Genet-reduksjon effekt av kromosom tap påvist i mage kreft

Genet-reduksjonseffekten av kromosomale tap påvist i gastriske cancere
Abstract
Bakgrunn
nivå av tap av heterozygositet (LOH) som reduserer et gen dose og utøver en celle-ugunstig effekt er kjent for å være en parameter for den genetiske oppsetningen av mage kreft. Denne studien undersøkte hvis celle-ugunstig effekt indusert med genet reduksjonen var et hastighetsbegrensende faktor for LOH hendelsene i to forskjellige histologiske typer av gastrisk kreft, de diffuse- og intestinal-typer.
Metoder
patologisk prøver hentet fra 145 kreftpasienter mage ble undersøkt for nivået av LOH bruker 40 mikro markører på åtte kreft-assosiert kromosomer (3p, 4p, 5q, 8p, 9 p, 13q, 17p og 18q).
Resultater
Most av kreft-assosiert kromosomer ble funnet å tilhøre gen-fattig kromosomer og for å inneholde noen mage-spesifikke gener som var sterkt uttrykt. En baseline-nivå LOH involverer én eller ingen kromosom var hyppig i diffus-type mage kreft. Kromosomet 17 inneholdende en forholdsvis høy tetthet av gener ble ofte tapt i intestinal-type kreft, men ikke i diffust-type kreft. Et høyt nivå LOH involverer fire eller flere kromosomer tendens til å være hyppig i mage kreft med tarm og blandet differensiering. Sykdom tilbakefall var vanlig for mage kreft med høyt nivå LOH gjennom både hematogenous (38%) og ikke-hematogene (36%) ruter, og for baseline-nivå LOH tilfeller gjennom ikke-hematogenous rute (67%).
Konklusjoner
celle-negative effekten av genet reduksjonen er mer tolereres i intestinal-type gastrisk cancer enn i diffust-type kreft, og tapet av høy-dose-gener er forbundet med hematogenous metastase.
Bakgrunn
Gastric kreft gjennomgå hypermutations i enkle gjentatte sekvenser og ubalanserte kromosom tap, og disse genetiske endringer er påvist som en mikro ustabilitet (MSI) og tap av heterozygositet (LOH), henholdsvis ved hjelp av svært polymorfe mikro markører [1-4]. Den pathobiological oppførsel og prognose av gastrisk kreft har vært forbundet med nivået av LOH og tilstedeværelsen av MSI [3-6]. Dybden av invasjonen og lymfeknutemetastase er betydelig avansert i tilfeller av små-sized kreft med høyt nivå LOH, og disse histologiske parametre tendens til å være lineært relatert til størrelsen på kreft for lavt nivå LOH tilfeller [7]. Fordi en enkelt mikro genotype er likeledes påvises i hele operasjons vev samt endoskopisk biopsiprøve [3, 7], er det mulig å forutsi sannsynligheten for sykdom tilbakefall og for å bestemme den riktige reseksjon prosedyre basert på mikroanalyse av en forbehandling vevsprøver.
to-hits hypotese har foreslått at kromosom tap og punktmutasjon resultat i biallelic inaktivering av tumorsuppressorgener [8]. Kromosomale tap som utøver en skadelig virkning på cellevekst er mye mindre tolerert enn kromosomal gevinster, og de to genetiske treff, ved å gi en vekstfordel kunne beskytte kreft progenitorceller fra dødelige LOH hendelser [9, 10]. I tillegg har tidligere undersøkelser foreslått at de metylerte gen-kontrollregioner er mink denaturert i et LOH-nivå-avhengig måte i gastriske cancere [11, 12] via en doserings kompensasjon mekanisme som opprettholder en genet eller transkripsjon dose i løpet av de påfølgende cellesyklus [9 ]. Med hensyn til doseringskompensasjonsmekanismen, kan kromosomalt vinning og LOH-assosiert demetylering resultatet fra dose-kompenserende genetiske og epigenetiske respons på en reduksjon i det kromosomale dose [11-14]. Derfor LOH hendelsene kombinert med en celle-negativ effekt og en dose-respons kompenserende i tillegg til tumorsuppressorgen inaktivering er sannsynlig å bestemme pathobiological oppførselen til kreft progenitorceller.
