Helikobakteeri kliinisiä kantoja on erilaisia ​​babAB genotyyppi jakaumien yli erilaiset topografisten sivustojen vatsaan korrelaatio kliinisen taudin tulosten

Helikobakteeri
kliinisiä kantoja on erilaisia ​​babAB
genotyyppi jakaumien yli erilaiset topografisten sivustojen vatsaan korrelaatio kliinisen taudin tuloksiin
tiivistelmä
tausta
Intragenomic rekombinoitavien Baba
ja Babb
välittää antigeenin vaihtelu ja voi auttaa helikobakteeri
kolonisaation. Tässä tutkimuksessa määritetään, onko muuttuja genotyyppejä Baba
ja Babb
korreloi eri kliinisen taudin tuloksia, ja voi jakaa yli eri mahalaukun markkinaraon.
Tulokset
Tutkimukseen otettiin 92 kliinistä kannat (45 mahahaava 27 gastriitti, ja 20 mahalaukun syöpä) tunnistaa, onko Baba
ja Babb
ovat lokuksen A tai B PCR-reaktioissa käyttämällä alukkeita suunniteltiin ylävirran ja vaihteleva alue Baba
ja Babb
geenejä. Neljä genotyyppien Baba
ja Babb
(A B, AB B, A AB, AB AB) ei löytynyt. Jakauma 4 genotyyppien 92 kliinisissä kannoissa oli merkittävästi erilainen potilailla, joilla on eri mahalaukun sairauksien (p
< 0,05). Isolaatit mahasyöpä potilailla oli korkeampi AB AB genotyypin kuin ei-syöpäpotilasta (40,0% vs.
9,7%, p
< 0,05). AB AB genotyyppi liittyi suurempi intensiteetti suoliston metaplasiaa (p
< 0,05), mutta ei korreloinut korkeampi tulehdusta ja kolonisaatio tiheys mahalaukun histologian (p
> 0,05). Sitä paitsi tutkimukseen otettiin 19 potilasta tarkistaa, onko muuttuja genotyypin babAB
olemassa eri mahalaukun markkinaraon. Niistä potilaista tartunnan useampia babAB
genotyypit yli antrum ja korpus oli korkeampi genotyyppien kuin AB tai AB AB isolaateissa antrumissa kuin niillä, corpus (75,0% vs.
16,7%, p
< 0,05).
Johtopäätökset
helikobakteeri
eristää kanssa AB AB genotyyppi korreloi lisääntyneeseen mahalaukun syövän riski, ja asuttaa käytettäessä antrumin hallitseva tavalla.
Background
Helicobacter pylori
infektion riskiä mahahaava ja mahalaukun adenokarsinooman ihmisen vatsa [1-3]. Helikobakteeri
noudattaminen mahalaukun epiteelin ja toimittaa effektorit aiheuttaa tulehduksen [4, 5]. Yksi parhaiten tutkittu adhesiineista on veriryhmäantigeeniä sitova adhesiini (Baba), joka sitoo Lewis b (Leb) ja liittyvät ABO-antigeenejä [6, 7]. Otaksutun adhesiini, Babb, koodataan Babb
, joka jakaa lähes identtinen N- ja C-terminaalisia sekvenssejä Baba
[7, 8]. Käännetty sijainnit kromosomissa Baba
ja Babb
välillä rasitusta J99 ja 26695 todistaa rekombinaatiotapahtumat näiden kahden geenin [9, 10]. Molemmat geenit osoittavat myös maantieteelliset ja alleelivariaatiota [11]. Lisäksi päällekkäisyyttä Baba
tai Babb
geeni välittyy geenikonversiota eri kromosomi loci [12-14]. Bäckström ym
. [14] osoittivat, että hiljaisen Baba
geeniä Leb-nonbinding kanta voidaan aktivoida rekombinaation avulla BABB
geenin. Reesusapina malli osoitti, että suurin osa talteen isolaatit ovat korvanneet Baba
toisen kopion Babb
useiden viikkojen kuluttua infektion [12].
