H. pylori klinické izoláty majú rozdielne rozloženie bababa genotyp cez rôzne topografických miest žalúdka sa korelácia s klinickým ochorením outcomes

H. pylori
klinické izoláty majú rôznorodé bababa
distribúciu genotypov viac rôznych topografických miest žalúdka sa korelácia s klinickými výsledkami chorobných
abstraktné
pozadia
Intragenomic rekombinácie medzi Baba stroje a Babb
sprostredkováva antigénne variácie a môže pomôcť H. pylori
kolonizáciu. Táto štúdia určiť, či je variabilný genotypov Baba stroje a Babb
korelujú s rôznymi klinické výsledky chorôb, a môžu distribuovať v priebehu rôznych žalúdočných výklenky.
Výsledky
štúdie bolo zaradených 92 klinických kmeňov (45 zo žalúdočného vredu , 27 zo žalúdka, a 20 z rakoviny žalúdka) pre detekciu, či je Baba stroje a Babb
sú v lokuse a alebo B podľa PCR reakciou za použitia primerov navrhnutých od vstupného a variabilné oblasti Baba a
Babb
gény. Neboli nájdené štyri genotypy Baba stroje a Babb
(A B, AB B A AB AB AB). Distribúcia genotypov 4 v 92 klinických kmeňov bolo významne odlišné u pacientov s rôznymi chorobami žalúdka (p Hotel &0,05). Izoláty od pacientov s karcinómom žalúdka mali vyššiu mieru AB AB genotypu ako tie z pacientov s non-rakovinou (40,0% vs.
9,7%, p Hotel &0,05). AB AB genotyp bol spojený s vyššou intenzitou črevnej metaplázia (p Hotel &0,05), ale nekoreluje s vyšším zápalom a kolonizácie hustota žalúdočné histológiu (p Hotel &0,05). Okrem toho štúdie bolo zaradených 19 pacientov za účelom overenia, či variabilný genotypy bababa
existovali v rôznych žalúdočných výklenky. U pacientov infikovaných viac než bababa
genotypov ako antra a corpus, boli vyššie miera genotypov ako AB alebo AB, AB v izolátov z antra, než v tých, z korpusu (75,0% vs. 16,7%
, p
. < 0,05)
Závery
H. pylori
izolovať s genotypom AB AB koreluje so zvýšeným rizikom rakoviny žalúdka, a kolonizovať v dutine prevažujúcim spôsobom
pozadí Helicobacter pylori infekcie
zvyšuje riziko vzniku peptických vredov žalúdka a adenokarcinóme ľudského žalúdka [1-3]. H. pylori
lipnutie na žalúdočné epitel a doručovať efektory indukuje zápal [4, 5]. Jeden z najlepšie študovaných Adhesin je viažuci antigén krvná skupina Adhesin (Baba), ktorý sa viaže Lewis b (Leb) a súvisiace ABO antigény [6, 7]. Domnelé Adhesin, Babb, je kódovaný Babb
, ktorý zdieľa takmer identické N- a C-koncové sekvencie s Baba
[7, 8]. Opačné, chromozomálne umiestnenie Baba stroje a Babb
medzi kmeňa J99 a 26695 preukázať rekombinácie medzi týmito dvoma génmi [9, 10]. Tieto dva gény tiež ukazujú zemepisných a alelické variácie [11]. Navyše, ich zdvojenie Baba
alebo Babb
génu je sprostredkovaná génovej konverzie medzi rôznymi chromozomálnych lokusov [12-14]. Backstrom et al
. [14] preukázali, že tichý Baba
génu kmeňa LEB-nezáväzné môže byť aktivovaný rekombináciou do Babb
génu. Opičie modelu opíc ukázali, že väčšina zotavil izoláty boli nahradené Baba
s druhou kópiu Babb
po niekoľkých týždňoch infekcie [12].
