H. pylori
klinikinių izoliatų turi įvairiapusę babAB
genotipo paskirstymo daugiau įvairių topografinių svetainėse skrandžio koreliacijos į klinikinius ligos rezultatų
Anotacija
faktai
Intragenomic rekombinacija tarp Baba
ir Babb
tarpininkauja antigeninėmis variantus ir gali padėti H. pylori
kolonizaciją. Šis tyrimas nustatyti, ar kintamos genotipai Baba
ir Babb
koreliuoja skirtingų klinikinių ligos pasekmių, ir gali platinti per įvairių skrandžio nišos.
Rezultatai
Šio tyrimo metu mokosi 92 klinikinių padermių (45 iš pepsinė opa 27 gastritu, ir 20 iš skrandžio vėžio) aptikti, ar baba parsisiųsti ir Babb
yra ne locus A arba B PGR reakcijų naudojant pradmenis, skirtos iš tiekėjų ir kintamos regione Baba parsisiųsti ir Babb
genus. buvo rasta Keturi genotipai Baba
ir Babb
(B, AB B, A, AB, AB ", AB). Numatytos 4 genotipo pasiskirstymas 92 klinikinių padermių buvo žymiai skiriasi tarp pacientų, kuriems skirtingų skrandžio ligų (p
< 0,05). Izoliatai iš skrandžio vėžiu sergančių pacientų turėjo didesnį tarifą AB AB genotipo nei iš ne vėžiu sergančių pacientų (40,0%, palyginti su pervežimas 9,7%, p pervežimas < 0,05). AB AB "genotipas buvo susijęs su didesne intensyvumo žarnyno metaplazijos (p
< 0,05), bet ne koreliuoja su aukštesniu uždegimą ir kolonizacijos tankio skrandžio histologiją (psl pervežimas > 0,05). Be to, tyrime dalyvavo 19 pacientai, patikrinti, ar kintamos genotipai babAB
egzistavo skirtingų skrandžio nišos. Tarp pacientų, infekuotų daugiau nei vienas babAB
genotipų nei antralinėje dalyje ir corpus, ten buvo didesnis tarifas genotipų kaip AB ar AB AB, išskirtų iš antralinėje dalyje, negu tiems iš tekstyno (75,0% vs
16,7%, p
. < 0,05)
Išvados Viesbutis The H. pylori pervežimas izoliato AB AB genotipo koreliuoja su padidėjusia skrandžio vėžio rizikos ir kolonizuoti į Ertmė svarbiausiam būdu
faktai
Helicobacter pylori
infekcija padidina skrandžio opos ir skrandžio adenokarcinomos žmogaus skrandžio [1-3] riziką. H. pylori
prisijungimas prie skrandžio epitelį ir pristatyti vykdymo sukelti uždegimą [4, 5]. Vienas iš geriausiai ištirtų adhezinų yra kraujo grupė antigeną surišantis adhezinas (Baba), kuris jungiasi Lewis B (LEB) ir susijusios ABO antigenus [6, 7]. Spėjamas adhezinas, Babb, užkoduotas Babb
, turinčiai beveik identiškas n- ir C-galo sekas su baba
[7, 8]. Atvirkštinių chromosomų vietų Baba
ir Babb
tarp deformacijų J99 ir 26695 įrodyti rekombinacijos įvykių tarp šių dviejų genų [9, 10]. Du genai taip pat rodo, geografines ir alelių variacijos [11]. Be to, baba dubliavimo
arba Babb
genas yra sąlygotas genų konversiją tarp skirtingų chromosomų lokuso [12-14]. Bäckström kt
. [14] parodė, kad tyli Baba
genas iš LEB-nonbinding padermės gali būti aktyvuojamas rekombinacijos į Babb
geno. Rezus beždžionės modelis parodė, kad dauguma atsigavo izoliatai pakeitė Baba
su antra kopija Babb
po kelių savaičių infekcijos [12].
