H. pylori kliničnih izolatov imajo različne babAB genotipa distribucij več različnih topografskih območij želodca z korelacija s klinično bolezen izidov

H. pylori
kliničnih izolatov ima raznoliko babAB
genotipov distribucij več različnih topografskih območij želodca s korelacijo z rezultati kliničnih bolezni
Abstract
Ozadje
intragenomskih rekombinacijo med Baba
in Babb
posreduje antigenskih variacij in lahko pomaga H. pylori
kolonizacijo. Ta študija naj si bo to
variabilni genotipov Baba
in Babb korelaciji do različnih rezultatov kliničnih bolezni, in lahko razdelili po različnih želodca niše.
Rezultati
Ta študija vpisanih 92 kliničnih sevov (45 od čira na želodcu 27 od gastritis in 20 zaradi raka želodca) za odkrivanje, ali Baba
in Babb
so na locus A ali B, ki ga PCR reakcije z uporabo primerjev, izdelane iz gorvodno in variabilno regijo Baba
in Babb
gene. Ugotovljeno je bilo štiri genotipe Baba
in Babb
(A, B, AB B, A AB AB AB). Porazdelitev 4 genotipov v 92 kliničnih sevov je bil bistveno drugačen pri bolnikih z različnimi želodčnih bolezni (p
< 0,05). Izolati iz bolnikov z rakom želodca imeli višjo stopnjo AB AB genotipa kot tisti iz bolnikov nerakave (40,0% v primerjavi z
9,7%, p
< 0,05). AB AB genotip je bil povezan z višjo intenzivnostjo intestinalno metaplazijo (p
< 0,05), vendar pa ni bilo povezano z višjo vnetje in kolonizacije gostote v želodcu histologijo (p
> 0,05). Poleg tega študijo so vključili 19 bolnikov, da se preveri, ali spremenljivi genotipov babAB
obstajala v različnih želodčnih niše. Med bolniki, okuženi z več kot enim babAB
genotipov več antruma in korpusa, je bilo višje stopnje genotipov kot AB in AB AB v izolatov iz antruma, kot pri tistih iz korpusa (75,0% v primerjavi
16,7%, p
. < 0,05)
Sklepi
H. pylori
izolirati z AB AB genotipa povezana s povečanim tveganjem za raka na želodcu in naselijo v antruma prevladujoči način
Ozadje Helicobacter pylori
okužba povečuje tveganje za nastanek želodčne razjede in adenokarcinomom želodca človeškega želodca [1-3]. H. pylori
upoštevanje želodčnega epitela in zagotavljajo efektorji za sprožanje vnetje [4, 5]. Eden izmed najbolj raziskanih adhezini je zavezujoča krvna skupina antigen adhezin (Baba), ki se veže Lewis b (Leb) in s tem povezanih antigenov ABO [6, 7]. Domnevni adhezin, Babb, ki je kodiran z Babb
, ki deli skoraj identična N- in C-terminalne sekvence z Baba
[7, 8]. V popravljene kromosomske lokacije Baba
in Babb
med sev J99 in 26695 dokazati rekombinacije dogodkov med tema dvema genov [9, 10]. Dva gena kažejo tudi tako geografsko in alelov spremembo [11]. Poleg tega, podvajanje Baba
ali Babb
gen je posredovana s konverzijo genov med različnimi kromosomske loci [12-14]. Bäckström et al
. [14] je pokazala, da se tiho Baba
gen seva Leb-nezavezujoči mogoče aktivirati z rekombinacijo v Babb
gena. Opici Rhesus model, je pokazala, da večina vrniti izolati so zamenjali Baba
z drugo kopijo Babb
po nekaj tednih okužbe [12].
V zahodnih državah, pri bolnikih, okuženih z Baba
-positive H . pylori
izolatov so povezana s povečanim tveganjem za želodčne bolezni ulkusa [15, 16]. Vendar pa je ta povezava ni potrjena pri bolnikih iz vzhodne Azije, in nekaterih drugih zahodnih državah [17-19]. Colbeck et al
. [20] uporablja PCR za ugotavljanje, ali so dolvodno od hpyD
(locus A) in S18
(locus B) Baba
ali Babb
in ugotovila, enotni kolonije izolirati z mešanimi Baba
in Babb
genotip na istem lokusu, kar kaže podpopulacije znotraj populacije bakterij, pridobljenih iz enega samega kolonije. To je vredno odgovoriti, ali bi se lahko genetske profile Baba
in Babb
vezana na različnih rezultatov kliničnih znakov bolezni ali posebne H. pylori
-povezana histološke značilnosti.