V západných krajinách, pacienti infikovaní Baba
-pozitívne H . pylori
izoláty sú spojené so zvýšeným rizikom ochorenia peptickým vredom [15, 16]. Avšak, toto spojenie nie je potvrdené u pacientov z východnej Ázie, alebo niektorých iných západných krajín [17-19]. Colbeck et al
. [20] použili PCR na zistenie, či je po prúde hpyD
(lokus A) a S18
(locus B) sú Baba
alebo Babb stroje a našiel jediné kolónie izolovať so zmiešaným Baba
a Babb
genotyp na rovnakom lokuse, čo ukazuje subpopulácie v rámci bakteriálnej populácie pochádzajúce z jedinej kolónie. Je hoden zodpovedať, či genetické profily Baba stroje a Babb
by mohla súvisieť s rôznym výsledkom klinického ochorenia alebo konkrétny H. pylori
spojené so štúdiom histologické rysy.
Existujú rôzne prevládajúce bunka typy v dutine a korpusu. Parietálnej bunky produkujúce HCl lokalizovať v korpuse a robiť inú pH gradientu k dutine. Naše predchádzajúce štúdie ukázali, pacienti s chronickou H. pylori
infekcie vyjadril vyššiu intenzitu Lewis B v žalúdku epitelu korpusu než v dutine [17]. Rekombinácia medzi baba stroje a Babb
by mohlo pomôcť H. pylori
zmeniť jeho adhézne schopnosť prispôsobiť rôzne výklenky v žalúdku [21]. V dôsledku toho je hoden stanovenie distribúcie genotyp Baba stroje a Babb
v H. pylori
infekcie v priebehu rôznych topografických miestach sú buď dutine alebo korpusu v ľudskom žalúdku. V tejto štúdii sme analyzovali klinický význam Baba stroje a Babb
genotypov a prítomnosť Baba stroje a Babb
na lokus A a B viac kolónií z rôznych žalúdočných výklenky pochopiť bababa
genetický profil H. pylori
izoluje cez žalúdočných regiónov v rámci rovnakého hostiteľa.
výsledky
Rozdeľovanie Baba a Babb genotypy u pacientov s rôznymi klinickými chorobami
Detekcia bababa
genotypov bolo na základe návrhu primérov je znázornené na obrázku 1. Medzi 92 kmeňov, rozdelenie štyroch genotypov (AB, AB B, a AB a AB AB) bol 46 (50%), 21 (22,8%), 10 (10,9%) a 15 (16,3%), v danom poradí. Nebol zistený žiadny rozdiel v rozložení klientov podľa pohlavia medzi jednotlivými genotypmi (Chi-kvadrát test, p Hotel > 0,05). Priemerný vek pacientov infikovaných genotypom ako AB AB bol nepatrne staršie než nakazených s ostatnými genotypom (57,6 vs. 50,3 rokov, t-testu Nezávislý-vzorky, p
= 0,09). Rozvody štyroch genotypov boli významne odlišné u pacientov s rôznymi klinickými ochorenia (tabuľka 1, Chi-kvadrát test, p = 0,04
). Priemerný vek pacientov GC bola vyššia ako u ostatných pacientov non-rakovinou (58,6 vs. 49,5
rokov, Nezávislé vzorka t test, p
= 0,01). Rýchlosť genotypu AB AB u pacientov s GC bola vyššia ako v troch skupinách pacientov bez nádorového ochorenia (40,0% [8/20] vs.
