različne odmerke transkripcije med razpršeni in črevesnega vrsta želodčnega raka, ki vzpostavljajo različne genske ekspresije vzorce.
V tej študiji so bile korelacije med dogodki LOH in pathobiological obnašanja želodca raka glede na učinke celične neželenih zmanjševanja genov. Osem-povezani z rakom kromosomi smo pregledali imajo nizko gostoto genov in ne želodca specifičnih genov, ki lahko povzroči blago celic neželen učinek LOH. V loh dogodki so bili pogosto v želodcu raka intestinalnega tipa, v katerem bi bila izguba kromosoma vplivajo na nizko dozo transkripcijo in sprožajo blage celično neželen učinek.
Metode
Izbira primerov
sto in petinštirideset bolniki z rakom na želodcu, ki so šli skozi kurativni kirurško resekcijo od februarja 1996 do junija 2003, so bili vključeni v to študijo. Clinicopathologic in radiološko informacije so bile pridobljene s pregledom natančno evidenco bolnikov. Sto šestnajst primerov je bila predhodno analizirala multifokalna genetsko pregleda heterogenih območij tumorskih [3]. Preostalih 29 bolnikov so bile pregledane z enim samim tkiva blok vsakega tumorja.
Bili pregledani se mikroskopskih preparatov, nato pa je bila izbrana stran tumor, ki je bil predstavnik histološko funkcijo. Histološka vrsta raka želodca je bila opredeljena kot črevesju (žlezne, kohezivno ali trdno), razpršeno in zmešamo v skladu s klasifikacijo Lauren [15, 16] in stopnjo diferenciacije je razvrščenih v skladu s klasifikacijo Svetovne zdravstvene organizacije. Tumorske lokacije šteje bili Cardia, telo in antruma. Clinicopathologic stopnja tumorja je bila določena v skladu z merili Tumor-Node-Metastasis (TNM) [19]. Večina bolnikov želodca rakom (140 od ​​145, 97%) so prestali kurativna R0 želodca in D2 ali bolj razširjeno limfadenektomijo. Splošno povprečje 28,6 (mediana: 33) bezgavk smo odstranili skupaj z vzorcem. Nobeden od bolnikov je prejelo pred operativno kemoterapijo in obsevanju.
Nadaljnji podatki o ponovitve in preživetje
A kombinacije zdravil intravensko mitomicin, fluorouracil in citarabina (MFC), ki mu sledi oralno fluorouracil je bilo uporabljeno kot standard pooperativna adjuvantno zdravljenje po presoji zdravnika na celotno prognozo vsakem primeru. V obdobju spremljanja, fizičnega pregleda, laboratorijskih meritev, prsih radiografijo, trebuhu ultrazvočnimi ali računalniška tomografija in gastrofiberscopy so bile izvedene na vsake 3 ali 6 mesecev in ponovitve bolezni je bilo histološko potrjena, če je to mogoče. Ko je bila več kot ena ponovitev stran odkrita na prvi čas izpada, so se posamezne ponovitve šteje ločeno. Spletna stran ponovitev je bila razvrščena v hematogenim metastaz vključuje pljuča, jetra ali druge oddaljene organe, in ne-hematogenim metastaze, ki je vključevala vozla sodelovanje in peritonealno razširjanje. Želodčne Preostali raka, so bili izključeni iz analize ponovitev vzorca.
Skupni čas preživetja je bila izračunana od datuma kirurški odstranitvi do obeh dneva zadnjega nadaljnjih stikih ali smrti, povezanih z rakom. Podatki o bolnikih, ki so umrli zaradi drugih vzrokov je bilo cenzurirano v času smrti. Statistična analiza je bila opravljena v aprilu 2007. srednjo obdobju spremljanja vseh preživelih bolnikov je bila 40 mesecev (razpon: od 5 do 96 mesecev) in je bila končana s 98% vpisanih pacientov. Med analizo preživetja, je 50 bolnikov umrlo zaradi svojih raka in 12 bolnikov je umrla zaradi drugih vzrokov.