Länsimaissa saaneiden potilaiden Baba
-positiivisille H . pylori
isolaatteja liittyy lisääntynyt riski mahahaava sairauksia [15, 16]. Kuitenkin tämä yhdistys ei ole vahvistettu potilailla päässä Itä-Aasia, tai joissakin muissa länsimaissa [17-19]. Colbeck ym
. [20] käytetään PCR tunnistaa, onko alavirtaan hpyD
(locus A) ja S18
(lokus B) ovat Baba
tai Babb
ja löysi yhden pesäkkeen eristämiseksi ristiriitaisin BABA
ja Babb
genotyyppi samaan lokukseen, osoittaen alapopulaatioita sisällä bakteerien johdettu yksittäinen pesäke. On syytä vastata, onko geneettinen profiilit Baba
ja Babb
voisi liittyä eri kliinisen taudin tuloksista tai erityiset helikobakteeri
-aiheiset histologisia ominaisuuksia.
Olemassa erilaisia ​​hallitseva solu tyyppejä antrumin ja corpus. Parietaalisoluihin tuottavat HCl paikantaa corpus ja tehdä eri pH liukuväriä antrumiin. Aikaisemmat tutkimus osoitti kroonista helikobakteeri
infektio ilmaisivat suurempi intensiteetti Lewis b mahalaukun epiteelin corpus kuin Antrumin [17]. Rekombinoitavien Baba
ja Babb
voisi auttaa helikobakteeri
muuttaa tarttuvuus kyky mukautua eri kapeampiin mahassa [21]. Näin ollen se ansaitsee määrittää genotyyppi jakelun Baba
ja Babb
että H. pylori
infektion aikana eri topografisten paikoissa joko antrum tai corpus ihmisen vatsassa. Tässä tutkimuksessa olemme analysoineet kliinistä merkitystä Baba
ja Babb
genotyyppien ja läsnäolo Baba
ja Babb
Locus A ja B useiden pesäkkeitä eri mahalaukun kapeampiin ymmärtää babAB
geneettinen profiili H.pylorin
isolaattien poikki mahan alueilla samassa isäntä.
tulokset
jaettavat Baba ja Babb genotyypit potilailla, joilla on erilaiset kliiniset sairaudet
havaitseminen babAB
genotyyppien oli joka perustuu alukkeen suunnittelu esitetään kuviossa 1. Niistä 92 kantoja, jakelu neljän genotyyppien (AB, AB B, A AB ja AB AB) oli 46 (50%), 21 (22,8%), 10 (10,9%) ja 15 (16,3%), vastaavasti. Ei ollut eroa sukupuolten jakautumista eri genotyyppiä (Chi-square testi, p
> 0,05). Keskimääräinen ikä saaneiden potilaiden genotyyppi kuin AB AB oli hieman vanhempi kuin tartunnan muiden genotyyppien (57,6 vs. 50,3 vuotta, Independent-otoksen t-testi, p
= 0,09). Jakaumia neljästä genotyypit olivat merkittävästi erilainen potilailla, joilla on erilaiset kliiniset sairaudet (taulukko 1, Chi-square testi, p
= 0,04). Keski-ikä GC potilailla oli suurempi kuin muiden syöpäpotilaiden (58,6 vs.
49,5 vuotta, Independent-otoksen t-testi, p
= 0,01). Käyttöön otettu AB AB genotyypin potilaiden GC oli korkeampi kuin kolmeen ryhmään ei-syöpäpotilasta (40,0% [8/20] vs.
9,7% [7/72], Fisherin eksakti testi, p
< 0,05, riskisuhde: 6,2; 95% CI: 1,9-20,3) .table 1 Baba ja Babb genotyypin helikobakteeri eri kliinisistä potilasryhmien
N (%) B
DU
(n = 18)
GU
(n = 27)
gastriitti
(n = 27)
GC
(n = 20)
Yhteensä
(n = 92)
tilastot
p
arvo
AB
11 (61,1)
14 (51,9)
15 (55,6) B 6 (30) B-46 (50) B 0,039
AB B
6 (33,3) B 4 (14,8)
7 (25,9) B 4 (20) B 21 (22,8)
AB
0 (0) B 4 (14,8) B 4 (14,8) B 2 (10) B-10 (10,9) B AB AB
1 (5,6) B-5 (18,5)
1 (3,7) B-8 (40) B 15 (16,3 )
DU: pohjukaissuolihaava. GU: mahahaava. GC: mahasyöpä. Ero neljän genotyyppien mahalaukun sairauksien arvioitiin Chi-neliö testi.