Vakarų šalyse užsikrėtę Baba pacientai
-positive H . pylori
izoliatai yra susiję su padidėjusia rizika susirgti skrandžio opa ligų [15, 16]. Tačiau ši asociacija nėra patvirtinta pacientams iš Rytų Azijoje, ar kai kurių kitų Vakarų šalių [17-19]. Colbeck kt
. [20] naudojama PGR aptikti, ar pasroviui hpyD
(locus A) ir S18
(B lokuso) yra baba
arba Babb parsisiųsti ir rado vieno kolonija izoliuoti mišrus Baba
ir Babb
genotipą tuo pačiu lokuso, nurodant subpopuliacijas, kaip apibrėžta bakterijų populiacijos, gautam iš atskiro kolonija. Verta atsakyti ar genetiniai profiliai Baba
ir Babb
gali būti susijęs su įvairių klinikinių ligos rezultatų ar konkrečiu H. pylori
"susiję histologiniai funkcijų.
Yra įvairių dominuojantis elementas tipai ir antralinėje dalyje ir corpus. Parietalinių ląstelių, gaminančių HCl įsikurti tekstyno ir padaryti kitą pH gradientas į antralinėje dalyje. Mūsų Ankstesnis tyrimas parodė, pacientai, sergantys lėtiniu H. pylori pervežimas infekcijos išreiškė didesnį intensyvumą Lewis B skrandžio epitelio corpus nei antralinėje dalyje [17]. Rekombinacija tarp Baba
ir Babb
gali padėti H.pylori
keisti savo sukibimą gebėjimą prisitaikyti skirtingas nišas per skrandį [21]. Taigi, ji yra verta nustatyti genotipo paskirstymą Baba parsisiųsti ir Babb
į H. pylori
infekcijos per įvairių topografinių vietose arba kaip antralinėje dalyje arba corpus į žmogaus skrandį. Šiame tyrime mes išanalizavo klinikinė reikšmė Baba
ir Babb
genotipų ir baba
buvimą ir Babb
ne locus A ir B keliais kolonijų iš įvairių skrandžio nišų suprasti babAB
genetinis aprašymą H. pylori pervežimas izoliatų visoje skrandžio regionuose per tą patį prieglobos.
rezultatai
skirstiniai Baba ir Babb genotipai pacientams su skirtingų klinikinių ligų
aptikimas babAB
genotipų buvo remiantis grunto dizaino parodyta 1 pav Tarp 92 štamai, iš keturių genotipų (AB, AB "B A AB ir AB AB) pasiskirstymas buvo 46 (50%), 21 (22,8%), 10 (10,9%) , ir 15 (16,3%), atitinkamai. Nebuvo skirtumo lyties pasiskirstymo tarp skirtingų genotipų (Chi-kvadrato testas, p
> 0,05). Vidutinis pacientų amžius užsikrėtusiems genotipo, kaip AB AB buvo šiek tiek vyresni nei užsikrėtę kitų genotipų (57.6 vs 50.3 metų, Nepriklausomas-imties t testas, p
= 0,09). Iš keturių genotipų pasiskirstymas buvo gerokai skiriasi sergančiųjų skirtingų klinikinių ligų (1 lentelė, Chi-kvadrato testas, p
= 0,04). Amžiaus vidurkis GC pacientams buvo didesnis nei kitų ne vėžiu sergančių pacientų (58,6 vs
49,5 metų, Nepriklausomas imties t testas, p
= 0,01). Iš AB AB genotipo pacientams, sergantiems GC lygis buvo aukštesnis nei trijose grupėse ne vėžiu sergančių pacientų (40,0% [8/20] vs
9,7% [7/72], Fišerio tikslusis testas, p
< 0,05, šansų santykis: 6,2; 95% PI: 1.9-20.3) .table 1 Baba ir Babb genotipai H. pylori iš įvairių klinikinių pacientų grupėms
N (%)
DU
(n = 18)
GU
(n = 27)
Gastritas
(n = 27)
GC
(n = 20)
viso
(n = 92)
Statistika
psl
vertė
AB "
11 (61,1)
14 (51,9)
15 (55,6)
6 (30)
46 (50)
0,039
AB "B
6 (33,3)
4 (14,8)
7 (25,9)
4 (20)
21 (22,8)
AB "
(0)
(14,8)
0 4 4 (14,8) 2 (10)
10 (10,9)
AB "AB"
1 (5,6)
5 (18,5)
1 (3,7)
8 (40)
15 (16,3 )
DU: dvylikapirštės žarnos opa. GU: skrandžio opa. GC: skrandžio vėžys. Skirtumas tarp keturių genotipų skrandžio ligų buvo įvertintas pagal chi-square testą.
