Антихеликобактерную клинические изоляты имеют различные распределения babAB генотип над различными топографическими участков желудка с корреляцией с клинической картиной заболевания исходы

H. Pylori
клинические изоляты имеют разнообразную babAB
генотипов распределений по различным топографическим участков желудка с корреляцией клинических исходов болезни
Аннотация
Справочная информация
Внутригеномный рекомбинации между Бабой
и Бабб <бр> посредничает антигенные вариации и может помочь H. Pylori
колонизацию. В данном исследовании определены ли переменная генотипы Baba
и Бабб
коррелируют с различными результатами клинических заболеваний, и может распределить по различным желудочным нишах.

Результаты Данное исследование включены 92 клинических штаммов (45 из язвенной болезни , 27 из гастрита, и 20 от рака желудка), чтобы обнаружить ли Baba
и Бэбб
находятся в локусе а или в с помощью ПЦР-реакции с использованием праймеров, сконструированных из вверх по течению, и вариабельной области Baba
и Бабб
генов. были обнаружены четыре генотипы Baba
и Бабб
(A B, AB B, A AB, AB AB). Распределение 4 генотипов в 92 клинических штаммов значительно отличалась среди пациентов с различными желудочными заболеваниями (р
≪ 0,05). Изоляты от больных раком желудка имели более высокий уровень AB AB генотипа, чем те, у пациентов без рака (40,0% против 9,7%
, р
&ЛТ; 0,05). Генотип AB AB был связан с более высокой интенсивностью кишечной метаплазии (р
&ЛТ; 0,05), но не коррелировали с более высоким воспалением и колонизация плотности в желудочном гистологии (р
≫ 0,05). Кроме того, исследование было включено 19 пациентов, чтобы проверить, существует ли переменная генотипы babAB
в различных желудочных ниш. Среди пациентов, инфицированных более одного babAB
генотипов над антрума и тела, были более высокие темпы генотипов как AB или AB AB в изолятов из антрума, чем в тех, из корпуса (75,0% против 16,7%
, р
≪ 0,05). Выводы

The H. Pylori
изолируют с генотипом AB AB коррелирует с повышенным риском развития рака желудка, и колонизировать в антрального преимущественным образом
фона <бр.> хеликобактерной
инфекция увеличивает риск развития язвенной болезни желудка и аденокарциномы желудка человека [1-3]. H. Pylori
соблюдение эпителия желудка и доставить эффекторы, чтобы вызвать воспаление [4, 5]. Одним из наиболее изученных адгезинов является группой крови антиген-связывающий Адгезиновая (Baba), который связывает Люис Б (Леб) и родственные АВО антигены [6, 7]. Предполагаемые Адгезиновая, Бабб, кодируется Бабб
, который разделяет почти идентичны N- и С-концевые последовательности с Бабой
[7, 8]. Реверсированный хромосомные расположение Baba
и Бабб
между штаммом J99 и 26695 доказывают события рекомбинации между этими двумя генами [9, 10]. Два гена, также показывают, как географический и аллельных вариации [11]. Кроме того, дублирование или Бабой
Бабб
ген опосредуется конверсии генов между различными хромосомных локусов [12-14]. Бэкстрем и др
. [14] показали, что молчание гена из Leb-рекомендательный штамма Baba
может быть активирована путем рекомбинации в Бабб
гена. Резуса модель обезьяны показали, что большинство выздоровел изоляты заменили Baba
со второй копией Бабб
после нескольких недель инфекции [12].
В западных странах, пациенты, инфицированные Baba
-положительным H . пилори
изоляты связаны с повышенным риском развития язвенной язвенных заболеваний [15, 16]. Тем не менее, эта ассоциация не подтверждена у пациентов из Восточной Азии или некоторых других западных стран [17-19]. Колбек и др
. [20] использовали ПЦР для обнаружения ли вниз по течению hpyD
(локус А) и s18
(Локус B) являются Baba
или Бабб
и нашли одной колонии изолировать со смешанным Baba
и Бэбб
генотип в том же локусе, что указывает на субпопуляции внутри бактериальной популяции, полученной из одной колонии. Он достоин того, чтобы ответить ли генетические профили Baba
и Бабб
может быть связано с различными результатами клинического заболевания или конкретного H. Pylori
гистологические особенности о связанных.
Существуют различные преобладающей ячейки типы в антральном и корпус. Теменные клетки, продуцирующие HCl найти в корпусе и сделать другой градиент рН до антральном. Наше предыдущее исследование показало, пациенты с хроническим хеликобактерной инфекции
выразили высокую интенсивность Льюиса б в желудочном эпителии корпуса, чем в антральном [17]. Рекомбинация между Бабой
и Бабб
может помочь H. Pylori
изменить его способность к адаптации адгезии различные ниши в желудке [21]. Соответственно, достоин того, чтобы определить распределение генотипов Бабы
и Бабб
в хеликобактерной инфекции
по различным топографическим местах либо как антральном или корпус в желудке человека. В данном исследовании мы проанализировали клиническую значимость Baba
и Бабб
генотипов и наличие Baba
и Бабб
в локусе А и В нескольких колоний из разных ниш желудка, чтобы понять babAB
генетический профиль H. Pylori
изолятов по желудочных регионах в пределах одного хоста.