Obstajajo različne prevladujejo mobilni vrste v antruma in korpusa. Parietalnih celic, ki proizvajajo HCl poiskati v korpusu in da drugačen pH gradient na antruma. Naša predhodna študija je pokazala, bolniki s kronično H. pylori
okužbe, izražajo višjo intenzivnost Lewis b v želodčni epitela korpusa kot v antruma [17]. Rekombinacija med baba
in Babb
lahko pomagajo H. pylori
, da spremeni svoj oprijem sposobnost prilagajanja različnih niše v želodcu [21]. Zato je vredno, da se določi razdelitev genotip Baba
in Babb
v pylori
okužbe H. več različnih topografskih krajih, bodisi antruma ali korpusa v človeški želodec. V tej študiji smo analizirali klinični pomen Baba
in Babb
genotipov in prisotnost Baba
in Babb
na locus A in B več kolonij iz različnih želodčnih niše razumeti babAB
genetski profil H. pylori
izolatov po želodčnih regijah v istem gostitelju.
Rezultati
Razdelitev Baba in Babb genotipov pri bolnikih z različnimi kliničnimi boleznimi
bil Odkrivanje babAB
genotipov na osnovi modela osnovnim je prikazano na sliki 1. med 92 sevi, je razporeditev štirih genotipov (AB, AB B, A AB AB AB) 46 (50%), 21 (22,8%), 10 (10,9%) in 15 (16,3%) oz. Ni bilo nobene razlike v distribuciji spola med različnimi genotipi (hi-kvadrat test, p
> 0,05). je bila povprečna starost bolnikov, okuženih z genotipom kot AB AB nekoliko starejši od tistih, ki so okužene z drugimi genotipi (57,6 v primerjavi s 50,3 let, preizkus Ločeno vzorca t, p
= 0,09). Razporejenost štirih genotipov pomembno razlikovala pri bolnikih z različnimi kliničnimi boleznimi (tabela 1, hi-kvadrat test, p
= 0,04). Povprečna starost bolnikov GC je bila višja od drugih bolnikov nerakave (58,6 v primerjavi z
49,5 let, test t Independent-vzorec, p
= 0,01). Stopnja genotipa AB AB pri bolnikih z GC je bila višja kot v treh skupinah bolnikov nerakave (40,0% [8/20] vs.
9,7% [7/72], Fisher natančen test, p
< 0,05, razmerje obetov: 6,2; 95% iZ: 1.9-20.3) .table 1 Baba in Babb genotipov H. pylori iz različnih kliničnih skupinah bolnikov
N (%)

DU
(n = 18)
GU
(n = 27)
gastritis
(n = 27)
GC
(n = 20)
Skupaj
(n = 92)
Statistika
p
vrednost
AB
11 (61,1)
14 (51,9)
15 (55,6)
6 (30)
46 (50)
0,039
AB B
6 (33,3)
4 (14,8)
7 (25,9)
4 (20)
21 (22,8)
AB
0 (0)
4 (14,8)
4 (14,8)
2 (10)
10 (10,9)
AB AB
1 (5.6)
5 (18,5)
1 (3.7)
8 (40)
15 (16,3 )
DU: razjeda na dvanajstniku. GU: želodčni ulkus. GC: rak želodca. Razlika med štirimi genotipi v želodčnih bolezni je ocenil hi-kvadrat testom.
Kot AB AB genotipa je bila večja pri bolnikih z rakom želodca, smo dodatno testirali, ali lahko takšna genotip vodi k višji stopnji predrakave spremembe ali hujši histološko vnetje. Pri bolnikih z GC, je AB AB genotip povezan z višjo intenzivnostjo intestinalno metaplazijo (IM) v antruma primerjavi z ne-AB AB genotipa (2,0 vs.
0,27, p
= 0,02). Pri bolnikih, ki niso raka, AB AB genotip ni bila povezana z višjo akutnih točk vnetje (vsota antruma, korpus in Kardije: 3,43 vs.
