H. pylori aislamientos clínicos tienen diversas distribuciones genotípicas Babab más diferentes sitios topográficas del estómago con relación a la enfermedad clínica outcomes

H. pylori
aislados clínicos tienen diversa Babab
genotipo distribuciones más diferentes sitios topográficas del estómago con correlación con los resultados clínicos de la enfermedad Resumen Antecedentes


intragenomic recombinación entre babA Opiniones y babB
media variaciones antigénicas y puede ayudar a H. pylori
colonización. Este estudio determinó si los genotipos variables sobre Baba Restaurant and babB
se correlacionan con diferentes resultados clínicos de la enfermedad, y pueden distribuir en los diferentes nichos gástricos.
Resultados
este estudio incluyeron 92 cepas clínicas (45 por úlcera péptica , 27 de gastritis, y 20 de cáncer gástrico) para detectar si el babA
y babB ¿Cuáles son en el locus a o B por las reacciones de PCR usando los cebadores diseñados a partir de la región aguas arriba y variable de la babA
y babB
genes. Se encontraron cuatro genotipos sobre Baba Restaurant and babB gratis (A B, AB B, A AB, AB AB). La distribución de los 4 genotipos en 92 cepas clínicas fue significativamente diferente entre los pacientes con diferentes enfermedades gástricas (p
< 0,05). Los aislados de pacientes con cáncer gástrico tuvieron una mayor tasa de AB AB genotipo que los de pacientes sin cáncer (40,0% vs.
9,7%, p
< 0,05). El genotipo AB AB se asoció con una mayor intensidad de metaplasia intestinal (p
< 0,05), pero no se correlacionó con una mayor densidad de la inflamación y la colonización en la histología gástrica (p
> 0,05). Además, el estudio incluyó a 19 pacientes para verificar si los genotipos variables de Babab
existían en los diferentes nichos gástricos. Entre los pacientes infectados con más de un Babab
genotipos más de antro y cuerpo, había una mayor tasa de genotipos como AB o AB AB en los aislados de antro que en los de corpus (75,0% vs. 16,7%
, p
. < 0,05) Conclusiones
Francia el H. pylori
aíslan con el genotipo AB AB se correlaciona con un mayor riesgo de cáncer gástrico, y colonizar de manera predominante antro
Antecedentes Helicobacter pylori
infección aumenta el riesgo de úlceras pépticas y adenocarcinoma gástrico del estómago humano [1-3]. H. pylori
adhesión al epitelio gástrico y entregar efectores para inducir la inflamación [4, 5]. Una de las adhesinas mejor estudiados es la adhesina de unión a antígeno del grupo sanguíneo (Baba), que se une Lewis b (Leb) y antígenos ABO relacionadas [6, 7]. adhesina putativo, Babb, es codificada por babB
, que comparte secuencias N- casi idénticos y C-terminal con Baba
[7, 8]. Las localizaciones cromosómicas invertidas sobre Baba Restaurant and babB
entre la cepa J99 y 26695 prueban los eventos de recombinación entre estos dos genes [9, 10]. Los dos genes también muestran tanto geográfica como la variación alélica [11]. Por otra parte, la duplicación del bizcocho borracho
o babB
génica está mediada por la conversión de genes entre los diferentes loci cromosómicos [12-14]. Bäckström et al
. [14] demostraron que el silencio babA
gen de una cepa Leb-no vinculante puede ser activado por recombinación en la babB
gen. El modelo de mono rhesus demostró que la mayoría se recuperaron los aislamientos han reemplazado babA
con una segunda copia de babB
