Výskumný tím skúmal 33 zdravých dospelých účastníkov ich štúdie. Jedna skupina 22 dobrovoľníkov bola študovaná počas chrípkovej sezóny 2014-2015, a druhá skupina s 11 dobrovoľníkmi bola študovaná počas chrípkovej sezóny 2015-2016. Skupina 22 dobrovoľníkov mala vysokú už existujúcu imunitu voči kmeňom vírusu chrípky obsiahnutým v sezónnej chrípkovej vakcíne na roky 2014-2015. Skupina 11 dobrovoľníkov mala nízku imunitu voči kmeňom vírusu sezónnej chrípkovej vakcíny 2015-2016.
Všetci účastníci štúdie dostali sezónnu očkovaciu látku proti chrípke. Polovica účastníkov v každej skupine tiež absolvovala päťdňový kurz širokospektrálneho antibiotického režimu (pozostávajúci z neomycínu, vankomycín, a metronidazol) ústami pred podaním očkovacej látky. Analýzou vzoriek stolice a krvného séra odobratých v rôznych časoch do jedného roka po očkovaní vedci sledovali imunitnú odpoveď účastníkov na chrípkové vakcíny, ako aj rozmanitosť a množstvo organizmov v ich črevných mikrobiómoch.
Podľa očakávania, väčšina účastníkov, ktorí dostávali antibiotiká, mala znížené hladiny črevných baktérií. Navyše, medzi účastníkmi 2015-2016, ktorí mali v minulosti malú imunitu voči sezónnym očkovacím kmeňom vírusu chrípky, priebeh antibiotík bránil ich imunitnej odpovedi na jeden z troch kmeňov vírusu chrípky vo vakcíne, vírus špecifický pre H1N1 A/Kalifornia. To pravdepodobne naznačuje, že ak by boli po očkovaní vystavení tomuto vírusu H1N1, títo účastníci by boli menej chránení pred infekciou týmto kmeňom ako ľudia, ktorí nedostali antibiotiká, podľa autorov. Toto zistenie podporuje predchádzajúce výsledky výskumu na myšiach.
Vedci tiež zistili, že ľudia, ktorí užívali antibiotiká, zaznamenali zmeny v ich imunitnom systéme, ktoré podporovali prozápalový stav, podobný stavu, ktorý sa pozoroval u starších dospelých, ktorí dostali očkovacie látky proti chrípke. Vyšetrovatelia sa domnievajú, že tento prozápalový stav súvisí s procesom, ktorým mikrobióm reguluje metabolizmus žlčových kyselín-s menším počtom mikroorganizmov, tento proces je narušený. Mikrobiómy ľudí sa s pribúdajúcim vekom prirodzene menia, a vedci naznačujú, že ďalší výskum týchto ciest by mohol poskytnúť pohľad na to, prečo starší dospelí reagujú na očkovanie proti chrípke odlišne a prečo majú celkovo slabší imunitný systém.