Kaip AB AB genotipo buvo didesnis pacientams, sergantiems skrandžio vėžiu, mes dar išbandyti, ar toks genotipas gali sukelti didesniu ikivėžinius pakeitimai ar sunkesnis histologinis uždegimą. Pacientams su GC, AB AB "genotipas buvo susijęs su didesne intensyvumo žarnyno metaplazijos (IM) į antralinėje dalyje, palyginti su ne AB AB genotipo (vs
2,0 0,27, p = 0,02 pervežimas). Tačiau, ne vėžiu sergantiems pacientams, AB AB "genotipas nebuvo susijęs su aukštojo ūminio uždegimo balai (suma Ertmė, corpus ir Cardia: 3,43 vs
2,94, p
> 0,05), lėtinis uždegimas balų suma (Ertmė, corpus ir Cardia: 7,29 vs
7,22, p
> 0,05), Helicobacter pylori
tankis (suma Ertmė, corpus ir Cardia: 8,14 vs
8.84 , P.
> 0,05), arba IM intensyvumas (0,43 vs
0,51, p
>. 0,05), palyginti su ne AB AB genotipo
skirtumas Baba ir Babb genotipas tarp išskirtų iš antralinėje dalyje ir corpus
už 19 pacientų, kurie pateikė išskirtus iš įvairių skrandžio nišos virš antralinėje dalyje ir corpus, genotipo sudėties Baba parsisiųsti ir Babb
ne locus A ir B savo antralinėje dalyje ir tekstynų izoliatų parodyta 2 lentelėje keturiems pacientams (Nr. 7, 12, 29, 30) buvo užsikrėtę su AB genotipo kamieno visoje antralinėje dalyje ir corpus, ir buvo nustatyta 15 pacientų turėti mišrus genotipas kamienai (AB B A AB arba AB "AB") tik tekstyno, ar abiejų skrandžio nišos. Tose 15 pacientų, 3 pacientai (Nr. 28, 2, 4), turi tas pačias mišrių genotipas visoje antralinėje dalyje ir korpuso. Aštuoni iš likusių 12 pacientų turėjo vieną svarbų genotipą abiejuose skrandžio nišos. Derinant su 7 pacientų (Nr. 7, 12, 29, 30, 28, 2, 4) su tik vienas genotipo, 78,9% (15/19) mūsų pacientams, kuriems vienas pagrindinis genotipas pasiskirstęs dviejų niches.Table 2 genotipas kompozicijos Ertmė ir Corpus H. pylori izoliatai 19 pacientų
byloje Nr
babAB
genotipas izoliatų
majoro babAB
genotipo visoje antralinėje dalyje & Corpus
Dominuojantis genotipas į Ertmė /corpus AB
ar AB "AB", kaip dominuojančios genotipo 12 pacientų, infekuotų daugiau nei vieną genotipą
Ertmė (n)
tekstynas (N)
Ertmė
Corpus
7
AB "(4)
AB" (4)
AB "
AB /AB"
x
x
12
AB "(4)
AB" (4)
AB "
AB /AB"
x
x
29
AB "(4)
AB" (4)
AB "
AB /AB
x
x
30
AB" (4 )
AB "(4)
AB"
AB /AB "
x
x
28
AB" (4)
AB "(4)
AB "
A AB" /A AB
x
x
2
AB AB (4)
AB "AB (4)
AB" AB "
AB AB /AB AB
x
x
4
AB "AB" (4)
AB "AB" (4)
AB "AB"
AB "AB" /AB "AB"
x
x
1
AB "AB" (3)
AB "AB" (2)
AB "AB"
AB "AB" /- CR.LT + -
AB "B (1)
AB "B (2)
3
AB" B (3)
AB "B (4)
AB" B
AB B /AB B -
- CR.LT AB (1)
6
AB "AB" (3)
AB "(1)
AB" AB "(4)
AB" AB "
AB" AB "/AB" AB "
+
+
10
AB "AB" (3)
AB "B (4) -
AB" AB "/AB" B
+ -
AB "B (1)
19
AB "(3)
AB" (3)
AB "
AB" /- CR.LT + -
AB "(4)
21