Tissue mikrodisekcijo in DNA ojačanja
Pet serijski 7 um-debele sekcije iz vsake formalinu fiksno parafin, vgrajeni vzorcu tkiva so deparaffinized in kratko obarvali s hematoksilinom in eozinom. Posamezen tumorske celice bogati Poudarek je bil izbran z mikroskopskim pregledom in območje tumorja v območju od 5 mm do 7 mm v premeru, je ročno razkosanih pod stereomikroskopom (povečavi x 40) s pomočjo kirurškega skalpela. kosi microdissected tkiva so mikroskopsko pregledajo, če je vsebina tumorskih celic > 70%, kar je bilo potrjeno, da izražajo razlike v genetskem vsebnosti med normalnimi in tumorskimi tkivi [3, 7].
Približno 1000 microdissected tumorske celice inkubiramo pri 20 p.L ekstrakcijskega pufra DNA (0,5% Tween-20 , 1 mM EDTA pH 8,0, 50 mM Tris pH 8,0, 0,5 mg /ml proteinaze K) pri 37 ° C za 24 ur. Formalin-fiksno parafin vgrajeni tkiva DNK kaže, da je slabo pomnožili s PCR v starejših osebkov. Večina DNA so bili pridobljeni v petih letih po pripravi patološki vzorci, ki zagotavlja kakovost DNA je za PCR. Količina DNA, z različnimi lastnostmi, v lizatu tkiva je določena na osnovi intenzitete pasu PCR z 5-10 ng /xl DNA, ki je ojačeno s pomočjo mikrosatelitni primerskega niza, D19S226
(naprej: 5 ' - CCA GCA GAT TTT GGT GTT GTC TA - 3 '; vzvratno: 5' - ACA GAG CCA GAG CCA GTA GGA GT - 3 '; velikost pomnožkov: 164 bp). PCR pomnoževanje smo izvedli pod pogojem vročim zagonom s pomočjo radioizotop (α- 32P dCTP, PerkinElmer, Boston, MA, ZDA), kot je opisano predhodno [3, 7]. Na kratko, skupno 10 ml PCR mešanice doživel 32 ciklov serijsko stopnjo pomnoževanja, ki je obsegal 94 ° C za 50 sekund, grundiranje specifično temperaturo žarjenja za 50 sekund in 72 ° C za 1 minuto. mikrosatelitna sekvence-radioizotop označene ločimo na 6% poliakrilamidnem gelu, ki je vsebovala 7 M sečnino in so bili vizualiziramo z večkratnim izpostavljenosti posameznega autoradiograph in uporabo radioluminograph skener (BAS 2500, Fuji fotografijo Film Co Ltd, Kanakawa, Japonska) .
Analiza mikrosatelitskih alelov
smernice za točkovanje status LOH in MSI so podrobno opisani v predhodnih študijah, ki uporabljajo isto ploščo mikrosatelitskih označevalcev [7]. Kot referenčno vrsto mikrosatelitni alelov smo najdena dinukleotid ponavljajočih se oznake, ki so v razponu od 88 bp do 247 bp velikost pomnožkov in da so imeli heterozigotnega frekvenco > 50%. Visoko polimorfne mikrosatelitna markerji na 8, povezanimi z rakom kromosomov (3p, 4p, 5q, 8p, 9p, 13q, 17p in 18q), ki je pogosto prihajalo do LOH želodčnega raka [3, 7, 20], so bili uporabljeni za povečanje število heterozigotnih alelov na vsakem kraku (slika 1A). Pet mikrosatelitna markerje na vsaki kromosomsko kraku jasne PCR pasov iz heterozigotnih alelov, razpon celotni dolžini osmih kromosomov [3, 5]. Da bi zagotovili zmanjšanje kromosomov, je bila dodeljena izguba kromosomsko ko dogodek LOH sodelovalo več kot dva mikrosatelitnih markerjev na eni kromosomsko roke [13]. Štirideset parov mikrosatelitni primerjev smo zmešali v skupno 22 epruvetah in od katerih vsaka vsebuje eno (4 mešanice) ali dve (18 mešanice) sete začetnih oligonukleotidov, ki razpon različnih velikosti amplikonov pri istih temperaturah žarjenje. Dobljene nedvoumnih mikrosatelitna trakovi navedla visoko specifičnost multipleks PCR stanju, ki je uporaben za majhne količine microdissected patoloških tkivih. Slika 1 mikrosatelitni Analiza temelji na PCR (A) in genska razvrstitev želodca raka (B). Reprezentativne autoradiographs iz vzorcev, ki so bile pregledane z analizo, ki temelji na PCR mikrosatelitno (A) in genetske klasifikacije črevesnega tipa in difuzna tipa želodčnega raka na osnovi izgube heterozigotnosti (LOH) in mikrosatelitno nestabilnost (MSI) (B). (A) levo gelsko elektroforezo kaže visokofrekvenčno MSI na več kot 40% 15 homozigotnih označevalcev. Pravica gel elektroforeza kaže na visoki ravni LOH vključujejo kromosome 3p, 4P, 5q, 9p, 13q, 17p in 18q. Normalo (N) in ustrezni tumor (T) DNA so prikazane nad vsakim alelne pasu. Zvezdica označuje, MSI in loh. Genomsko DNA microdissected od-formalinom vgrajeni-parafinskega določena tkiva smo pomnožili in [α-32P] dCTP označena v začetnem stanju vroče za multipleks PCR. Skupno 80 mikrosatelitskih pomnožkov iz vsakega vzorca smo izvedli hkrati na dveh zaporedja gelov. (B) Z plošče 40 mikrosatelitskih označevalcev osem z rakom povezana kromosomov, je LOH razlagajo na heterozigotnih markerjev, če 40% ali manj od homozigotnih označevalcev razstavljene MSI. Obseg izgube kromosomskih, ko je po številu LOH pozitivnih kromosomov, je bil razdeljen na visoki ravni (LOH-H) in nizko stopnjo (LOH-L) izgube tako črevesju-in difuzne vrstami. V primeru želodčnih raka difuzna tipa, je nič ali ena kromosomska izguba razvrščeni v ravni izhodiščnega (LOH-B).
Na isti klasifikaciji genotipov mikrosatelitskih, ki se je uporabljal v prejšnji raziskavi (slika 1B) [ ,,,0],7], so bili analizirani profili alelne iz mikrosatelitskih označevalcev 40 za MSI na homozigotno markerjev, ki so pokazali nekaj senčnih ali jecljanje pasov v paru normalnih in tumorskih DNA. Ker MSI zatemni status heterozigotnega alelov, so alelne profili 40 mikrosatelitskih zaporedij najprej analizirali za MSI na homozigotno označevalcev. Status LOH bila določena na osnovi izgube alelne v heterozigotnim označevalca (slika 1B). Obseg izgube kromosomskih v vsakem primeru, je dosegel po številu ustavnih izgub kromosomskih vključujejo alel več kot eno mikrosatelitnega.
Analiza v silico
podatki za gostoto gena in prepisovanja posameznih kromosomov
A skupno 17,723 referenčnih genov, opredeljenih v javnem baze podatkov (http:.. //genom UCSC edu /, marec 2006 montaža) [21] so bili analizirani za izračun števila genov na 1 Mb nukleotidov segmentu. Serijska analiza genske ekspresije (SAGE) podatki normalno želodčne sluznice je bila pridobljena iz javne baze podatkov (http:.... //Www NCBI NLM nih gov /geo /, "SAGE_Stomach_normal_B_antrum"). Transkripcijski aktivnost posameznih genov je bila izračunana s kombiniranjem referenčnega gena zemljevid in izraženih genov oznak. Na podlagi primerjave mikromrež in podatkov SAGE ocenjevanje na profile izražanja genov, je bilo ugotovljeno, da je število prepisov preštetih v podatkih SAGE natančno oceniti veliko razliko v genski aktivnosti med želodčnih specifičnih genov in oskrbniška genov [21].
Statistična analiza
Fisherjev test, in χ
2 testa smo uporabili za primerjavo clinicopathologic funkcije z mikrosatelitnih genotipa želodca raka. Verjetnost krivulje smo izračunali po metodi Kaplan-Meier, in v primerjavi s testom log-rang. Multivariatna analiza je bila opravljena z metodo Cox sorazmernih tveganj s pomočjo stopenjsko postopkov. Vrednosti verjetnosti sta bila dva-repa, z vrednostjo P
manj kot 0,05, ki se šteje kot statistično značilne. Programski paket statistični SPSS 11.0 (SPSS Inc., Chicago, IL, ZDA) je za analizo podatkov, ki se uporabljajo.
