H. pylori kliničkih izolata imaju različite babAB genotip distribucija preko različitih topografskih stranicama želuca s korelaciji s kliničkim bolesti outcomes

H. pylori pregled kliničkih izolata imaju raznolik babAB
genotipa distribucija preko različitih topografskih stranicama želuca s korelaciji s kliničkim ishodima bolesti pregled apstraktne pregled pozadine pregled Intragenomic rekombinacije između Baba Netlogu i Babb Netlogu posreduje antigenske varijacije i može pomoći H. pylori
kolonizaciju. Ova studija određuje da li promjenjive genotipova Baba Netlogu i Babb
korelaciji s različitim ishodima kliničke bolesti, a mogu distribuirati preko različitih želučanih nišama. Pregled Rezultati
Ova studija uključuje 92 kliničkih sojeva (45 od peptičkog ulkusa 27 od gastritisa, a 20 od karcinoma želuca) kako bi se utvrdilo je li baba pregled i Babb pregled kod lokusa a ili B pomoću PCR reakcija pomoću primera koji su oblikovani iz uzvodnog i varijabilne regije Baba Netlogu i Babb
gene. pronađena su četiri genotipova Baba Netlogu i Babb pregled (B, AB B, A AB, AB AB). Raspodjela 4 genotipova u 92 kliničkih sojeva bila značajno različita kod pacijenata s različitim želučanih bolesti (p izvoznici < 0,05). Izolata s pacijentima s rakom želuca imali veću stopu AB AB genotipa u odnosu na one iz pacijenata bez raka (40,0% vs
9,7%, p izvoznici &0,05). AB AB genotipa bila je povezana s većim intenzitetom intestinalne metaplazije (p Netlogu < 0,05), ali nije u korelaciji s većim upale i kolonizacije gustoće u želučanom histologiju (p izvoznici > 0,05). Osim toga, istraživanje je upisao 19 pacijenata kako bi provjerili jesu li promjenjive genotipova babAB Netlogu postojao u različitim želučane nišama. Među pacijenata zaraženih više od jedne babAB pregled genotipova više antruma i korpusa, bilo je viša stopa genotipova kao AB ili AB AB u izolatima iz antruma nego u onima iz korpusa (75,0% u odnosu na pregled, 16,7%, p
. < 0,05) pregled Zaključci
H. pylori
izolirati sa AB AB genotipa korelira s povećanim rizikom od raka želuca, i kolonizirati u antralnom dominantnim način pregled Pozadina Helicobacter pylori infekcija pregled povećava rizik od peptičkog ulkusa i želuca adenokarcinom ljudskog želuca [1-3]. H. pylori pregled prianjanje na želučanu epitela i isporučiti efektora da izazove upalu [4, 5]. Jedan od najbolje istraženih adhezina je obvezujuća krvna grupa antigena adhezin (Baba), koji se veže Lewis b (Leb) i srodni ABO antigena [6, 7]. Pretpostavljeni adhezin, Babb, kodiran Babb
, koji dijeli gotovo identičan N- i C-terminalne sekvencije s Baba pregled [7, 8]. Reverznim kromosomske lokacije Baba Netlogu i Babb pregled između soja J99 i 26695 dokazati rekombinacije događaja između ova dva gena [9, 10]. Dva gena se također prikazivati ​​i zemljopisni i alela varijacije [11]. Štoviše, dupliciranje Baba
ili Babb pregled gena je posredovana gena konverziju između različitih kromosomske lokusa [12-14]. Bäckström sur pregled. [14] pokazala da je tiha Baba pregled gena soja Leb-obvezujuće može aktivirati rekombinacije se u Babb pregled gena. Rezus majmuna model pokazao da je većina oporavio izolati su zamijenile Baba
s drugom kopijom Babb pregled nakon nekoliko tjedana infekcije [12].