Koska AB AB genotyyppi oli suurempi potilailla, joilla on mahalaukun syövän, testasimme lisäksi, onko tällainen genotyyppi voi johtaa korkeampaa precancerous muutokset tai ankarampaa histologisia tulehdus. Niistä potilaista, joilla GC, AB AB genotyyppi liittyi suurempi intensiteetti suoliston metaplasiaa (IM) Antrumin verrattuna ei-AB AB genotyyppi (2,0 vs.
0,27, p
= 0,02). Kuitenkin ei-syöpäpotilaita, AB AB genotyyppi ei liittynyt korkeampia akuutin tulehduksen pisteet (summa antrum, corpus ja cardia: 3,43 vs.
2,94, p
> 0,05), krooninen tulehdus tulokset (summa antrum, corpus ja cardia: 7,29 vs.
7,22, p
> 0,05), helikobakteeri
tiheys (summa antrum, corpus ja cardia: 8,14 vs.
8,84 , p
> 0,05), tai intensiteetti IM (0,43 vs.
0,51, p
> 0,05) verrattuna ei-AB AB genotyypin.
ero Baba ja Babb genotyyppi isolaattien välillä antrumiin ja corpus
Sillä 19 potilailla, jotka tarjotaan isolaateissa eri mahalaukun markkinaraon yli antrumiin ja corpus, genotyyppi koostumus Baba
ja Babb
locus A ja B niiden antrumin ja corpus isolaattien on esitetty taulukossa 2. Neljä potilasta (no. 7, 12, 29, 30) infektoitiin AB genotyyppi rasitusta poikki antrumiin ja corpus, ja 15 potilasta todettiin sekoitettu genotyypin kannat (AB B, A AB tai AB AB) vain corpus tai molemmat mahalaukun markkinaraon. Näissä 15 potilasta, 3 potilasta (no. 28, 2, 4) oli sama sekoitettu genotyyppien koko antrumissa että korpuksessa. Kahdeksan Loput 12 potilaista oli yksi suuri genotyyppi sekä kautta mahalaukun markkinaraon. Yhdistämistä 7 potilasta (no. 7, 12, 29, 30, 28, 2, 4), jossa on vain yksi genotyyppi, 78,9% (15/19) meidän potilaista oli yksi suuri genotyyppi jakautunut kahteen niches.Table 2 genotyyppi koostumukset antrum ja korpus helikobakteeri isolaateissa 19 potilasta
Case No.