Rezultati
Analiza dogodkov loh v želodcu raka
Večina želodca raka (116 od 145 primerov), so bili pregledani v prejšnjem multifokalne analize na heterogenih tumorskih straneh z rakom določenem želodca [3]. je bilo ugotovljeno, da so bodisi podobno raven LOH ali MSI s heterogenimi tumorskih mestih pogosto skupne in potem je vsak rak želodca razvrstiti v eno mikrosatelitnih genotip, in ne mešano genotip devetdeset pet odstotkov želodca raka pregledanih. Mikrosatelitni genotipov 27 dodatnih primerov je bilo doseženih glede na stopnjo LOH in prisotnosti MSI, ki so bile odkrite v enem tkivni del, ki vsebuje reprezentativne histološke komponento.
Vsako izgubo kromosomov je povezana z clinicopathologic parametrih obstoječega želodčni rak (tabela 1). Večina kromosomske izgube (4p, 5q, 9p, 13q, 17p in 18q), so bile povezane s poznim nastopom bolezni (P
< 0,05). Dve ali več kromosomske izgube so bile hkrati povezane z antralnih lokaciji (9P in 18q izgube), črevesne, ali mešani tip histologijo (5q, 17P in 18q izgube), in slabo preživetje (3p, 9P in 13q izgube) (P
< 0,05). Izguba 17p je bil najpogostejši v raka na črevesnih tipa (67%). Izguba 13q je bil najpogostejši v raka na difuzna tipa (47%). Tabela 1 odnosi iz clinicopathologic značilnosti in samega izgubo kromosomov
Lastnosti

3p izguba izguba
4p
izida 5q izgubo
8P
9p izguba
13q izguba
17p izguba
18q izguba
No. bolnikov
130
47
47
51
30
50
57
77
55
dobe
Povprečna
60
61
63
63
63
64
63
63
63
± SD
± 12,60
± 10.18
± 10,49
± 9,28
± 10.24
± 10.28
± 10,43
± 10,94
± 11.20
P
0,290
0,029
0,014
0,102
0.003
0,030
< 0,0001
0,030
seks
Moški
86
37
34
36
18
37
42
52
36
Ženski
44
10
13
15
12
13
15
25
19
P
0.033
0,335
0.450
0,510
0,182
0,136
0,710
1.000
Tumor lokacija
Kardije
13
4
3
5
1
2
5
8
3
organa
48
16
16
13
10
14
16
24
16
antruma
69
27
28
33
19
34
36
45
36
P
0,743
0,424
0,078
0,267
0,018
0,119
0,253
0,043
histološke vrste
črevesne
54
19
19
23
13
22
20
36
27
razpršenih
32
9
9
6
5
8
15
11
7
Mešani
44
19
19
22
12
20
22
30
21
P
0,395
0,395
0,018
0,480
0.176
0,404
0.004
0,026
velikost tumorja
Povprečna
5.3
5.8
5.1
4.9
5.1
4,9
5.7
5.2
5.5
± SD
± 3,01
± 2,86
± 2,64
± 2,29
± 2,42
± 2,73
± 3,02
± 2,86
± 3.13
P
0,129
0,631
0,131
0,705
0,181
0,179
0,564
0,483
Stage
I & II
64
20
21
20
14
22
21
36
24
III & IV
66
27
26
31
16
28
36
41
31
P
0,277
0,469
0,075
0.836
0,372
0.014
0,593
0,292
Ponavljanje
peritonealni
24
10
9
8
5
10
12
16
11
limfnega vozla
10
4
3
3
2
5
4
6
3
hematogenim
22
13
11
14
8
11
14
15
po 10
Skupaj
56
27
23
25
15
26
30
37
24
P

0,422
0,507
0.070
0,428
0,826
0,415
0,899
0,663
Vital stanje
119
42
41
47
29
44
51
68
48
Alive
70
19
21
26
16
20
24
36
27
Dead
49
23
20
21
13
24
27
32
21
P
0,021
0,152
0.330
0,402
0,019
0,019
0.094
0,389
P
vrednosti manj kot 0.05 so navedene v krepki tisk.
velik del (52%) želodčnih raka difuzna-type je eno ali brez izgub kromosomske, ki so bile razvrščene v LOH na ravni izhodiščno (LOH-B), saj je večina črevesju -in mešanega tipa raka (86%), dve ali več kromosomske izgube (slika 2) [7]. primeri loh na visoki ravni s štirimi ali več izgub kromosomskih Najpogostejše so bile v mešanih primerih diferenciacije z obema intestinal- in difuzno tipa želodčnega raka (44%). Na splošno, 15 LOH-B (10%), 65 LOH-L (45%), 50 LOH-H (35%) in 15 MSI (10%) primerih so bile ugotovljene pri kirurških osebkov 145. Slika 2 Odnosi med histološki tip in št. kromosomskih izgub v želodčnega raka. Histološka vrsta raka želodca je bila opredeljena kot razpršeni (n = 32, zabojnik), intestinal- (n = 54, sivo polje) in mešani-vrste (n = 44, open box), po klasifikaciji Lauren.