U zapadnim zemljama, pacijenti zaraženi Baba
pozitivnih H . pylori pregled izolati su povezane s povećanim rizikom peptičkog ulkusa bolesti [15, 16]. Međutim, ova povezanost nije potvrđena kod bolesnika s istočne Azije, ili nekim drugim zapadnim zemljama [17-19]. Colbeck sur pregled. [20] koristi PCR za otkrivanje je li nizvodno od hpyD pregled (locus A) i S18 pregled (locus B) su Baba pregled ili Babb pregled i našao jednog kolonija izolirati s mješovitim Baba Netlogu i Babb
genotip na istom mjestu, što ukazuje na subpopulacije unutar bakterijske populacije izveden iz jednog kolonije. Vrijedno je odgovoriti da li su genetski profili Baba Netlogu i Babb pregled mogao biti povezan s različitim ishodima klinička bolest ili specifičnog H. pylori pregled povezani s grupom histološke značajke. Netlogu Postoje različiti prevladava stanica vrste u antruma i korpusa. Parijetalni stanice koje proizvode HCl smjestiti u korpusu i napraviti različite pH gradijent antruma. Naša prethodna studija pokazala pacijenti s kroničnim H. pylori
infekcije izrazili veći intenzitet Lewis B u želučanog epitela korpusa nego u antruma [17]. Rekombinacije između Baba Netlogu i Babb Netlogu moglo pomoći H. pylori pregled promijeniti svoje prianjanja sposobnost prilagođavanja različitim nišama unutar želuca [21]. U skladu s tim, to je vrijedno za određivanje raspodjele genotip Baba Netlogu i Babb
u H. pylori pregled infekcije tijekom različitih topografskih mjestima kao ni antruma i korpusa u ljudskom želucu. U ovoj studiji analizirali smo kliničko značenje Baba Netlogu i Babb pregled genotipova i prisutnost Baba Netlogu i Babb
na locus A i B više kolonija iz različitih želučanih nišama razumjeti babAB
genetski profil H. pylori
izolata preko želučanih regijama unutar iste domaćina. | Rezultati
Raspodjela Baba i Babb genotipova u bolesnika s različitim kliničkim bolestima pregled Otkrivanje babAB pregled genotipova na temelju dizajn početnice je prikazan na slici 1. od 92 sojeva, distribucija genotipova četiri (AB AB B, AB i AB AB) bio je 46 (50%), 21 (22,8%), 10 (10,9%) i 15 (16,3%), redom. Nije bilo razlike u raspodjeli ravnopravnost između različitih genotipova (hi-kvadrat test, p izvoznici &0.05). Srednja dob bolesnika zaraženih genotipom kao AB AB je neznatno starija od one zaražene s drugim genotipovima (57.6 vs 50.3 godina, Nezavisni-uzorak t test, p
= 0,09). Raspodjela četiri genotipova bile značajno različite u bolesnika s različitim kliničkim bolesti (Tablica 1, Hi-kvadrat test, p pregled = 0,04). Srednja dob bolesnika GC bio je veći od ostalih pacijenata bez raka (58.6 vs pregled 49.5 godina, Nezavisni-uzorak t-test, p pregled = 0.01). Stopa AB AB genotipa kod bolesnika s GC je bio veći nego u tri skupine pacijenata bez raka (40,0% [8/20] vs. pregled 9,7% [7/72], Fisher egzaktni test, p izvoznici < 0,05, omjer izgleda: 6,2; 95% CI: 1.9-20.3) .table 1 babi i Babb genotipova H. pylori iz različitih kliničkih skupina bolesnika
N (%) pregled
DU pregled (n = 18)
GU pregled (n = 27)
Gastritis pregled (n = 27)
GC pregled (n = 20)
Ukupno pregled (n = 92)
statistikama
p pregled vrijednost
AB
11 (61.1)
14 (51,9)
15 (55,6) pregled, 6 (30)
46 (50)
0,039 pregled AB B
6 (33,3) pregled, 4 (14,8) pregled, 7 (25,9) pregled, 4 (20)
21 (22,8)
AB
0 (0) pregled, 4 (14,8) pregled, 4 (14,8) pregled 2 (10)
10 (10,9) pregled AB AB
1 (5.6) pregled 5 (18,5)
1 (3,7) pregled, 8 (40)
15 (16,3 )
DU: čirom na dvanaestercu. GU: želuca. GC: rak želuca. Razlika između četiri genotipova u želučanih bolesti procijenjena je Hi-kvadrat testom.