después de varias semanas de la infección [12].
En los países occidentales, los pacientes infectados con Baba
-positivo H . pylori
aislamientos están asociados con un mayor riesgo de enfermedades de úlceras pépticas [15, 16]. Sin embargo, esta asociación no se confirma en los pacientes de la región de Asia del Este, o algunos otros países occidentales [17-19]. Colbeck et al
. [20] utilizó la PCR para detectar si la corriente abajo de hpyD gratis (locus A) y S18 gratis (locus B) son babA
o babB Opiniones y encontraron una sola colonia de aislar con Baba mixta
y babB
genotipo en el mismo locus, lo que indica subpoblaciones dentro de la población bacteriana derivada de una sola colonia. Es digno de responder si los perfiles genéticos sobre Baba Restaurant and babB
podrían estar relacionados con los diferentes resultados de la enfermedad clínica o el H. pylori específica
características histológicas relacionados con la PI.
Hay diferentes celular predominante tipos en el antro y el cuerpo. Las células parietales productoras de HCl Situar en el corpus y hacen un gradiente de pH diferente al antro. Nuestro estudio anterior mostró que los pacientes con H. pylori
infección crónica expresaron una mayor intensidad de Lewis b en el epitelio gástrico del corpus que en el antro [17]. La recombinación entre babA Opiniones y babB
podría ayudar a H. pylori
para cambiar su capacidad de adhesión para adaptar diferentes nichos dentro del estómago [21]. En consecuencia, es digno de determinar la distribución de los genotipos sobre Baba Restaurant and babB
en la infección por H. pylori
lo largo de los diferentes lugares topográficos como sea antro o cuerpo en el estómago humano. En este estudio, hemos analizado la importancia clínica sobre Baba Restaurant and Babb
genotipos y la presencia sobre Baba Restaurant and babB
en el locus A y B de múltiples colonias de diferentes nichos gástricos para entender la Babab
perfil genético de los aislados de H. pylori
en todas las regiones gástricas en el mismo host.
Resultados
Distribuciones de Baba y babB genotipos en pacientes con diferentes enfermedades clínicas
la detección de genotipos fue Babab
basado en el diseño del cebador se muestra en la Figura 1. Entre 92 cepas, la distribución de los cuatro genotipos (AB, AB B, a y AB AB AB) fue de 46 (50%), 21 (22,8%), 10 (10,9%) y 15 (16,3%), respectivamente. No hubo diferencias en la distribución de género entre los diferentes genotipos (prueba de Chi-cuadrado, p Restaurant > 0,05). La edad media de los pacientes infectados con el genotipo como AB AB fue ligeramente mayor que los infectados con otros genotipos (57,6 vs. 50,3 años, prueba de la t-muestras independientes, p = 0,09)
. Las distribuciones de los cuatro genotipos fueron significativamente diferentes en los pacientes con diferentes enfermedades clínicas (Tabla 1, la prueba de Chi-cuadrado, p = 0,04
). La edad media de los pacientes era de GC más alto que los otros pacientes sin cáncer (58,6 vs. 49,5 años
, prueba de la t-muestras independientes, p = 0,01)
. El tipo del genotipo AB AB en los pacientes con GC fue mayor que en los tres grupos de pacientes sin cáncer (40,0% [8/20] vs.
9,7% [7/72], prueba exacta de Fisher, p Hotel < 0,05, odds ratio: 6,2; IC del 95%: 1.9-20.3) .table 1 El Baba y Babb genotipos de H. pylori a partir de diferentes grupos clínicos del paciente
N (%)