9,7% [7/72], Fisherov presný test, p Hotel < 0,05, pomer šancí: 6,2; 95% CI: 1.9-20.3) .Table 1 Baba a Babb genotypy H. pylori z rôznych klinických skupín pacientov
N (%)

DU
(n = 18)
GU
(n = 27)
Gastritída
(n = 27)
GC
(n = 20)
Celkom
(n = 92)
štatistiky
p
hodnota
AB
11 (61,1)
14 (51,9)
15 (55,6)
6 (30)
46 (50)
0,039
AB B
6 (33,3)
4 (14,8)
7 (25,9)
4 (20)
21 (22,8)
AB NETHRY.cz 0 (0)
4 (14,8)
4 (14,8)
2 (10)
10 (10,9)
AB AB
1 (5,6)
5 (18,5)
1 (3,7)
8 (40)
15 (16,3 )
DU: dvanástnikové vredy. GU: žalúdočný vred. GC: rakovina žalúdka. Rozdiel medzi štyrmi genotypy v žalúdočných ochorení bola hodnotená pomocou Chi-kvadrát testu.
Ako genotypu AB AB bola vyššia u pacientov s rakovinou žalúdka, sme ďalej testovať, či takáto genotyp môže viesť k vyššej miere prekanceróznych zmeny alebo vážnejšie histologické zápalu. U pacientov s GC, AB AB genotyp bolo spojené s vyššou intenzitou črevnej metaplázia (IM) v dutine v porovnaní s non-AB AB genotypom (2,0 vs.
0,27, p
= 0,02). Avšak u pacientov s non-rakovinou, AB AB genotyp nebolo spojené s vyšším skóre akútnych zápalových (súčet dutine, korpus a kardio: 3,43 vs. 2,94
, p Hotel > 0,05), chronický zápal skóre (suma dutine, korpus a kardio: 7,29 vs. 7,22
p Hotel >, 0,05), H. pylori
hustotou (súčet dutine, korpus a kardio: 8,14 vs. 8,84
, p Hotel &0,05), alebo intenzita IM (0,43 vs.
0,51, p Hotel >. 0,05) v porovnaní s non-AB AB genotypom
Rozdiel v Baba a Babb genotyp medzi izolátov z antra a corpus Apartmán v 19 pacientov, ktorí poskytli izoláty z rôznych žalúdočných výklenkov nad antra a corpus, genotypom zloženie Baba stroje a Babb
v locus a a B ich antra a corpus izolátov je uvedené v tabuľke 2. Štyri pacienti (č. 7, 12, 29, 30) boli infikované s genotypom kmeňom AB v celej dutine a korpusu, a zistilo sa, 15 pacientov sa majú zmiešané genotyp kmene (AB B, a AB alebo AB AB) iba v korpuse, alebo obaja žalúdočné výklenky. V týchto 15 pacientov, u 3 pacientov (č. 28, 2, 4) majú rovnaké zmiešané genotypov v celej dutine a korpusu. Osem zvyšných 12 pacientov malo jednu veľkú genotyp cez obe žalúdočných výklenky. Kombinuje s 7 pacientov (č. 7, 12, 29, 30, 28, 2, 4) s iba jedným genotypom, 78,9% (15/19), z našich pacientov malo jeden hlavný genotyp distribuované cez dva niches.Table 2 genotypu prostriedky antra a corpus H. pylori izolátov od 19 pacientov
Prípad č
bababa
genotyp izolátov
spoločností majora bababa
genotypom v celej dutine & corpus
dominantné genotyp v dutine /corpus
AB alebo AB AB ako dominantný genotyp 12 pacientov infikovaných s viac ako jednou genotyp
Antrum (n)
corpus (n)
Antrum
corpus
7
AB (4)
AB (4)
AB
AB /AB
x
x
12
AB (4)
AB (4)
AB
AB /AB
x
x
29
aB (4)
aB (4)
aB
aB /ab
x
x
30
aB (4 )
AB (4)
AB
AB /AB
x
x
28
AB (4)
AB (4)
aB
aB /A aB
x
x
2.