AB "(4)
AB" (3)
AB "
AB /AB"
+
+
AB "B (1)
25
AB" (4)
AB "(1) -
AB /AB" B
+ -
AB "B (3)
14
AB" (4)
AB "(2 )
AB "
AB" /- CR.LT + -
AB "B (2)
AB" B (2) AB "AB" (2)
24
AB "(3 )
AB "(1) -
AB" /- CR.LT + -
AB "(1)
AB" B (1)
A AB (2)
27
AB "(3)
AB" (1)
AB "
AB" /A AB "UAB -
- AB" AB "(1)
AB "(3)
11
AB" (4)
AB "(2) -
AB" /- CR.LT + -
AB "B (1 )
AB "AB" (3)
AB "AB" (2)
17
AB "(3)
AB" (3)
AB "UAB - /- CR.LT -
- CR.LT AB "B (3)
AB" (1)
A AB (2)
AB "AB" (2)
pacientas nėra. 1, 3, 6, 19 ir 21, kuris buvo užkrėstas 2 genotipas, vis dar turi viena iš pagrindinių abiejuose skrandžio nišos, ir kad taip pat buvo teisinga 2 (14 Nr., 27) pacientai, turintis 3, ir 1 (Nr. 17) Pacientų, kurių 4 genotipus atstovauti jų infekcijų. - Rodo, kad pacientai turi ne dominuojančią Baba parsisiųsti ir Babb
genotipą, prisideda prie antralinėje dalyje arba corpus izoliatų. Pacientų skaičius buvo pagal mūsų ankstesniame tyrime [22].
Tarp šių 12 pacientų, infekuotų daugiau nei vieną genotipą (2 lentelė), iš pagrindinės dominuojančios genotipo dažnis, AB kartu su AB AB, į Ertmė buvo didesnis, palyginti su ta, kurią korpuso (75% [9/12] vs
16,2% [2/12], P.
= 0,012, šansų santykis: 15). Tačiau 6 iš 12 pacientų neturėjo dominuojantis genotipas savo corpus izoliatai.
Seka analizė ir palyginimas
Tuo locus A, kiekvieno paciento Ertmė ir Corpus izoliatų turėjo konkrečius keitimus amino rūgščių Baba (2 pav regione ir 3 lentelė). Tačiau, nebuvo akivaizdaus skirtumas tarp antralinėje dalyje ir korpusas izoliatų sekos sudarymo regione, išskyrus iš pacientų Nr. 27 (amino rūgštis, 134 ir 198). Mes taip pat nustatė, 5 skirtingų nonsynonymous keitimus aminorūgšties 161 6 pacientų izoliatų, palyginti su padermės J99. Tas pats scenarijus (seka specifiškumas atskirose pacientų padermių bet ne tarp antralinėje dalyje ir corpus izoliatų) buvau Babb
sekas. 1 pav PGR laminavimo modeliai babAB genotipų. (A), gruntas poros naudojami genų aptikti ne locus A ir B. Pirmyn gruntus, HypDF1 ir S18F1, esančių tiekėjų regione Baba
arba Babb
, yra suporuotas su BabAR1 arba BabBR1 gruntų siekiant nustatyti, ar genas ne locus A ir B yra baba
arba Babb
. (B) PGR laminavimo modeliai genotipo B, AB B, A, AB ir AB "AB. AB B genotipo parodė dvi bakterijų populiacijas vieną stovyklavietėje izoliatas, dominuojanti, kaip baba parsisiųsti ir nepilnamečio kaip Babb
, ne locus A. kamienas su A AB genotipo atstovavo dominuojančią gyventojų Babb ir nepilnamečio gyventojų Baba
ne locus B AB B ir A AB derinys buvo apibrėžta kaip AB "AB genotipą. Lane M1 100 BP molekulinės žymeklis; Lane M2, L Hindlll žymeklis. Iš PGR produktų dydis ne locus A ir B buvo 2.1-2.6 kb ir 1,0-1,5 kb, atitinkamai.