Результаты Распределения Бабы и Бабб генотипов у больных с различными клиническими заболеваниями
Обнаружение babAB
генотипов на основе конструкции праймера, показанного на рисунке 1. Среди 92 штаммов, распределение четырех генотипов (АВ, АВ в, а и АВ АВ АВ) было 46 (50%), 21 (22,8%), 10 (10,9%) , и 15 (16,3%), соответственно. Там не было никакого различия в распределении полов между различными генотипами (хи-квадрат, р
≫ 0,05). Средний возраст больных с генотипом как AB AB была несколько старше, чем у инфицированных другими генотипами (57,6 против 50,3 лет, тест-образца Независимый T, P
= 0,09). Распределение четырех генотипов значительно отличались у больных с различными клиническими заболеваниями (таблица 1, хи-квадрат, р
= 0,04). Средний возраст пациентов GC был выше, чем у других нераковых больных (58,6 против 49,5 лет
, тест-т Независимые выборки, р = 0,01
). Скорость генотипом АВ АВ у больных с ГК был выше, чем в трех группах больных нераковых (40,0% [8/20] по сравнению с 9,7%
[7/72], точный критерий Фишера, р
&л; 0,05, отношение шансов: 6,2; 95% ДИ: 1.9-20.3) .table 1 Бабы и Бабб генотипы H. Pylori из различных клинических групп пациентов
N (%)
<бр> DU
(п = 18)

GU
(п = 27)

Гастрит
(п = 27)

GC
(п = 20)

Общее
(п = 92)