Analiza gostote genov in močno izraženi geni on-rakom povezana kromosomov
gostoto genov na 1-Mb segment top 100 aktivnih geni, ki so bili močno izražena v želodcu, in pogostost LOH genotipi odkrite v želodčnih rakov smo analizirali na vsakem kromosomu (tabela 2). V primerjavi osmih raka povezana kromosomov smo pregledali in preostalih 14 kromosomov, gostote genov (4.8 genov v primerjavi z 6,9 genov na 1-Mb segmentu) in povprečno število visoko izraženih genov (3.3 genov v primerjavi z 5.3 genov) so bili nižja v kromosomih z rakom povezana kot v drugih kromosomov. Povprečno število prepisov ocenjenih v vsaki zelo izražena gena je bila nizka tudi v raka povezana kromosomov (54 v primerjavi z 69 prepisov na vsak gen). Posamezni autosomes so razvrščeni v vrstnem redu genov gostote. Kromosomi 2, 3, 4, 5, 8, 13 in 18 so bile razvrščene v skupino nizko gen gostoto manj kot pet genov na 1 Mb segmenta. Kromosomi 11, 16, 17, 19, 20 in 22 so imeli visoko gostoto genov za več kot osem genov na 1 Mb segmenta. Zato od osmih, povezanimi z rakom genov, ki so bile pregledane, šest (kromosomi 3, 4, 5, 8, 13 in 18) pripadal gena revnih kromosomov, in preostala dva gena pripadal srednjedolgodelujoče (kromosom 9 ) in visoko (kromosomske skupine z 17) gen gostote. Kromosomi 17 in 13 vsebujejo visoke in nizke gostote genov (13,4 in 2,7 genov na 1 Mb segmentu), oz. Kromosoma 17 pokazali visoko frekvenco LOH v LOH-L (49%), ne pa v primerih LOH-B (13%). Pogostosti kromosoma 13 izgube bil podoben v LOH-L (25%) in primeri LOH-B (27%). Tabela 2 Gostota gen, močno izraženi geni, in raven LOH na posamezne kromosomih ocenjenih v želodcu rakasto in noncancerous tkiv

No. genov na odseku 1 Mb *
Top 100 visoko izraženih genov
(Število prepisov na gena) *
Stopnja LOH (%) §




izhodiščem
(n = 15)
Nizka
(n = 65)
Visoka
(n = 50)
raka povezana kromosomi
3
4,9
3 (76)
1 (7)
18 (28)
28 (56)
4
3,6
5 (53)
2 (13)
12 (18)
33 (66)
5
4.4
4 (44)
0 (0)
14 (22)
37 (74)
8
4,1
3 (32)
0 (0)
9 (14)
21 (42)
9
5,2
4 (60)
1 (7)
15 (23)
34 (68)
13
2,7
2 (121)
4 (27)
16 (25)
37 (74)
17
13,4
5 (42)
2 (13)
32 (49)
43 (86)
18
3,2
0 (0)
1 (7)
18 (28)
36 (72)
Povprečne vrednosti
4,8
3.3 (54)
Drugi kromosomi
1
7,7
8 (47)
2
4.7
9 (132)
6
5,8
7 (39)
7
5,2
6 (45)
10
5,0
2 ( 37)
11
8,9
9 (85)
12
7.3
10 (62)
14
5.3
6 (43)
15
5.3
2 (90)
16
8,6
3 (34)
19
19,8
8 (61)
20
8.3
2 (76)
21
5.1
1 (268)
22
8.4
1 (55)
Povprečne vrednosti
6,9
5.3 (69)
* število prepisov 17,723 genov smo analizirali s pomočjo že objavljenih podatkov [21].