DU gratis (n = 18) guía empresas GU gratis (n = 27) guía empresas Gastritis gratis (n = 27) guía empresas GC
(n = 20) guía empresas
total (n = 92)
estadísticas
valor de p
AB página 11 (61,1)
14 (51,9)
15 (55,6) página 6 (30)
46 (50)
0.039
AB B página 6 (33,3) página 4 (14,8) página 7 (25,9) página 4 (20)
21 (22,8)
A AB
0 (0) página 4 (14,8) página 4 (14,8)
2 (10)
10 (10,9)
AB AB
1 (5,6) página 5 (18,5)
1 (3,7) página 8 (40)
15 (16,3 ) Hotel du: úlcera duodenal. GU: úlcera gástrica. GC: cáncer gástrico. La diferencia entre los cuatro genotipos en las enfermedades gástricas se evaluó mediante la prueba de Chi-cuadrado.
Como el genotipo AB AB fue mayor en los pacientes con cáncer gástrico, hemos probado más a fondo si un genotipo de este tipo puede conducir a una mayor tasa de precancerosa cambios o inflamación histológica más grave. En los pacientes con GC, el genotipo AB AB se asoció con una mayor intensidad de metaplasia intestinal (IM) en el antro en comparación con la no-AB AB genotipo (2.0 vs.
0,27, p
= 0,02). Sin embargo, en los pacientes sin cáncer, el genotipo AB AB no se asoció con puntuaciones de inflamación superior agudas (suma de antro, cuerpo y cardias: 3,43 vs 2,94
, p Hotel > 0,05), la inflamación crónica (suma de las puntuaciones antro, cuerpo y cardias: 7,29 vs 7,22
, p Hotel > 0,05), H. pylori densidad gratis (suma de antro, cuerpo y cardias: 8,14 vs 8,84
, p Hotel > 0,05), o la intensidad de IM (0,43 vs 0,51
, p Hotel >. 0,05) en comparación con la no-AB AB genotipo
Diferencia en el Baba y el genotipo babB entre los aislados de antro y cuerpo Opiniones de los 19 pacientes que proporcionaron aislados de diferentes nichos gástricos sobre el antro y el cuerpo, la composición del genotipo sobre Baba Restaurant and babB
en el locus a y B de su antro y aislamientos corpus se muestra en la Tabla 2. Cuatro pacientes (n. 7, 12, 29, 30) fueron infectados con una cepa del genotipo AB a través del antro y el cuerpo, y se encontró que 15 pacientes a tener un genotipo cepas mixtas (AB B, AB o a AB AB) sólo en el corpus, o ambos nichos gástricos. En esos 15 pacientes, 3 pacientes (n. 28, 2, 4) tenían los mismos genotipos mixtos en todo el antro y el cuerpo. Ocho de los 12 pacientes restantes tenían un genotipo importante a través de ambos nichos gástricos. La combinación con los 7 pacientes (no. 7, 12, 29, 30, 28, 2, 4) con un solo genotipo, 78,9% (15/19) de los pacientes había distribuido un genotipo principal a través de dos niches.Table 2 El genotipo composiciones de antro y el cuerpo de H. pylori aisladas de 19 pacientes
el caso núm
Babab
genotipo de los aislados
Mayor Babab
genotipo a través de antro & corpus
genotipo dominante en el corpus
AB AB AB o genotipo antro /as dominante de 12 pacientes infectados con más de un genotipo
antro (n)
corpus (n)
antro
corpus
7
AB (4)
AB (4)
AB
AB /AB
x x
página 12
AB (4)
AB (4)
AB
AB /AB
x
x 29