Gastriske kreft har blitt kategorisert i to forskjellige typer histologiske , det vil si de diffuse- og intestinal-typer [15, 16]. Diffuse-type kreft er vanlig hos unge aldrende pasienter som mangler en forstadier lesjon, mens intestinal-type kreft er vanlig i gamle aldrende pasienter knyttet til forstadier intestinal metaplasi som ligner intestinal kjertler [17]. Forutsatt at de marg-avledede stamceller tilpasser seg magen vev-miljø [18], den nylig faste stamceller som er potensielt ikke-sammenhengende og spre seg i unge individer, utvikler seg til diffus-type kreft. Intestinal-type kreft er hyppig blant de gamle aldrende pasienter som har en langsiktig tilpasning av nye faste stamceller til mage vev miljø. I denne forbindelse kan en gitt LOH hendelse påvirker forskjellige doser av transkripsjon mellom diffuse- og intestinal-type mage kreft som etablerer tydelige genuttrykksmønster.
I denne studien korrelasjoner ble gjort mellom LOH hendelser og pathobiological oppførsel av magekreft i form av celle-uønskede effekter av genet reduksjon. De åtte kreft-assosiert kromosomer vi undersøkt hadde en lav densitet av gener og ingen mage-spesifikke gener, noe som kan resultere i en mild celle-bivirkning av LOH. De LOH hendelsene var hyppig i intestinal-type mage kreft, hvor tap av et kromosom vil påvirke en lav dose av transkripsjon og utøver en mild celle-negativ effekt.
Metoder
utvalg av saker
Ett hundre og førtifem pasienter med magekreft som gjennomgikk en helbredende kirurgisk reseksjon mellom februar 1996 og juni 2003 ble inkludert i denne studien. Den clinicopathologic og radiologisk informasjon ble innhentet ved å gå gjennom de detaljerte registreringer av pasientene. Ett hundre og seksten tilfeller ble tidligere analysert ved multifokal genetisk undersøkelse av heterogene tumor nettsider [3]. De resterende 29 pasienter ble undersøkt ved hjelp av en enkelt vev blokk med hver svulst.
Den mikroskopiske lysbilder ble anmeldt og deretter en svulst område som var representant for histologisk funksjonen er valgt. Den histologiske type magekreft ble definert som intestinal (kjertel, sammenhengende eller fast stoff), diffus, og blandet i henhold til den Lauren klassifiseringen [15, 16] og graden av differensiering ble gradert i henhold til WHO klassifisering. Tumor steder mente var Cardia, kropp og antrum. Den clinicopathologic tumor stadium ble bestemt i henhold til de Tumor-Node-metastaser (TNM) kriterier [19]. De fleste mage kreft (140 av 145, 97%) hadde gjennomgått R0 gastrektomi og D2 eller mer utvidet lymphadenectomy. En samlet gjennomsnittet av 28.6 (middelverdi: 33) lymfeknuter ble fjernet sammen med prøven. Ingen av pasientene fikk preoperativ kjemoterapi og strålebehandling.
Oppfølgings data på tilbakefall og overlevelse
En kombinasjonsbehandling av intravenøs mitomycin, fluorouracil, og cytarabin (MFC) etterfulgt av peroral fluorouracil ble gitt som en standard postoperativ adjuvant behandling i henhold til legens vurdering av den generelle prognose for hvert enkelt tilfelle. I løpet av oppfølgingsperioden, en fysisk undersøkelse, laboratorieprøver, røntgen thorax, ultralyd abdomen eller computertomografi, og gastrofiberscopy ble utført hver 3 eller 6 måneder og sykdom tilbakefall ble histologisk bekreftet, hvis mulig. Når mer enn en gjentakelse nettstedet ble oppdaget for første gang for å mislykkes, ble de enkelte tilbakefall telles hver for seg. Tilbakefalls området ble kategorisert i hematogenous metastase involverer lunge, lever, eller andre fjerne organer, og ikke-hematogenous metastaser som inkluderte lymfeknuteaffeksjon og peritoneal formidling. Gastric rest kreft ble ekskludert fra gjentakelse mønster analyse.
Total overlevelse tid ble beregnet fra tidspunktet for kirurgisk reseksjon til enten den dagen den siste oppfølgingskontakt eller kreft-relaterte dødsfall. Dataene på pasienter som døde av andre årsaker ble sensurert på tidspunktet for dødsfallet. Statistisk analyse ble utført i april 2007. Gjennomsnittlig oppfølgingstid av alle de overlevende pasientene ble 40 måneder (spredning: 5 til 96 måneder) og ble gjennomført med 98% av de inkluderte pasientene. I løpet av overlevelsesanalyse, hadde 50 pasienter døde som et resultat av deres kreft og 12 pasienter hadde dødd av andre årsaker.