2,94, p
> 0,05), kronično vnetje rezultati (vsota antruma, korpusa in Kardije: 7.29 vs.
7.22, p
> 0,05), H. pylori
gostota (vsota antruma, korpus in Kardije: 8.14 vs.
8,84 , p
> 0,05), ali intenzivnost IM (0,43 vs.
0,51, p
>. 0,05) v primerjavi z ne-AB AB genotipa
Razlika v Baba in Babb genotip med izolati iz antruma in corpus
za 19 bolnikov, ki so predvideni izolatov iz različnih želodčnih niše nad antruma in korpusa, sestavo genotipa Baba
in Babb
na locus A in B njihove antruma in corpus izolatov je prikazano v tabeli 2. Štiri bolnikov (št. 7, 12, 29, 30) so bile okužene z AB genotipa seva preko antruma in korpusa, in ugotovljeno je bilo 15 pacienti imajo mešane seve genotipa (AB B, a AB ali AB AB) le korpusa, ali oba želodčnih niše. V teh 15 bolnikih, 3 bolniki (št. 28, 2, 4) je bilo isti mešani genotipe vsej antrum in korpusa. Osem preostalih 12 bolnikov je imelo eno veliko genotip prek obeh želodca niše. Kombiniranje s 7 bolnikov (št. 7, 12, 29, 30, 28, 2, 4), s samo enim genotipom, 78,9% (15/19) naših bolnikov je eden glavnih genotip porazdeljeni po dveh niches.Table 2 genotipom sestavki antruma in corpus H. pylori izolira od 19 bolnikov
zadevi št
babAB
genotipa izolatov
majorja babAB
genotipa čez antruma & corpus
Dominant genotip v antruma /corpus
AB ali AB AB kot prevladujoči genotipa 12 bolnikov, okuženih z več kot enim genotipom
antruma (n)

korpus (n)

antruma
corpus
7
AB (4)
AB (4)
AB
AB /AB
x
x
12
AB (4)
AB (4)
AB
AB /AB
x
x
29
AB (4)
AB (4)
AB
AB /AB
x
x
30
AB (4 )
AB (4)
AB
AB /AB
x
x
28
AB (4)
AB (4)
AB
A AB /A AB
x
x
2
AB AB (4)
AB AB (4)
AB AB
AB AB /AB AB
x
x
4
AB AB (4)
AB AB (4)
AB AB
AB AB /AB AB
x
x
1
AB AB (3)
AB AB (2)
AB AB
AB AB /-
+ -
AB B (1)
AB B (2)
3
AB B (3)
AB B (4)
AB B
AB B /AB B -
-
AB (1)
6
AB AB (3)
AB (1)
AB AB (4)
AB AB
AB AB /AB AB
+
+
10
AB AB (3)
AB B (4) -
AB AB /AB B
+ -
AB B (1)
19
AB (3)
AB (3)
AB
AB /-
+ -
AB (4)
21
AB (4)
AB (3)
AB
AB /AB
+
+
AB B (1)
25
AB (4)
AB (1) -
AB /AB B
+ -
AB B (3)
14
AB (4)
AB (2 )
AB
AB /-
+ -
AB B (2)
AB B (2) AB AB (2)
24
AB (3 )
AB (1) -
AB /-
+ -
AB (1)
AB B (1)
A AB (2)
27
AB (3)
AB (1)
AB
AB /A AB
- -
AB AB (1)
A AB (3)
11
AB (4)
AB (2) -
AB /-
+ -
AB B (1 )
AB AB (3)
AB AB (2)
17
AB (3)
AB (3)
AB
- /-
-
-
AB B (3)
AB (1)
A AB (2)
AB AB (2)
bolnik št. 1, 3, 6, 19 in 21, ki so bili okuženi z 2 genotipov, še vedno velik eno preko obeh želodčnih niše, in da je prav tako velja 2 (št. 14, 27), pri bolnikih, ki imajo 3 in 1 (št. 17) pacienta s 4 genotipov predstavljeni v svojih okužb. - Kaže, da imajo bolniki, ki niso prevladujoči Baba
in Babb
genotip v izolatov antruma ali korpusa. Število bolnikov je bilo po naši prejšnji raziskavi [22].