AB (4)
AB (4)
AB
AB /AB
x
x 30

AB (4 )
AB (4)
AB
AB /AB
x
x 28

A AB (4): perfil A AB (4) Un
AB
Una AB /A AB
x x

2 AB AB (4)
AB AB (4)
AB AB AB AB
/AB AB
x x

4 de AB AB (4)
AB AB (4)
AB AB AB AB
/AB AB
x
x
1 | AB AB (3)
AB AB (2)
AB AB AB AB
/-
+ -
AB B (1)
AB B (2) Estrellas: 3
AB B (3)
AB B (4)
AB B Opiniones AB B /AB B Opiniones -
- AB (1) página 6
AB AB (3)
Una AB (1)
AB AB (4)
AB AB AB AB
/AB AB
+
+
10
AB AB (3)
AB B (4) -
AB AB /AB + B Opiniones -
AB B (1) página 19
AB (3)
AB (3)
AB
AB /-
+
- A AB (4): perfil 21
AB (4)
AB (3)
AB
AB /AB +

+
AB B (1): perfil 25
AB (4)
AB (1) -
AB /AB + B Opiniones -
AB B (3): perfil 14
AB (4)
AB (2 )
AB
AB /-
+ -
AB B (2)
AB B (2) AB AB (2)
24
AB (3 )
AB (1) -
AB /-
+
- A AB (1)
AB B (1)
Una AB (2)
27
A AB (3)
AB (1): perfil A AB
Una AB /A AB CD -
- AB AB (1)
A AB (3): perfil 11
AB (4)
Una AB (2) -
AB /-
+ -
AB B (1 )
AB AB (3)
AB AB (2)
17
AB (3)
AB (3)
AB CD - /- CD -
-
AB B (3)
Una AB (1)
Una AB (2)
AB AB (2)
paciente Nº. 1, 3, 6, 19 y 21, que fueron infectados por 2 genotipos, todavía tienen una de las principales a través de ambos nichos gástricos, y que también era cierto en 2 (no. 14, 27) de los pacientes que tienen 3 y 1 (sin. 17) paciente que tiene 4 genotipos representados en sus infecciones. - Lo que indica que los pacientes tienen no dominante babA Opiniones y babB
genotipo de los aislados de antro o cuerpo. número de los pacientes fue de acuerdo con nuestro estudio anterior [22].
Entre los 12 pacientes infectados con más de un genotipo (Tabla 2), la frecuencia del genotipo dominante importante, AB combinado con AB AB, en el antro fue mayor en comparación con la del corpus (75% [9/12] vs.
16,2% [2/12], p = 0,012
, odds ratio: 15). Sin embargo, 6 de los 12 pacientes carecían de un genotipo dominante en su corpus aísla.
Análisis de la secuencia y comparación
en el locus A, antro y el cuerpo de cada paciente aislados tenían sustituciones específicas de aminoácidos en la región de baba (Figura 2 y Tabla 3). Sin embargo, no hubo una diferencia obvia entre el antro y corpus aísla en la región de la secuencia, excepto de ningún paciente. 27 (aminoácidos 134 y 198). También encontramos 5 sustituciones no sinónimas diferentes en el aminoácido 161 en aislamientos 6 pacientes, en comparación con la cepa J99. El mismo escenario (especificidad de secuencia en cepas individuales de los pacientes, pero no entre el antro y el cuerpo aislamientos) fue en las secuencias de la Babb
. Figura 1 PCR patrones de bandas de los genotipos Babab. (A) Los pares de cebadores utilizados para la detección de genes en el locus A y B. Los cebadores directos, HypDF1 y S18F1, ubicadas en la región aguas arriba del bizcocho borracho
o babB
, se empareja con BabAR1 o BabBR1 cebadores para determinar si el gen en el locus a y B es babA
o babB
. patrones de bandas (B) de PCR genotipo A B, AB B, A y AB AB AB. El genotipo AB B mostró dos poblaciones bacterianas en la única colonia de aislar, los dominantes Baba
y el menor como babB
, en el locus A. La cepa con un genotipo AB representa una población dominante de babB y un menor de edad población de babA
en el locus B. La combinación de AB y B a AB se definió como un genotipo AB AB. Carril M1, un marcador molecular de 100 pb; carril M2, l marcador HindIII. El tamaño de los productos PCR en el locus A y B era 2.1-2.6 kb y 1,0-1,5 kb, respectivamente.
Tabla 3 Las sustituciones de aminoácidos en BabA codificados por Baba en el locus A
La ubicación de amino sustituciones Venta de CASE No.
6
9
37
92
131
134
136
161
165
166
198
202
204
206
212
218
25
L
T
Un
N N
sobre K
T
R
Y
G
N
S
T T

E S

27
L
Un
Un
N
N
T, K
T
Un
D
G
N, K
S
T
T
Q
P
2 L
A
S S

N
E
T sobre K
Y
S
N
S
T
T
E S

24
L
Un
Un
N N
sobre K

T
Y
G
N
E S

T
E D
página 6
L
Un
Un
N
H
Q
T
P
Y
G
N
N
T
T
Un
S
26
F
Un
Un
N N
sobre K
T
S
Y
G
N
S
N
Un
e S