Tissue mikrodisseksjon og DNA forsterkning
fem serie 7 mikrometer tykke seksjoner fra hver formalinfiksert parafin-embedded vevsprøve ble deparaffinized og kort farget med hematoxylin og eosin. En enkelt tumor-celle-rik fokus ble valgt av mikroskopisk undersøkelse og et tumorområde som varierer fra 5 mm til 7 mm i diameter ble manuelt dissekert under et stereomikroskop (forstørrelse x 40) ved anvendelse av en kirurgisk skalpell. De microdissected vev stykker ble mikroskopisk undersøkt om svulsten celleinnholdet var > 70%, som hadde blitt bekreftet til å reflektere en forskjell i den genetiske innhold mellom de normale og tumorvev [3, 7].
Omtrent 1000 microdissected tumorceller ble inkubert i 20 ul av DNA-ekstraksjon buffer (0,5% Tween-20 , 1 mM EDTA pH 8,0, 50 mM Tris pH 8,0, 0,5 mg /ml proteinase K) ved 37 ° C i 24 timer. Formalin-fikserte paraffin-innleiret vev-DNA har en tendens til å være dårlig amplifisert ved PCR i eldre prøver. De fleste DNA ble ekstrahert i løpet av fem år etter fremstilling av de patologiske prøver, noe som sikrer DNA kvalitet for PCR. Mengden av DNA, med varierende kvaliteter, av vevet lysat ble beregnet basert på PCR bandet intensiteten med 5-10 ng /mL av DNA, som ble forsterket ved hjelp av en mikro primer sett, D19S226 plakater (forover: 5 ' - CCA GCA GAT TTT GGT GTT GTC TA - 3 '; omvendt: 5' - ACA GAG CCA GAG CCA GTA GGA GT - 3 '; amplicon størrelse: 164 bp). PCR-amplifikasjon ble utført under en hot-start-tilstand med anvendelse av en radioaktiv isotop (α- 32P dCTP, PerkinElmer, Boston, MA, USA) som tidligere beskrevet [3, 7]. I korthet ble et total på 10 ul PCR-blanding gjennomgikk 32 cykler av en serieforsterkertrinn som besto av 94 ° C i 50 sek, en primer-annealing spesifikk temperatur i 50 sek, og 72 ° C i 1 min. De radioisotop-merkede mikro sekvenser ble adskilt på en 6% polyakrylamidgel som inneholdt 7 M urea og de ble gjort synlige ved gjentatte eksponeringer av hver autoradiograf og ved bruk av en skanner (radioluminograph BAS 2500, Fuji Photo Film Co Ltd, Kanakawa, Japan) .
Analyse av mikro alleler
retningslinjene for å oppnå status som LOH og MSI har blitt beskrevet i tidligere studier som brukte det samme panelet av mikro markører [7]. Som et referansetype av mikrolene, vi hentet dinucleotide gjenta markører som varierte fra 88 bp til 247 bp i amplicon størrelse og som hadde en heterozygot frekvens > 50%. Den svært polymorfe mikro markører på 8 kreft-assosiert kromosomer (3p, 4p, 5q, 8p, 9 p, 13q, 17p og 18q), som ofte led av LOH i magekreft [3, 7, 20], ble brukt til å øke antall heterozygote alleler på hver arm (figur 1A). De fem mikrosatellittmarkører på hver kromosomale arm viste det klare PCR-bånd i de heterozygote alleler og spredte hele lengden av de åtte kromosomer [3, 5]. For å sikre kromosom reduksjonen ble kromosom tap tildelt da LOH hendelsen involverte mer enn to mikro markører på en kromosom arm [13]. Førti mikro par av primere ble blandet i en total av 22 reaksjonsrør og som hver inneholdt en (4-blandinger) eller to (18 blandinger) primersett som strakte forskjellige størrelser amplikonene ved de samme varmebehandlingstemperaturer. De resulterende utvetydige mikro band indikerte høy spesifisitet av multipleks PCR tilstand, som var nyttig for små mengder microdissected patologiske vev. Figur 1 PCR-baserte mikroanalysen (A) og den genetiske klassifisering av mage kreft (B). Representative autoradiografer av prøvene som ble undersøkt ved hjelp av PCR-basert mikroanalysen (A) og den genetiske klassifiseringen av intestinal-type og diffus-type gastrisk kreft basert på tap av heterozygositet (LOH) og mikro ustabilitet (MSI) (B). (A) Den venstre gelelektroforese viser