babAB
genotyyppi isolaattien
Major babAB
genotyyppi poikki antrum & corpus
Hallitseva genotyypin Antrumin /corpus
AB tai AB AB hallitsevina genotyyppi 12 saaneiden potilaiden useampia genotyypin
antrum (n)

corpus (n)
antrum
corpus
7
AB (4) B-AB (4)
AB
AB /AB
x
x
12
AB (4) B-AB (4) B AB
AB /AB
x
x
29
AB (4) B-AB (4) B AB
AB /AB
x
x
30
AB (4 ) B AB (4) B AB
AB /AB
x
x
28
AB (4)
AB (4) B AB
AB /A AB
x
x
2
AB AB (4) B-AB AB (4) B-AB AB
AB AB /AB AB
x
x
4
AB AB (4) B-AB AB (4) B-AB AB
AB AB /AB AB
x
x
1
AB AB (3) B-AB AB (2) B-AB AB
AB AB /-
+
- AB B (1) B- AB B (2) B-3
AB B (3) B-AB B (4) B AB B
AB B /AB B -
-
AB (1) B-6
AB AB (3)
AB (1) B-AB AB (4) B-AB AB
AB AB /AB AB
+
+
10
AB AB (3) B-AB B (4) -
AB AB /AB B
+
- AB B (1)
19
AB (3) B-AB (3) B-AB
AB /-
+
- AB (4) B-21
AB (4) B-AB (3) B-AB
AB /AB
+
+
AB B (1) B-25
AB (4)
AB (1) -
AB /AB B
+
- AB B (3) B 14
AB (4) B-AB (2 ) B AB
AB /-
+
- AB B (2) B-AB B (2) AB AB (2) B 24
AB (3 ) B AB (1) -
AB /-
+
- ab (1) B-AB B (1)
AB (2)
27
AB (3) B-AB (1)
AB
AB /A AB -
-
AB AB (1)
ab (3) B 11
AB (4)
AB (2) -
AB /-
+
- AB B (1 ) B AB AB (3) B-AB AB (2) B 17
AB (3) B-AB (3) B-AB
- /-
-
-
AB B (3)
AB (1)
AB (2) B-AB AB (2) B-potilaalla ei. 1, 3, 6, 19 ja 21, jotka sairastui 2 genotyyppejä, on vielä merkittävä yksi kaikkialle sekä mahalaukun markkinaraon, ja että myös vuonna 2 (no. 14, 27) potilasta, joilla on 3, ja 1 (no. 17) Potilas, jolla 4 genotyyppejä edustettuina niiden infektioita. - Osoittaa, että potilailla on ei-hallitsevan Baba
ja Babb
genotyyppi on isolaattien antrumiin tai corpus. Potilaiden määrä oli mukaan edellisessä tutkimuksessa [22].
Joukossa 12-infektiota sairastavilla potilailla useampia genotyypin (taulukko 2), taajuus suurten hallitseva genotyyppi, AB yhdistettynä AB AB, Antrumin oli korkeampi verrattuna corpus (75% [9/12] vs.
16,2% [2/12], p
= 0,012, kerroinsuhde: 15). Kuitenkin 6 potilasta 12 puuttui hallitseva genotyypin niiden corpus isolaateissa.
Sekvenssianalyysi ja vertailu
Locus A, kunkin potilaan antrumiin ja corpus isolaatit oli erityinen aminohapposubstituointeja alueella Baba (kuvio 2 ja taulukko 3). Kuitenkin, ei ollut selvää eroa antrum ja corpus eristää sekvensointi alueella, lukuun ottamatta potilaalla ei. 27 (aminohappo 134 ja 198). Olemme myös löytäneet 5 eri nonsynonymous substituutioita aminohapossa 161 6 potilaiden isolaatit verrattuna kannan J99. Sama skenaario (sekvenssispesifisyytensä yksittäisten potilaiden kantoja, mutta ei välillä antrum ja corpus isolaatit) oli Babb
sekvenssit. Kuva 1 PCR vyöhykekuvia of babAB genotyyppien. (A) käytetyt alukeparit geenin detektio lokuksen A ja B. eteenpäin-alukkeita, HypDF1 ja S18F1, joka sijaitsee ylävirran Baba
tai Babb
, pariksi BabAR1 tai BabBR1 alukkeita onko geenin lokuksen A ja B on Baba
tai Babb
. (B) PCR vyöhykekuvia genotyypin A B, AB B, A AB ja AB AB. AB B genotyyppi havaittiin kaksi bakteerien populaatioita yhden pesäkkeen eristämiseksi, hallitseva kuten Baba
ja pienet kuin Babb
, Locus A. rasittava AB genotyyppi edusti valtaväestön of Babb ja vähäinen väestöstä BABA
locus B. yhdistelmä AB B ja A AB määriteltiin AB AB genotyyppi. Lane M1, 100 emäsparin molekulaarinen merkkiaine; kaista M2, l HindIII merkki. Koko PCR-tuotteiden lokuksen A ja B oli 2,1-2,6 kb ja 1,0-1,5 kb, vastaavasti.
Taulukko 3 aminohapposubstituutioita Baba koodaa Baba on kasvupaikalle
sijainti amino nohapposubstituutiot
Case No.