Med temi 12 bolnikov, okuženih z več kot enim genotipom (tabela 2), pogostost večjih prevladujočega genotip, AB v kombinaciji z AB AB, v je antruma višji v primerjavi s tisto v korpusu (75% [9/12] vs.
16,2% [2/12], str
= 0.012, odds ratio: 15). Vendar, 6 od 12 bolnikov manjkalo prevladujoč genotip v njihovem korpusu izolatov.
Sekvenčna analiza in primerjava
Na procesnega A vsakega pacienta antruma in corpus izolira imeli specifične substitucije aminokislin v regiji Baba (slika 2 in tabela 3). Vendar pa ni bilo očitne razlike med antruma in corpus izolira v zaporedja regiji, razen iz št pacientov. 27 (aminokislina 134 in 198). Našli smo tudi 5 različnih nonsynonymous substitucije na aminokislini 161 v izolatov 6 pacientov v primerjavi s sevom J99. Isti scenarij (zaporedje specifičnost sevov posameznih pacientov, ne pa med antruma in korpusa izolatov), ​​je bil v Babb
sekvenc. Slika 1 PCR upogibanje vzorce babAB genotipov. (A) Primer parov, ki se uporabljajo za odkrivanje genov v locus A in B. Terminske primerji, HypDF1 in S18F1, ki se nahaja na nabavnem regije Baba
ali Babb
, so seznanjene z BabAR1 ali BabBR1 primerji, da ugotovi, ali je gen na locus A in B je Baba
ali Babb
. (B) PCR upogibanje vzorce genotip A, B, AB B, A AB AB AB. Genotip AB B pokazala dva bakterijskih populacij na enotnem naselju izolira, dominantna kot Baba
in manjši kot Babb
na locus A. seva z AB genotipom predstavljala prevladujoč prebivalcev Babb in mladoletnika populacija baba
na locus B. kombinacija AB B in A AB je bil opredeljen kot AB AB genotip. Lane M1, 100 bp molekulsko dvojno podajo; lane M2, l HindIII dvojno podajo. Velikost produktov PCR na locus A in B je bil 2.1-2.6 kb in 1.0-1.5 kb, oz.
Tabela 3 aminokislinskih substitucij v Baba Baba kodirani na lokusu A
lokacijo amino kisline substitucije
Case No.
6
9
37
92
131
134
136
161
165
166
198
202
204
206
212
218
25
L
T

N
N
K
T
R
Y
G
N
S
T
T
E
S
27
L


N
N
T, K
T
A
D
G
N, K
S
T
T
Q
P
2
L
A
S
S
N
E
T
K
Y
S
N
S
T
T
E
S
24
L


N
N
K
sem
T
Y
G
N
E
S
T
E
D
6
L


N
H
Q
T
P
Y
G
N
N
T
T

S
26
F
A
A
N
N
K
T
S
Y
G
N
S
N

E
s
CT ponovitev Baba in Babb na lokusu B
genov v locus B ureja CT ponovi v 5 'kodiranje regijo, in število CT ponavlja (5, 8 in 11), da v slikah beljakovin izražanje možni [12, 20]. CT ponovitve na Babb
gena na locus B so prikazani v tabeli 4. Korpus izolatov pri 7 od 12 bolnikov je imelo spremembo CT ponovitev v Babb
gena na locus B in antruma izolira od teh bolnikov vedno enake CT ponovi, razen bolnik 17 (tabela 4) .table 4 število CT ponavlja v 5 'kodiranje regijo Babb na locus B
Primer št
antruma izolatov (n = 2)
(CT ponovitev številka)
Corpus izolatov (n = 2)
(CT ponovitev številka)
Skladnost
Sprememba CT ponovi v corpus
2
8, 8
8, 8
+ -
12
8, 8
8, 8
+
-
24
7, 7
7, 7
+ -
30
11, 11
11, 11
+
-
1
8, 8
7, 10 -
+
11
8, 8
7, 9 -
+
26
8, 8
8, 9 -
+
6
9, 9
9, 12 -
+
21
7, 7
9, 10 -
+
27
9, 9
9, 8 -
+
14
8, 8
7, 7 -
-
17
7, 10
8, 7 -
+
Štirje bolniki (št. 2, 12, 24, 30) so bile okužene z izolatov z ene vrste CT ponovitev (7, 8 in 11) preko antruma in korpusa, vendar je le ena od njiju (št. 24) je imela zunaj okvirja Babb
. V drugih pacientov (št. 1, 11 in 26), izolatov njihova antruma vsebovala 8 CT ponovi vendar korpus izolatov spremenilo do 7, 9 ali 10 ponovitev. Za bolnike (št. 6, 21 in 27), ki so bile okužene z antruma izolatov s 7 ali 9 CT ponavlja, njihova korpus izolatov imel tudi spremembo CT ponovi, vendar se je število CT ponovitev je še vedno zunaj okvirja (9 , 10 in 12), razen v enem izolata iz Noben bolnik. 27 (CT ponavlja = 8).