Kao AB AB genotipa bila je viša u bolesnika s karcinomom želuca, mi dalje testirati da li takav genotip može dovesti do veće stope prekanceroznih promjene ili teža histološki upala. U bolesnika s GC, AB AB genotipa bila je povezana s većim intenzitetom intestinalne metaplazije (IM) u antruma u odnosu na ne-AB AB genotipa (2,0 vs pregled 0.27, p
= 0,02). Međutim, kod bolesnika koji nisu raka, AB AB genotip nije povezana s više akutna upala rezultata (zbroj antralnom, corpus i kardija 3,43 vs. pregled 2,94, p pregled i 0.05), kronična upala rezultati (zbroj antralnom, korpusa i kardija: 7.29 vs pregled 7.22, p izvoznici > 0,05), H. pylori pregled gustoće (zbroj antralnom, korpusa i kardija: 8.14 vs 8.84 pregled , p izvoznici > 0,05), ili intenzitet IM (0,43 vs pregled 0.51, p izvoznici >. 0.05) u odnosu na ne-AB AB genotipa pregled razlika u Baba i Babb genotip između izolata iz antruma i korpusa Netlogu za 19 bolesnika koji su dali izolate iz različitih želučanih niše preko antruma i korpusa, u sastavu genotipom Baba Netlogu i Babb pregled kod lokusa a, B njihovog antruma i corpus izolata prikazan je u tablici 2. Četiri bolesnika (br. 7, 12, 29, 30) su inficirane s genotipom AB soja preko antruma i korpusa, a 15 pacijenata je utvrđeno da imaju mješoviti sojeva genotip (AB B, a AB ili AB AB) samo u korpusu, ili oba želučani niše. Kod tih 15 pacijenata, 3 bolesnika (br. 28, 2, 4) imaju iste pomiješanih genotipa preko antrum i korpusa. Osam od preostalih 12 bolesnika imalo je jedan veliki genotip u obje želučanog nišama. Kombinirajući sa 7 bolesnika (br. 7, 12, 29, 30, 28, 2, 4) sa samo jednim genotipom, 78,9% (15/19) naših pacijenata je jedan od glavnih genotipova distribuira preko dva niches.Table 2 genotipom sastavi antruma i korpusa H. pylori izolira od 19 bolesnika
predmetu broj
babAB pregled genotip izolata
bojnika babAB pregled genotipa preko antruma & korpus
Dominantna genotip u antralnom /corpus
AB ili AB AB kao dominantni genotip 12 pacijenata zaraženih s više od jednog genotipa
antruma (n)
pregled korpus (n)
antruma
korpus
7 pregled AB (4) pregled, AB (4) pregled AB
AB /AB pregled x
x pregled 12 pregled AB (4) pregled, AB (4) pregled AB
AB /AB pregled x pregled x pregled 29 pregled AB (4) pregled, AB (4) pregled AB
AB /AB pregled x
x pregled 30 pregled AB (4 ) pregled, AB (4) pregled AB pregled AB /AB pregled x
x pregled 28 pregled AB (4)
AB (4) pregled AB
A AB /A AB
x
x
2
AB AB (4)
AB AB (4) pregled AB AB AB AB
/AB AB pregled x
x
4 pregled AB AB (4) pregled AB AB (4) pregled AB AB AB AB pregled /AB AB pregled x pregled x
1 pregled AB AB (3) pregled AB AB (2) pregled AB AB AB AB pregled /- pregled +
- AB B (1) pregled AB B (2)
3 pregled AB B (3) pregled AB B (4) pregled AB B
AB B /AB B
-
- AB (1)
6 pregled AB AB (3)
AB (1) pregled AB AB (4) pregled AB AB AB AB
/AB AB pregled +
+ pregled, 10 pregled, AB AB (3) pregled AB B (4)
- AB AB /AB B pregled +
- AB B (1) pregled, 19 pregled, AB (3) pregled, AB (3) pregled AB pregled AB /- pregled +
- AB (4)
21
AB (4) pregled, AB (3) pregled AB pregled AB /AB pregled + pregled + pregled AB B (1)
25 pregled AB (4)
AB (1)
- AB /AB B pregled +