aB aB (4)
aB aB (4)
aB aB
aB aB /ab aB
x
x
4
AB AB (4)
AB AB (4)
AB AB AB AB
/AB AB
x
x
1
AB AB (3)
AB AB (2)
AB AB AB AB
/-
+ -
AB B (1)
AB B (2) Sims 3
AB B (3)
AB B (4)
AB B
AB B /AB B -
- www.Booked.cz AB (1)
6
AB AB (3)
AB (1)
AB AB (4)
AB AB AB AB
/AB AB
+
+
10
AB AB (3)
AB B (4) -
AB AB /AB B
+ -
AB B (1)
19
AB (3)
AB (3)
AB
AB /-
+ -
AB (4)
21
AB (4)
AB (3)
AB
AB /AB
+
+
AB B (1)
25
AB (4)
AB (1) -
AB /AB B
+ -
AB B (3)
14
AB (4)
AB (2 )
AB
AB /-
+ -
AB B (2)
AB B (2) AB AB (2)
24
AB (3 )
AB (1) -
AB /-
+ -
AB (1)
AB B (1)
AB (2)
27
AB (3)
AB (1)
AB
AB /A AB - -
AB AB (1)
A AB (3)
11
AB (4)
AB (2) -
AB /-
+ -
AB B (1 )
AB AB (3)
AB AB (2)
17
AB (3)
AB (3)
AB
- /-
-
-
AB B (3)
AB (1)
AB (2)
AB AB (2)
pacientov nie je. 1, 3, 6, 19 a 21, ktoré boli infikované 2 genotypy, majú stále veľký jeden cez obe žalúdočné výklenky, a to platí aj v 2 (č. 14, 27) u pacientov s 3, a 1 (č. 17) pacienta, ktorý 4 genotypy zastúpené v ich infekcie. - Naznačuje, že pacienti majú non-dominantné Baba stroje a Babb
genotyp v izolátov dutine alebo korpusu. číslo pacienta bola v súlade s našou predchádzajúce štúdie [22].
Medzi týmito 12 pacientov infikovaných s viac ako jedným genotypu (tabuľka 2), na frekvencii hlavné dominantného genotypu, AB v kombinácii s AB AB, v Antra bol vyššia v porovnaní s údajmi v korpuse (75% [9/12] vs.
16,2% [2/12], str
= 0,012, kurzy pomer: 15). Avšak, 6 z 12 pacientov chýbali dominantné genotyp vo svojom korpuse izolátov.
Sekvenčné analýza a porovnanie
V lokus A, Antrum a corpus každého pacienta izoluje mala špecifické substitúcie aminokyselín v oblasti Baba (obrázok 2 a tabuľka 3). Avšak, neexistuje žiadny zrejmý rozdiel medzi antra a corpus izoluje v oblasti sekvenčné, s výnimkou žiadny pacient. 27 (aminokyseliny 134 a 198). Tiež sme zistili, 5 rôznych nonsynonymous substitúcie v aminokyseline 161 v izolátoch 6 pacientov, v porovnaní s kmeňom J99. Rovnaký scenár (sekvencia špecifickosť medzi kmeňmi v jednotlivých pacientov, ale nie medzi antra a corpus izoluje) bol v Babb
sekvencií. Obrázok 1 PCR pruhovanie vzory bababa genotypov. (A) Primer pary používané na detekciu génu v lokuse A a B. forward primery, HypDF1 a S18F1, ktorý sa nachádza v hornej oblasti Baba
alebo Babb
sú spárované s BabAR1 alebo BabBR1 priméry určiť, či gén v lokuse a a B je Baba
alebo Babb
. (B) PCR pruhovanie vzory genotyp A B, AB B A AB a AB AB. AB B genotyp vykazuje dva bakteriálnej populácie v jedinej osade izolovať dominantné ako Baba stroje a menšie ako Babb
v locus A. Kmeň A AB genotypom reprezentoval dominantné populáciu Babb a moll populácie Baba
v locus B. kombinácia AB B a AB bola definovaná ako AB AB genotyp. Lane M1, 100 bp molekulárnej marker; lane M2, l HindIII značky. Veľkosť PCR produktov na lokus A a B bola 2.1-2.6 kb a 1,0-1,5 kb, resp.