§The podrobnosti so opisane v poglavju materiala in metod.
odnosi med clinicopathologic posebnosti ter mikrosatelitna genotipi
145 želodčni rak smo analizirali razmerja med stopnjo LOH in clinicopathologic funkcij (tabela 3). Oba sta bila v želodčni rak LOH-H in LOH-B pogosto povezano z fenotipi z visokim tveganjem, kot so limfni invazije (P
= 0,006), venske invazijo (P
= 0,005), poznejših fazah (P
< 0,0001), ponovitev (P
= 0,023) in nizka stopnja preživetja (P
< 0,0001), medtem ko je LOH-L in želodčnega raka MSI so povezana z dobro in zmerno diferenciacije (P
= 0,033) in stopnja zgodnje tumor (P
< 0,0001). Dva genotipe, povezane z visokim tveganjem-fenotip so različni glede na anatomske mestu nastanka in vzorec ponovitve. Primeri LOH-H pogosto prišlo v antralnih delu (70%) in so se ponovno pojavili po hematogenim širi na jetra, pljuča in druge oddaljene organe (38%), kot tudi ne-hematogenim metastaz kot peritonealno setev in bezgavk udeležbo ( 36%). Večini primerov LOH-B so bili prisotni v srčne in trup (94%) in se ponovljeno v peritonealni votlini (67%), ne pa v oddaljenih organih (13%). Nastop starost LOH-B (45 let) in LOH-H (65 let) primerih je bila bistveno drugačna (P
< 0,0001) .table 3 Odnosi med mikrosatelitskih genotipov in clinicopathologic značilnosti želodca raka
Lastnosti

genotipi z visoko stopnjo tveganja


genotipi z majhnim tveganjem

P
vrednosti

(%)
LOH H (v%) *
LOH-B (%) *
P
vrednost
LOH-L (%) *
MSI (%) *
P
vrednost

No. bolnika
145
50
15
65
15
Starost (leta)
< 0,0001
0,038
0,710
Mean
61
65
45
60
67
SD
± 12,5
± 9,8
± 12.7
± 11,6
± 9,8
Sex
0.118
0.008
0,393
Moški
90 (62)
36 (72)
7 (47)
43 (66)
4 (27)
ženski
55 (38)
14 (28)
8 (53)
22 (34)
11 (73)
velikost tumorja
0,247
0,502
0,394
Povprečna
5,34
5.3
6.34
5.0
5.6
SD
± 2,94
± 2,62
± 3,77
± 3,10
± 2,33
Diferenciacija
0,052
0.094
0.033
No
11 (8)
3 (6)
8 (12)
Zmerna
53 (36)
17 (34)
1 (7)
25 (39)
10 (67)
Poor
81 (56)
30 (60)
14 (93)
32 (49)
5 (33)
lokacija tumorja
< 0,0001
0,037
0,791
Cardia
13 (9)
3 (6)
4 (27)
6 (9)
telesa
50 ( 35)
12 (24)
10 (67)
26 (40)
2 (13)
antruma
82 (56)
35 (70)
1 (6)
33 (51)
13 (87)
razvrstitev Lauren
< 0,0001
0,016
< 0,0001
Črevesne
58 (40)
19 (38)
0 (0)
35 (54)
4 (27)
razpršenih
32 (22 )
9 (18)
15 (100)
8 (12)
0 (0)
Mešani
55 (38)
22 (44)
0 (0)
22 (34)
11 (73)
vzorec rasti
0.600
< 0,0001
< 0,0001
Širjenje
20 (14)
1 (2)
1 (7)
9 (14)
9 (60)
infiltracijsko
70 (48 )
32 (64)
10 (67)
28 (43)
Mešani
55 (38)
17 (34)
4 (26)
28 (43)
6 (40)
Limfna invazija
1.000
0,771
0,006
št
44 (30)
9 (18)
3 (20)
34 (52)
5 (33)
Da
101 (70)
41 (82)
12 (80)
31 (48)
10 (67)
Venska invazija
0.351
0.113
0,005
št
112 (77)
35 (70)
8 (53)
54 (83)
15 (100)
Da
33 (23)
15 (30)
7 (47)
11 (17)
fazo tumorje
0,757
0,763
< 0,0001
Zgodnje
75 (52)
16 (32)
6 (40)
42 (65)
11 (73)
Napredno
70 (48 )
34 (68)
9 (60)
23 (35)
4 (27)
Ponavljanje
0.035
0,517
0,023
neobvezni

• Učinek laktuloze na strpnosti želodčne hranjenja v dolgoročno ICU patients
• Altered izraz domnevne matičnih celic marker DCAMKL1 v podganji želodčne sluznice v regeneracijo, metaplazijo in dysplasia