Genotipa in Baba izraz
Za določitev vpliva Baba
na locus A in B na Baba izražanja (slika 3A), smo ugotovili, da je Baba
na lokusu B ni bistveno vplivalo na raven Baba izražanja, v primerjavi z izolatov 19C3 (A AB) in 19C1 (AB). Vsi izolati (26A1, A4, C2 in C3) je imel A AB genotip, vendar CT ponovitev Baba
na procesno B C2 je iz okvirja. Izraz Baba ni vplivala ali je Baba
na locus B v ali izven okvirja. Mi še ugotoviti, ali bi bila mešana genotip na locus A vpliva Baba izraz, in ugotovila, 14C2 in 14C3 z genotipom AB B (Baba /Hsp60 razmerje: 0,76 in 0,70), je imela nekoliko nižji izraz kot 14A2 in 14A4 z AB genotipom (Baba /razmerje hsp60: 0,90 in 0,87, slika 3B). AB AB genotip so imeli tudi nižjo Baba izraz od A B (Baba /Hsp60 razmerje: 1,09 in 0,89, slika 3C). Slika 2 Baba sekvenc na procesnega A antruma in korpusa izolatov. Kardinalno število kažejo izolatov različnih bolnikov. A1-4 in 1.4 je bilo eno samo kolonijo izolirati izoliran iz antruma in korpusa oz. Bela poudarjanje kaže aminokisline, ki se razlikujejo od konsenza.
Pogovor
pojava intragenomskih rekombinacije med Baba
in Babb
je bilo dokazano v in vitro
in vivo
poskusih, implicating to mehanizem lahko morebiti pomaga H. pylori
prilagoditi v človeškem želodcu [12, 14]. Poleg tega so mešani genotipi Baba
in Babb
na locus A ali B, je bilo dokazano, [20]. Klinični združenje Baba
in Babb
genotipa H. pylori
sevov in genskega profila s okužb antruma in korpusa enim gostiteljem še vedno nejasna. V tej študiji smo dokazali, da AB AB genotip, ena dominantna genotip v antruma, je bil povezan s predrakave lezije kot IM, in povezana z rakom želodca. Vendar H. pylori
okužbe s takim AB AB genotipa je ne vodi v bolj gosto kolonizacije ali vnetje težo v želodcu histologijo. Naši podatki kažejo, H. pylori Baba
in Babb
genotipov kot AB AB naj bi vsaj izvajati z boljšim prilagajanjem na želodčno okolje med rakotvornost.
Colbeck et al
. [20] je dalo 9 genotipov (A, B, AB B, A AB, A, B, B, B A, B, C, C B in B AB) v svoji študiji. Kljub temu pa je naša raziskava je pokazala, le štiri genotipe (A B, A AB, AB B in AB AB) v 168 izolatov iz antruma in korpusa (tabela 2), 19 bolnikov. To pomeni, genotip raznolikost babAB
v tajvanskih izolatov bi bilo očitno manj zaplete. Poleg tega vsaj enega Baba
gena na locus A obstajala v vsakem od izolatov. Ta ugotovitev je v skladu z našim predhodnim poročilom, da razkrije tajvanski H. pylori
izolatov so skoraj 100% Baba
-positive [17], in podporo bolj razširjena Baba
v H. pylori
sevov iz vzhodnoazijskih držav, razen tistih iz zahodnih svetov [23]. Poleg tega, Matteo et al
. [24] je pokazala, da je 9 od 34 bolnikov (26,5%) BAB spremembo
genski čez antruma in korpusa enim gostiteljem na določeni časovni točki. Ugotovili smo, da 12 od 19 bolnikov (63,2%), z več kot enim genotipom okuženih na enega ali obeh želodca niše. Razširjenost razlika med dvema študij lahko posledica analize Bab
genotipa iz bakterijske bazenu ali single-kolonije izolata.