repeticiones de TC de Baba y babB en el locus B Opiniones genes en el locus B están regulados por CT se repite en la región 5 'no codificante, y el número de repeticiones CT (5, 8 y 11) hacen que la expresión de proteínas en marco posible [12, 20]. Las repeticiones de TC del babB
gen en el locus B se muestran en la Tabla 4. El corpus aislados en 7 de los 12 pacientes tenían un cambio de repeticiones de TC del babB
gen en el locus B, y el antro aislados de estos pacientes siempre tienen las mismas repeticiones de TC, a excepción del paciente 17 (Tabla 4) .Tabla 4 el número de CT se repite en la región 5 'no codificante de babB en el locus B Opiniones Caso No.
antro aísla (n = 2) gratis (número de repeticiones CT) guía empresas Corpus aislados (n = 2) gratis (número de repeticiones CT) guía empresas Concordancia
Cambio de repetición de CT en el corpus
2 página 8, 8 página 8, 8
+ CD - página 12 página 8, 8 página 8, 8
+
-
24 página 7, 7 página 7, 7
+
- 30 de página 11, página 11 11, 11
+ CD -
1 página 8, 8 página 7, 10 -
+ página 11 página 8, 8 página 7, 9 -
+
26 página 8, 8 página 8, 9 -
+ página 6 página 9, 9 página 9, 12 -
+ 21
página 7, 7 página 9, 10 -
+
27 página 9, 9 página 9, 8 -
+ página 14
8, 8 página 7, 7 -
-
17 página 7, 10 página 8, 7 -
+
Cuatro pacientes (n. 2, 12, 24, 30) estaban infectados por cepas con un tipo de repetición CT (7, 8 y 11) a través del antro y el cuerpo, pero sólo uno de ellos (no. 24) tuvo un fuera de cuadro babB
. En los otros pacientes (no. 1, 11 y 26), su antro aislados contenía 8 repeticiones CT pero el corpus aislamientos cambió a 7, 9 o 10 repeticiones. A los pacientes (n. 6, 21 y 27) que fueron infectadas por el antro aislamientos con 7 o 9 repeticiones CT, su corpus también aísla tuvo un cambio de CT se repite, pero el número de repeticiones de TC todavía estaba fuera de marco (9 , 10 y 12), excepto en una cepa de ningún paciente. 27 (TC repite = 8).
Expresión del genotipo y Baba
Para determinar el efecto sobre Baba Restaurant at locus A y B en la expresión baba (Figura 3A), se encontró que Baba
en el locus B no obviamente afecta el nivel de expresión Baba, en comparación con los aislados 19C3 (a AB) y 19C1 (AB). Todos los aislamientos (26A1, A4, C2 y C3) tenían el genotipo A AB, pero las repeticiones de TC de The Baba
en el locus B de C2 estaba fuera de marco. La expresión de Baba no se vio afectada por el hecho de babA
en el locus B fue dentro o fuera del marco. Hemos determinado, además, si un genotipo mixto en el locus A afectaría expresión Baba, y se encontró 14C2 y 14C3 con el genotipo AB B (Baba /relación de Hsp60: 0,76 y 0,70) tuvieron expresión ligeramente inferior a 14A2 y 14A4 con el genotipo AB (Baba /relación de hsp60: 0,90 y 0,87, Figura 3B). AB AB genotipo también tenía la expresión BabA inferior a la unidad B (Baba relación /Hsp60: 1,09 y 0,89, Figura 3C). Figura 2 Las secuencias babA en el locus A del antro y el cuerpo aísla. Los números cardinales indican los aislados 'diferentes pacientes. A1-4 y eran C1-4 aislado aislante de una sola colonia del antro y el cuerpo, respectivamente. subida de blancos indica aminoácidos diferentes de consenso.
Discusión Francia El ocurrencia de recombinación entre intragenomic babA Opiniones y babB
se ha demostrado in vitro
e in vivo
, implicando esto mecanismo, posiblemente, puede ayudar a H. pylori
para adaptarse en el estómago humano [12, 14]. Además, los genotipos mixtos sobre Baba Restaurant and babB
en el locus A o B se ha demostrado [20]. La asociación clínica de The Baba Restaurant and babB
genotipo de las cepas de H. pylori
y el perfil genético con infecciones del antro y el cuerpo de un único host aún no están claros. En este estudio, hemos demostrado que el genotipo AB AB, un genotipo dominante en el antro, se asoció con la lesión precancerosa como IM, y se correlacionó con el cáncer gástrico. Sin embargo, la infección por H. pylori
por dicho genotipo AB AB no ha dado lugar a una intensidad de colonización o inflamación más denso en la histología gástrica. Nuestros datos indican H. pylori babA
y Babb
genotipos como AB AB deben ejercer por lo menos con una mejor adaptación al entorno gástrico durante la carcinogénesis.
Colbeck et al