- AB B (3)
14 pregled AB (4) pregled, AB (2 ) pregled AB
AB /- pregled +
- AB B (2) pregled AB B (2) AB AB (2)
24 pregled AB (3 ) pregled, AB (1)
- AB /- pregled +
- AB (1) pregled AB B (1)
A AB (2) pregled 27 pregled AB (3) pregled, AB (1)
AB
AB /A AB pregled -
- AB AB (1)
A AB (3)
11 pregled AB (4)
AB (2)
- AB /- pregled +
- AB B (1 ) pregled AB AB (3) pregled AB AB (2)
17 pregled AB (3) pregled, AB (3) pregled AB pregled - /- pregled -
- pregled AB B (3)
AB (1)
A AB (2) pregled AB AB (2) pregled pacijenta ne. 1, 3, 6, 19 i 21, koji su bili zaraženi 2 genotipova, i dalje imaju važnu jedan u obje želučanog nišama, a to je također istina u 2 (br. 14, 27) bolesnika s 3, i 1 (br. 17) da pacijent ima 4 genotipa zastupljeni u njihovim infekcija. - Ukazuje na to da pacijenti imaju ne-dominantne Baba
i Babb pregled genotip u izolatima antruma ili korpusa. Broj pacijenata bila je u skladu s našim prethodnim studija [22].
Među tih 12 pacijenata zaraženih s više od jednog genotipa (tablica 2), frekvenciji od glavnih dominantnog genotip AB kombinaciji s AB AB, u antruma veći u usporedbi s onim u korpusu (75% [9/12] vs. pregled 16,2% [2/12], str pregled = 0,012, izgledi omjer: 15). Međutim, šest od 12 pacijenata nedostajalo dominantni genotip u svom korpusu izolata. Pregled Slijed analiza i usporedba pregled Na locus A, svaki pacijent je antruma i korpusa izolira imali određene supstitucije aminokiselina u regiji Baba (slika 2 i tablica 3). Međutim, nije bilo očita razlika između antruma i korpusa izolata u sekvenciranja regiji, osim Nijedan pacijent. 27 (amino kiseline 134 i 198). Također smo otkrili 5 različitih nonsynonymous supstitucije na amino kiseline 161 u izolatima 6 pacijenata, u usporedbi sa sojem J99. Isti scenarij (slijed specifičnost u sojevima pojedinih pacijenata, ali ne i između antruma i korpusa izolira) bio je u Babb pregled sekvenci. Slika 1 PCR banding obrasci babAB genotipova. (A) Primer parova koji se koriste za otkrivanje gena na locus A i B. naprijed primera, HypDF1 i S18F1, koji se nalazi u uzvodnom području Baba Netlogu ili Babb Netlogu, u paru s BabAR1 ili BabBR1 primera kako bi se utvrdilo je li gen na locus a i B je Baba pregled ili Babb pregled. (b) PCR osnovu prikupljenih uzoraka genotipa B, AB B, A AB i AB AB. AB B genotip pokazao dva bakterijske populacije u jednom naselju izdvojiti dominantni kao Baba Netlogu a manje kao Babb Netlogu na locus A. soj s A AB genotipa predstavljao dominantnu populaciju Babb i maloljetnika populacija Baba
na locus B. kombinacija AB B i a AB je definiran kao AB AB genotipa. Lane M1, 100 bp molekularni marker; lane M2, ja Hindlll marker. Veličina PCR proizvoda na locus A i B je 2.1-2.6 kb i 1.0-1.5 kb, respektivno. Pregled Tablica 3. zamjene aminokiselina u Baba kodirani Baba na lokusu A
položaja amino kiselina po

predmetu broj
6
9
37
92
131
134
136
161
165
166
198
202
204
206
212
218
25 pregled, L pregled T pregled pregled N pregled N pregled K pregled T pregled R
Y pregled G pregled N pregled S
T pregled T pregled E
S pregled, 27 pregled, L pregled pregled pregled N pregled N pregled T, K pregled T
A