Analiza sekvenc Baba
in Babb
je pokazala, da nonsynonymous menjav v aminokisline pojavila med posameznimi sevi (slika 2, tabela 3 in podatki niso prikazani), ki pa ni razlikovala med želodca niše. Pride et al
. [11] je pokazala tudi visok alelov različnost znotraj Baba
in Babb
in sevov iz različnih bolnikov. Sodeč po 6 različnih nonsynonymous zamenjave za v sevov 6 pacientov aminokisline 161, je bila, da kodon zelo spremenljiva mesto. To je vredno nadaljnje preiskave, ker je lahko posebno mesto odgovornost za prilagajanje na razlike v posameznih želodcev.
CT ponavlja v 5 'kodiranje območje Baba
in Babb
se bolj pogosto pojavljajo na procesno B kot procesno A [20]. Ugotovili smo, da izolatov imel korpus večjo pogostost sprememb v številu CT ponovitev Babb
na procesno B kot pa antruma izolatov (tabela 4). Med temi 7 bolnikih, okuženih z korpusa izolatov s spremembo CT ponavlja, le en (bolnika št. 27) je imel izolat spreminjajoče CT ponavlja, da v slikah (CT = 8) (tabela 4). Ti podatki kažejo, da bi se Babb izraz strogo nadzorovani s spremembo faze zaradi zunaj okvirja ponovitev v korpusu. Med 12 bolnikih, okuženih z izolatov z več kot enim genotipom, njihovih izolatov iz antruma imajo višjo stopnjo AB in AB AB, kot je prevladujoče genotipov kot korpusa (9/12 vs.
2/12, str
< 0,05 ). Poleg tega je polovica teh bolnikov ni imel prevladujoč genotip v njihovo corpus izolatov. Ti rezultati kažejo, okolje, v korpusu lahko vzpodbudi drugačno prilagoditev za izolatov z različnimi H. pylori
genske raznolikosti.
Prisotnost AB AB genotipa bila večja pri bolnikih GC s starostjo (tabela 1). Poleg tega je AB AB genotip ni povezan s težjo vnetja ali predrakavih sprememb pri bolnikih, ki niso rakom. Na podlagi te presečni klinični histoloških podatkov predlaga, seve AB AB ima lahko boljše prilagajanje rakavi okolje v želodcu, namesto da vodijo v še večje toksičnosti v želodcu rakotvornost. Na sliki 3A, bomo pokazali, da lahko Baba
gena na rastišče pretežno določa Baba izraz, in mešani genotip kot AB na locus A zmanjšanje Baba izraz (slika 3B in 3C). Tako je mogoče mešani genotip kot AB na locus A lahko H. pylori
izolatov vsebovati podskupini bolnikov izgubi Baba izraz. Druga možnost je, lahko mešani genotip kot AB na locus B Morda omogočajo H. pylori
spremeniti Babb izražanja in s tem zasluži dodatne študije.
Poleg tega so naši prejšnji podatki pokazali, da b, intenzivnost Lewis postal zmanjšala antruma atrofija, vendar se lahko hranijo v korpusu posredovati v večjo kolonizacijo bug overthere [17]. Torej, mora biti tudi implicative preveriti, ali ima lahko AB AB genotip pretežno v antruma prednost, da se prilagodi želodčne epitelij s šibkim Lewis b izražanja v prihodnosti.
Sklepi
H. pylori
izolata Baba
and Babb
genotip kot AB AB genotipa povezana s povečanim tveganjem za raka želodca in naselijo v antruma prevladujoči način. Takšna AB AB genotip je povezana z boljšim prilagajanjem želodčni predrakavih ali raka na okolje, in morda ustvari podpopulacije izgubili Baba ali Babb.