3 lentelė aminorūgščių Baba koduojami Baba ne lokuso A
amino vietą rūgščių pakeitimai
bylą Nr
6
9
37
92
131
134
136
161
165
166
198
202
204
206
212
218
25
l
T
N.
N.
K
T
R
Y
G
N.
S
T
T
El
S
27
l
N.
N.
, T, K, T
D
G
N. K
S
T
T
Klausimas
P
2
l
A
S
S
N
El
T
K
Y
S
N.
S
T
T
El
S
24
l
N.
N.
K
i
T
Y
G
N
El
S
T
El
D
6
l
N.
O
Klausimas
T
P
Y
G
N
N.
T
T
S
26
F
A
N
N.
K
T
S
Y
G
N.
S
N. pervežimas
El
S
CT kartojasi Baba ir Babb ne locus B
genų ne locus B reguliuoja CT kartojasi per 5 'kodavimo regioną, o CT skaičius pakartoja (5, 8 ir 11) padaryti rėmo baltymo ekspresija galimą [12, 20]. CT kartojasi iš Babb
geną locus B rodomi 4. Corpus izoliatų 7 iš 12 pacientų iš CT kartojasi iš Babb
geno pokyčius esant locus B lentelėje, ir Ertmė izoliatų tiems pacientams, visada turi tas pačias KT kartojasi, išskyrus paciento 17 (4 lentelė) .table 4 CT skaičius kartoja per 5 'kodavimo regionas Babb ne locus B
Byla Nr
Ertmė izoliatų (N = 2)
(KT Pakartokite numeris)
Korpus izoliatai (N = 2)
(KT Pakartokite numeris)
Concordance
keitimas CT pakartoti Europos Sąjungos oficialiajame Corpus
2
8, 8
8, 8
+ -
12
8, 8
8, 8
+
- CR.LT 24
7, 7
7, 7
+ -
30
11, 11
11, 11
+ UAB -
1
8, 8
7, 10 -
+
11
8, 8
7, 9 -
+
26
8, 8
8, 9 -
+
6
9, 9
9, 12 -
+
21
7, 7
9, 10 -
+
27
9, 9
9, 8 -
+
14
8, 8
7, 7 -
- CR.LT 17
7, 10
8, 7 -
+
Keturiems pacientams (Nr. 2, 12, 24, 30) buvo užsikrėtę izoliatų su vienos rūšies CT pakartoti (7, 8 ir 11) visoje antralinėje dalyje ir corpus, tačiau tik vienas iš jų (ne 24). Turėjo kadro Babb
situaciją , Ir kitiems pacientams (Nr. 1, 11 ir 26), jų Ertmė izoliatų nuo 8 CT kartojasi bet geltonasis izoliatų pakeistas į 7, 9 arba 10 kartojasi. Dėl pacientų (Nr. 6, 21 ir 27), kurie buvo užsikrėtę antralinėje dalyje išskirtų su 7 ar 9 CT kartojasi, jų korpusas izoliatų taip pat turėjo KT kartojasi kaita, bet CT kartojasi skaičius buvo dar iš rėmo (9 , 10 ir 12), išskyrus vieną izoliato iš pacientų Nr. 27 (KT kartoja = 8).
Genotipas ir baba išraiška
Norėdami nustatyti Baba poveikį
ne locus A ir B ant Baba išraiškos (3A pav), mes nustatėme, kad baba
ne lokuso B nebuvo akivaizdžiai įtakos Baba išraiškos lygį, lyginant su izoliatų 19C3 (A AB) ir 19C1 (AB). Visi izoliatai (26A1, A4, C2 ir C3) turėjo A AB genotipą, bet CT kartojasi iš Baba
čia locus B C2 buvo iš rėmo. Baba išraiška nebuvo paveikti ar baba
ne locus B buvo arba iš rėmo. Mes taip pat nustatyti, ar mišrus genotipas ne locus A paveiktų Baba išraišką, ir nustatė 14C2 ir 14C3 su AB "B genotipo (baba /Hsp60 santykis: 0,76 ir 0,70) turėjo šiek tiek mažesnę raišką, nei 14A2 ir 14A4 su AB genotipu (baba /Hsp60 santykis: 0,90 ir 0,87, 3B pav.) AB "AB" genotipas taip pat turėjo mažesnę Baba išraišką nei B (baba /Hsp60 santykis: 1.09 ir 0,89, 3c pav.) 2 pav Baba sekas ne locus A į antralinėje dalyje ir corpus izoliatai. Kardinolas skaičiai nurodo skirtingus pacientų izoliatai. A1-4 ir C1-4 buvo vieno kolonija izoliuoti izoliuota nuo antralinėje dalyje ir corpus, atitinkamai. Balta paryškinimas rodo amino rūgščių skiriasi nuo bendru sutarimu.