Статистика
р
значение

AB
11 (61,1)
14 (51,9) 15
(55,6)
6 (30)
46 (50) завод
0,039
AB B 6 (33,3)
4 (14.8)
7 (25,9)
4 (20)
21 (22,8)
AB
0 (0)
4 (14.8)
4 (14.8)
2 (10) 10
(10,9)
AB AB
1 (5,6)
5 (18,5)
1 (3,7)
8 (40) 15
(16,3 )
DU: язва двенадцатиперстной кишки. GU: язва желудка. GC: рак желудка. Разница между этими четырьмя генотипов в желудочных заболеваний оценивали с помощью критерия хи-квадрат.
В генотипе AB AB был выше у больных раком желудка, мы далее тестируют, может ли такой генотип привести к более высокому уровню предраковых изменения или более серьезными гистологическое воспаление. У больных с ГК, генотип AB AB был связан с более высокой интенсивностью кишечной метаплазии (IM) в антральном по сравнению с не-AB AB генотипа (2,0 против
0,27, р = 0,02
). Тем не менее, у пациентов, нераковых, генотип АВ АВ не было связано с более острым воспалением баллов (сумма антрального, корпус и кардии: 3,43 против 2,94
, р
> 0,05), хроническое воспаление оценки (сумма антрума, корпус и кардии: 7,29 против 7,22
, р
> 0,05), H. плотность пилори
(сумма антрума, корпус и кардии: 8,14 против 8,84
, р
> 0,05), или интенсивность обмена мгновенными сообщениями (0,43 против 0,51
, р
>. 0,05) по сравнению с не-AB AB генотипа
Разница в Baba и Бабб генотип между изолятов из антрума и мозолистого
для 19 пациентов, которые предоставили изолятов из различных желудочных ниш над антрума и тела, генотип состава Baba
и Бабб
Результаты в локусе а и в их антральном и корпусная изолятов показано в таблице 2. у четырех пациентов (нет. 7, 12, 29, 30) были инфицированы штаммом генотипом AB через антральном и тела, и были обнаружены у 15 пациентов с Одновременная генотип штаммов (AB B, A AB или AB AB) только в корпусе, или оба желудка нишах. В этих 15 пациентов, 3 пациента (нет. 28, 2, 4), имели такие же смешанные генотипы через антральном и тела. Восемь из оставшихся 12 пациентов имели один крупный генотип по обоим желудочных ниш. Объединение с 7 пациентов (нет. 7, 12, 29, 30, 28, 2, 4) только с одним генотипом, 78,9% (15/19) наших пациентов имели один из основных генотипа распределены между двумя niches.Table 2 генотипа композиции Антрум и Corpus хеликобактерной изоляты от 19 пациентов
Дело №

babAB
генотип изолирует

Major babAB
генотипа через антральном &Amp; корпус

Категории генотип в антрального /мозолистого

AB или AB AB в качестве доминирующего генотипа 12 пациентов, инфицированных более одного генотипа


Антрум (п)

корпус (п):

Антрум

корпус

7
AB (4)
AB (4)
AB
AB /AB
х
х
12
AB (4)
AB (4)
AB
AB /AB
х
х
29
AB (4)
AB (4)
AB
AB /AB
х
х
30
AB (4 )
AB (4)
AB
AB /AB
х
х
28
AB (4)
AB (4)
AB
A AB /A AB
х
х страница 2 AB AB (4)
AB AB (4)
AB AB
AB AB /AB AB
х
х 4
AB AB (4)
AB AB (4)
AB AB
AB AB /AB AB
х
х
1
AB AB (3)
AB AB (2)
AB AB
AB AB /-
+
-
AB B (1)
AB B (2) страница 3 AB B (3)
AB B (4)
AB B B AB
/AB B
- Форум -
AB (1)
6
AB AB (3)
AB (1)
AB AB (4)
AB AB AB AB
/AB AB
+ <бр> + 10