6
9
37
92
131
134
136
161
165
166
198
202
204
206
212
218
25
L
T

N
N
K
T
R
Y
G
N
S
T
T
E
S
27
L


N
N
T, K
T

D
G
N, K
S
T
T
Q
P
2
L

S
S
N
E
T
K
Y
S
N
S
T
T
E
S
24
L


N
N
K
I
T
Y
G
N
E
S
T
E
D
6
L


N
H
Q
T
P
Y
G
N
N
T
T

S
26
F


N
N
K
T
S
Y
G
N
S
N

E
S
CT mallikertaa Baba ja Babb locus B
Genes locus B säätelevät CT toistuu 5 'koodaavan alueen, ja määrä CT toistaa (5, 8 ja 11) tekevät in-frame-proteiinin ilmentymisen mahdollista [12, 20]. CT mallikertaa BABB
geenin lokukseen B on esitetty taulukossa 4. corpus eristää 7 12 potilaista oli muutos CT toistojen BABB
geenin lokukseen B, ja antrum eristää potilaista, jotka on aina sama CT toistuu, paitsi potilaan 17 (taulukko 4) .table 4 määrä CT toistaa 5 'koodaavan alueen BABB on lokuksen B
asiassa nro
antrum-isolaattien (n = 2) B (CT toistolukumäärä)
Corpus isolaatit (n = 2) B (CT toistolukumäärä)
Concordance
muutos CT toista vuonna corpus
2
8, 8
8, 8
+
- 12
8, 8
8, 8
+
-
24
7, 7
7, 7
+
- 30
11, 11
11, 11
+
-
1
8, 8
7, 10 -
+
11
8, 8
7, 9 -
+
26
8, 8
8, 9 -
+
6
9, 9
9, 12 -
+
21
7, 7
9, 10 -
+
27
9, 9
9, 8 -
+
14
8, 8
7, 7 -
-
17
7, 10
8, 7 -
+
Neljä potilasta (no. 2, 12, 24, 30) on tarttunut sellaisia ​​kantoja yhdenlaisen CT toista (7, 8 ja 11) poikki antrumiin ja corpus, mutta vain yksi niistä (no. 24) oli pois kehyksen Babb
. Muista potilaista (no. 1, 11 ja 26), niiden antrum-isolaattien sisälsi 8 ​​CT toistoa, mutta corpus isolaattien muutettiin 7, 9 tai 10 toistaa. Potilaille (no. 6, 21 ja 27), jotka olivat saaneet Antrumin isolaateissa 7 tai 9 CT toistoja, niiden corpus isolaatit oli myös muutos CT toistaa, mutta määrä CT toistojen oli vielä ulos rungon (9 , 10 ja 12), paitsi yksi isolaatti potilaalla ei. 27 (CT toistuu = 8).
Genotyypin ja Baba ilmaus
vaikutuksen määrittämiseksi Baba
Locus A ja B Baba ilmaus (kuvio 3A), huomasimme, että Baba
Locus B ei ilmeisesti vaikuta tason Baba ilmentymisen, verrattuna isolaattien 19C3 (A AB) ja 19C1 (AB). Kaikki isolaatit (26A1, A4, C2 ja C3) oli A AB genotyyppi, mutta CT toistoa Baba
Locus B C2 oli pois rungon. Ilmaisu Baba ei vaikuta se, onko Baba
Locus B oli tai ulos rungosta. Olemme lisäksi määritetään, onko seka genotyyppi kasvupaikalle vaikuttaisi Baba ilmaus, ja löysi 14C2 ja 14C3 kanssa AB B genotyyppi (Baba /Hsp60-suhde: 0,76 ja 0,70) oli hieman alempi ilmaisun kuin 14A2 ja 14A4 kanssa AB genotyyppi (Baba /hsp60-suhde: 0,90 ja 0,87, kuvio 3B). AB AB genotyyppi oli myös alempi Baba ilmaus kuin A B (Baba /Hsp60-suhde: 1,09 ja 0,89, kuvio 3C). Kuva 2 Baba sekvenssit Locus A antrum ja corpus isolaatteja. Cardinal numerot osoittavat eri potilaiden isolaatteja. A1-4 ja C1-4 olivat yhden pesäkkeen eristää eristetty Antrumin ja corpus, vastaavasti. Valkoinen korostus osoittaa aminohappoa eroaa konsensus.