Diskusija Viesbutis The iš intragenomic rekombinacija tarp Baba
ir Babb
buvo įrodytas in vitro parsisiųsti ir in vivo
eksperimentų atsiradimo, implicating tai mechanizmas gali galbūt padėti H. pylori
pritaikyti žmogaus skrandžio [12, 14]. Be to, mišrios genotipai Baba
ir Babb
ne locus A arba B buvo įrodytas [20]. Klinikinis asociacija, baba
ir Babb
genotipo H. pylori
padermių ir genetinės profilis su infekcijomis antralinėje dalyje ir corpus vieną priimančiosios vis dar neaišku. Šiame tyrime mes parodė, kad AB "AB" genotipas, vienas dominuojantis genotipas į antralinėje dalyje, buvo susijęs su ikivėžinių pažeidimo kaip IM ir koreliuoja su skrandžio vėžiu. Tačiau H. pylori
infekcija tokia AB "AB genotipo nėra švino į daugiau tankus kolonizacijos ar uždegimas sunkumo skrandžio histologiją. Mūsų duomenys rodo, H. pylori, baba parsisiųsti ir Babb
genotipai kaip AB AB kancerogenezėje metu turėtų būti bent jau daryti geriau prisitaikyti prie skrandžio aplinkoje.
Colbeck kt
. [20] nustatė, 9 genotipus (B, AB, B A AB ", A, B B B A, B, C, C B ir B AB) savo tyrime. Nepaisant to, mūsų tyrimas nustatė tik keturis genotipus (B A AB ", AB, B ir AB" ab) 168 izoliatai 19 pacientų antralinėje dalyje ir korpuso (2 lentelė). Tai rodo, genotipas įvairovė babAB
Taivano izoliatų gali būti akivaizdžiai mažiau komplikuoti. Be to, bent vienas Baba
genas ne locus A egzistavo kiekvienoje izoliatų. Ši išvada yra suderinama su mūsų ankstesnėje ataskaitoje atskleisti Taivano H. pylori
izoliatai yra beveik 100% Baba
-positive [17], ir remti didesnį paplitimą Baba
H. pylori
padermės iš Rytų Azijos šalių, nei iš Vakarų pasaulių [23]. Be to, Matteo ir kt
. [24] parodė, kad 9 iš 34 pacientų (26,5%) buvo BaB
genų variacijos visoje antralinėje dalyje ir korpuso vienos priimančiosios tam tikru laiko momentu. Mes nustatėme, kad 12 iš 19 pacientų (63,2%) užkrėsti daugiau nei vieną genotipu, vienas arba abu skrandžio nišos. Paplitimas neatitikimas tarp dviejų tyrimų gali būti dėl to, kad BAB pervežimas genotipo analizę nuo bakterijų baseine ar vieno kolonijos izoliato.
Analizė Baba
ir Babb sekų
atskleidė, kad nonsynonymous pavadavimų nuo amino rūgštys įvyko tarp atskirų padermių (2 pav, 3 lentelė ir duomenų neparodyta), bet ne skiriasi tarp skrandžio nišos. Puikybė ir kt
. [11] taip pat parodė didelį alelių įvairovė per baba
ir Babb
į padermių iš skirtingų pacientų. Sprendžiant iš 6 skirtingų nonsynonymous pavadavimų aminorūgšties 161 6 pacientų padermių, kad kodono buvo labai įvairi svetainė. Tai verta toliau tirti, nes tai gali būti specialus svetainė atsakingas už prisitaikant prie skirtingų atskirų skrandžius.