AB AB (3)
AB B (4)
-
AB AB /AB B
+
-
AB B (1)
19
AB (3)
AB (3)
AB
AB /-
+
-
AB (4)
21 <бр> AB (4)
AB (3)
AB
AB /AB
+
+
AB B (1)
25
AB (4)
AB (1)
-
AB /AB B
+
-
AB B (3)
14
AB (4)
AB (2 )
AB
AB /-
+
-
AB B (2)
AB B (2) AB AB (2)
24
AB (3 )
AB (1)
-
AB /-
+
-
AB (1)
AB B (1) A AB
(2)
27
AB (3)
AB (1)
AB
AB /A AB
-
-
AB AB (1) <бр> а AB (3)
11
AB (4)
AB (2)
-
AB /-
+
-
AB B (1 )
AB AB (3)
AB AB (2)
17
AB (3)
AB (3)
AB
- /- Форум -
-
AB B (3)
AB (1) A AB
(2)
AB AB (2)
Пациент нет. 1, 3, 6, 19 и 21, которые были инфицированы 2 генотипов, по-прежнему имеют большое одно на обоих желудочных ниш, и это было верно и в 2 (нет. 14, 27) пациентов, имеющих 3 и 1 (нет. 17) пациент, имеющий 4 генотипов, представленных в их инфекций. - Указывая, что пациенты имеют недоминирующую Baba
и Бабб
генотипа в изолятов антрума или корпуса. Число пациентов было в соответствии с нашим предыдущим исследованием [22].
Среди этих 12 пациентов, инфицированных более одного генотипа (таблица 2), частота основного доминирующего генотипа, AB в сочетании с AB AB, в Антрум было выше по сравнению с таковой в корпусе (75% [9/12] по сравнению с 16,2%
[2/12], р = 0,012
, отношение шансов: 15). Тем не менее, 6 из 12 пациентов не было доминирующим генотипом в их корпусе изолирует.
Анализ последовательности и сравнение
В локуса А, Антрум каждого пациента и изолирует корпус имел специфические замены аминокислот в области Baba (рис 2 и Таблица 3). Тем не менее, не было никакой очевидной разницы между антральном и Corpus изолирует в области секвенирования, за исключением Ни у одного пациента. 27 (аминокислоты 134 и 198). Мы также нашли 5 различных несинонимичными замен в аминокислоте 161 в изолятов 6 пациентов, по сравнению с штаммом J99. Тот же сценарий (специфичность последовательности у штаммов отдельных пациентов, но не между антральном и изолирует корпус) был в Бабб
последовательностей. Рисунок 1 ПЦР-облицовывания модели babAB генотипов. (A) пар праймеров, используемых для обнаружения генов в локусе A и B. праймеры, HypDF1 и S18F1, расположенные в верхнем районе Baba
или Бабб
, в паре с BabAR1 или BabBR1 праймеров для определения, является ли гена в локусе а и в Baba
или Бабб
. (B) PCR облицовывания модели генотипа A B, AB B, A AB и AB AB. AB B генотип показал две популяции бактерий в одиночной колонии изолят доминанте как Baba
и несовершеннолетний, как Бабб
на локуса А. Штамм с генотипом АВ представляет собой доминирующую популяцию Бабб и несовершеннолетнего население Baba
в локусе B. сочетание AB B и A AB была определена как генотипом АВ АВ. Lane M1, 100 п.н. молекулярный маркер; полоса М2, л HindIII маркер. Размер продуктов ПЦР в локусе А и В был 2,1-2,6 кб и 1,0-1,5 кб, соответственно.
Таблица 3 аминокислотные замены в Бабу, кодируемые Baba в очаге

Место расположения амино- кислотных замен
Главная дело №
6
9
37
92
131
134
136
161
165
166
198
202
204
206
212
218
25
L
T

N
N
K
T
R
Y
G
N
S
T
T
E
S
27
L


N
N
T, K
T
а
D
G
N, K
S
T
T
Q
P страница 2 L
A
S
S
N
E
T
K
Y
S
N
S
T
T
E
S
24
L


N
N
K
I
T
Y
G
N
E
S
T
E
D
6
L


N
H
Q
T
P
Y
G
N
N
T
T

S
26
F
а
A
N
N
K
T
S
Y
G
N
S
N

E
S
CT повторы Baba и Бабб в локус B
Гены локуса B регулируются с помощью КТ повторов в 5'-кодирующей области, а число повторов CT (5, 8 и 11) делают экспрессию белка в кадре возможно [12, 20]. КТ повторами Бэбб
гена в локусе B приведены в таблице 4. Состав изолирует у 7 из 12 пациентов имели изменение КТ повторами Бэбб
гена на Локус B, и Антрум изоляты тех пациентов, всегда имеют те же КТ повторы, кроме больной 17 (таблица 4) .table 4 число КТ повторов в 5'-кодирующую область Бэбб в локус B
Дело №

Антрум изолятов (N = 2)
(КТ число повтор)

Корпус изоляты (п = 2)
(КТ число повтор)