Tabuľka 3 substitúcie aminokyselín v kódovanej Baba Baba na miesto aplikuje
umiestnenie amino kyselina substitúcia
Prípad č
6
9
37
92
131
134
136
161
165
166
198
202
204
206
212
218
25
L
T
N
N
K
T
R
Y
G
N
S
T
T
E
S
27
L
N
N
T, K
T
A
D
G
N, K
S
T
T
Q
P
2
L
A
S
S
N
E
T
K
Y
S
N
S
T
T
E
S
24
L
N
N
K
Aj
T
Y
G
N
E
S
T
E
D
6
L
N
H
Q
T
P
Y
G
N
N
T
T
S
26
F
A
N
N
K
T
S
Y
G
N
S
N

E
s
CT opakuje Baba a Babb v locus B
génov u lokuse B sú regulované CT opakuje v 5 'kódujúce región a počet CT opakuje (5, 8 a 11), aby expresie proteínov in-frame možnú [12, 20]. CT repetície Babb
génu v lokuse B sú uvedené v tabuľke 4. Korpus izoluje v 7 z 12 pacientov malo zmenu CT repetície Babb
génu v lokuse B a Antrum izoluje z týchto pacientov vždy rovnaké CT repetície, s výnimkou pacienta 17 (tabuľka 4) .Table 4 Celkový počet CT opakuje v 5 'kódujúci región Babb na lokuse B
Prípad č
antra izolátov (n = 2)
(repeat číslo CT)
Corpus izoláty (n = 2)
(repeat číslo CT)
Zhoda
Zmena CT opakovaní v korpus
2
8, 8
8, 8
+ -
12
8, 8
8, 8
+
-
24
7, 7
7, 7
+ -
30
11, 11
11, 11
+
-
1
8, 8
7, 10 -
+
11
8, 8
7, 9 -
+
26
8, 8
8, 9 -
+
6
9, 9
9, 12 -
+
21
7, 7
9, 10 -
+
27
9, 9
9, 8 -
+
14
8, 8
7, 7 - -
17
7, 10
8, 7 -
+
Štyri pacienti (no. 2, 12, 24, 30) boli infikované izoláty s jedným druhom CT opakovaní (7, 8 a 11) cez antra a korpusu, ale iba jeden z nich (č. 24) mal mimo rámca Babb
, U ostatných pacientov (č. 1, 11 a 26), ich Antrum izoláty obsahoval 8 CT sa opakuje, ale corpus izoláty sa zmenil na 7, 9 alebo 10 opakovaní. Pre pacientov (č. 6, 21 a 27), ktoré boli infikované antra izoluje sa 7 alebo 9 CT opakuje, ich corpus izoláty tiež mal zmenu CT opakuje, ale počet CT opakuje ešte z rámu (9 , 10 a 12), s výnimkou jedného izolátu z žiadneho pacienta. 27 (CT opakuje = 8).
Genotyp a Baba výraz
Pre určenie vplyvu Baba
na lokus A a B na Baba výrazu (obrázok 3A), sme zistili, že Baba
na lokuse B nebola samozrejme vplyv na úroveň expresie Baba, v porovnaní s izolátmi 19C3 (a AB) a 19C1 (AB). Všetky izoláty (26A1, A4, C2 a C3) mal genotyp A AB, ale CT looping Baba
v lokuse B C2 bola z rámu. Expresia Baba nebola ovplyvnená tým, či Baba
na lokuse B bol dovnútra alebo von z rámu. Ďalej určiť, či zmiešané genotyp v lokuse A by mohli ovplyvniť Baba výraz a našiel 14C2 a 14C3 s genotypom AB B (Baba /HSP60 pomer: 0,76 a 0,70) mal mierne nižší expresiu ako 14A2 a 14A4 s genotypom AB (Baba /hsp60 pomer: 0,90 a 0,87, obrázok 3B). AB AB genotyp tiež mali nižšie Baba výraz ako B (Baba /HSP60 pomer: 1,09 a 0,89, obrázok 3C). Obrázok 2 BABA sekvencie v locus A antra a corpus izoluje. Kardinálne čísla označujú izoláty rôznych pacientov. A1-4 a C1-4 boli jediné kolónie izolovať izolovaný z antra a korpusu, v danom poradí. Biela zvýraznenie označuje aminokyseliny odlišné od konsenzu.