Metode
Bolniki in bakterijska
izolatov skupno 92 H. pylori
sevi smo kultivirali iz biopsijo vzorcih pacientov z različnimi kliničnimi boleznimi, kot dvanajstnika (DU, n = 18), želodcu (GU, n = 27), gastritis (n = 27) ali rak želodca (GCA, n = 20), ki je opredeljena z endoskopijo z histološke potrditve. Vsi bolniki je dal privolitev in bile predmet panendoscopy v našem zavodu. Med panendoscopy za vsakega bolnika, smo pridobili pet bitov želodca biopsijo, vključno z 2 iz antruma, 2 iz korpusa, in 1 iz Kardije. Bakterijska kultura in histološki pregled so bile uporabljene kot prejšnjega člena [17]. Ta študija je bila odobrena s "Human Experiment in Odbor za etiko National Cheng Kung University Hospital" (št HR-98-023).
Enotni kolonije izolatov iz antruma in corpus smo naključno izbrali iz primarne kulture plošče. Za vsako mesto je bilo vsaj 3-4 single-kolonije izolatov naključno izbrana za določitev babAB
genotip. Colony kultura za ekstrakcijo DNK je manj kot 8 prehode za zmanjšanje možnosti za genetske variacije in vitro. Vsaka od 19 bolnikov, okuženih v antruma in korpusa, ki ga izolatov z enako RAPD povezovanje vzorec je bilo prej opisano [22].
Dokaz Baba in Babb genotipov
odkrivanje Baba
in Babb
genotipov temelji na metodi Colbeck sod
[20]. HypDF1-BabAR1 in HypDF1-BabBR1 primerja uporabimo za ugotavljanje, ali je gen na locus A Baba
ali Babb
. Na enak način so bili uporabljeni S18F1-BabAR1 in S18F1-BabBR1 primerji, da se ugotovi, ali je gen na locus B Baba
ali Babb
(slika 1A). 40 ciklov pomnoževanja reakcije smo izvedli z 20 pmoles s primerjem, 0,15 mM vsakega deoksinukleozid trifosfat, reakcijski pufer s MgCl 2 in 1 U Taq DNA polimeraze (New England Biolabs, Beverly, MA, USA) v končnem volumnu 50 ul. Pogoji za toplotnim ciklom so bili prej [20] opisano. Vsak ojačeno produkt (20 ul) smo analizirali na 1% agaroznem gelu, obarvanem z etidijevim bromidom. Slika 3 baba na rastišče pretežno določena Baba izraz. (A) Učinek Baba
na locus B na Baba
expression.The izolira (19C3) je imela Baba
na locus A in-frame CT ponovitev Baba
na locus B, ki so bile v primerjavi s izolata le ob Baba
na locus A (19C1). Prisotnost Baba
na locus A in B je bil v izolatov 26A1, A4, C2 in C3, vendar C2 imel zunaj okvirja Baba
na locus B (B) Vpliv mešanih genotipa na rastišče na Baba
izraz. Izolati iz enega bolnika (št. 14) je imela mešano genotip na locus A (14C2 in C3), ki je bila v primerjavi s tistimi, ki Baba
le na procesno A (14A2 in A4). (C) Primerjava Baba
med AB AB in genotipov A B. Hsp60 je bil kot notranji nadzor. Opredelitev
Genotip
je Baba
in Babb
genotip vsake enim kolonije izolata, ki temelji na prejšnjem opisu [20]. J99-kot izolat pokazala pričakovane PCR trakovi Baba
na locus A in Babb
na locus B in je bila opredeljena kot "A genotip B" (slika 1B-a). En kolonije izolat vsebuje tako Baba
in Babb
na istem lokusu je bil opredeljen kot "mešani genotipa" (kot je AB B, A AB in AB AB), kar kaže, da je bilo Podskupine znotraj bakterijske populacije izvira iz enega kolonije. Izolat z genotipom AB B je vseboval eno prebivalstvu Baba
in druga populacija z Babb
na isti locus A (slika 1B-b). A AB genotip zastopali dve bakterijske populacije, prevladujoči eno z Babb
in manjši enega z Baba
na locus B, čeprav je tako izhaja iz samega naselja (slika 1B-c). Mešani genotip odkrita na obeh locus A in B je definiran kot AB AB (slika 1B-d).

• Nenavadna vzrok obstrukcije želodca izstopne: velikan želodca trichobezoar: primer report
• Laparoskopska anterior gastropexy za kronično ponavljajoče se želodčne volvulus: primer report