D pregled G pregled N, K pregled S pregled, T pregled T pregled P pregled P pregled 2 pregled, L pregled A
S pregled S pregled N pregled, E pregled, T pregled K pregled Y pregled S
N pregled S pregled, T pregled T pregled E pregled S pregled, 24 pregled, L pregled pregled pregled N pregled N pregled K
sam
T
Y pregled G
N pregled E
S pregled, T pregled E
D
6
L pregled pregled pregled N pregled H pregled P pregled T pregled P pregled Y
G pregled N pregled N pregled T pregled T pregled pregled S pregled, 26 pregled F
A pregled A Netlogu N pregled N pregled K pregled T pregled S pregled Y pregled G pregled N pregled S pregled N
pregled E
s pregled CT ponavljanja Baba i Babb na locus B
gena u locus B regulirana CT ponavlja u 5 'kodiranje regiju, a broj CT ponavlja (5, 8 i 11) bi u kadar ekspresije proteina moguće [12, 20]. CT ponavljanja Babb pregled gena u locus B prikazani su u tablici 4. korpus izolira u 7 od 12 bolesnika imalo promjenu CT ponavljanja Babb pregled gena na locus B i antruma izolira od tih pacijenata uvijek imaju iste CT ponavlja, osim bolesnika 17 (Tablica 4) .table 4 broj CT ponavlja u 5 'područje kodiranja Babb na locus B pregled, predmet br
antruma izolira (n = 2) pregled (CT ponoviti broj)
Corpus izolati (n = 2) pregled (CT ponoviti broj)
Concordance
Promjena CT ponoviti u korpus
2 pregled, 8, 8
8, 8 pregled +
- 12 pregled, 8, 8 pregled 8, 8 pregled +
- pregled 24 pregled 7, 7 pregled 7, 7 pregled +
- 30 pregled, 11, 11 pregled, 11, 11 pregled + pregled - pregled 1 pregled 8, 8 pregled 7, 10
- + pregled, 11 pregled, 8, 8 pregled 7, 9
- +
26 pregled, 8, 8 pregled 8, 9
- + pregled 6 pregled 9, 9 pregled 9, 12
- + pregled, 21 pregled 7, 7 pregled 9, 10
- + pregled, 27 pregled, 9, 9 pregled 9, 8
- + pregled 14
8, 8 pregled 7, 7 pregled -
- 17 pregled, 7, 10 pregled, 8, 7
- + pregled Četiri bolesnika (br. 2, 12, 24, 30) su zaraženi izolata s jednom vrstom CT ponoviti (7, 8 i 11) preko antruma i korpusa, ali samo jedan od njih (br. 24) imao je izvan okvira Babb Netlogu , U drugim bolesnika (br. 1, 11 i 26), njihove antruma izolata sadržavala 8 CT ponavljanja ali corpus izolata promijenjen u 7, 9 ili 10 ponavljanja. Za pacijente (br. 6, 21 i 27) koji su bili zaraženi od antruma izolata sa 7 ili 9 CT ponavljanja, njihov korpus izolata je imao promjenu CT ponavlja, ali je broj CT ponavljanja je i dalje izvan okvira (9 , 10 i 12), osim u jednom izolirati od Nijedan pacijent. 27 (CT ponavlja = 8). Pregled, genotip i Baba izraz
Da bi se odredio učinak Baba pregled kod lokusa A i B na izrazu Baba (slika 3A), otkrili smo da je Baba pregled po lokusu B nije očigledno utječe na razinu ekspresije Baba, u usporedbi s izolata, 19C3 (a AB) i 19C1 (AB). Svi izolati (26A1, A4, C2 i C3) imali su na A AB genotipa, ali CT ponavljanja Baba Netlogu na locus B C2 bio izvan okvira. Izraz Baba nije bio pod utjecajem li Baba pregled na locus B je u ili izvan okvira. Mi i dalje određuje da li je mješoviti genotipa na locus A bi utjecati na ekspresiju Baba, i našao 14C2 i 14C3 sa AB B genotipa (baba /Hsp60 omjer: 0,76 i 0,70) imali nešto nižu ekspresiju od 14A2 i 14A4 s AB genotipa (baba /omjer hsp60: 0,90 i 0,87, slika 3B). AB AB genotipa također imali nižu izraz Baba od B (Baba /Hsp60 omjer: 1,09 i 0,89, slika 3C). Slika 2 babi sljedovima na locus A antruma i korpusa izolata. Kardinalni brojevi pokazuju izolate različitih pacijenata. A1-4 i C14 su single-kolonija izolirati izoliran iz antruma i korpusa, respektivno. Bijela isticanje pokazuje aminokiselina razlikuje od konsenzusa. Pregled Rasprava