Keskustelu
esiintyminen intragenomic rekombinoitavien Baba
ja Babb
on osoitettu in vitro
ja in vivo
kokeissa syytetään tämä mekanismi saattaa mahdollisesti auttaa helikobakteeri
sopeutua ihmisen mahalaukussa [12, 14]. Lisäksi seka-genotyyppejä Baba
ja BABB
Locus A tai B on osoitettu [20]. Kliininen assosiaatiosta Baba
ja Babb
genotyyppi helikobakteeri
kantoja ja geneettinen profiili infektioiden antrum ja korpus yksi isäntä ovat vielä epäselviä. Tässä tutkimuksessa osoitimme, että AB AB genotyyppi, yksi hallitseva genotyyppi Antrumin, liitettiin precancerous vaurion IM, ja korreloi mahalaukun syöpään. Kuitenkin helikobakteeri
infektio tällainen AB AB genotyyppi ei ole johtaa tiheämmän kolonisaatiota tai tulehduksen vaikeusasteen mahalaukun histologia. Tuloksemme osoittavat, helikobakteeri Baba
ja Babb
genotyyppien kuin AB AB tulisi ainakin käyttää paremmin sopeutumista mahan ympäristöön syövän syntymistä.
Colbeck et al
. [20] todettu 9 genotyyppien (A B, AB B, A AB, A, B B, B A, B C, C B ja B AB) tutkimuksessaan. Kuitenkin tutkimuksessamme vain löydettiin neljä genotyyppiä (A B, A AB, AB B ja AB AB) on 168 isolaateissa 19 potilaiden antrum ja corpus (taulukko 2). Se ilmaisee genotyypin monimuotoisuuden babAB
Taiwanin isolaateissa saattaa olla selvästi vähemmän mutkistaa. Lisäksi ainakin yksi Baba
geenin kasvupaikalle olemassa kussakin isolaattien. Tämä havainto on sopusoinnussa edellisessä raportissa paljastaa Taiwanin H. pylori
-bakteerit ovat lähes 100% Baba
positiivisten [17], ja tukea muita yleisemmin Baba
H. pylori
kannat Aasian maihin kuin Länsi maailmoista [23]. Lisäksi Matteo et al
. [24] osoitti, että 9 34 potilasta (26,5%) oli bab
geeni vaihtelua antrum ja korpus yksi isäntä tiettyyn aikaan piste. Huomasimme, että 12 potilaalla 19: stä (63,2%) tartunnan useamman kuin yhden genotyypin joko toinen tai molemmat mahalaukun markkinaraon. Esiintyvyys välinen ero kahdessa tutkimuksessa voi johtua analyysin bab
genotyypin bakteerin allas tai yhden pesäkkeen eristää.
Analyysi sekvenssien Baba
ja BABB
paljasti, että nonsynonymous substituutiot aminohappoja välillä ilmennyt yksittäisten kantojen (kuvio 2, taulukko 3 ja tuloksia ei esitetty), mutta ei ollut eroa mahan markkinaraon. Pride ym
. [11] osoittivat myös korkean alleelinen monimuotoisuuden Baba
ja Babb
kannoissa eri potilailla. Päätellen 6 eri nonsynonymous substituutioita aminohapon 161 6 potilaiden kantoja, että kodoni oli erittäin vaihteleva sivusto. Tämä on syytä lisätutkimuksia, koska se voi olla erityinen sivusto vastuuta sopeutumisesta yksilökohtaiset vatsat.