KT kartojasi per 5 'kodavimo regioną Baba
ir Babb
dažniau rasti locus B nei locus A [20]. Mes nustatėme, kad Corpus izoliatų buvo didesnis dažnis pokyčių skaičiaus CT pasikartojimai Babb
ne locus B nei Ertmė izoliatų (4 lentelė). Tarp šių 7 pacientų, užkrėstų tekstyno izoliatų su CT kartojasi kaita, tik vienas (pacientų Nr. 27) turėjo izoliatas keičiasi KT kartoja į rėmo (CT = 8) (4 lentelė). Tai duomenys rodo, kad Babb išraiška galėtų būti tvirtai kontroliuojamos fazės keistis dėl out karkasinių pasikartojimų korpuso. Tarp 12 pacientų, užkrėstų izoliatų su daugiau nei viena genotipo, jų išskirtų iš antralinėje dalyje turi didesnę spartą AB ir AB AB, kaip dominuojančių genotipų nei tekstyno (vs
9/12 2/12, P.
< 0,05 ). Be to, pusė šių pacientų neturėjo dominuojančią genotipą jų Corpus izoliatai. Šie rezultatai rodo, in tekstyno aplinka gali skatinti kitokį pritaikymas izoliatų su skirtingais H. pylori
genetinių skirtumų.
Į AB AB genotipo buvimas buvo didesnis GC pacientams, sergantiems vyresnio amžiaus (1 lentelė). Be to, AB AB "genotipas nėra susijęs su sunkesne uždegimo ar ikivėžinius pokyčius ne vėžiu sergantiems pacientams. Remiantis šia skerspjūvio klinikinės histologinio duomenimis, tai rodo, AB AB kamienai gali turėti geresnį prisitaikymą prie vėžinių aplinkos skrandyje, o ne iš pirmaujančių į daugiau toksiškumo skrandžio kancerogenezėje. 3A pav, mes parodome, kad baba
geną lokuso Vyraujanti nustato Baba išraiška, ir mišrios genotipas kaip AB ne locus A gali sumažėti Baba išraišką (3b pav ir 3C). Tokiu būdu galima mišrus genotipas kaip AB ne locus A gali H.pylori
izoliatai būti pogrupį prarasti Baba išraiška. Arba mišrios genotipas kaip AB ne locus B galbūt leistų H.pylori
pakeisti Babb išraiška ir todėl nusipelno tolesnio tyrimo.
Be to, mūsų ankstesni duomenys parodė, kad Lewis intensyvumas b tapti sumažėjo antralinėje dalyje atrofija, tačiau gali būti saugomi corpus tarpininkauti aukštąjį kolonizaciją klaidą perten [17]. Taigi, tai taip pat turi būti implicative patikrinti, ar AB AB "genotipas Vyraujanti į antralinėje dalyje gali turėti pranašumą prisitaikyti skrandžio epitelį su silpna Lewis b išraiškos ateityje.
Išvados Viesbutis The H. pylori pervežimas izoliato Baba parsisiųsti ir Babb
genotipas kaip AB "AB genotipo koreliuoja su padidėjusiu skrandžio vėžio rizikos ir kolonizuoti į Ertmė svarbiausiam būdu. Toks AB "AB" genotipas turi būti susijęs su geriau prisitaikoma prie skrandžio ikivėžinių ar vėžio aplinkoje, ir galbūt sukelti subpopuliacijas prarasti baba ar Babb.
Metodai
pacientų ir bakterijų izoliatų
A 92 H. pylori kamienai buvo auginamos iš biopsijos pacientų, kuriems skirtingų klinikinių ligos, kaip dvylikapirštės žarnos opa (DU, n = 18), skrandžio opa (GU, n = 27), gastritas (n = 27), arba skrandžio vėžys (GCA, n = 20), kuris apibrėžiamas Endoskopiškai su histologinio patvirtinimo. Visi pacientai buvo davęs sutikimo, ir patyrė panendoscopy mūsų institute. panendoscopy kiekvienam pacientui metu buvo gauti penki bitai skrandžio biopsija, įskaitant 2 iš antralinėje dalyje, 2 iš tekstyno ir 1 iš Cardia. Bakterijų kultūros ir histologinis ištyrimas buvo taikoma kaip ankstesniame straipsnyje [17]. Šis tyrimas buvo patvirtintas "Žmogiškųjų eksperimentuoti ir etikos komiteto Krašto Cheng Kung universitetinė ligoninė" (Nr HR-98-023).