pojavu intragenomic rekombinacije između Baba Netlogu i Babb pregled je pokazao u in vitro i in vivo pregled pregled eksperimenata, što ukazuje na to mehanizam može eventualno pomoći H.pylori
prilagoditi u ljudskom želucu [12, 14]. Osim toga, mješoviti genotipova Baba Netlogu i Babb
na locus A ili B su pokazali [20]. Klinički udruga Babe Netlogu i Babb pregled genotipa H. pylori pregled sojeva i genetskog profila sa infekcija antruma i korpusa hostu su još uvijek nejasni. U ovom istraživanju, pokazali smo da je AB AB genotipa, jedan dominantni genotip u antruma, bio povezan s pretkarcinomsku lezije kao IM, te povezana s rakom želuca. Međutim, H. pylori
infekcije takve AB AB genotipa nije dovesti u više guste kolonizacije ili upale težini u želučanom histologiju. Naši podaci ukazuju H. pylori Baba
i Babb pregled genotipovi su AB AB bi trebao barem vršiti bolju prilagodbu na probavnom traktu tijekom karcinogeneze. Pregled Colbeck sur pregled. [20] pronađeno 9 genotipova (B, AB B, A AB, A A, B B B A, B C, C B i B AB) u svojoj studiji. Ipak, naše istraživanje je pokazalo samo četiri genotipa (A B A AB, AB B i AB AB) u 168 izolira od antruma i korpusa (tablica 2) 19 pacijenata. To ukazuje da je genotip raznolikost babAB Netlogu u tajvanskim izolata može biti očito manje komplicirati. Štoviše, najmanje jedan Baba pregled gena na locus A postoji u svakom od izolata. Ovaj nalaz je u skladu s našim prethodnim izvješćem bi otkrio tajvanski H. pylori pregled izolati su gotovo 100% Baba pregled pozitivnih [17], a podržavaju veću prevalenciju Baba Netlogu u H. pylori pregled sojevi iz istočno-azijskih zemalja, od onih iz zapadnog svijeta [23]. Štoviše, Matteo i dr pregled. [24] pokazalo je da je 9 od 34 bolesnika (26,5%) imalo Bab varijacije pregled gena preko antruma i korpusa hostu u određenom vremenskom trenutku. Otkrili smo da je 12 od 19 pacijenata (63,2%) zaražena više od jednog genotipa u bilo jednog ili oba želučane nišama. Prevalencija raskorak između dviju studija može biti s obzirom na analizu Bab
genotipa od bakterijske bazen ili single-kolonija izolata. Pregled, analiza sekvenci Baba Netlogu i Babb pregled otkrio da nonsynonymous supstitucije aminokiseline dogodila između pojedinačnih sojeva (Slika 2, Tablica 3 i podaci nisu prikazani), ali se nije razlikovala između želučane udubljenja. Ponos i sur pregled. [11] Također su pokazali visoku alela raznolikost unutar Baba Netlogu i Babb pregled u sojevima iz različitih pacijenata. Sudeći po 6 različitih nonsynonymous supstitucije aminokiseline 161 u sojevima od 6 pacijenata, koji kodon je vrlo varijabilna stranica. To je vrijedan daljnje istraživanje, jer to može biti posebna stranica odgovorni su za prilagodbu na razlike u pojedinim želuca.