CT toistuu 5 'koodaavan alueen Baba
ja Babb
ovat yleisesti osoitteessa lokuksessa B kuin kasvupaikalle [20]. Huomasimme, että korpus isolaatit oli korkeampi taajuus muutosten lukumäärän CT toistojen Babb
Locus B kuin antrum isolaattien (taulukko 4). Niistä 7 potilasta tartunnan Korpuksen isolaateissa muutos CT toistoja, vain yksi (potilas ei. 27) oli eristää muuttamalla CT toistaa olevan kehyksen (CT = 8) (taulukko 4). Nämä tiedot osoittavat, että Babb ilmaisua voitaisiin tiukasti ohjata vaihe vaihtelun takia pois kehyksen toistojen corpus. Niistä 12 potilasta tartunnan isolaatteja on enemmän kuin yksi genotyyppi, heidän isolaateissa antrum on korkeampi AB ja AB AB hallitsevina genotyyppien kuin corpus (9/12 vs.
2/12, p
< 0,05 ). Lisäksi puolet potilaista puuttui hallitseva genotyypin niiden corpus isolaateissa. Nämä tulokset viittaavat siihen, ympäristön corpus voivat suosia eri sopeutumista varten sellaisia ​​kantoja eri H. pylori
geneettisen monimuotoisuuden.
Läsnäolo AB AB genotyyppi suurempi GC potilailla iän myötä (taulukko 1). Lisäksi AB AB genotyyppi ei korreloi ankarampaa tulehdus tai syövän esiasteita muutoksia kuin syöpäpotilailla. Tämän perusteella poikkileikkauksen kliinisten histologinen data, se ehdottaa AB AB kannat saattavat olla parempi sopeutuminen syöpä ympäristöön vatsassa, sen sijaan johtaa enemmän toksisuutta mahasyövän. Kuvassa 3A, osoitamme, että Baba
geenin lokuksen vallitsevasti määrittää Baba ilmaus, ja sekoitettu genotyyppi kuin AB Locus A voi vähentää Baba ilmaus (kuvio 3B ja 3C). Näin on mahdollista sekoittaa genotyyppi kuin AB Locus A voi tehdä helikobakteeri
isolaattia sisältävän alapopulaatioon menettää baba ilme. Vaihtoehtoisesti sekoitettu genotyyppi kuin AB Locus B voi mahdollisesti sallia helikobakteeri
muuttaa Babb ilmaisun ja siten ansaitsee lisätutkimuksia.
Lisäksi edellisessä tiedot ovat osoittaneet, että intensiteetti Lewis B tullut väheni antrumissa surkastuminen, mutta voidaan säilyttää corpus välittävän suurempi siirtokuntien bug overthere [17]. Niin, se on myös implicative testata onko AB AB genotyyppi dominantly antrumissa voi olla etu sopeuttaa mahalaukun epiteelin heikoilla Lewis b ilmaisun tulevaisuudessa.
Johtopäätökset
Helikobakteeri
eristää Baba
ja Babb
genotyyppi kuin AB AB genotyyppi korreloi suurentunut mahalaukun syövän riski, ja asuttaa käytettäessä antrumin hallitseva tavalla. Tällaiset AB AB genotyyppi on liittyä parempi mukautuminen mahalaukun precancerous tai syöpä ympäristöön, ja mahdollisesti tuottaa -alapopulaatioiksi menettää Baba tai Babb. Tool Menetelmät
Potilaat ja bakteerieristyksiä
yhteensä 92 H. pylori
kantoja viljeltiin biopsianäytteet potilailla, joilla on erilaiset kliiniset sairaudet, kuten pohjukaissuolihaava (DU, n = 18), mahahaava (GU, n = 27), gastriitti (n = 27), tai mahasyöpä (GCA, n = 20), on määritelty tähystys histologisia vahvistuksen. Kaikki potilaat olivat antaneet tietoon perustuvan suostumuksen ja jalostustoiminto panendoscopy meidän instituutti. Aikana panendoscopy kullekin potilaalle, viisi bittiä mahalaukun koepala, mukaan lukien 2 alkaen antrumiin, 2 alkaen corpus, ja 1 alkaen cardia saatiin. Bakteeriviljelmä ja histologiseen tutkimukseen sovellettiin kuin edellisessä artikkelissa [17]. Tutkimus hyväksyttiin "Human Experiment ja eettisen komitean National Cheng Kung yliopistollisen sairaalan (nro HR-98-023).