høyfrekvente MSI på mer enn 40% av de 15 homozygote markører. Retten gelelektroforese viser høyt nivå LOH involverer kromosomer 3p, 4p, 5q, 9 p, 13q, 17p og 18q. Normal (N) og tilsvarende tumor (T) DNA er angitt over hver allelisk band. Stjernen indikerer MSI og LOH. Den genomisk DNA microdissected fra formalin-embedded parafin-fiksert vev ble forsterket og merket etter [α-32P] dCTP i den varme starten tilstanden multipleks PCR. Totalt 80 mikro amplikonene fra hver prøve ble kjørt samtidig på to sekvense geler. (B) Ved å bruke et panel på 40 mikrosatellittmarkører på åtte cancerassosierte kromosomer, ble LOH tolket på heterozygote merker hvis 40% eller mindre av de homozygote markører oppviste MSI. Omfanget av de kromosomale tap, som scoret i henhold til antall LOH-positive kromosomer, ble delt i høyt nivå (LOH-H) og lav-nivå (LOH-L) tap for både intestinal-og diffuse-typer. Ved diffuse typen mage kreft, ble null eller en kromosom tap klassifiseres i basisnivå (LOH-B).
Basert på samme klassifisering av mikro genotypene som ble benyttet ved forrige undersøkelse (figur 1B) [ ,,,0],7], ble alleliske profiler av de 40 mikro markørene analysert for MSI på homozygote markører som viste noen skygge eller stutter bånd i et par av normale og tumor DNA. Fordi MSI tilslører heterozygot alleliske status ble allele profiler av de 40 mikrosekvenser utgangspunktet analysert for MSI på homozygot markører. Den LOH status ble fastsatt basert på alleliske tap i heterozygot markør (figur 1B). Omfanget av kromosom tap i hvert tilfelle ble scoret i henhold til antall konstitusjonelle kromosom tap som involverer mer enn ett mikro allel
. Analyse av in-silico
data for genet tetthet og transkripsjon av individuelle kromosomer
A totalt 17,723 referanse gener identifisert i en offentlig database (http:.. //genom UCSC edu /mars 2006 montasje) [21] ble analysert for å beregne antall gener per 1-Mb nukleotider segmentet. Serie analyse av genuttrykk (SAGE) data med normal mageslimhinnen ble hentet fra en offentlig database (http:.... //Www NCBI NLM nih gov /geo /"SAGE_Stomach_normal_B_antrum"). Den transkripsjonelle aktivitet av individuelle gener ble beregnet ved å kombinere gen kart referansen og de uttrykte genet koder. Basert på en sammenligning av microarray og SAGE data evaluere genuttrykk profiler, ble antall utskrifter telles i SAGE data funnet å nøyaktig anslå en stor forskjell i genaktivitet mellom mage-spesifikke gener og rengjøring gener [21].
Statistisk analyse
Fishers eksakte test og χ
2 tester ble brukt for å sammenligne clinicopathologic funksjonene med mikro genotype av mage kreft. Sannsynlighets kurvene ble beregnet i henhold til Kaplan-Meier metoden og sammenlignet med log-rank test. Multivariat analyse ble utført av Cox proporsjonale farer metode med å bruke trinnvise prosedyrer. Sannsynlighets verdiene var tosidige, med en P
verdi mindre enn 0,05 ble ansett som statistisk signifikant. Den statistiske programvarepakken SPSS 11.0 (SPSS Inc., Chicago, IL, USA) ble brukt for dataanalyse.
Resultater
Analyse av LOH hendelsene i mage kreft
fleste av mage kreft (116 av 145 tilfeller) ble undersøkt i en tidligere multifokal analyse på de heterogene tumor nettsteder fra en gitt magekreft [3]. Nittifem prosent av gastrisk kreft undersøkes ble funnet å ha enten et tilsvarende nivå av LOH eller MSI vanligvis delt av heterogene tumor områder og deretter hver magekreft ble kategorisert i en enkelt mikro genotype, og ikke en blandet genotype. De mikro genotyper av de 27 ekstra tilfeller ble bedømt i henhold til nivået av LOH og tilstedeværelsen av MSI, som ble påvist i et enkelt stykke vev inneholdende en representativ histologisk komponent.