Diskusiu
Výskyt intragenomic rekombinácie medzi Baba stroje a Babb
bolo preukázané v in vitro stroje a in vivo experimenty
, zapletať toto mechanizmus môže prípadne pomôcť H. pylori
prispôsobiť v ľudskom žalúdku [12, 14]. Okrem toho zmiešané genotypy Baba stroje a Babb
na lokus A alebo B bolo preukázané, [20]. Klinický združenia Baba stroje a Babb
genotypu kmeňov H. pylori stroje a genetického profilu s infekciou antra a corpus jedného hostiteľa sú stále nejasné. V tejto štúdii sme preukázali, že AB AB genotyp, jeden dominantný genotyp v dutine, bola spojená s prekanceróznych lézie IM a v korelácii s rakovinou žalúdka. Avšak, H. pylori infekcie
taký AB AB genotypu neviedol do hustejšieho kolonizačné alebo zápalom žalúdočnej tiaže v histológii. Naše dáta ukazujú, H. pylori Baba stroje a Babb
genotypy ako AB AB mala prinajmenšom vyvinúť lepšiu adaptáciu na prostredie žalúdka počas karcinogenézy.
Colbeck et al
. [20] nájdených 9 genotypov (A B, AB B, A AB, A, B B, B A, B, C, C B a B AB) vo svojej štúdii. Avšak, naša štúdia zistila iba štyri genotypy (B, A AB, AB B a AB AB) v 168 izolátov z dutine 19 pacientov a korpusu (tabuľka 2). Znamená to, že genotyp rozmanitosť bababa
v Taiwane izolátov by mohlo byť zrejme menej komplikovať. Okrem toho, aspoň jeden gén Baba
na lokus A existoval v každej z izolátov. Tento nález je v súlade s našou predchádzajúcej správe odhaliť taiwanský H. pylori
izolátov takmer 100% Baba
-pozitívne [17], a podporovať vyššiu prevalenciu Baba
v H. pylori
kmene z východoázijských krajinách než tie zo západných svetov [23]. Okrem toho Matteo et al
. [24] preukázali, že 9 z 34 pacientov (26,5%) malo Bab
génovou variantu v celej dutine a korpusu z jedného hostiteľa v určitom časovom okamihu. Zistili sme, že 12 z 19 pacientov (63,2%) infikovaných viac než jedným genotypom buď v jednej alebo oboch žalúdočné výklenky. Prevalencia rozpor medzi dve štúdie by mohlo byť spôsobené analýzy bab
genotypu z bakteriálneho bazéna alebo single-kolónií izolátov.
Analýza sekvencií Baba stroje a Babb
ukázalo, že nonsynonymous substitúciou aminokyseliny došlo medzi jednotlivými kmeňmi (obrázok 2, tabuľka 3 a dáta nie sú ukázaná), ale nelíšila medzi žalúdočných výklenky. Pride et al
. [11] tiež ukázal vysokú alelickou variabilitu v rámci jedného Baba stroje a Babb
v kmeňoch z rôznych pacientov. Súdiac podľa 6 rôznych nonsynonymous substitúciou aminokyseliny 161 v kmeňoch zo 6 pacientov, že Kodona bol vysoko variabilné miesto. To stojí za ďalšie vyšetrovanie, ako to môže byť zvláštne miesto zodpovedný za prispôsobenie sa rozdiely v jednotlivých žalúdkoch.