CT ponavlja u 5 'područje kodiranja Baba Netlogu i Babb pregled se češće naći na locus B od locus A [20]. Otkrili smo da je korpus izolati imali su veću učestalost promjene u broju CT ponavljanja Babb Netlogu na locus B nego antruma izolata (Tablica 4). Među tim 7 bolesnika zaraženih korpusu izolira s promjenom CT ponavlja, samo je jedan (pacijent, br. 27) imao je izolat mijenja CT ponavlja se u kadar (CT = 8) (tablica 4). Ovi podaci pokazuju da Babb izraz može se strogo kontroliraju faze varijacije zbog izvan okvira ponavlja u korpusu. Među 12 pacijenata zaraženih izolata s više od jednog genotipa, njihovi izolati iz antruma imaju višu stopu AB i AB AB kao dominantne genotipova od korpusa (9/12 vs pregled 2/12, str izvoznici < 0,05 ). Osim toga, polovica od tih bolesnika nije imao dominantan genotip u njihov korpus izolata. Ovi rezultati ukazuju na okoliš u korpusu mogu favorizirati različite prilagodbe za izolata s različitim H. pylori pregled genetskih različitosti.
Prisutnost AB AB genotipa bila je viša u GC bolesnika s starijoj dobi (tablica 1). Osim toga, AB AB genotip ne korelira s težim upalu ili prekanceroznih promjena u pacijenata bez raka. Na temelju tog presjeka kliničke histološke podataka, to sugerira sojevi AB AB može imati bolju adaptaciju na kancerozne okruženja u želucu, umjesto da vodi u više toksičnosti u želučanom karcinogeneze. Na slici 3A, pokazali smo da je Baba pregled gena na lokusu dominantno određuje Baba izraz, a mješoviti genotip kao AB u locus A može smanjiti ekspresiju Baba (slika 3B i 3C). Stoga je moguće mješoviti genotip kao AB u locus A mogu napraviti H. pylori pregled izolati sadržavati subpopulacije gubi Baba izraz. Alternativno, miješani genotip kao AB u locus B eventualno dopustiti H. pylori pregled mijenjati Babb izraz, a time i zaslužuje daljnje istraživanje.
Osim toga, naši prethodni podaci pokazali su da je intenzitet Lewis b postati smanjen u antruma atrofija, ali se može sačuvati u korpusu da posreduje u višu kolonizaciju bug overthere [17]. Dakle, to će se i implikativnu za testiranje da li je AB AB genotipa dominantno u antruma može imati prednost da se prilagodi želučanog epitela slabe Lewisove izražavanja b u budućnosti.
Zaključci
H. pylori
izolirati s Babom
and Babb pregled genotip kao AB AB genotipa korelira s povećanim rizikom od raka želuca, i kolonizirati u antralnom dominantnim način. Takva AB AB genotipa mora biti povezana s boljim adaptacije na želučanu pretkarcinomsku ili raka okruženju, a možda i generirati subpopulacije gube Baba ili Babb.