Concordance

Изменение КТ повторения в корпус 2
8, 8
8, 8
+
-
12
8, 8
8, 8
+ <бр> -
24
7, 7
7, 7
+
-
30
11, 11
11, 11
+
-
1
8, 8
7, 10
-
+
11
8, 8
7, 9
-
+ <бр> 26
8, 8
8, 9
-
+
6
9, 9
9, 12
-
+
21
7, 7
9, 10
-
+
27
9, 9
9, 8
-
+
14 <бр> 8, 8
7, 7
-
-
17
7, 10
8, 7
-
+
Четыре пациента (нет. 2, 12, 24, 30) были заражены изолятов с одного вида CT повтора (7, 8 и 11) через антрума и тела, но только один из них (№. 24) была из кадра Бабб
, У других пациентов (нет. 1, 11 и 26), их Антрум изолятов содержал 8 CT повторы но Corpus изолятов изменено на 7, 9 или 10 повторов. Для пациентов (нет. 6, 21 и 27), которые были заражены антральном изолирует с 7 или 9 CT повторами, их Corpus изоляты также имели изменение КТ повторяется, но количество повторов КТ до сих пор из кадра (9 , 10 и 12), за исключением одного изолята от Ни у одного пациента. 27 (СТ повторяется = 8).
Выражение Генотип и Baba
Для определения влияния Бабы
Результаты в локусе А и В на экспрессию Baba (рис 3А), мы обнаружили, что Baba
в локус B не очевидно, влияет на уровень экспрессии Baba, по сравнению с изолятов 19C3 (A AB) и 19C1 (AB). Все изоляты (26А1, A4, C2 и C3) имели генотип АВ, но повторы CT Бабы
на Локус B С2 был вне кадра. Выражение Baba не была затронута была ли Baba
на Локус B в или из кадра. Кроме того, мы определить, являются ли смешанный генотип в очаге будет влиять на экспрессию Baba, и нашел 14C2 и 14C3 с генотипом AB B (Baba /Hsp60 отношение: 0,76 и 0,70) была немного ниже выражение, чем 14A2 и 14A4 с генотипом АВ (Baba /отношение Hsp60: 0,90 и 0,87, фигура 3В). AB AB генотип также имели более низкую экспрессию Baba, чем A B (Baba /Hsp60 отношение: 1,09 и 0,89, рис 3C). изолирует Рисунок 2 Бабы последовательностей в локусе А антральном и тела. Количественные числительные указывают на изоляты разных пациентов. A1-4 и С1-4 были одной колонии изолировать изолированы от антрального и корпуса, соответственно. Белый подсветка указывает на аминокислоты, отличные от
консенсуса. Обсуждение
Возникновение внутригеномных рекомбинации между Бабой
и Бабб
было продемонстрировано в в пробирке
и в экспериментах естественных условиях
, вовлекая это механизм может помочь, возможно, H. пилори
адаптироваться в желудке человека [12, 14]. Кроме того, смешанные генотипы Baba
и Бабб
в локусе А или В было показано [20]. Клиническое объединение Baba
и Бабб
генотипа штаммов H. Pylori
и генетического профиля с инфекциями антрума и тела одного хозяина до сих пор неясны. В данном исследовании мы показали, что генотип AB AB, одним доминирующим генотипом в антральном, был связан с предраковым поражением как IM, и коррелируют с раком желудка. Тем не менее, антихеликобактерную
инфекции такой AB AB генотипа не приводит к более плотной колонизации или воспаление тяжести в желудке гистологии. Наши данные указывают на H. Pylori Baba
и Бабб
генотипы как AB AB должна по крайней мере, оказывать с лучшей адаптации к окружающей среде желудка во время канцерогенеза.
Колбек др
. [20] найдено 9 генотипов (A B, AB B, A AB, A A, B B, B A, B C, C B и B AB) в своем исследовании. Тем не менее, наше исследование можно найти только четыре генотипа (A B, A AB, AB B и AB AB) в 168 изолятов из антрума и тела (таблица 2) 19 пациентов. Это указывает на то генотип разнообразие babAB
в тайваньских изолятов может быть явно меньше усложнять. К тому же, по крайней мере, один Baba
генов в локусе А существует в каждом из изолятов. Этот вывод совместим с нашим предыдущим докладом, чтобы выявить тайваньский H. Pylori
изоляты почти 100% Baba
-положительным [17], а также поддерживать более высокую распространенность Baba
в H. Pylori
штаммы из стран Восточной Азии, чем те из западных миров [23]. Кроме того, Маттео и др
. [24] показали, что 9 из 34 пациентов (26,5%) имели Б.А.Б. вариацию