CT opakuje v 5 'kódujúce oblasti Baba stroje a Babb
sú viac bežne vyskytujú v lokuse B než locus A [20]. Zistili sme, že korpus izoláty mala vyššiu frekvenciu zmien v počte opakovaní CT Babb
na lokuse B ako antra izolátov (tabuľka 4). Medzi týmito 7 pacientov nakazených korpusu izolátmi so zmenou CT opakuje, iba jeden (pacient č. 27) mal izolát meniace CT opakuje v čítacom rámci (CT = 8) (tabuľka 4). Tieto údaje naznačujú, že Babb expresia by mohla byť prísne kontrolovaná fázovým zmenám v dôsledku mimo rámca repetíciami v korpuse. Z 12 pacientov infikovaných izoláty s viac ako jedným genotypu ich izoláty z antra majú vyššiu mieru AB a AB AB, ako je dominantný genotypov než korpusu (9/12 verzus
2/12, p Hotel < 0,05 ). Okrem toho, polovica z týchto pacientov postrádal dominantné genotyp vo svojom korpuse izolátov. Tieto výsledky naznačujú, že prostredie v korpuse môže uprednostňovať odlišný prispôsobenie pre izolátov s rôznymi H. pylori
genetickej diverzity.
Prítomnosť genotypu AB AB bola vyššia u pacientov s GC staršom veku (tabuľka 1). Okrem toho, AB AB genotyp nie je v korelácii s ťažším zápalom alebo prekancerózne zmeny u pacientov s non-rakovinou. Na tejto prierezovej klinických histologické dát na základe toho vyplýva, že kmene AB AB, môže mať lepšie adaptácie na nádorové prostredie v žalúdku, namiesto toho, vedúce do väčšej toxicity v žalúdočnej karcinogenéze. Na obrázku 3A, ukazujeme, že Baba
génu v lokuse dominantne určuje Baba expresiu, a zmiešaný genotyp ako AB na lokus A môže znížiť Baba expresie (obrázok 3B a 3C). Je teda možné, zmiešaný genotyp ako AB na lokus A môže H. pylori
izoláty obsahovať subpopulácie straty Baba výraz. Alternatívne, zmiešaný genotyp ako AB v lokuse B môže prípadne umožniť H. pylori
zmeniť Babb expresiu, a tak si zaslúži ďalšie štúdium.
Okrem toho sú naše predchádzajúce dáta ukazujú, že intenzita Lewis b o stať znížená antra atrofia, ale môže byť zachované v korpuse sprostredkovať vyššej kolonizáciu chyby overthere [17]. Takže, musí byť tiež implicative otestovať, či AB AB genotyp prevažne v dutine môžu mať výhodu na prispôsobenie žalúdočné epitel so slabou Lewis b prejavu v budúcnosti.
Závery
H. pylori
izolovať s Baba stroje a Babb
genotyp ako AB AB genotypu koreluje so zvýšeným rizikom rakoviny žalúdka, a kolonizovať v dutine prevládajúcim spôsobom. Taký AB AB genotyp musí byť spojená s lepšiu adaptáciu na žalúdočné prekancerózne alebo rakoviny životného prostredia, a prípadne vytvárať subpopulácie stráca Baba alebo Babb.
Metódy
pacientov a bakteriálnych izolátov
celkom 92 H. pylori
kmene boli kultivované z biopsiou pacientov s rôznymi klinickými ochorení, ako sú vredu dvanástnika (DU, n = 18), žalúdočný vred (GU, n = 27), gastritída (n = 27), alebo rakovina žalúdka (GCA, n = 20), ktoré sú definované endoskopicky s histologického overenia. Všetci pacienti dali informovaný súhlas a podstúpil panendoscopy v našom ústave. Počas panendoscopy pre každého pacienta, boli získané päť bitov žalúdočné biopsia, vrátane 2 z antra, 2 z korpusu a 1 z Cardia. Bakteriálna kultúra a histologické vyšetrenie boli použité ako v predchádzajúcom článku [17]. Táto štúdia bola schválená "Human Experiment a etickej komisii Národný univerzitnej nemocnice Cheng Kung '(č HR-98-023).