Vieno kolonija izoliuoja nuo antralinėje dalyje ir tekstynas buvo atsitiktinai atrenkami iš pirminių kultūros plokščių. Už kiekvieną svetainę, bent 3-4 vieno kolonijas izoliatai buvo atsitiktinai atrinkti siekiant nustatyti babAB
genotipą. Kolonija kultūra DNR ekstrakcijai buvo mažesnis nei 8 ištraukos sumažinti genetinės variacijos in vitro galimybę. Kiekvienas iš 19 pacientams, infekuotiems į antralinėje dalyje ir corpus iki izoliatų su tuo pačiu RAPD laminavimo modelis buvo aprašyta anksčiau [22].
Aptikimas Baba ir Babb genotipai
Baba
ir Babb
aptikimo genotipas buvo remiantis Colbeck et al
[20] metodu. HypDF1-BabAR1 ir HypDF1-BabBR1 pradmenys buvo naudojamos siekiant nustatyti, ar ne locus geną buvo baba
arba Babb
. Tokiu pačiu būdu, S18F1-BabAR1 ir S18F1-BabBR1 pradmenys buvo taikomi siekiant nustatyti, ar ne locus B genas buvo baba
arba Babb
(1A pav.) 40 ciklų amplifikacija reakcijų buvo atliktas su 20 pmoles grunto, 0,15 mM kiekvieno dezoksinukleozidtrifosfatas, reakcijos buferyje su MgCl 2 ir 1 U Taq DNR polimerazė (New England Biolabs Beverly, MA, JAV) galutinio tūrio 50 mikrol. Šiluminių ciklų sąlygos buvo anksčiau [20] aprašyta. Kiekvienas amplifikuotas produktas (20 mikrol) buvo analizuojama 1% agarozės gelyje tamsintas su etidžio bromido. 3 paveikslas Baba ne lokuso Vyraujanti nustatomas Baba išraiška. (A), poveikis Baba
ne locus B ant Baba
expression.The izoliuoti (19C3) turėjo Baba
ne locus A ir rėmo CT kartojasi Baba
ne locus B, kuris buvo palyginti su izoliato tik turint Baba
ne locus A (19C1). Baba buvimas
ne locus A ir B buvo per izoliatų 26A1, A4, C2 ir C3, bet C2 turėjo kadro Baba
Out at locus B (B) Poveikis mišrių genotipo ne locus įtakos Baba
išraiška. Izoliatai iš vieno paciento (14 nr.) Turėjo mišrios genotipą ne locus A (14C2 ir C3), kuris buvo palyginti su tais, su baba
tik locus A (14A2 ir A4). (C) Palyginimas Baba
tarp AB, AB ir B genotipo. Hsp60 buvo kaip vidaus kontrolė.
Genotipas apibrėžimas Viesbutis The Baba parsisiųsti ir Babb
genotipas kiekvieno vieno kolonijos izoliato buvo grindžiamas ankstesniu aprašymas [20]. J99-kaip izoliatas rodė sulėtėjusią PGR juostos Baba
ne locus A ir Babb
ne locus B ir buvo apibrėžta kaip "A B genotipo" (1b paveikslas-A). Vieno kolonija izoliatas, kuriame yra tiek Baba parsisiųsti ir Babb
tuo pačiu lokuso buvo apibrėžiamas kaip "mišrių genotipo" (pavyzdžiui, AB "B, A, AB ir AB AB), nurodant, kad buvo pogrupius, kaip bakterijų populiacijos gautas iš vieno kolonija. Izoliatas su AB "B genotipo esančius vieną gyventojus su baba parsisiųsti ir kitas gyventojų su Babb
tuo pačiu locus A (pav 1B-b). A AB "genotipas atstovavo dvi bakterijų populiacijas, dominuojančią vieną su Babb
ir nedidelių vieną su baba
čia locus B, nors abu yra kilę iš vieno kolonijoje (pav 1B-C). Mišri genotipas aptikti tiek locus A ir B buvo apibrėžiamas kaip AB AB (pav 1B-D).