гена через антральном и своде одного хоста в определенный момент времени. Мы обнаружили, что зараженные более чем одного генотипа в одной или обеих желудочных ниш 12 из 19 пациентов (63,2%). Преобладание несоответствие между двух исследований может быть связано с анализом баб
генотипа от бактериального пула или одной колонии изолята.
Анализ последовательностей Baba
и Бабб
показал, что несинонимичных замен аминокислоты происходили между отдельными штаммами (рисунок 2, таблица 3 и данные не показаны), но не отличались между желудочными нишах. Гордость и др
. [11] также показали высокое разнообразие аллелей в Baba
и Бабб
в штаммов из разных пациентов. Судя по 6 различных несинонимичных замен аминокислот в 161 штаммов 6 пациентов, что кодон был сильно варьирует сайт. Это стоит дальнейшее расследование, поскольку это может быть специальный сайт отвечает за адаптацию к различиям в отдельных желудков.
CT повторов в 5'-кодирующей области Бабы
и Бабб
чаще встречаются в локусе B чем локуса А [20]. Мы обнаружили, что корпус изоляты имели более высокую частоту изменений числа КТ повторов Бабб
на Локус B, чем изолятов Антрум (таблица 4). Среди этих 7 пациентов, инфицированных изолирует корпус с изменением повторами КТ, только один (пациент нет. 27) имел изолят меняющийся КТ повторяется в рамке считывания (CT = 8) (таблица 4). Эти данные показывают, что экспрессия Бабб может быть под жестким контролем изменения фазы из-за из кадра повторов в корпусе. Среди 12 пациентов, инфицированных изолятов с более чем одним генотипом, их изоляты из антрального имеют более высокую скорость AB и AB AB в качестве доминирующих генотипов, чем корпус (9/12 против 2/12
, р
&л; 0,05 ). Кроме того, половина из этих больных не было доминирующего генотипа в их изолирует корпус. Эти результаты предполагают, что среда в корпусе может способствовать различное приспособление для изолятов с различными H. Pylori
генетических различий.
Присутствие генотипа AB AB был выше у больных с ГЦ старшего возраста (таблица 1). Кроме того, генотип АВ АВ не коррелирует с более сильным воспалением или предраковых изменений у больных нераковых. На основании этого поперечного сечения клинической гистологического данных, можно предположить, что штаммы AB AB может иметь лучшую адаптацию к раковой среды в желудке, вместо того, чтобы привести в большее количество токсичности в желудочном канцерогенезе. На рисунке 3А, мы покажем, что Baba
гена в локус доминантного определяет экспрессию Baba, и смешанный генотип, как AB в очаге может уменьшить экспрессию Baba (рис 3B и 3C). Таким образом, возможно смешанный генотип, как AB в локусе A может сделать H. Pylori
изоляты, чтобы содержать выражение Baba субпопуляционного потери. В качестве альтернативы, смешанный генотип, как AB в Локус B, возможно, позволит H. Pylori
изменить выражение Бабб и, таким образом, заслуживает дальнейшего изучения.
Кроме того, наши предыдущие данные показали, что интенсивность Льюиса б стать снизился в антральном атрофии, но могут быть сохранены в корпусе опосредовать высокую колонизацию ошибка overthere [17]. Таким образом, оно должно быть также импликативная проверить, является ли генотип AB AB доминируя в антральном может иметь преимущество для адаптации желудочного эпителия со слабым выражением б Льюиса в будущем.
Выводы
The H. Pylori
изолировать с Бабой
и Бабб
генотип, как AB AB генотип коррелирует с повышенным риском развития рака желудка, и колонизировать в антрального преобладающим образом. Такой AB AB генотип должен быть связан с лучшей адаптации к желудочному предраковых или раковых заболеваний окружающей среды, и, возможно, генерировать субпопуляций проигрышные Baba или Бэбб.
Методы
Пациенты и бактериальных изолятов
в общей сложности 92 H. Pylori