Yhden pesäkeisolaateista päässä antrumiin ja corpus poimittiin satunnaisesti päässä primaariviljelmän levyt. Kullekin alueelle vähintään 3-4 single-pesäkeisolaateista valittiin sattumanvaraisesti määrittää babAB
genotyyppi. Colony kulttuuri DNA: n eristämiseksi oli alle 8 kohtia pienentää mahdollisuutta geneettinen vaihtelu in vitro. Kukin 19 saaneiden potilaiden Antrumin ja korpukseen isolaattien kanssa samaa RAPD ryhmittelyä malli oli kuvattu aiemmin [22].
Toteaminen Baba ja Babb genotyyppien
havaitseminen Baba
ja Babb
genotyyppien perustui menetelmä Colbeck et al
[20]. HypDF1-BabAR1 ja HypDF1-BabBR1 alukkeita käytettiin sen määrittämiseksi, onko-geenin lokukseen A oli Baba
tai Babb
. Samalla tavalla, S18F1-BabAR1 ja S18F1-BabBR1 alukkeita käytettiin määrittämään, onko-geenin lokukseen B oli Baba
tai BABB
(kuvio 1A). 40 monistussykliä reaktiot suoritettiin 20 pmol aluketta, 0,15 mM kutakin deoksinukleosiditrifosfaattia, reaktio puskuri MgCl 2 ja 1 U Taq DNA-polymeraasia (New England Biolabs, Beverly, MA, USA) lopulliseen tilavuuteen 50 ui. Edellytykset lämpökäsittelyyn kuvattiin aiemmin [20]. Jokainen monistettu tuote (20 ui) analysoitiin 1% agaroosigeelillä värjättiin etidiumbromidilla. Kuva 3 Baba Locus vallitsevasti määritetty baba ilme. (A) vaikutus Baba
Locus B Baba
expression.The eristää (19C3) oli Baba
Locus A ja in-frame CT toistoja Baba
Locus B, jotka olivat verrattuna isolaatti vain ottaa Baba
locus A (19C1). Läsnäolo Baba
Locus A ja B oli isolaateista 26A1, A4, C2 ja C3, mutta C2 oli pois kehyksen Baba
Locus B. (B) vaikutus sekoitettu genotyypin Locus A Baba
ilmaisua. Isolaatit yhdestä potilaasta (no. 14), oli sekoitettu genotyyppi lokuksen A (14C2 ja C3), joka on verrattuna Baba
vain lokuksen A (14A2 ja A4). (C) vertailu Baba
välillä AB AB ja A B genotyypit. Hsp60 oli sisäisenä kontrollina.
Genotyyppi määrittely
Baba
ja Babb
genotyypistä kussakin yhden pesäkkeen eristää perustui edellisessä kuvauksessa [20]. J99 kaltainen eristää osoitti odotetun PCR bändejä Baba
Locus A ja Babb
Locus B ja määriteltiin "A B genotyyppi" (kuvio 1 B-a). Yksi pesäkkeitä eristää sisältävät sekä Baba
ja BABB
samaan lokuksessa määriteltiin "mixed genotyyppi" (kuten AB B, A AB ja AB AB), mikä osoittaa, että oli olemassa alapopulaatioita sisällä bakteerien johdettu yksittäinen pesäke. Isolaatti kanssa AB B genotyyppi sisälsi yhden väestölle Baba
ja muut väestön Babb
samaan lokuksen A (kuvio 1 B-b). A AB genotyyppi edusti kaksi bakteeripopulaatioita, hallitseva yksi Babb
ja vähäinen Baba
Locus B, vaikka molemmat johdettu yksi pesäke (kuvio 1 B-c). Seka-genotyyppi havaitaan sekä lokuksen A ja B määritellään AB AB (kuvio 1 B-d).

• Epätavallinen syy mahalaukun pistorasiaan tukkeuma: giant mahalaukun trichobezoar: tapaus report
• Laparoskooppinen anterior gastropexy krooninen toistuva mahalaukun kiertymä: tapaus report