. [20] encontraron 9 genotipos (A B, AB B, A AB, A, B B, B A, B C, C B y B AB) en su estudio. Sin embargo, nuestro estudio sólo encontró cuatro genotipos (A B, A AB, AB B y AB AB) en el 168 aislamientos de antro y cuerpo (Tabla 2) 19 pacientes. Indica el genotipo diversidad de Babab
en los aislados de Taiwán podría ser, obviamente, menos complicaría. Por otra parte, al menos un babA
gen en el locus A existía en cada uno de los aislados. Este hallazgo es compatible con nuestro informe anterior para revelar la taiwanesa H. pylori
aislados son casi el 100% babA
-positivo [17], y apoyar a la mayor prevalencia de babA Hoteles en H. pylori
cepas procedentes de países de Asia oriental que los de los mundos occidental [23]. Por otra parte, Matteo et al
. [24] demostró que 9 de 34 pacientes (26,5%) tuvieron variación
genes bab al otro lado del antro y el cuerpo de un único host en un punto de tiempo específico. Se encontró que 12 de 19 pacientes (63,2%) infectados por más de un genotipo en uno o ambos nichos gástricos. La discrepancia prevalencia entre dos estudios podría ser debido al análisis de bab
genotipo de la piscina bacteriana o aislado de una sola colonia.
Análisis de las secuencias de babA
y babB
reveló que las sustituciones no sinónimas de aminoácidos se produjeron entre las cepas individuales (Figura 2, Tabla 3 y datos no presentados), pero no fueron diferentes entre los nichos gástricos. El orgullo y col
. [11] también mostró una alta diversidad alélica dentro babA Opiniones y babB
en las cepas de diferentes pacientes. A juzgar por las sustituciones no sinónimas 6 diferentes de aminoácido 161 en las cepas de los 6 pacientes, que codón era un sitio muy variable. Esto vale la pena una mayor investigación, ya que puede ser un sitio especial responsable de la adaptación a las diferencias en los estómagos individuales.
CT se repite en la región 5 'del bizcocho borracho Opiniones y babB de codificación
son más comúnmente encontrado en el locus B de locus A [20]. Hemos encontrado que el corpus aislamientos tuvieron una mayor frecuencia de cambios en el número de repeticiones de TC de babB
en el locus B de los aislados del antro (Tabla 4). Entre los 7 pacientes infectados por el corpus aislados con un cambio de repeticiones CT, sólo uno (paciente no. 27) tenía el aislado cambiando CT repite en marco (CT = 8) (Tabla 4). Estos datos indican que la expresión Babb podría ser estrechamente controlada por variación de fase debido a la salida de repeticiones marco en el corpus. Entre 12 pacientes infectados por cepas con más de un genotipo, sus aislamientos de antro tienen una mayor tasa de AB y AB AB genotipos tan dominante que corpus (9/12 frente a 2/12
, p Hotel < 0,05 ). Por otra parte, la mitad de los pacientes que carecían de un genotipo dominante en su corpus aísla. Estos resultados sugieren que el ambiente en el corpus puede favorecer la adaptación diferente de las cepas de H. pylori con diferentes
diversidades genéticas. México La presencia del genotipo AB AB fue mayor en los pacientes con GC mayor edad (Tabla 1). Además, el genotipo AB AB no se correlaciona con la inflamación más severa o cambios precancerosos en los pacientes sin cáncer. Sobre la base de estos datos histológicos clínica de la sección transversal, que sugiere las cepas AB AB pueden tener una mejor adaptación al entorno canceroso en el estómago, en lugar de conducir a más toxicidad en la carcinogénesis gástrica. En la Figura 3A, se muestra que Baba
gen en el locus A determina predominantemente expresión Baba, y el genotipo mixto como AB en el locus A pueden disminuir la expresión baba (Figura 3B y 3C). Así, es posible un genotipo mixto como AB en el locus A puede hacer que H. pylori
aislamientos para contener una expresión BabA subpoblación perder. Como alternativa, el genotipo mixto como AB en el locus B, posiblemente, puede permitir que H. pylori
para cambiar la expresión Babb y por lo tanto merece más estudio.
Además, nuestros datos anteriores han demostrado que la intensidad de Lewis B se convierten en una disminución en el antro atrofia, pero puede ser conservado en corpus para mediar mayor colonización de insectos mal por allí [17]. Por lo tanto, se deberá asimismo implicativo para probar si el genotipo AB AB dominantemente en el antro puede tener la ventaja de adaptar el epitelio gástrico con una débil expresión b Lewis en el futuro.
Conclusiones Francia El H. pylori
aislar con Baba
y babB