Hver kromosomalt tap ble korrelert med clinicopathologic parametre av mage kreft (tabell 1). De fleste kromosom tap (4p, 5q, 9 p, 13q, 17p og 18q) var assosiert med sent oppstått sykdom (P
< 0,05). To eller flere kromosomale tapene ble samtidig beslektet med antral plassering (9p og 18q tap), intestinal-eller blandet-type histologi (5q, 17p og 18q tap), og en dårlig overlevelse (3p, 9p og 13q tap) (P
< 0,05). Den 17p tap var hyppigst i intestinal-type kreft (67%). Den 13q tap var mest vanlig i de diffuse-type kreft (47%). Tabell 1 Forhold av clinicopathologic egenskaper og enkelt kromosom tap
Kjennetegn

3p tap
4p tap
5q tap
8p tap
9p tap
13q tap
17p tap
18q tap
No. av pasientene
130
47
47
51
30
50
57
77
55
Age
Mean
60
61
63
63
63
64
63
63
63
± SD
± 12,60
± 10,18
± 10,49
± 9.28
± 10,24
± 10,28
± 10,43
± 10,94
± 11,20
P
0.290
0,029
0,014
0,102
0,003
0,030
< 0,0001
0,030
Sex
male 86
37
34
36
18
37
42
52
36
Kvinne
44
10
13
15
12
13
15
25
19
P
0,033
0,335
0.450
0,510
0,182
0,136
0,710
1,000
Tumor plassering
Cardia
13
4
3
5
1 2
5
8
3
Body
48
16
16
13
10
14
16
24
16
antrum
69
27
28
33
19
34
36
45
36
P
0,743
0,424
0,078
0,267
0,018
0,119
0,253
0,043
histologiske typen
tarm~~POS=TRUNC
54
19
19
23
13
22
20
36
27
Diffuse
32
9
9
6
5
8
15
11
7
Blandet
44
19
19
22
12
20
22
30
21
P
0,395
0,395
0,018
0.480
0,176
0,404
0,004
0,026
Tumor størrelse
Mean
5,3
5,8
5,1
4,9
5,1
4,9
5,7
5,2
5.5
± SD
± 3.01
± 2.86
± 2.64
± 2.29
± 2.42
± 2.73
± 3.02
± 2,86
± 3.13
P
0,129
0,631
0.131
0,705
0,181
0,179
0,564
0,483
Stage
I & II
64
20
21
20
14
22
21
36
24
III & IV
66
27
26
31
16
28
36
41
31
P
0,277
0,469
0,075
0,836
0,372
0,014
0,593
0,292
Tilbakefall
Peritoneal
24
10
9
8
5
10
12
16
11
lymfeknute
10
4
3
3
2
5
4
6
3
hematogenous
22
13
11
14
8
11
14
15
10
Total
56
27
23
25
15
26
30
37
24
P

0,422
0,507
0,070
0,428
0,826
0,415
0,899
0,663
Vital status
119
42
41
47
29
44
51
68
48
Alive
70
19
21
26
16
20
24
36
27
Døde
49
23
20
21
13
24
27
32
21
P
0,021
0,152
0.330
0,402
0,019
0,019
0,094
0.389
P
verdier mindre enn 0,05 er angitt i fet skrift print., en stor andel (52%) av diffus-type mage kreft hadde én eller ingen kromosom tap, som ble klassifisert til en baseline nivå LOH (LOH-B), fordi de fleste av tarm -og mixed-type kreft (86%) hadde to eller flere kromosom tap (figur 2) [7]. Høyt nivå LOH tilfeller med fire eller flere kromosom tap var hyppigst i de blandede differensiering tilfeller med både intestinal- og diffus-type mage kreft (44%). Total, 15-B LOH (10%), 65 LOH-L (45%), 50 LOH-H (35%), og 15 MSI (10%) tilfellene ble identifisert i 145 kirurgiske prøver. Figur 2 Forholdet mellom histologisk type og nei. av kromosom tap i mage kreft. Den histologiske type magekreft ble definert som diffuse- (n = 32, lukket boks), intestinal- (n = 54, grå boks), og blandet-typer (n = 44, åpen boks), ifølge Lauren klassifisering.