штаммы культивируют из биоптатов больных с различными клиническими заболеваниями, как язва двенадцатиперстной кишки (DU, п = 18), язва желудка (GU, п = 27), гастрит (п = 27), или рак желудка (GCA, п = 20), определяется эндоскопии с гистологическим подтверждением. Все пациенты дали информированное согласие и прошли panendoscopy в нашем институте. Во время panendoscopy для каждого пациента, были получены пять битов биопсии желудка, в том числе 2 из антрального, 2 из корпуса, и 1 из кардии. Бактериальная культура и гистологическое исследование были применены в предыдущей статье [17]. Это исследование было одобрено "Человеческий эксперимент и комитет по этике National Cheng Kung University Hospital" (№ HR-98-023). Одностоечные колонию изолирует от антрального и корпус отбирали случайным образом из первичных пластин культуры. Для каждого сайта, по крайней мере 3-4 одной колонии изолятов были выбраны случайным образом для определения babAB
генотип. Колония культуры для экстракции ДНК была менее 8 проходов, чтобы уменьшить возможность генетической изменчивости в лабораторных условиях. Каждый из 19 пациентов, инфицированных в антральном и тела с помощью изолятов с той же схеме RAPD полосатость была описана ранее [22].
Обнаружение Baba и Бабб генотипы
The обнаружение Baba
и Бабб
генотипы была основана на методе Колбек др
[20]. HypDF1-BabAR1 и HypDF1-BabBR1 праймеры были использованы для определения, был ли ген в локусе A Baba
или Бабб
. Таким же образом, S18F1-BabAR1 и S18F1-BabBR1 праймеров были применены для определения, был ли этот ген в локусе B Baba
или Бэбб
(Фигура 1А). 40 циклов реакции амплификации проводили с 20 пмоль праймера, 0,15 мМ каждого дезоксинуклеозид трифосфат реакционного буфера с MgCl <суб> 2 и 1 ЕД Taq ДНК-полимеразы (New England Biolabs, Beverly, MA, США) в конечном объеме 50 мкл. Условия термоциклирования были описаны ранее [20]. Каждый амплифицированный продукт (20 мкл) анализировали на агарозном геле 1% окрашивали бромистым этидием. Рисунок 3 Baba в очаге доминантно определяется выражение Бабы. (A) Влияние Baba изображения на Локус B на Baba
expression.The изолирования (19C3) была Бабой
в очаге и в рамке считывания CT повторы Baba
в Локус B, которые были по сравнению с изолята только при наличии Baba изображения в локусе A (19C1). Присутствие Baba
в локусе А и В был в изолятов 26А1, A4, С2 и С3, но C2 имел из кадра Baba
в локусе B. (б) Влияние смешанного генотипа в локусе А на Бабы
выражение. Изоляты от одного пациента (нет. 14) был смешанный генотип по локусу А (14C2 и С3), который по сравнению с теми, с Baba
только в локусе A (14A2 и А4). (C) Сравнение Baba
между AB AB и A B генотипов. Hsp60 был в качестве внутреннего контроля. Определение
Генотип
бабе
и Бэбб
генотип каждой одной колонии изолята была основана на предыдущем описании [20]. J99 типа изолята показали ожидаемые ПЦР полосы Бабы изображения в очаге и Бабб
в локусе B и был определен как "A B генотипа" (рис 1B-а). Изолят одной колонии, содержащие как Baba
и Бэбб
в том же самом локусе был определен как "смешанный генотип" (например, AB B, A AB и AB AB), что свидетельствует о том, что были субпопуляций в пределах бактериальной популяции полученный из одной колонии. Изолят с генотипом AB B содержал одну популяцию с Бабой
и остальное население с Бабб
в то же локуса А (рис 1В-б). Генотип АВ представлены два бактериальных популяций, доминирующим с Бабб
и минорный с Бабой
в Локус B, хотя оба получены из одной колонии (рис 1B-C). Смешанное генотип обнаружен у обоих локусов А и В была определена как AB AB (рис 1B-D).

• Необычный причиной желудочного выпускном обструкции: гигантский trichobezoar желудка: отчет случай
• Лапароскопическая передняя гастропексии для хронического рецидивирующего заворота желудка: случай report