Metode
pacijenata i bakterijski izolati pregled ukupno 92 H. pylori
sojeva kultivirani su iz uzoraka biopsije bolesnika s različitim kliničkim bolestima kao što su čir na dvanaestercu (DU, n = 18), želučani čir (GU, n = 27), gastritis (n = 27), ili raka želuca (GCA, n = 20), definiran endoskopije s histološke potvrde. Svi pacijenti su dale pristanak i podvrgnut panendoscopy u našem institutu. Tijekom panendoscopy za svakog pacijenta, dobivene su pet komadići želuca biopsijom, uključujući i 2 iz antruma, 2 iz korpusa i 1. od cardia. Bakterijska kultura i histološki pregled se primjenjivati ​​prethodnom članku [17]. Ova studija je odobrio 'ljudski eksperiment i Etičkog povjerenstva Nacionalnog Cheng Kung University Hospital "(br HR-98-023). Pregled Jedna kolonija izolati iz antruma i korpusa je odabrano slučajnim odabirom iz tanjura primarne kulture. Za svaku stranicu, barem 3-4 jedne kolonije izolati su nasumično odabrani kako bi se utvrdilo babAB pregled genotip. Kolonija kulture za dobivanje DNA bila je manja od 8 prolaza kako bi se smanjila mogućnost genetskih varijacija u uvjetima in vitro. Svaka od 19 pacijenata zaraženih u antruma i korpusa od izolata s istim RAPD banding uzorak je prethodno opisano [22]. Pregled Otkrivanje Baba i Babb genotipova
otkrivanje Baba Netlogu i Babb Netlogu genotipovi se temelji na metodi Colbeck sur pregled [20]. HypDF1-BabAR1 i HypDF1-BabBR1 primeri su korišteni kako bi se utvrdilo da li je gen na locus A bio je Baba
ili Babb pregled. Na isti način, S18F1-BabAR1 i S18F1-BabBR1 primeri su primijenjene kako bi se utvrdilo da li je gen na locus B je Baba pregled ili Babb pregled (Slika 1A). 40 ciklusa reakcija amplifikacije provedene su s 20 pmol prajmera, 0.15 mM svakog deoksinukleozid trifosfata reakcijskog pufera s MgCl 2 i 1 U Taq DNA polimeraze (New England Biolabs, Beverly, MA, USA) u konačnom volumenu od 50 jal. Uvjeti toplinske biciklizam su ranije [20] što je opisano. Svaki povećani proizvod (20 ul) je analiziran na 1% agaroznom gelu, obojani s etidij bromidom. Slika 3 Baba na lokusu dominantno određuje Baba izraz. (A) Utjecaj Baba
na locus B na Baba pregled expression.The izolirati (19C3) imala Baba
na locus A i in-frame CT ponavljanja Baba
na locus B, koji su bili u usporedbi s izolata samo da Baba
na locus A (19C1). Prisutnost Baba
na locus A i B je bio u izolatima 26A1, A4, C2 i C3, a C2 je imao izvan okvira Baba Netlogu na locus B. (B) Učinak mješovitog genotipa na locus A na babi pregled izraz. Izolata iz jednog pacijenta (br. 14), imao je mješoviti genotip na locus A (14C2 i C3), koji je u usporedbi s onima koji Baba
samo na locus A (14A2 i A4). (C) Usporedba Baba
između AB AB genotipa A B. Hsp60 je kao interna kontrola. Definicija pregled genotip
Baba pregled i Babb pregled genotip svake pojedinačne kolonije izolata je na temelju prethodnog opisa [20]. J99-kao izolat je pokazao očekivani PCR bendova Baba
na locus A i Babb
na locus B i definirana je kao "A B genotipu" (Slika 1B-a). Jedna kolonija izolat sadrži i Baba
i Babb
na istom mjestu je definiran kao "mješoviti genotipu" (kao što je AB B, A AB i AB AB), što ukazuje da su subpopulacije unutar bakterijske populacije izvedeni iz jednog kolonije. Izoliran s AB B genotipom sadrži jednu populaciju sa Baba
a druga populacija s Babb
na istom mjestu A (Slika 1B-b). A AB genotipa zastupljene dvije bakterijske populacije, dominantan onaj s Babb pregled i manje jedna s Baba Netlogu na locus B, iako su obje izvedene iz jedne kolonije (Slika 1B-c). Mješoviti genotip otkriven na obje locus A i B je definiran kao AB AB (slika 1B-d).

• Neobična uzrok izlazna opstrukcija želuca: div želuca trichobezoar: prikaz slučaja
• Laparoskopska prednji gastropexy za kronične rekurentnog želučane volvulus: slučaj report