Analyse av genet tetthet og de høyt uttrykte gener for cancerassosierte kromosomer
tettheten av gener per 1-Mb segment, de 100 aktive gener som var sterkt uttrykt i magen, og frekvensen av den LOH genotyper detektert i gastriske cancere ble analysert på hvert kromosom (tabell 2). Ved sammenligning av de åtte kreft-assosiert kromosomer vi undersøkt, og de resterende 14 kromosomer, tettheten av gener (4,8-gener versus 6,9 gener per 1-Mb segmentet), og det gjennomsnittlige antall av de høyt uttrykte gener (3,3-gener versus 5,3-gener) ble lavere i kreft-assosiert kromosomet enn i de andre kromosomer. Det midlere antall transkripter estimert i hver høyt uttrykt gen var også lav i kreft-assosiert kromosomer (54 versus 69 transkripsjonene pr hvert gen). De enkelte autosomer ble gruppert i størrelsesorden genet tettheter. Kromosomene 2, 3, 4, 5, 8, 13 og 18 ble kategorisert i den lav-genet tetthet gruppe på mindre enn fem gener per 1 Mb segment. Kromosomene 11, 16, 17, 19, 20 og 22 hadde en høy tetthet av gener som er av mer enn åtte gener per 1 Mb segment. Følgelig, av de åtte cancerassosierte gener som ble undersøkt, seks (kromosomene 3, 4, 5, 8, 13 og 18) tilhørte genet fattig kromosomer, og de resterende to gener som hørte til den mellomliggende gruppe (kromosomet 9 ) og høy (kromosom 17) gen-density grupper. Kromosomene 17 og 13 inneholdt høye og lave tettheter av gener (13,4 og 2,7 gener per 1-Mb segment), henholdsvis. Kromosom 17 viste en høy frekvens av LOH i LOH-L (49%), men ikke i LOH-B-tilfeller (13%). Hyppigheten av kromosom 13 tapet var lik i LOH-L (25%) og LOH-B-tilfeller (27%). Tabell 2 Genet tetthet, høyt uttrykte gener, og LOH nivå på de enkelte kromosomer estimert i mage kreft og noncancerous vev

No. av gener per en en-Mb segment *
Top 100 høyt uttrykte gener
(Antall utskrifter per gen) *
Nivå LOH (%) §




Baseline product: (n = 15)
lav product: (n = 65)
Høy product: (n = 50)
Cancer-forbundet kromosomer
3
4,9
3 (76)
1 (7)
18 (28)
28 (56)
4
3,6
5 (53)
2 (13)
12 (18)
33 (66)
5
4,4
4 (44)
0 (0)
14 (22)
37 (74)
8
4,1
3 (32)
0 (0)
9 (14)
21 (42)
9
5,2
4 (60)
1 (7)
15 (23)
34 (68)
13
2,7
2 (121)
4 (27)
16 (25)
37 (74)
17
13,4
5 (42)
2 (13)
32 (49)
43 (86)
18
3,2
0 (0)
1 (7)
18 (28)
36 (72)
Gjennomsnittsverdier verdier~~POS=HEADCOMP
4,8
3.3 (54)
Andre kromosomer
1 7,7
8 (47)
2
4.7
9 (132)
6
5,8
7 (39)
7
5,2
6 (45)
10
5.0
2 ( 37)
11
8,9
9 (85)
12
7,3
10 (62)
14
5,3
6 (43)
15
5,3
2 (90)
16
8,6
3 (34)
19
19,8
8 (61)
20
8.3
2 (76)
21
5,1
1 (268)
22
8,4
1 (55)
Gjennomsnittsverdier verdier~~POS=HEADCOMP
6,9
5.3 (69) product: * antall utskrifter av 17,723 gener ble analysert ved hjelp av de tidligere publiserte data [21].