genotipo como AB AB genotipo se correlaciona con un mayor riesgo de cáncer gástrico, y colonizar de manera predominante antro. Tal genotipo AB AB se asocia con una mejor adaptación al entorno gástrico precancerosas o cáncer, y posiblemente generar subpoblaciones que pierden BabA o Babb.
Métodos Pacientes y
bacteriana
aísla un total de 92 H. pylori
cepas fueron cultivadas a partir de las muestras de biopsia de pacientes con diferentes enfermedades clínicas como la úlcera duodenal (DU, n = 18), úlcera gástrica (GU, n = 27), gastritis (n = 27), o cáncer gástrico (GCA, n = 20), definida por endoscopia con confirmación histológica. Todos los pacientes habían dado su consentimiento informado y se sometieron a panendoscopia en nuestro instituto. Durante panendoscopia para cada paciente, se obtuvieron cinco bits de biopsia gástrica, incluyendo 2 del antro, 2 del corpus, y 1 de las cardias. El cultivo bacteriano y el examen histológico se aplicaron como el artículo anterior [17]. Este estudio fue aprobado por el 'experimento humano y el Comité de Ética del Hospital de la Universidad Nacional Cheng Kung' (Nº HR-98-023).
Una sola colonia aísla del antro y el cuerpo se seleccionaron al azar de las placas de cultivo primario. Para cada sitio, se seleccionaron al azar por lo menos 3-4 aislados de una sola colonia para determinar el genotipo Babab
. cultura de colonias para la extracción de ADN era inferior a 8 pasajes para disminuir la posibilidad de la variación genética in vitro. Cada uno de los 19 pacientes infectados en el antro y el cuerpo por cepas con el mismo patrón de bandas RAPD se describió anteriormente [22].
Detección de Baba y Babb genotipos comentario El detección de babA Opiniones y babB
genotipos se basó en el método de Colbeck et al
[20]. Se han usado HypDF1-BabAR1 y HypDF1-BabBR1 cebadores para determinar si el gen en el locus A era babA
o babB
. De la misma manera, se aplicaron S18F1-BabAR1 y S18F1-BabBR1 cebadores para determinar si el gen en el locus B era babA
o babB
(Figura 1A). Los 40 ciclos de reacciones de amplificación se llevaron a cabo con 20 pmoles de cebador, 0,15 mM cada desoxinucleósido trifosfato, tampón de reacción con MgCl 2 y 1 U Taq ADN polimerasa (New England Biolabs, Beverly, MA, EE.UU.) en un volumen final de 50 l. Las condiciones de ciclado térmico fueron descritas anteriormente [20]. Cada producto amplificado (20 l) se analizó en un gel de agarosa al 1% teñido con bromuro de etidio. Figura 3 babA en el locus Una expresión BabA determinada manera dominante. (A) Efecto sobre Baba Restaurant at locus B en The Baba
expression.The aislar (19C3) tenían babA Restaurant at locus A y en marco repeticiones TC sobre Baba Restaurant at locus B, que eran en comparación con el aislado sólo tener babA Restaurant at locus a (19C1). La presencia de babA
en el locus A y B se encontraba en los aislamientos 26A1, A4, C2 y C3, C2, pero tenía un fuera de babA marco
en el locus B. (B) Efecto del genotipo mixto en el locus A en The Baba
expresión. Los aislados de un paciente (no. 14) tenían un genotipo mixto en el locus A (14C2 y C3), que se comparó con aquellos con Baba
sólo al locus A (14A2 y A4). (C) Comparación de BabA
entre AB AB y A genotipos B. Hsp60 era como un control interno.
Definición Genotipo
The Baba Restaurant and babB
genotipo de cada aislado de una sola colonia se basó en la descripción anterior [20]. Un aislado J99-como mostró las bandas de PCR esperados sobre Baba Restaurant at locus A y babB
en el locus B y se definió como el "Un genotipo B" (Figura 1B-a). Un aislado de una sola colonia que contiene tanto babA
y babB
en el mismo locus se definió como "genotipo mixto" (como AB B, A AB, AB y AB), lo que indica que había subpoblaciones dentro de la población bacteriana derivado de una sola colonia. Un aislado con un genotipo AB B contenía una población con Baba
y la otra población con babB
en el mismo locus A (Figura 1B-b). El genotipo A AB representado dos poblaciones bacterianas, el dominante con babB
y el menor con babA
en el locus B, aunque ambos derivados de una única colonia (Figura 1B-c). Un genotipo mixto detecta en ambos locus A y B se define como un AB AB (Figura 1B-d).

• causa poco frecuente de obstrucción de la salida gástrica: gigante tricobezoar gástrica: reporte de un caso
• gastropexia anterior laparoscópica para el vólvulo gástrica crónica recurrente: un informe del caso