Single-kolónie izoláty z antra a corpus boli náhodne vybral z kultivačných doštičiek primárnych. Pre každé miesto, aspoň 3-4 single-kolónie izoláty boli náhodne vybraných cieľom určiť, či bababa
genotyp. Kolónie kultúra pre extrakciu DNA bola menej ako 8 priechody, aby sa znížila možnosť genetickej variability in vitro. Každý z 19 pacientov infikovaných v dutine a corpus tým, izoláty s rovnakým RAPD prúžkov bolo opísané skôr [22].
Detekcia Baba a Babb genotypy
detekciu Baba stroje a Babb
genotypy bol založený na metóde Colbeck et al
[20]. HypDF1-BabAR1 a HypDF1-BabBR1 priméry boli použité na určenie, či gén v lokuse A bol Baba
alebo Babb
. Rovnakým spôsobom, S18F1-BabAR1 a S18F1-BabBR1 priméry boli použité na určenie, či je gén v lokuse B bol Baba
alebo Babb
(obrázok 1A). Na 40 cyklov amplifikačnej reakcie boli vykonané s 20 pmol priméru, 0,15 mM každého deoxynukleosidtrifosfátu, reakčného pufra s MgCl 2 a 1 U Taq DNA polymerázy (New England Biolabs, Beverly, MA, USA) v konečnom objeme 50 ul. Podmienky tepelné cykly boli popísané skôr [20]. Každý zosilnený produkt (20 ul) bol analyzovaný na 1% agarózovom géli farbeného Ethidium bromidom. Obrázok 3 baba na miesto aplikuje dominantne určená Baba výraz. (A) Vplyv Baba
v lokuse B na Baba
expression.The izolovať (19C3) mala Baba
v locus A a in-frame CT opakovanie Baba
na lokuse B, ktoré boli v porovnaní s izolovať iba s Baba
v locus A (19C1). Prítomnosť Baba
v locus A a B bola v izolátov 26A1, A4, C2 a C3, ale C2 mal mimo rámec Baba
na locus B. (B) Vplyv zmiešané genotypu na miesto aplikuje na baba
výraz. Izoláty z jedného pacienta (č. 14), mal zmiešaný genotyp v lokuse A (14C2 a C3), ktorý bol v porovnaní s tými, ktoré sa Baba
len na lokus A (14A2 a A4). (C) Porovnanie Baba
medzi AB AB a A genotypov B. Hsp60 bol ako vnútorná kontrola. Definícia
Genotyp
Baba stroje a Babb
genotyp každého single-kolónie izolovať vychádzalo z vyššie uvedeného popisu [20]. J99-ako izolát obsahuje očakávaný PCR pásy Baba
na lokus A a Babb
na lokuse B a bol definovaný ako "A B genotypu" (obrázok 1B-A). Jeden izolát kolónie obsahujúce ako Baba stroje a Babb
na rovnakom lokuse bola definovaná ako "zmiešaný genotypu" (ako je AB B, A AB, AB a AB), čo naznačuje, že bolo v rámci subpopulácie bakteriálnej populácie odvodený z jedinej kolónie. Izolát s genotypom AB B obsahoval jeden populáciu Baba stroje a druhej populácie s Babb
na rovnakom lokuse A (obrázok 1B-b). A AB genotyp zastúpené dve bakteriálne populácie, dominantný jeden s Babb
a menšie jeden s Baba
v lokuse B, hoci obaja pochádzali z jedinej kolónie (obr 1B-C). Zmesový genotyp detekované ako na lokus A a B bola definovaná ako AB AB (Obrázok 1B-d).

• Neobvyklá príčina žalúdočné obštrukcie: obrie žalúdočné trichobezoárov: kazuistika
• Laparoskopická predné gastropexy pre chronické recidivujúce žalúdočné volvulus: kazuistika