§The detaljer er beskrevet i materialet og metodedelen.
relasjoner mellom clinicopathologic funksjoner og mikro genotyper
den 145 mage kreft ble analysert for forholdet mellom nivået av LOH og clinicopathologic funksjoner (Tabell 3). Både LOH-H og LOH-B mage kreft ble ofte forbundet med høy risiko fenotyper som lymfatisk invasjon (P
= 0,006), vene invasjon (P
= 0,005), avanserte stadier (P
< 0,0001), gjentakelse (P
= 0,023) og en dårlig overlevelse (P
< 0,0001), mens den LOH-L og MSI gastriske cancere var korrelert med godt og moderat differensiering (P
= 0,033) og en tidlig tumorstadium (P
< 0,0001). De to genotyper relatert med høy risiko-fenotype var ulik i henhold til den anatomiske området for forekomst og mønster av gjentakelse. De LOH-H tilfeller ofte forekommet i antral partiet (70%) og de dukket opp igjen gjennom hematogenous sprer seg til lever, lunge og andre fjerntliggende organer (38%), så vel som ikke-hematogenous metastaser, for eksempel peritoneal såing og nodal engasjement ( 36%). De fleste av de LOH-B-tilfeller var tilstede i hjerte- og hovedpartiet (94%), og de fikk tilbakefall i bukhulen (67%), snarere enn i fjerntliggende organer (13%). Utbruddet alder av LOH-B (45 år) og LOH-H (65 år) tilfeller var signifikant forskjellig (P
< 0,0001) .table 3 Relasjonene mellom mikro genotyper og clinicopathologic funksjonene i mage kreft
Kjennetegn

Høyrisiko genotyper


lav risiko genotyper

P
verdi
product: (%)
LOH -H (%) *
LOH-B (%) *
P
verdi
LOH-L (%) *
MSI (%) *
P
verdi

No. pasient
145
50
15
65
15
Alder (år)
< 0,0001
0,038
0,710
Mean
61
65
45
60
67
SD
± 12,5
± 9,8
± 12,7
± 11,6
± 9,8
Sex
0,118
0,008
0,393
Mann fra 90 (62)
36 (72)
7 (47)
43 (66)
4 (27)
Kvinne
55 (38)
14 (28)
8 (53)
22 (34)
11 (73)
Tumor størrelse
0,247
0,502
0,394
Mean
5,34
5,3
6,34
5.0
5,6
SD
± 2.94
± 2.62
± 3,77
± 3.10
± 2.33
Differensiering
0,052
0,094
0,033
Vel
11 (8)
3 (6)
8 (12)
Moderat
53 (36)
17 (34)
1 (7)
25 (39)
10 (67)
Dårlig 81 (56)
30 (60)
14 (93)
32 (49)
5 (33)
Tumor plassering
< 0,0001
0,037
0,791
Cardia
13 (9)
3 (6)
4 (27)
6 (9)
Body
50 ( 35)
12 (24)
10 (67)
26 (40)
2 (13)
antrum
82 (56)
35 (70)
1 (6)
33 (51)
13 (87)
Lauren klassifisering
< 0,0001
0,016
< 0,0001
Tarm
58 (40)
19 (38)
0 (0)
35 (54)
4 (27)
Diffuse
32 (22 )
9 (18)
15 (100)
8 (12)
0 (0)
Blandet
55 (38)
22 (44)
0 (0)
22 (34)
11 (73)
Vekst mønster
0.600
< 0,0001
< 0,0001
Utvide
20 (14)
1 (2)
1 (7)
9 (14)
9 (60)
infiltrerende
70 (48 )
32 (64)
10 (67)
28 (43)
Blandet
55 (38)
17 (34)
4 (26)
28 (43)
6 (40)
lymfatisk invasjon
1,000
0,771
0,006
Ingen
44 (30)
9 (18)
3 (20)
34 (52)
5 (33)
Ja
101 (70)
41 (82)
12 (80)
31 (48)
10 (67)
venøs invasjon
0,351
0,113
0,005
Ingen
112 (77)
35 (70)
8 (53)
54 (83)
15 (100)
Ja
33 (23)
15 (30)
7 (47)
11 (17)
Tumor scenen
0,757
0,763
< 0,0001
Tidlig
75 (52)
16 (32)
6 (40)
42 (65)
11 (73)
Avansert
70 (48 )
34 (68)
9 (60)
23 (35)
4 (27)
Tilbakefall
0,035
0,517
0,023
Ikke-

• Effekten av laktulose på toleranse av mage fôring i lang sikt ICU patients
• Endret uttrykk for en antatt stamcelle markør DCAMKL1 i rotte mageslimhinnen i regenerasjon, metaplasi og dysplasia